MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis L2b/Canada1 high quality draft genome sequence

Total Repeats: 20245

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5002	NC_020935	TTA	2	6	258238	258243	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478452454
5003	NC_020935	TAA	2	6	258258	258263	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478452454
5004	NC_020935	TTG	2	6	258299	258304	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478452454
5005	NC_020935	ACT	2	6	258330	258335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478452454
5006	NC_020935	TAT	2	6	258369	258374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478452454
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5008	NC_020935	CACT	2	8	258414	258421	25 %	25 %	0 %	50 %	478452454
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5010	NC_020935	ATGA	2	8	258499	258506	50 %	25 %	25 %	0 %	478452454
5011	NC_020935	A	6	6	258549	258554	100 %	0 %	0 %	0 %	478452454
5012	NC_020935	TTG	2	6	258592	258597	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478452454
5013	NC_020935	A	6	6	258603	258608	100 %	0 %	0 %	0 %	478452454
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5016	NC_020935	AGC	2	6	258742	258747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478452454
5017	NC_020935	AGC	3	9	258768	258776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478452454
5018	NC_020935	GAT	2	6	258829	258834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478452454
5019	NC_020935	TGG	2	6	258897	258902	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478452454
5020	NC_020935	TC	3	6	258930	258935	0 %	50 %	0 %	50 %	478452454
5021	NC_020935	TAA	2	6	258965	258970	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478452454
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5027	NC_020935	CT	3	6	259284	259289	0 %	50 %	0 %	50 %	478452454
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5036	NC_020935	CTTTT	2	10	259808	259817	0 %	80 %	0 %	20 %	478452454
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5040	NC_020935	A	7	7	260009	260015	100 %	0 %	0 %	0 %	478452455
5041	NC_020935	TG	3	6	260153	260158	0 %	50 %	50 %	0 %	478452455
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5054	NC_020935	AAT	2	6	261307	261312	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478452457
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5057	NC_020935	CTG	2	6	261423	261428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478452457
5058	NC_020935	TA	3	6	261440	261445	50 %	50 %	0 %	0 %	478452457
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5092	NC_020935	CA	3	6	263323	263328	50 %	0 %	0 %	50 %	478452459
5093	NC_020935	GCA	2	6	263450	263455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478452459
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5099	NC_020935	TCATT	2	10	263893	263902	20 %	60 %	0 %	20 %	478452460
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5109	NC_020935	TTG	2	6	264412	264417	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478452460
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5112	NC_020935	A	7	7	264853	264859	100 %	0 %	0 %	0 %	478452461
5113	NC_020935	TTCT	2	8	264906	264913	0 %	75 %	0 %	25 %	478452461
5114	NC_020935	GA	3	6	264968	264973	50 %	0 %	50 %	0 %	478452461
5115	NC_020935	TAAAA	2	10	264999	265008	80 %	20 %	0 %	0 %	478452461
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5119	NC_020935	AG	3	6	265156	265161	50 %	0 %	50 %	0 %	478452461
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5247	NC_020935	TAT	2	6	271064	271069	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478452465
5248	NC_020935	TCT	2	6	271151	271156	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478452465
5249	NC_020935	ATCCT	2	10	271165	271174	20 %	40 %	0 %	40 %	478452465
5250	NC_020935	GAT	2	6	271218	271223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478452465
5251	NC_020935	AGA	2	6	271313	271318	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478452465
5252	NC_020935	TGA	2	6	271377	271382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478452466
5253	NC_020935	AGGAG	2	10	271416	271425	40 %	0 %	60 %	0 %	478452466
5254	NC_020935	GCT	2	6	271516	271521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478452466
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5369	NC_020935	TGA	2	6	276671	276676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478452470
5370	NC_020935	CT	3	6	276719	276724	0 %	50 %	0 %	50 %	478452470
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5458	NC_020935	AAGC	2	8	281345	281352	50 %	0 %	25 %	25 %	478452472
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5486	NC_020935	CTTT	2	8	282696	282703	0 %	75 %	0 %	25 %	478452474
5487	NC_020935	T	7	7	282701	282707	0 %	100 %	0 %	0 %	478452474
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