MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis L2b/Canada2 high quality draft genome sequence

Total Repeats: 20291

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_020932	CCTT	2	8	634777	634784	0 %	50 %	0 %	50 %	478453710
12502	NC_020932	TCCAT	2	10	634843	634852	20 %	40 %	0 %	40 %	478453710
12503	NC_020932	AGAA	2	8	634853	634860	75 %	0 %	25 %	0 %	478453710
12504	NC_020932	CCT	2	6	634894	634899	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478453710
12505	NC_020932	CT	3	6	634898	634903	0 %	50 %	0 %	50 %	478453710
12506	NC_020932	CTA	2	6	634912	634917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478453710
12507	NC_020932	GAAA	2	8	635006	635013	75 %	0 %	25 %	0 %	478453710
12508	NC_020932	A	6	6	635011	635016	100 %	0 %	0 %	0 %	478453710
12509	NC_020932	CTCTTT	2	12	635114	635125	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478453710
12510	NC_020932	ATATCC	2	12	635131	635142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478453710
12511	NC_020932	AGC	2	6	635169	635174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478453710
12512	NC_020932	T	6	6	635229	635234	0 %	100 %	0 %	0 %	478453710
12513	NC_020932	TAAACA	2	12	635242	635253	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	478453710
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12515	NC_020932	CAA	2	6	635418	635423	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478453711
12516	NC_020932	GA	3	6	635444	635449	50 %	0 %	50 %	0 %	478453711
12517	NC_020932	TCC	2	6	635480	635485	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478453711
12518	NC_020932	A	7	7	635491	635497	100 %	0 %	0 %	0 %	478453711
12519	NC_020932	ATGC	2	8	635507	635514	25 %	25 %	25 %	25 %	478453711
12520	NC_020932	ACGA	2	8	635547	635554	50 %	0 %	25 %	25 %	478453711
12521	NC_020932	GA	4	8	635606	635613	50 %	0 %	50 %	0 %	478453711
12522	NC_020932	AAG	2	6	635614	635619	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478453711
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12525	NC_020932	ACA	2	6	635709	635714	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478453712
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12529	NC_020932	AAG	2	6	635771	635776	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478453712
12530	NC_020932	TTTC	2	8	635777	635784	0 %	75 %	0 %	25 %	478453712
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12533	NC_020932	CAT	2	6	635870	635875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478453712
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12550	NC_020932	TCC	2	6	636582	636587	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478453713
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12553	NC_020932	CAC	2	6	636714	636719	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478453713
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12559	NC_020932	TAA	3	9	637035	637043	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478453713
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12982	NC_020932	TCT	2	6	659353	659358	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478453730
12983	NC_020932	ATG	2	6	659384	659389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478453730
12984	NC_020932	GAA	2	6	659473	659478	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478453730
12985	NC_020932	GAC	2	6	659539	659544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478453730
12986	NC_020932	ATTG	2	8	659565	659572	25 %	50 %	25 %	0 %	478453730
12987	NC_020932	TCA	2	6	659609	659614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478453730
12988	NC_020932	AACCA	2	10	659615	659624	60 %	0 %	0 %	40 %	478453730
12989	NC_020932	GCTAC	2	10	659678	659687	20 %	20 %	20 %	40 %	478453730
12990	NC_020932	AGA	2	6	659715	659720	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478453730
12991	NC_020932	TAC	2	6	659721	659726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478453730
12992	NC_020932	GAA	2	6	659827	659832	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478453730
12993	NC_020932	AATA	2	8	660034	660041	75 %	25 %	0 %	0 %	478453731
12994	NC_020932	CACG	2	8	660059	660066	25 %	0 %	25 %	50 %	478453731
12995	NC_020932	TG	3	6	660091	660096	0 %	50 %	50 %	0 %	478453731
12996	NC_020932	TAT	2	6	660102	660107	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478453731
12997	NC_020932	CTC	2	6	660165	660170	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478453731
12998	NC_020932	TTTA	2	8	660198	660205	25 %	75 %	0 %	0 %	478453731
12999	NC_020932	ACA	2	6	660219	660224	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478453731
13000	NC_020932	CT	3	6	660254	660259	0 %	50 %	0 %	50 %	478453731

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