MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis L2b/UCH-2 complete genome

Total Repeats: 20291

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5502	NC_020931	ATT	2	6	282909	282914	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478454279
5503	NC_020931	AAC	2	6	282944	282949	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478454279
5504	NC_020931	GAA	2	6	282973	282978	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478454279
5505	NC_020931	GAA	2	6	283051	283056	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478454279
5506	NC_020931	T	6	6	283060	283065	0 %	100 %	0 %	0 %	478454279
5507	NC_020931	TTC	2	6	283084	283089	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478454279
5508	NC_020931	TGT	2	6	283116	283121	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478454279
5509	NC_020931	CTT	2	6	283160	283165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478454279
5510	NC_020931	TTTG	2	8	283191	283198	0 %	75 %	25 %	0 %	478454279
5511	NC_020931	TCTTT	2	10	283199	283208	0 %	80 %	0 %	20 %	478454279
5512	NC_020931	TTTA	2	8	283219	283226	25 %	75 %	0 %	0 %	478454279
5513	NC_020931	CGC	2	6	283245	283250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	478454279
5514	NC_020931	A	8	8	283307	283314	100 %	0 %	0 %	0 %	478454279
5515	NC_020931	TTA	2	6	283513	283518	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478454280
5516	NC_020931	T	6	6	283524	283529	0 %	100 %	0 %	0 %	478454280
5517	NC_020931	TTC	2	6	283555	283560	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478454280
5518	NC_020931	GAG	2	6	283602	283607	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478454280
5519	NC_020931	CGA	2	6	283610	283615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478454280
5520	NC_020931	CTT	2	6	283644	283649	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478454280
5521	NC_020931	AAG	2	6	283679	283684	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478454280
5522	NC_020931	AGTA	2	8	283702	283709	50 %	25 %	25 %	0 %	478454280
5523	NC_020931	TA	3	6	283789	283794	50 %	50 %	0 %	0 %	478454280
5524	NC_020931	TTC	2	6	283891	283896	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478454280
5525	NC_020931	TTC	2	6	284093	284098	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478454281
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5527	NC_020931	CTT	2	6	284179	284184	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478454281
5528	NC_020931	A	6	6	284210	284215	100 %	0 %	0 %	0 %	478454281
5529	NC_020931	TCT	2	6	284278	284283	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478454281
5530	NC_020931	TAG	2	6	284329	284334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478454281
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5533	NC_020931	GTC	2	6	284635	284640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478454281
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5535	NC_020931	GAA	2	6	284664	284669	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478454281
5536	NC_020931	T	6	6	284710	284715	0 %	100 %	0 %	0 %	478454281
5537	NC_020931	ATG	2	6	284716	284721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478454281
5538	NC_020931	TA	3	6	284743	284748	50 %	50 %	0 %	0 %	478454281
5539	NC_020931	GGT	2	6	284799	284804	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478454281
5540	NC_020931	CTT	2	6	284841	284846	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478454281
5541	NC_020931	GAA	2	6	284874	284879	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478454281
5542	NC_020931	ATC	2	6	284944	284949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478454281
5543	NC_020931	TAT	2	6	284975	284980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478454281
5544	NC_020931	TGA	2	6	284984	284989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478454281
5545	NC_020931	GATT	2	8	285007	285014	25 %	50 %	25 %	0 %	478454281
5546	NC_020931	TGA	2	6	285044	285049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478454281
5547	NC_020931	CTCA	2	8	285085	285092	25 %	25 %	0 %	50 %	478454281
5548	NC_020931	TGT	2	6	285101	285106	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478454281
5549	NC_020931	TGC	2	6	285110	285115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478454281
5550	NC_020931	CTA	2	6	285166	285171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478454281
5551	NC_020931	TG	3	6	285291	285296	0 %	50 %	50 %	0 %	478454281
5552	NC_020931	TA	3	6	285306	285311	50 %	50 %	0 %	0 %	478454281
5553	NC_020931	AACT	2	8	285327	285334	50 %	25 %	0 %	25 %	478454281
5554	NC_020931	CCT	2	6	285360	285365	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478454282
5555	NC_020931	ATG	2	6	285394	285399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478454282
5556	NC_020931	TAC	2	6	285439	285444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478454282
5557	NC_020931	A	6	6	285460	285465	100 %	0 %	0 %	0 %	478454282
5558	NC_020931	TTA	2	6	285485	285490	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478454282
5559	NC_020931	TCA	2	6	285559	285564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478454282
5560	NC_020931	ATT	2	6	285619	285624	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478454282
5561	NC_020931	GTC	2	6	285628	285633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478454282
5562	NC_020931	AATT	2	8	285644	285651	50 %	50 %	0 %	0 %	478454282
5563	NC_020931	TC	3	6	285662	285667	0 %	50 %	0 %	50 %	478454282
5564	NC_020931	A	6	6	285680	285685	100 %	0 %	0 %	0 %	478454282
5565	NC_020931	TCA	2	6	285852	285857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478454282
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5570	NC_020931	ATA	2	6	286208	286213	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478454282
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5573	NC_020931	AC	3	6	286334	286339	50 %	0 %	0 %	50 %	478454282
5574	NC_020931	ATT	2	6	286369	286374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478454282
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5582	NC_020931	GCT	2	6	286914	286919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478454283
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5595	NC_020931	TGCT	2	8	287347	287354	0 %	50 %	25 %	25 %	478454283
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5600	NC_020931	TA	3	6	287654	287659	50 %	50 %	0 %	0 %	478454283
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5604	NC_020931	A	6	6	287828	287833	100 %	0 %	0 %	0 %	478454284
5605	NC_020931	TCT	2	6	287842	287847	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478454284
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5607	NC_020931	GAC	2	6	287888	287893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478454284
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5609	NC_020931	AGT	2	6	288096	288101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478454284
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5613	NC_020931	GTT	2	6	288354	288359	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478454284
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5615	NC_020931	CAA	2	6	288407	288412	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478454284
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5619	NC_020931	CAG	2	6	288930	288935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478454285
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5621	NC_020931	ATT	2	6	289023	289028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478454285
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5623	NC_020931	CTT	2	6	289121	289126	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478454285
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5993	NC_020931	CAA	2	6	307538	307543	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478454304
5994	NC_020931	TTC	2	6	307567	307572	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478454304
5995	NC_020931	TA	3	6	307620	307625	50 %	50 %	0 %	0 %	478454304
5996	NC_020931	CTC	2	6	307659	307664	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478454304
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6000	NC_020931	A	6	6	307888	307893	100 %	0 %	0 %	0 %	478454304

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