MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis L2b/Canada2 high quality draft genome sequence

Total Repeats: 20291

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_020932	GCA	2	6	207767	207772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478453322
4002	NC_020932	TTCC	2	8	207792	207799	0 %	50 %	0 %	50 %	478453322
4003	NC_020932	TAA	2	6	207807	207812	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478453322
4004	NC_020932	AGTA	2	8	207896	207903	50 %	25 %	25 %	0 %	478453322
4005	NC_020932	TTC	2	6	207950	207955	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478453322
4006	NC_020932	CGC	2	6	207981	207986	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	478453322
4007	NC_020932	ATC	2	6	208030	208035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478453322
4008	NC_020932	TGA	2	6	208047	208052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478453322
4009	NC_020932	ATA	2	6	208070	208075	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478453322
4010	NC_020932	TCT	2	6	208076	208081	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478453322
4011	NC_020932	ACG	2	6	208120	208125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478453322
4012	NC_020932	TTC	2	6	208159	208164	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478453322
4013	NC_020932	TAAC	2	8	208179	208186	50 %	25 %	0 %	25 %	478453322
4014	NC_020932	TCT	2	6	208187	208192	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478453322
4015	NC_020932	ATA	2	6	208210	208215	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478453322
4016	NC_020932	TGT	2	6	208346	208351	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478453322
4017	NC_020932	TAC	2	6	208390	208395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478453322
4018	NC_020932	AAG	2	6	208421	208426	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478453322
4019	NC_020932	TTTA	2	8	208456	208463	25 %	75 %	0 %	0 %	478453322
4020	NC_020932	TTC	3	9	208476	208484	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478453322
4021	NC_020932	AAC	2	6	208624	208629	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478453322
4022	NC_020932	T	6	6	208645	208650	0 %	100 %	0 %	0 %	478453322
4023	NC_020932	ATTT	2	8	208761	208768	25 %	75 %	0 %	0 %	478453322
4024	NC_020932	AAT	2	6	208792	208797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478453322
4025	NC_020932	GC	3	6	208841	208846	0 %	0 %	50 %	50 %	478453322
4026	NC_020932	AAT	2	6	208903	208908	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478453322
4027	NC_020932	CCT	2	6	208910	208915	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478453322
4028	NC_020932	AATT	2	8	208999	209006	50 %	50 %	0 %	0 %	478453322
4029	NC_020932	TTG	2	6	209031	209036	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478453322
4030	NC_020932	GAG	2	6	209057	209062	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478453322
4031	NC_020932	GCA	2	6	209216	209221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478453322
4032	NC_020932	CAA	2	6	209262	209267	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478453322
4033	NC_020932	AAT	2	6	209482	209487	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478453322
4034	NC_020932	GAT	2	6	209548	209553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478453322
4035	NC_020932	TTC	2	6	209554	209559	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478453322
4036	NC_020932	TTTA	2	8	209560	209567	25 %	75 %	0 %	0 %	478453322
4037	NC_020932	ATT	2	6	209598	209603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478453323
4038	NC_020932	TTG	2	6	209744	209749	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478453323
4039	NC_020932	TC	3	6	209774	209779	0 %	50 %	0 %	50 %	478453323
4040	NC_020932	TTC	2	6	209813	209818	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478453323
4041	NC_020932	AGT	2	6	209831	209836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478453323
4042	NC_020932	AACA	2	8	209858	209865	75 %	0 %	0 %	25 %	478453323
4043	NC_020932	TCT	2	6	209884	209889	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478453323
4044	NC_020932	TGGA	2	8	209916	209923	25 %	25 %	50 %	0 %	478453323
4045	NC_020932	TTC	2	6	209970	209975	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478453323
4046	NC_020932	TA	3	6	209990	209995	50 %	50 %	0 %	0 %	478453323
4047	NC_020932	TTC	2	6	210018	210023	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478453323
4048	NC_020932	GCA	2	6	210028	210033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478453323
4049	NC_020932	GCT	2	6	210037	210042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478453323
4050	NC_020932	GGA	2	6	210094	210099	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478453323
4051	NC_020932	T	6	6	210162	210167	0 %	100 %	0 %	0 %	478453323
4052	NC_020932	AACG	2	8	210210	210217	50 %	0 %	25 %	25 %	478453323
4053	NC_020932	TCA	2	6	210253	210258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478453323
4054	NC_020932	CTTT	2	8	210271	210278	0 %	75 %	0 %	25 %	478453323
