MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis L2b/UCH-2 complete genome

Total Repeats: 20291

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_020931	A	7	7	54707	54713	100 %	0 %	0 %	0 %	478454080
1003	NC_020931	TTC	2	6	54730	54735	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478454080
1004	NC_020931	CAC	2	6	54859	54864	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478454080
1005	NC_020931	CAA	2	6	54893	54898	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478454080
1006	NC_020931	GAA	2	6	54920	54925	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478454080
1007	NC_020931	CT	3	6	54944	54949	0 %	50 %	0 %	50 %	478454080
1008	NC_020931	TCGA	2	8	54979	54986	25 %	25 %	25 %	25 %	478454080
1009	NC_020931	CTTC	2	8	55073	55080	0 %	50 %	0 %	50 %	478454080
1010	NC_020931	GAAT	2	8	55108	55115	50 %	25 %	25 %	0 %	478454080
1011	NC_020931	TGT	2	6	55144	55149	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478454080
1012	NC_020931	GAT	2	6	55172	55177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478454080
1013	NC_020931	TTGA	2	8	55178	55185	25 %	50 %	25 %	0 %	478454080
1014	NC_020931	AGC	2	6	55227	55232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478454080
1015	NC_020931	TCA	2	6	55233	55238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478454080
1016	NC_020931	AAG	2	6	55295	55300	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478454080
1017	NC_020931	A	6	6	55367	55372	100 %	0 %	0 %	0 %	478454080
1018	NC_020931	CAA	2	6	55386	55391	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478454080
1019	NC_020931	G	6	6	55423	55428	0 %	0 %	100 %	0 %	478454080
1020	NC_020931	AAT	2	6	55520	55525	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478454080
1021	NC_020931	GGAA	2	8	55534	55541	50 %	0 %	50 %	0 %	478454080
1022	NC_020931	TGG	2	6	55683	55688	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478454080
1023	NC_020931	GGTTCA	2	12	55706	55717	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	478454080
1024	NC_020931	TTATC	2	10	55807	55816	20 %	60 %	0 %	20 %	478454080
1025	NC_020931	AGAA	2	8	55880	55887	75 %	0 %	25 %	0 %	478454080
1026	NC_020931	CTG	2	6	55902	55907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478454080
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1029	NC_020931	TTA	2	6	56167	56172	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478454080
1030	NC_020931	TGT	2	6	56334	56339	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478454081
1031	NC_020931	TGG	2	6	56343	56348	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478454081
1032	NC_020931	T	6	6	56380	56385	0 %	100 %	0 %	0 %	478454081
1033	NC_020931	CTGG	3	12	56445	56456	0 %	25 %	50 %	25 %	478454081
1034	NC_020931	ATT	2	6	56460	56465	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478454081
1035	NC_020931	GAT	2	6	56473	56478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478454081
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1037	NC_020931	TCC	2	6	56505	56510	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478454081
1038	NC_020931	TCC	2	6	56523	56528	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478454081
1039	NC_020931	TTA	2	6	56536	56541	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478454081
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1041	NC_020931	AGCG	2	8	56619	56626	25 %	0 %	50 %	25 %	478454081
1042	NC_020931	T	6	6	56631	56636	0 %	100 %	0 %	0 %	478454081
1043	NC_020931	GTA	2	6	56662	56667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478454081
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1045	NC_020931	TGG	2	6	56793	56798	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478454081
1046	NC_020931	GTTGT	2	10	56872	56881	0 %	60 %	40 %	0 %	478454081
1047	NC_020931	T	6	6	56927	56932	0 %	100 %	0 %	0 %	478454081
1048	NC_020931	GAAAAG	2	12	56962	56973	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478454081
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1050	NC_020931	AGT	3	9	57066	57074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478454081
1051	NC_020931	AGCT	2	8	57078	57085	25 %	25 %	25 %	25 %	478454081
1052	NC_020931	CT	3	6	57084	57089	0 %	50 %	0 %	50 %	478454081
1053	NC_020931	GAG	2	6	57097	57102	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478454081
1054	NC_020931	TGG	2	6	57120	57125	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478454081
1055	NC_020931	GT	3	6	57134	57139	0 %	50 %	50 %	0 %	478454081
1056	NC_020931	TGT	2	6	57143	57148	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478454081
1057	NC_020931	AGT	2	6	57153	57158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478454081
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1059	NC_020931	T	6	6	57238	57243	0 %	100 %	0 %	0 %	478454081
