MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis L2b/Canada2 high quality draft genome sequence

Total Repeats: 20291

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2125	NC_020932	TAA	2	6	111151	111156	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478453232
2126	NC_020932	T	6	6	111177	111182	0 %	100 %	0 %	0 %	478453232
2127	NC_020932	TCA	2	6	111279	111284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478453232
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2129	NC_020932	TAG	2	6	111523	111528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478453232
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2231	NC_020932	ACTTCG	2	12	115942	115953	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	478453234
2232	NC_020932	ACA	3	9	116032	116040	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478453234
2233	NC_020932	CAA	2	6	116057	116062	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478453234
2234	NC_020932	TTC	3	9	116106	116114	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478453234
2235	NC_020932	TCT	2	6	116167	116172	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478453234
2236	NC_020932	AAGC	2	8	116176	116183	50 %	0 %	25 %	25 %	478453234
2237	NC_020932	TATCG	2	10	116184	116193	20 %	40 %	20 %	20 %	478453234
2238	NC_020932	T	6	6	116200	116205	0 %	100 %	0 %	0 %	478453234
2239	NC_020932	GGTT	2	8	116508	116515	0 %	50 %	50 %	0 %	478453235
2240	NC_020932	T	7	7	116524	116530	0 %	100 %	0 %	0 %	478453235
2241	NC_020932	GCT	2	6	116650	116655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478453235
2242	NC_020932	TTTCT	2	10	116700	116709	0 %	80 %	0 %	20 %	478453235
2243	NC_020932	ACA	2	6	116737	116742	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478453235
2244	NC_020932	GGAGA	2	10	116896	116905	40 %	0 %	60 %	0 %	478453235
2245	NC_020932	TAT	2	6	116925	116930	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478453235
2246	NC_020932	TATC	2	8	116957	116964	25 %	50 %	0 %	25 %	478453235
2247	NC_020932	TTTG	2	8	117054	117061	0 %	75 %	25 %	0 %	478453235
2248	NC_020932	AGG	3	9	117066	117074	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478453235
2249	NC_020932	AGA	2	6	117087	117092	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478453235
2250	NC_020932	GA	3	6	117141	117146	50 %	0 %	50 %	0 %	478453235
2251	NC_020932	A	6	6	117194	117199	100 %	0 %	0 %	0 %	478453235
2252	NC_020932	GTTC	2	8	117250	117257	0 %	50 %	25 %	25 %	478453235
2253	NC_020932	TAA	2	6	117270	117275	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478453235
2254	NC_020932	ACC	2	6	117286	117291	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478453235
2255	NC_020932	GCT	2	6	117304	117309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478453235
2256	NC_020932	AGG	2	6	117354	117359	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478453235
2257	NC_020932	ATT	2	6	117388	117393	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478453235
2258	NC_020932	TTC	2	6	117405	117410	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478453235
2259	NC_020932	TGC	2	6	117435	117440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478453235
2260	NC_020932	CTG	2	6	117482	117487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478453235
2261	NC_020932	GCA	2	6	117687	117692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478453236
2262	NC_020932	TGC	2	6	117698	117703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478453236
2263	NC_020932	AAG	2	6	117706	117711	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478453236
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2265	NC_020932	GTT	2	6	117801	117806	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478453236
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2272	NC_020932	CAA	2	6	118038	118043	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478453237
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2274	NC_020932	AAG	2	6	118090	118095	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478453237
2275	NC_020932	TAA	2	6	118103	118108	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478453237
2276	NC_020932	CA	3	6	118312	118317	50 %	0 %	0 %	50 %	478453237
2277	NC_020932	AT	3	6	118519	118524	50 %	50 %	0 %	0 %	478453238
2278	NC_020932	T	6	6	118529	118534	0 %	100 %	0 %	0 %	478453238
2279	NC_020932	AGA	3	9	118535	118543	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478453238
2280	NC_020932	CTTT	2	8	118572	118579	0 %	75 %	0 %	25 %	478453238
2281	NC_020932	G	6	6	118665	118670	0 %	0 %	100 %	0 %	478453238
2282	NC_020932	T	6	6	118688	118693	0 %	100 %	0 %	0 %	478453238
2283	NC_020932	GTT	2	6	118806	118811	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478453238
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2288	NC_020932	AAAGA	2	10	118947	118956	80 %	0 %	20 %	0 %	478453238
2289	NC_020932	AAT	2	6	118957	118962	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478453238