4055	NC_020932	CCAT	2	8	210301	210308	25 %	25 %	0 %	50 %	478453323
4056	NC_020932	GA	3	6	210319	210324	50 %	0 %	50 %	0 %	478453323
4057	NC_020932	T	6	6	210339	210344	0 %	100 %	0 %	0 %	478453323
4058	NC_020932	AGG	2	6	210363	210368	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478453323
4059	NC_020932	CATT	2	8	210385	210392	25 %	50 %	0 %	25 %	478453323
4060	NC_020932	AGA	2	6	210419	210424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478453323
4061	NC_020932	CAA	2	6	210432	210437	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478453323
4062	NC_020932	ATA	4	12	210475	210486	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478453323
4063	NC_020932	GCT	2	6	210544	210549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478453323
4064	NC_020932	GAA	2	6	210629	210634	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478453323
4065	NC_020932	ACG	2	6	210645	210650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478453323
4066	NC_020932	AGCG	2	8	210755	210762	25 %	0 %	50 %	25 %	478453323
4067	NC_020932	CT	3	6	210792	210797	0 %	50 %	0 %	50 %	478453323
4068	NC_020932	CT	3	6	210800	210805	0 %	50 %	0 %	50 %	478453323
4069	NC_020932	AGC	2	6	210807	210812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478453323
4070	NC_020932	A	6	6	210879	210884	100 %	0 %	0 %	0 %	478453323
4071	NC_020932	CAC	2	6	210899	210904	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478453323
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4073	NC_020932	CTA	2	6	211001	211006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478453323
4074	NC_020932	TCT	2	6	211021	211026	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478453323
4075	NC_020932	TAGA	2	8	211052	211059	50 %	25 %	25 %	0 %	478453323
4076	NC_020932	CTTGT	2	10	211130	211139	0 %	60 %	20 %	20 %	478453323
4077	NC_020932	ATT	2	6	211146	211151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478453323
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4079	NC_020932	CAT	2	6	211220	211225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478453323
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4081	NC_020932	CG	3	6	211425	211430	0 %	0 %	50 %	50 %	478453323
4082	NC_020932	CTGGAT	2	12	211457	211468	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	478453323
4083	NC_020932	GTA	2	6	211682	211687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478453323
4084	NC_020932	ACC	2	6	211696	211701	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478453323
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4086	NC_020932	GAAATA	2	12	211780	211791	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	478453323
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4089	NC_020932	CGT	2	6	211973	211978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478453323
4090	NC_020932	TTTCT	2	10	211980	211989	0 %	80 %	0 %	20 %	478453323
4091	NC_020932	TAA	2	6	212009	212014	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478453324
4092	NC_020932	CTG	2	6	212047	212052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478453324
4093	NC_020932	CTT	2	6	212177	212182	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478453324
4094	NC_020932	ACG	2	6	212315	212320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478453324
4095	NC_020932	ACA	2	6	212563	212568	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478453325
4096	NC_020932	AATA	2	8	212608	212615	75 %	25 %	0 %	0 %	478453325
4097	NC_020932	CTT	2	6	212658	212663	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478453325
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4101	NC_020932	AAG	2	6	212841	212846	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478453325
4102	NC_020932	CTT	2	6	212847	212852	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478453325
4103	NC_020932	CTT	2	6	212874	212879	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478453325
4104	NC_020932	CTG	2	6	212933	212938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478453325
4105	NC_020932	CCA	2	6	212996	213001	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478453325
4106	NC_020932	CAAA	2	8	213016	213023	75 %	0 %	0 %	25 %	478453325
4107	NC_020932	CCA	2	6	213035	213040	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478453325
4108	NC_020932	GCA	2	6	213047	213052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478453325
4109	NC_020932	CAA	2	6	213060	213065	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478453325
4110	NC_020932	TAC	2	6	213111	213116	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478453325
4111	NC_020932	CTT	2	6	213174	213179	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478453325
4112	NC_020932	TA	3	6	213300	213305	50 %	50 %	0 %	0 %	478453326
4113	NC_020932	ATG	2	6	213353	213358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478453326
4114	NC_020932	TGT	2	6	213361	213366	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478453326
4115	NC_020932	GC	3	6	213426	213431	0 %	0 %	50 %	50 %	478453326
