MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis L2b/Canada2 high quality draft genome sequence

Total Repeats: 20291

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5002	NC_020932	TTC	2	6	257643	257648	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478453367
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5004	NC_020932	CAAA	2	8	257767	257774	75 %	0 %	0 %	25 %	478453367
5005	NC_020932	CTT	2	6	257840	257845	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478453367
5006	NC_020932	ATT	2	6	257865	257870	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478453367
5007	NC_020932	CTC	2	6	257938	257943	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478453367
5008	NC_020932	CAT	2	6	258019	258024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478453367
5009	NC_020932	CTT	2	6	258043	258048	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478453367
5010	NC_020932	TGT	2	6	258059	258064	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478453367
5011	NC_020932	CAA	2	6	258093	258098	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478453367
5012	NC_020932	GCTT	2	8	258121	258128	0 %	50 %	25 %	25 %	478453367
5013	NC_020932	GAT	2	6	258137	258142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478453367
5014	NC_020932	AAT	2	6	258143	258148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478453367
5015	NC_020932	TTA	2	6	258155	258160	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478453367
5016	NC_020932	TAA	2	6	258175	258180	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478453367
5017	NC_020932	TTG	2	6	258216	258221	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478453367
5018	NC_020932	ACT	2	6	258247	258252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478453367
5019	NC_020932	TAT	2	6	258286	258291	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478453367
5020	NC_020932	CCG	2	6	258297	258302	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	478453367
5021	NC_020932	CACT	2	8	258331	258338	25 %	25 %	0 %	50 %	478453367
5022	NC_020932	TC	4	8	258361	258368	0 %	50 %	0 %	50 %	478453367
5023	NC_020932	ATGA	2	8	258416	258423	50 %	25 %	25 %	0 %	478453367
5024	NC_020932	A	6	6	258466	258471	100 %	0 %	0 %	0 %	478453367
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5034	NC_020932	TAA	2	6	258882	258887	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478453367
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5039	NC_020932	GTTC	2	8	259138	259145	0 %	50 %	25 %	25 %	478453367
5040	NC_020932	CT	3	6	259201	259206	0 %	50 %	0 %	50 %	478453367
5041	NC_020932	GCA	2	6	259280	259285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478453367
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5052	NC_020932	A	6	6	259824	259829	100 %	0 %	0 %	0 %	478453367
5053	NC_020932	A	7	7	259926	259932	100 %	0 %	0 %	0 %	478453368
5054	NC_020932	TG	3	6	260070	260075	0 %	50 %	50 %	0 %	478453368
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5105	NC_020932	CA	3	6	263240	263245	50 %	0 %	0 %	50 %	478453372
5106	NC_020932	GCA	2	6	263367	263372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478453372
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5111	NC_020932	T	6	6	263645	263650	0 %	100 %	0 %	0 %	478453372
5112	NC_020932	TCATT	2	10	263810	263819	20 %	60 %	0 %	20 %	478453373
5113	NC_020932	A	6	6	263823	263828	100 %	0 %	0 %	0 %	478453373
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5118	NC_020932	TTC	3	9	264018	264026	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478453373
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5121	NC_020932	TC	3	6	264315	264320	0 %	50 %	0 %	50 %	478453373
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5123	NC_020932	GAA	2	6	264365	264370	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478453373
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5128	NC_020932	TAAAA	2	10	264916	264925	80 %	20 %	0 %	0 %	478453374
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5240	NC_020932	A	7	7	270330	270336	100 %	0 %	0 %	0 %	478453378
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5370	NC_020932	ACC	2	6	275835	275840	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478453381
5371	NC_020932	CCAT	2	8	275847	275854	25 %	25 %	0 %	50 %	478453381
5372	NC_020932	GAG	2	6	275907	275912	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478453381
5373	NC_020932	GCTT	2	8	275948	275955	0 %	50 %	25 %	25 %	478453381
5374	NC_020932	GCA	2	6	276224	276229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478453382
5375	NC_020932	GCT	2	6	276246	276251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478453382
5376	NC_020932	TCT	2	6	276252	276257	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478453382
5377	NC_020932	GCA	2	6	276282	276287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478453382
5378	NC_020932	TTA	2	6	276397	276402	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478453382
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5380	NC_020932	GTA	2	6	276497	276502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478453382
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5382	NC_020932	TGA	2	6	276587	276592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478453383
5383	NC_020932	CT	3	6	276635	276640	0 %	50 %	0 %	50 %	478453383
5384	NC_020932	ATC	2	6	276641	276646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478453383
