MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis L2b/UCH-2 complete genome

Total Repeats: 20291

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_020931	CCTT	2	8	634921	634928	0 %	50 %	0 %	50 %	478454602
12502	NC_020931	TCCAT	2	10	634987	634996	20 %	40 %	0 %	40 %	478454602
12503	NC_020931	AGAA	2	8	634997	635004	75 %	0 %	25 %	0 %	478454602
12504	NC_020931	CCT	2	6	635038	635043	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478454602
12505	NC_020931	CT	3	6	635042	635047	0 %	50 %	0 %	50 %	478454602
12506	NC_020931	CTA	2	6	635056	635061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478454602
12507	NC_020931	GAAA	2	8	635150	635157	75 %	0 %	25 %	0 %	478454602
12508	NC_020931	A	6	6	635155	635160	100 %	0 %	0 %	0 %	478454602
12509	NC_020931	CTCTTT	2	12	635258	635269	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478454602
12510	NC_020931	ATATCC	2	12	635275	635286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478454602
12511	NC_020931	AGC	2	6	635313	635318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478454602
12512	NC_020931	T	6	6	635373	635378	0 %	100 %	0 %	0 %	478454602
12513	NC_020931	TAAACA	2	12	635386	635397	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	478454602
12514	NC_020931	AGG	2	6	635495	635500	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478454603
12515	NC_020931	CAA	2	6	635562	635567	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478454603
12516	NC_020931	GA	3	6	635588	635593	50 %	0 %	50 %	0 %	478454603
12517	NC_020931	TCC	2	6	635624	635629	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478454603
12518	NC_020931	A	7	7	635635	635641	100 %	0 %	0 %	0 %	478454603
12519	NC_020931	ATGC	2	8	635651	635658	25 %	25 %	25 %	25 %	478454603
12520	NC_020931	ACGA	2	8	635691	635698	50 %	0 %	25 %	25 %	478454603
12521	NC_020931	GA	4	8	635750	635757	50 %	0 %	50 %	0 %	478454603
12522	NC_020931	AAG	2	6	635758	635763	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478454603
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12525	NC_020931	ACA	2	6	635853	635858	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478454604
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12529	NC_020931	AAG	2	6	635915	635920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478454604
12530	NC_020931	TTTC	2	8	635921	635928	0 %	75 %	0 %	25 %	478454604
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12532	NC_020931	TCT	2	6	635949	635954	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478454604
12533	NC_020931	CAT	2	6	636014	636019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478454604
12534	NC_020931	CCA	2	6	636108	636113	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478454604
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12536	NC_020931	CAT	2	6	636140	636145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478454604
12537	NC_020931	T	8	8	636172	636179	0 %	100 %	0 %	0 %	478454604
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12540	NC_020931	AATC	2	8	636255	636262	50 %	25 %	0 %	25 %	478454605
12541	NC_020931	ACC	2	6	636370	636375	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478454605
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12550	NC_020931	TCC	2	6	636726	636731	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478454605
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12553	NC_020931	CAC	2	6	636858	636863	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478454605
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12557	NC_020931	AAG	2	6	637094	637099	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478454605
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12564	NC_020931	CGT	2	6	637333	637338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478454605
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12604	NC_020931	AAT	2	6	639228	639233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478454607
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12982	NC_020931	TCT	2	6	659497	659502	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478454622
12983	NC_020931	ATG	2	6	659528	659533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478454622
12984	NC_020931	GAA	2	6	659617	659622	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478454622
12985	NC_020931	GAC	2	6	659683	659688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478454622
12986	NC_020931	ATTG	2	8	659709	659716	25 %	50 %	25 %	0 %	478454622
12987	NC_020931	TCA	2	6	659753	659758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478454622
12988	NC_020931	AACCA	2	10	659759	659768	60 %	0 %	0 %	40 %	478454622
12989	NC_020931	GCTAC	2	10	659822	659831	20 %	20 %	20 %	40 %	478454622
12990	NC_020931	AGA	2	6	659859	659864	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478454622
12991	NC_020931	TAC	2	6	659865	659870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478454622
12992	NC_020931	GAA	2	6	659971	659976	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478454622
12993	NC_020931	AATA	2	8	660178	660185	75 %	25 %	0 %	0 %	478454623
12994	NC_020931	CACG	2	8	660203	660210	25 %	0 %	25 %	50 %	478454623
12995	NC_020931	TG	3	6	660235	660240	0 %	50 %	50 %	0 %	478454623
12996	NC_020931	TAT	2	6	660246	660251	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478454623
12997	NC_020931	CTC	2	6	660309	660314	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478454623
12998	NC_020931	TTTA	2	8	660342	660349	25 %	75 %	0 %	0 %	478454623
12999	NC_020931	ACA	2	6	660363	660368	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478454623
13000	NC_020931	CT	3	6	660398	660403	0 %	50 %	0 %	50 %	478454623

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