MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis L2b/Canada2 high quality draft genome sequence

Total Repeats: 20291

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_020932	A	7	7	54707	54713	100 %	0 %	0 %	0 %	478453187
1003	NC_020932	TTC	2	6	54730	54735	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478453187
1004	NC_020932	CAC	2	6	54859	54864	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478453187
1005	NC_020932	CAA	2	6	54893	54898	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478453187
1006	NC_020932	GAA	2	6	54920	54925	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478453187
1007	NC_020932	CT	3	6	54944	54949	0 %	50 %	0 %	50 %	478453187
1008	NC_020932	TCGA	2	8	54979	54986	25 %	25 %	25 %	25 %	478453187
1009	NC_020932	CTTC	2	8	55073	55080	0 %	50 %	0 %	50 %	478453187
1010	NC_020932	GAAT	2	8	55108	55115	50 %	25 %	25 %	0 %	478453187
1011	NC_020932	TGT	2	6	55144	55149	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478453187
1012	NC_020932	GAT	2	6	55172	55177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478453187
1013	NC_020932	TTGA	2	8	55178	55185	25 %	50 %	25 %	0 %	478453187
1014	NC_020932	AGC	2	6	55227	55232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478453187
1015	NC_020932	TCA	2	6	55233	55238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478453187
1016	NC_020932	AAG	2	6	55295	55300	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478453187
1017	NC_020932	A	6	6	55367	55372	100 %	0 %	0 %	0 %	478453187
1018	NC_020932	CAA	2	6	55386	55391	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478453187
1019	NC_020932	G	6	6	55423	55428	0 %	0 %	100 %	0 %	478453187
1020	NC_020932	AAT	2	6	55520	55525	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478453187
1021	NC_020932	GGAA	2	8	55534	55541	50 %	0 %	50 %	0 %	478453187
1022	NC_020932	TGG	2	6	55683	55688	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478453187
1023	NC_020932	GGTTCA	2	12	55706	55717	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	478453187
1024	NC_020932	TTATC	2	10	55807	55816	20 %	60 %	0 %	20 %	478453187
1025	NC_020932	AGAA	2	8	55880	55887	75 %	0 %	25 %	0 %	478453187
1026	NC_020932	CTG	2	6	55902	55907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478453187
1027	NC_020932	GAG	2	6	55908	55913	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478453187
1028	NC_020932	AT	3	6	56152	56157	50 %	50 %	0 %	0 %	478453187
1029	NC_020932	TTA	2	6	56167	56172	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478453187
1030	NC_020932	TGT	2	6	56334	56339	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478453188
1031	NC_020932	TGG	2	6	56343	56348	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478453188
1032	NC_020932	T	6	6	56380	56385	0 %	100 %	0 %	0 %	478453188
1033	NC_020932	CTGG	3	12	56445	56456	0 %	25 %	50 %	25 %	478453188
1034	NC_020932	ATT	2	6	56460	56465	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478453188
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1038	NC_020932	TCC	2	6	56523	56528	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478453188
1039	NC_020932	TTA	2	6	56536	56541	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478453188
1040	NC_020932	TTGC	2	8	56579	56586	0 %	50 %	25 %	25 %	478453188
1041	NC_020932	AGCG	2	8	56619	56626	25 %	0 %	50 %	25 %	478453188
1042	NC_020932	T	6	6	56631	56636	0 %	100 %	0 %	0 %	478453188
1043	NC_020932	GTA	2	6	56662	56667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478453188
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1046	NC_020932	GTTGT	2	10	56872	56881	0 %	60 %	40 %	0 %	478453188
1047	NC_020932	T	6	6	56927	56932	0 %	100 %	0 %	0 %	478453188
1048	NC_020932	GAAAAG	2	12	56962	56973	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478453188
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1050	NC_020932	AGT	3	9	57066	57074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478453188
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1052	NC_020932	CT	3	6	57084	57089	0 %	50 %	0 %	50 %	478453188
1053	NC_020932	GAG	2	6	57097	57102	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478453188
1054	NC_020932	TGG	2	6	57120	57125	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478453188
1055	NC_020932	GT	3	6	57134	57139	0 %	50 %	50 %	0 %	478453188
1056	NC_020932	TGT	2	6	57143	57148	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478453188
1057	NC_020932	AGT	2	6	57153	57158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478453188
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1059	NC_020932	T	6	6	57238	57243	0 %	100 %	0 %	0 %	478453188
1060	NC_020932	TTTG	2	8	57312	57319	0 %	75 %	25 %	0 %	478453188
1061	NC_020932	AGA	2	6	57394	57399	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478453188
1062	NC_020932	CAG	2	6	57557	57562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478453188
1063	NC_020932	CAT	2	6	57566	57571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478453188
1064	NC_020932	TTG	2	6	57579	57584	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478453188
1065	NC_020932	TG	3	6	57763	57768	0 %	50 %	50 %	0 %	478453188
1066	NC_020932	GGTT	2	8	57772	57779	0 %	50 %	50 %	0 %	478453188
1067	NC_020932	TAA	2	6	57828	57833	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478453188
1068	NC_020932	ACT	2	6	57844	57849	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478453188
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1072	NC_020932	T	6	6	57883	57888	0 %	100 %	0 %	0 %	478453188
1073	NC_020932	ATT	2	6	57898	57903	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478453188
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1084	NC_020932	CTA	2	6	58254	58259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478453189
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1096	NC_020932	CAA	2	6	58957	58962	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478453189
1097	NC_020932	GCT	2	6	58986	58991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478453189
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1103	NC_020932	CTT	2	6	59116	59121	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478453189
1104	NC_020932	TTC	2	6	59147	59152	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478453189
1105	NC_020932	TGG	2	6	59173	59178	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478453189
1106	NC_020932	TAGA	2	8	59275	59282	50 %	25 %	25 %	0 %	478453189
1107	NC_020932	TTA	2	6	59361	59366	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478453189
1108	NC_020932	TGAA	2	8	59380	59387	50 %	25 %	25 %	0 %	478453189
1109	NC_020932	TGT	2	6	59394	59399	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478453189
1110	NC_020932	T	8	8	59457	59464	0 %	100 %	0 %	0 %	478453189
1111	NC_020932	T	6	6	59477	59482	0 %	100 %	0 %	0 %	478453189
1112	NC_020932	T	6	6	59488	59493	0 %	100 %	0 %	0 %	478453189
1113	NC_020932	AGA	2	6	59562	59567	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478453190
1114	NC_020932	TCT	2	6	59578	59583	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478453190
1115	NC_020932	T	6	6	59610	59615	0 %	100 %	0 %	0 %	478453190
1116	NC_020932	CGTT	2	8	59761	59768	0 %	50 %	25 %	25 %	478453190
1117	NC_020932	GGAG	2	8	59770	59777	25 %	0 %	75 %	0 %	478453190
1118	NC_020932	GTAA	2	8	59822	59829	50 %	25 %	25 %	0 %	478453190
1119	NC_020932	TCCTAA	2	12	59889	59900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478453190
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1121	NC_020932	T	6	6	59950	59955	0 %	100 %	0 %	0 %	478453190
1122	NC_020932	AGC	2	6	59998	60003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478453190
1123	NC_020932	GCT	2	6	60010	60015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478453190
1124	NC_020932	GTC	2	6	60036	60041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478453190
1125	NC_020932	ATGG	2	8	60049	60056	25 %	25 %	50 %	0 %	478453190
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1249	NC_020932	CGA	2	6	66555	66560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478453195
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1366	NC_020932	T	6	6	72611	72616	0 %	100 %	0 %	0 %	478453200
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