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5388	NC_020932	AAAG	2	8	276735	276742	75 %	0 %	25 %	0 %	478453383
5389	NC_020932	ATA	2	6	276833	276838	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478453383
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5393	NC_020932	GAT	2	6	277014	277019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478453383
5394	NC_020932	TTC	2	6	277078	277083	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478453383
5395	NC_020932	A	6	6	277089	277094	100 %	0 %	0 %	0 %	478453383
5396	NC_020932	TAAT	2	8	277156	277163	50 %	50 %	0 %	0 %	478453383
5397	NC_020932	TTC	2	6	277166	277171	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478453383
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5399	NC_020932	TG	3	6	277247	277252	0 %	50 %	50 %	0 %	478453383
5400	NC_020932	GAA	2	6	277253	277258	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478453383
5401	NC_020932	CTT	2	6	277261	277266	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478453383
5402	NC_020932	TCC	2	6	277436	277441	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478453383
5403	NC_020932	CAG	2	6	277444	277449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478453383
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5405	NC_020932	CACGCG	2	12	277703	277714	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	478453383
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5407	NC_020932	TTTCTT	2	12	277882	277893	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	478453383
5408	NC_020932	TCT	2	6	278006	278011	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478453384
5409	NC_020932	TGC	2	6	278029	278034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478453384
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5412	NC_020932	TTG	2	6	278070	278075	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478453384
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5422	NC_020932	AGCT	2	8	278366	278373	25 %	25 %	25 %	25 %	478453384
5423	NC_020932	CTG	2	6	278532	278537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478453384
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5442	NC_020932	ATA	2	6	279465	279470	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478453384
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5444	NC_020932	TCT	2	6	279601	279606	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478453384
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5453	NC_020932	CAG	2	6	280116	280121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478453384
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5460	NC_020932	ATTC	2	8	280353	280360	25 %	50 %	0 %	25 %	478453384
5461	NC_020932	CAT	2	6	280672	280677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478453385
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5470	NC_020932	CTCC	2	8	281239	281246	0 %	25 %	0 %	75 %	478453385
5471	NC_020932	AAGC	2	8	281261	281268	50 %	0 %	25 %	25 %	478453385
5472	NC_020932	ATG	2	6	281278	281283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478453385
5473	NC_020932	T	6	6	281334	281339	0 %	100 %	0 %	0 %	478453385
5474	NC_020932	CTC	2	6	281340	281345	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478453385
5475	NC_020932	GAT	2	6	281389	281394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478453385
5476	NC_020932	A	7	7	281395	281401	100 %	0 %	0 %	0 %	478453385
5477	NC_020932	AG	3	6	281462	281467	50 %	0 %	50 %	0 %	478453385
5478	NC_020932	CTT	2	6	281765	281770	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478453386
5479	NC_020932	ACT	2	6	281794	281799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478453386
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5481	NC_020932	GTC	2	6	281875	281880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478453386
5482	NC_020932	T	6	6	281894	281899	0 %	100 %	0 %	0 %	478453386
5483	NC_020932	ACT	2	6	281922	281927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478453386
5484	NC_020932	ACT	2	6	281991	281996	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478453386
5485	NC_020932	TGC	2	6	282027	282032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478453386
5486	NC_020932	T	7	7	282037	282043	0 %	100 %	0 %	0 %	478453386
5487	NC_020932	CTCCTA	2	12	282044	282055	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	478453386
5488	NC_020932	AAC	2	6	282129	282134	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478453386
5489	NC_020932	TC	3	6	282244	282249	0 %	50 %	0 %	50 %	478453386
5490	NC_020932	ATC	2	6	282269	282274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478453386
5491	NC_020932	TGGC	2	8	282279	282286	0 %	25 %	50 %	25 %	478453386
5492	NC_020932	ATT	2	6	282333	282338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478453386
5493	NC_020932	AG	3	6	282340	282345	50 %	0 %	50 %	0 %	478453386
5494	NC_020932	TTG	2	6	282347	282352	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478453386
5495	NC_020932	ACT	2	6	282380	282385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478453386
5496	NC_020932	AT	3	6	282390	282395	50 %	50 %	0 %	0 %	478453386
5497	NC_020932	TTG	2	6	282422	282427	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478453387
5498	NC_020932	T	6	6	282454	282459	0 %	100 %	0 %	0 %	478453387
5499	NC_020932	CTTT	2	8	282612	282619	0 %	75 %	0 %	25 %	478453387
5500	NC_020932	T	7	7	282617	282623	0 %	100 %	0 %	0 %	478453387

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