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2291	NC_020932	T	6	6	119116	119121	0 %	100 %	0 %	0 %	478453239
2292	NC_020932	TTC	2	6	119202	119207	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478453239
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2295	NC_020932	CTG	2	6	119431	119436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478453239
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2302	NC_020932	GTT	2	6	119665	119670	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478453239
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2315	NC_020932	GCTA	2	8	120095	120102	25 %	25 %	25 %	25 %	478453240
2316	NC_020932	CGGC	2	8	120144	120151	0 %	0 %	50 %	50 %	478453240
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2321	NC_020932	GA	4	8	120295	120302	50 %	0 %	50 %	0 %	478453240
2322	NC_020932	GGC	2	6	120335	120340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	478453240
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2324	NC_020932	TCT	2	6	120519	120524	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478453240
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2329	NC_020932	TCA	2	6	121144	121149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478453241
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2332	NC_020932	TGC	2	6	121215	121220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478453241
2333	NC_020932	CTG	2	6	121223	121228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478453241
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2336	NC_020932	GTA	2	6	121453	121458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478453241
2337	NC_020932	AGGATC	2	12	121476	121487	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	478453241
2338	NC_020932	CTT	2	6	121628	121633	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478453241
2339	NC_020932	CAG	2	6	121670	121675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478453241
2340	NC_020932	AGG	2	6	121701	121706	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478453241
2341	NC_020932	CT	3	6	121761	121766	0 %	50 %	0 %	50 %	478453241
2342	NC_020932	GAA	2	6	121815	121820	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478453241
2343	NC_020932	TCT	2	6	121900	121905	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478453241
2344	NC_020932	CCAAT	2	10	121910	121919	40 %	20 %	0 %	40 %	478453241
2345	NC_020932	ATG	2	6	122015	122020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478453241
2346	NC_020932	TGC	2	6	122032	122037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478453241
2347	NC_020932	CTT	2	6	122057	122062	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478453241
2348	NC_020932	AGA	2	6	122154	122159	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478453241
2349	NC_020932	GAA	2	6	122170	122175	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478453241
2350	NC_020932	TTTC	2	8	122252	122259	0 %	75 %	0 %	25 %	478453241
2351	NC_020932	AAC	2	6	122303	122308	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478453241
2352	NC_020932	TGA	2	6	122351	122356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478453241
2353	NC_020932	TTA	2	6	122504	122509	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478453241
2354	NC_020932	CAA	2	6	122520	122525	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478453241
2355	NC_020932	AAG	2	6	122528	122533	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478453241
2356	NC_020932	AGA	2	6	122595	122600	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478453241
2357	NC_020932	TGA	2	6	122607	122612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478453241
2358	NC_020932	CTT	2	6	122650	122655	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478453241
2359	NC_020932	TC	3	6	122673	122678	0 %	50 %	0 %	50 %	478453241
2360	NC_020932	ATC	2	6	122856	122861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478453241
2361	NC_020932	AACA	2	8	122880	122887	75 %	0 %	0 %	25 %	478453241
2362	NC_020932	AAAG	2	8	122983	122990	75 %	0 %	25 %	0 %	478453241
2363	NC_020932	GA	3	6	123003	123008	50 %	0 %	50 %	0 %	478453241
2364	NC_020932	GCTTC	2	10	123011	123020	0 %	40 %	20 %	40 %	478453241
2365	NC_020932	CTC	2	6	123048	123053	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478453241
2366	NC_020932	AAGGGT	2	12	123283	123294	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	478453242
2367	NC_020932	AG	3	6	123309	123314	50 %	0 %	50 %	0 %	478453242
2368	NC_020932	T	6	6	123325	123330	0 %	100 %	0 %	0 %	478453242
2369	NC_020932	AGCT	2	8	123358	123365	25 %	25 %	25 %	25 %	478453242
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2492	NC_020932	AGCT	2	8	129137	129144	25 %	25 %	25 %	25 %	478453249
2493	NC_020932	TTC	2	6	129147	129152	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478453249
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