1060	NC_020931	TTTG	2	8	57312	57319	0 %	75 %	25 %	0 %	478454081
1061	NC_020931	AGA	2	6	57394	57399	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478454081
1062	NC_020931	CAG	2	6	57557	57562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478454081
1063	NC_020931	CAT	2	6	57566	57571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478454081
1064	NC_020931	TTG	2	6	57579	57584	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478454081
1065	NC_020931	TG	3	6	57763	57768	0 %	50 %	50 %	0 %	478454081
1066	NC_020931	GGTT	2	8	57772	57779	0 %	50 %	50 %	0 %	478454081
1067	NC_020931	TAA	2	6	57828	57833	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478454081
1068	NC_020931	ACT	2	6	57844	57849	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478454081
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1072	NC_020931	T	6	6	57883	57888	0 %	100 %	0 %	0 %	478454081
1073	NC_020931	ATT	2	6	57898	57903	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478454081
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1080	NC_020931	TGA	2	6	58088	58093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478454082
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1085	NC_020931	GAG	2	6	58269	58274	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478454082
1086	NC_020931	AGTTGT	2	12	58311	58322	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	478454082
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1089	NC_020931	CTG	2	6	58570	58575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478454082
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1092	NC_020931	GAAA	2	8	58710	58717	75 %	0 %	25 %	0 %	478454082
1093	NC_020931	CT	3	6	58720	58725	0 %	50 %	0 %	50 %	478454082
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1095	NC_020931	AGGT	2	8	58749	58756	25 %	25 %	50 %	0 %	478454082
1096	NC_020931	CAC	2	6	58862	58867	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478454082
1097	NC_020931	AGG	2	6	58913	58918	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478454082
1098	NC_020931	TCT	2	6	58929	58934	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478454082
1099	NC_020931	T	9	9	59035	59043	0 %	100 %	0 %	0 %	478454082
1100	NC_020931	CAA	2	6	59101	59106	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478454082
1101	NC_020931	GCT	2	6	59130	59135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478454082
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1103	NC_020931	T	7	7	59176	59182	0 %	100 %	0 %	0 %	478454082
1104	NC_020931	TGT	2	6	59203	59208	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478454082
1105	NC_020931	TCTTGT	2	12	59220	59231	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	478454082
1106	NC_020931	T	8	8	59242	59249	0 %	100 %	0 %	0 %	478454082
1107	NC_020931	CTT	2	6	59260	59265	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478454082
1108	NC_020931	TTC	2	6	59291	59296	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478454082
1109	NC_020931	TGG	2	6	59317	59322	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478454082
1110	NC_020931	TAGA	2	8	59419	59426	50 %	25 %	25 %	0 %	478454082
1111	NC_020931	TTA	2	6	59505	59510	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478454082
1112	NC_020931	TGAA	2	8	59524	59531	50 %	25 %	25 %	0 %	478454082
1113	NC_020931	TGT	2	6	59538	59543	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478454082
1114	NC_020931	T	8	8	59601	59608	0 %	100 %	0 %	0 %	478454082
1115	NC_020931	T	6	6	59621	59626	0 %	100 %	0 %	0 %	478454082
1116	NC_020931	T	6	6	59632	59637	0 %	100 %	0 %	0 %	478454082
1117	NC_020931	AGA	2	6	59706	59711	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478454083
1118	NC_020931	TCT	2	6	59722	59727	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478454083
1119	NC_020931	T	6	6	59754	59759	0 %	100 %	0 %	0 %	478454083
1120	NC_020931	CGTT	2	8	59905	59912	0 %	50 %	25 %	25 %	478454083
1121	NC_020931	GGAG	2	8	59914	59921	25 %	0 %	75 %	0 %	478454083
1122	NC_020931	GTAA	2	8	59966	59973	50 %	25 %	25 %	0 %	478454083
1123	NC_020931	TCCTAA	2	12	60033	60044	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478454083
1124	NC_020931	AGT	2	6	60062	60067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478454083
1125	NC_020931	T	6	6	60094	60099	0 %	100 %	0 %	0 %	478454083
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1127	NC_020931	GCT	2	6	60154	60159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478454083
1128	NC_020931	GTC	2	6	60180	60185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478454083
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1252	NC_020931	A	7	7	66691	66697	100 %	0 %	0 %	0 %	478454088
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