MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis L2b/UCH-2 complete genome

Total Repeats: 20291

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2005	NC_020931	AGTA	2	8	104395	104402	50 %	25 %	25 %	0 %	478454119
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2125	NC_020931	GAT	2	6	110960	110965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478454125
2126	NC_020931	TG	3	6	111029	111034	0 %	50 %	50 %	0 %	478454125
2127	NC_020931	T	6	6	111248	111253	0 %	100 %	0 %	0 %	478454125
2128	NC_020931	TTG	2	6	111272	111277	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478454125
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2133	NC_020931	TAG	2	6	111667	111672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478454125
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2235	NC_020931	ACTTCG	2	12	116086	116097	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	478454127
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2239	NC_020931	TCT	2	6	116311	116316	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478454127
2240	NC_020931	AAGC	2	8	116320	116327	50 %	0 %	25 %	25 %	478454127
2241	NC_020931	TATCG	2	10	116328	116337	20 %	40 %	20 %	20 %	478454127
2242	NC_020931	T	6	6	116344	116349	0 %	100 %	0 %	0 %	478454127
2243	NC_020931	GGTT	2	8	116652	116659	0 %	50 %	50 %	0 %	478454128
2244	NC_020931	T	7	7	116668	116674	0 %	100 %	0 %	0 %	478454128
2245	NC_020931	GCT	2	6	116794	116799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478454128
2246	NC_020931	TTTCT	2	10	116844	116853	0 %	80 %	0 %	20 %	478454128
2247	NC_020931	ACA	2	6	116881	116886	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478454128
2248	NC_020931	GGAGA	2	10	117040	117049	40 %	0 %	60 %	0 %	478454128
2249	NC_020931	TAT	2	6	117069	117074	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478454128
2250	NC_020931	TATC	2	8	117101	117108	25 %	50 %	0 %	25 %	478454128
2251	NC_020931	TTTG	2	8	117198	117205	0 %	75 %	25 %	0 %	478454128
2252	NC_020931	AGG	3	9	117210	117218	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478454128
2253	NC_020931	AGA	2	6	117231	117236	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478454128
2254	NC_020931	GA	3	6	117285	117290	50 %	0 %	50 %	0 %	478454128
2255	NC_020931	A	6	6	117338	117343	100 %	0 %	0 %	0 %	478454128
2256	NC_020931	GTTC	2	8	117394	117401	0 %	50 %	25 %	25 %	478454128
2257	NC_020931	TAA	2	6	117414	117419	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478454128
2258	NC_020931	ACC	2	6	117430	117435	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478454128
2259	NC_020931	GCT	2	6	117448	117453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478454128
2260	NC_020931	AGG	2	6	117498	117503	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478454128
2261	NC_020931	ATT	2	6	117532	117537	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478454128
2262	NC_020931	TTC	2	6	117549	117554	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478454128
2263	NC_020931	TGC	2	6	117579	117584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478454128
2264	NC_020931	CTG	2	6	117626	117631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478454128
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2267	NC_020931	AAG	2	6	117850	117855	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478454129
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2269	NC_020931	GTT	2	6	117945	117950	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478454129
2270	NC_020931	TAT	2	6	117961	117966	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478454129
2271	NC_020931	TCC	2	6	117988	117993	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478454129
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2278	NC_020931	AAG	2	6	118234	118239	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478454130
2279	NC_020931	TAA	2	6	118247	118252	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478454130
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2281	NC_020931	AT	3	6	118663	118668	50 %	50 %	0 %	0 %	478454131
2282	NC_020931	T	6	6	118673	118678	0 %	100 %	0 %	0 %	478454131
2283	NC_020931	AGA	3	9	118679	118687	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478454131
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2285	NC_020931	G	6	6	118809	118814	0 %	0 %	100 %	0 %	478454131
2286	NC_020931	T	6	6	118832	118837	0 %	100 %	0 %	0 %	478454131
2287	NC_020931	GTT	2	6	118950	118955	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478454131
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2296	NC_020931	TTC	2	6	119346	119351	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478454132
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2299	NC_020931	CTG	2	6	119575	119580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478454132
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2302	NC_020931	GA	4	8	119650	119657	50 %	0 %	50 %	0 %	478454132
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2311	NC_020931	AG	3	6	120085	120090	50 %	0 %	50 %	0 %	478454133
2312	NC_020931	GCTA	2	8	120107	120114	25 %	25 %	25 %	25 %	478454133
