MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis L2b/UCH-2 complete genome

Total Repeats: 20291

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_020931	GAA	2	6	27808	27813	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478454053
502	NC_020931	T	6	6	27890	27895	0 %	100 %	0 %	0 %	478454053
503	NC_020931	TGA	2	6	27903	27908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478454053
504	NC_020931	GGAGA	2	10	27911	27920	40 %	0 %	60 %	0 %	478454053
505	NC_020931	GGATA	2	10	27937	27946	40 %	20 %	40 %	0 %	478454053
506	NC_020931	A	7	7	27961	27967	100 %	0 %	0 %	0 %	478454053
507	NC_020931	AAG	2	6	27978	27983	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478454053
508	NC_020931	T	6	6	27998	28003	0 %	100 %	0 %	0 %	478454053
509	NC_020931	A	8	8	28095	28102	100 %	0 %	0 %	0 %	478454054
510	NC_020931	TTC	2	6	28139	28144	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478454054
511	NC_020931	GTTT	2	8	28157	28164	0 %	75 %	25 %	0 %	478454054
512	NC_020931	CAGA	2	8	28179	28186	50 %	0 %	25 %	25 %	478454054
513	NC_020931	TTC	2	6	28257	28262	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478454054
514	NC_020931	AAG	2	6	28272	28277	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478454054
515	NC_020931	TTC	2	6	28372	28377	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478454054
516	NC_020931	AAG	2	6	28386	28391	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478454054
517	NC_020931	AAG	2	6	28404	28409	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478454054
518	NC_020931	A	6	6	28410	28415	100 %	0 %	0 %	0 %	478454054
519	NC_020931	GAA	2	6	28642	28647	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478454055
520	NC_020931	ATCCG	2	10	28662	28671	20 %	20 %	20 %	40 %	478454055
521	NC_020931	TTC	2	6	28775	28780	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478454055
522	NC_020931	TAG	2	6	28823	28828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478454055
523	NC_020931	AGA	2	6	28836	28841	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478454055
524	NC_020931	GAT	3	9	28918	28926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478454055
525	NC_020931	GAG	2	6	28961	28966	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478454055
526	NC_020931	TG	3	6	28993	28998	0 %	50 %	50 %	0 %	478454055
527	NC_020931	GCA	2	6	29017	29022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478454055
528	NC_020931	TC	3	6	29046	29051	0 %	50 %	0 %	50 %	478454055
529	NC_020931	AGGGT	2	10	29180	29189	20 %	20 %	60 %	0 %	478454055
530	NC_020931	TTC	2	6	29216	29221	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478454055
531	NC_020931	CAG	2	6	29228	29233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478454055
532	NC_020931	GAA	2	6	29242	29247	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478454055
533	NC_020931	TGA	2	6	29256	29261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478454055
534	NC_020931	TTC	2	6	29289	29294	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478454055
535	NC_020931	GC	4	8	29460	29467	0 %	0 %	50 %	50 %	478454055
536	NC_020931	AAG	2	6	29468	29473	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478454055
537	NC_020931	TA	3	6	29582	29587	50 %	50 %	0 %	0 %	478454055
538	NC_020931	GAA	2	6	29671	29676	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478454055
539	NC_020931	TGT	2	6	29703	29708	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478454056
540	NC_020931	TCT	2	6	29771	29776	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478454056
541	NC_020931	ACA	2	6	29999	30004	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478454056
542	NC_020931	ATG	2	6	30009	30014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478454056
543	NC_020931	CTTT	2	8	30151	30158	0 %	75 %	0 %	25 %	478454056
544	NC_020931	TTTG	2	8	30166	30173	0 %	75 %	25 %	0 %	478454056
545	NC_020931	TTGT	2	8	30201	30208	0 %	75 %	25 %	0 %	478454056
546	NC_020931	CCTAT	2	10	30220	30229	20 %	40 %	0 %	40 %	478454056
547	NC_020931	T	6	6	30236	30241	0 %	100 %	0 %	0 %	478454056
548	NC_020931	ATC	2	6	30315	30320	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478454056
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550	NC_020931	T	8	8	30470	30477	0 %	100 %	0 %	0 %	478454056
551	NC_020931	ATG	2	6	30495	30500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478454056
552	NC_020931	GA	3	6	30533	30538	50 %	0 %	50 %	0 %	478454056
553	NC_020931	AGG	2	6	30608	30613	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478454057
554	NC_020931	AG	3	6	30631	30636	50 %	0 %	50 %	0 %	478454057
555	NC_020931	GTT	2	6	30712	30717	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478454057
556	NC_020931	GAA	2	6	30721	30726	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478454057
557	NC_020931	TC	3	6	30740	30745	0 %	50 %	0 %	50 %	478454057
558	NC_020931	TCT	2	6	30787	30792	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478454057
559	NC_020931	CTG	2	6	30809	30814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478454057
560	NC_020931	ACT	2	6	30877	30882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478454057
561	NC_020931	TTC	2	6	30905	30910	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478454057
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563	NC_020931	CCT	2	6	30941	30946	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478454057
564	NC_020931	AAAC	2	8	30994	31001	75 %	0 %	0 %	25 %	478454057
565	NC_020931	T	6	6	31011	31016	0 %	100 %	0 %	0 %	478454057
566	NC_020931	GAAGG	2	10	31019	31028	40 %	0 %	60 %	0 %	478454057
567	NC_020931	GGC	2	6	31047	31052	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	478454057
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569	NC_020931	GATG	2	8	31137	31144	25 %	25 %	50 %	0 %	478454057
570	NC_020931	TAG	2	6	31148	31153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478454057
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574	NC_020931	GAA	2	6	31471	31476	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478454057
575	NC_020931	AGA	2	6	31491	31496	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478454057
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584	NC_020931	GA	3	6	31829	31834	50 %	0 %	50 %	0 %	478454057
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592	NC_020931	A	6	6	32164	32169	100 %	0 %	0 %	0 %	478454058
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599	NC_020931	CTT	2	6	32505	32510	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478454059
600	NC_020931	CGT	2	6	32536	32541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478454059
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630	NC_020931	ATT	2	6	34594	34599	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478454062
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