4116	NC_020932	AGA	2	6	213488	213493	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478453326
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4118	NC_020932	CTG	2	6	213655	213660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478453326
4119	NC_020932	CAC	2	6	213683	213688	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478453326
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4121	NC_020932	C	6	6	213797	213802	0 %	0 %	0 %	100 %	478453326
4122	NC_020932	ATGA	2	8	213803	213810	50 %	25 %	25 %	0 %	478453326
4123	NC_020932	T	6	6	213837	213842	0 %	100 %	0 %	0 %	478453326
4124	NC_020932	GCA	2	6	213925	213930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478453326
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4127	NC_020932	TCA	2	6	214044	214049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478453326
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4241	NC_020932	T	6	6	219521	219526	0 %	100 %	0 %	0 %	478453331
4242	NC_020932	GAT	2	6	219533	219538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478453331
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4247	NC_020932	T	6	6	219673	219678	0 %	100 %	0 %	0 %	478453331
4248	NC_020932	AGA	2	6	219687	219692	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478453331
4249	NC_020932	AGA	2	6	219717	219722	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478453331
4250	NC_020932	TAC	2	6	219728	219733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478453331
4251	NC_020932	TAA	2	6	219736	219741	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478453331
4252	NC_020932	CAT	2	6	219775	219780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478453331
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4254	NC_020932	CTGCTT	2	12	219795	219806	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	478453331
4255	NC_020932	CAAA	2	8	219882	219889	75 %	0 %	0 %	25 %	478453331
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4261	NC_020932	AGC	2	6	220080	220085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478453331
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4263	NC_020932	CAA	2	6	220097	220102	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478453331
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4265	NC_020932	CTGA	2	8	220142	220149	25 %	25 %	25 %	25 %	478453331
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4280	NC_020932	GTA	2	6	220855	220860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478453332
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4291	NC_020932	A	7	7	221403	221409	100 %	0 %	0 %	0 %	478453332
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4355	NC_020932	TGA	2	6	224844	224849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478453336
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4361	NC_020932	GATA	2	8	225108	225115	50 %	25 %	25 %	0 %	478453336
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4364	NC_020932	TCT	2	6	225188	225193	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478453336
4365	NC_020932	AGA	2	6	225222	225227	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478453336
4366	NC_020932	CTT	2	6	225314	225319	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478453337
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4368	NC_020932	TAT	2	6	225425	225430	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478453337
4369	NC_020932	TCT	2	6	225485	225490	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478453337
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4372	NC_020932	CTT	2	6	225623	225628	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478453337
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4479	NC_020932	GAA	2	6	231246	231251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478453341
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4485	NC_020932	CTG	2	6	231444	231449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478453341
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4487	NC_020932	TAG	2	6	231556	231561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478453341
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4489	NC_020932	AG	3	6	231752	231757	50 %	0 %	50 %	0 %	478453341
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4491	NC_020932	GTA	2	6	231849	231854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478453341
4492	NC_020932	TTCC	2	8	231881	231888	0 %	50 %	0 %	50 %	478453341
4493	NC_020932	A	6	6	231899	231904	100 %	0 %	0 %	0 %	478453341
4494	NC_020932	A	6	6	231983	231988	100 %	0 %	0 %	0 %	478453341
4495	NC_020932	TAA	2	6	232053	232058	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478453341
4496	NC_020932	ACG	2	6	232114	232119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478453341
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4499	NC_020932	AAG	2	6	232195	232200	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478453341
4500	NC_020932	GACT	2	8	232212	232219	25 %	25 %	25 %	25 %	478453341

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