2313	NC_020931	GA	3	6	120118	120123	50 %	0 %	50 %	0 %	478454133
2314	NC_020931	AAG	2	6	120126	120131	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478454133
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2319	NC_020931	GCTA	2	8	120239	120246	25 %	25 %	25 %	25 %	478454133
2320	NC_020931	CGGC	2	8	120288	120295	0 %	0 %	50 %	50 %	478454133
2321	NC_020931	AGC	2	6	120329	120334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478454133
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2325	NC_020931	GA	4	8	120439	120446	50 %	0 %	50 %	0 %	478454133
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2328	NC_020931	TCT	2	6	120663	120668	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478454133
2329	NC_020931	GA	3	6	120772	120777	50 %	0 %	50 %	0 %	478454133
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2332	NC_020931	TG	3	6	121280	121285	0 %	50 %	50 %	0 %	478454134
2333	NC_020931	TCA	2	6	121288	121293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478454134
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2336	NC_020931	TGC	2	6	121359	121364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478454134
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2338	NC_020931	AGC	2	6	121390	121395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478454134
2339	NC_020931	CTTC	2	8	121588	121595	0 %	50 %	0 %	50 %	478454134
2340	NC_020931	GTA	2	6	121597	121602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478454134
2341	NC_020931	AGGATC	2	12	121620	121631	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	478454134
2342	NC_020931	CTT	2	6	121772	121777	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478454134
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2345	NC_020931	CT	3	6	121905	121910	0 %	50 %	0 %	50 %	478454134
2346	NC_020931	GAA	2	6	121959	121964	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478454134
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2348	NC_020931	CCAAT	2	10	122054	122063	40 %	20 %	0 %	40 %	478454134
2349	NC_020931	ATG	2	6	122159	122164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478454134
2350	NC_020931	TGC	2	6	122176	122181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478454134
2351	NC_020931	CTT	2	6	122201	122206	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478454134
2352	NC_020931	AGA	2	6	122298	122303	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478454134
2353	NC_020931	GAA	2	6	122314	122319	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478454134
2354	NC_020931	TTTC	2	8	122396	122403	0 %	75 %	0 %	25 %	478454134
2355	NC_020931	AAC	2	6	122447	122452	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478454134
2356	NC_020931	TGA	2	6	122495	122500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478454134
2357	NC_020931	TTA	2	6	122648	122653	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478454134
2358	NC_020931	CAA	2	6	122664	122669	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478454134
2359	NC_020931	AAG	2	6	122672	122677	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478454134
2360	NC_020931	AGA	2	6	122739	122744	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478454134
2361	NC_020931	TGA	2	6	122751	122756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478454134
2362	NC_020931	CTT	2	6	122794	122799	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478454134
2363	NC_020931	TC	3	6	122817	122822	0 %	50 %	0 %	50 %	478454134
2364	NC_020931	ATC	2	6	123000	123005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478454134
2365	NC_020931	AACA	2	8	123024	123031	75 %	0 %	0 %	25 %	478454134
2366	NC_020931	AAAG	2	8	123127	123134	75 %	0 %	25 %	0 %	478454134
2367	NC_020931	GA	3	6	123147	123152	50 %	0 %	50 %	0 %	478454134
2368	NC_020931	GCTTC	2	10	123155	123164	0 %	40 %	20 %	40 %	478454134
2369	NC_020931	CTC	2	6	123192	123197	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478454134
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2372	NC_020931	T	6	6	123469	123474	0 %	100 %	0 %	0 %	478454135
2373	NC_020931	AGCT	2	8	123502	123509	25 %	25 %	25 %	25 %	478454135
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2491	NC_020931	T	6	6	128937	128942	0 %	100 %	0 %	0 %	478454140
2492	NC_020931	GAA	2	6	128999	129004	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478454140
2493	NC_020931	CTT	3	9	129029	129037	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478454140
2494	NC_020931	GAA	2	6	129197	129202	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478454141
2495	NC_020931	T	6	6	129221	129226	0 %	100 %	0 %	0 %	478454141
2496	NC_020931	AGCT	2	8	129281	129288	25 %	25 %	25 %	25 %	478454142
2497	NC_020931	TTC	2	6	129291	129296	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478454142
2498	NC_020931	TGA	2	6	129339	129344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478454142
2499	NC_020931	ATCCA	2	10	129351	129360	40 %	20 %	0 %	40 %	478454142
2500	NC_020931	T	6	6	129363	129368	0 %	100 %	0 %	0 %	478454142

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