MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis L2b/UCH-2 complete genome

Total Repeats: 20291

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5003	NC_020931	CAAA	2	8	257911	257918	75 %	0 %	0 %	25 %	478454259
5004	NC_020931	CTT	2	6	257984	257989	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478454259
5005	NC_020931	ATT	2	6	258009	258014	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478454259
5006	NC_020931	CTC	2	6	258082	258087	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478454259
5007	NC_020931	CAT	2	6	258163	258168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478454259
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5009	NC_020931	TGT	2	6	258203	258208	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478454259
5010	NC_020931	CAA	2	6	258237	258242	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478454259
5011	NC_020931	GCTT	2	8	258265	258272	0 %	50 %	25 %	25 %	478454259
5012	NC_020931	GAT	2	6	258281	258286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478454259
5013	NC_020931	AAT	2	6	258287	258292	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478454259
5014	NC_020931	TTA	2	6	258299	258304	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478454259
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5016	NC_020931	TTG	2	6	258360	258365	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478454259
5017	NC_020931	ACT	2	6	258391	258396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478454259
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5021	NC_020931	TC	4	8	258505	258512	0 %	50 %	0 %	50 %	478454259
5022	NC_020931	ATGA	2	8	258560	258567	50 %	25 %	25 %	0 %	478454259
5023	NC_020931	A	6	6	258610	258615	100 %	0 %	0 %	0 %	478454259
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5033	NC_020931	TAA	2	6	259026	259031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478454259
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5039	NC_020931	CT	3	6	259345	259350	0 %	50 %	0 %	50 %	478454259
5040	NC_020931	GCA	2	6	259424	259429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478454259
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5042	NC_020931	GCT	2	6	259496	259501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478454259
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5052	NC_020931	A	7	7	260070	260076	100 %	0 %	0 %	0 %	478454260
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5060	NC_020931	TCT	2	6	260656	260661	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478454261
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5104	NC_020931	CA	3	6	263384	263389	50 %	0 %	0 %	50 %	478454264
5105	NC_020931	GCA	2	6	263511	263516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478454264
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5110	NC_020931	T	6	6	263789	263794	0 %	100 %	0 %	0 %	478454264
5111	NC_020931	TCATT	2	10	263954	263963	20 %	60 %	0 %	20 %	478454265
5112	NC_020931	A	6	6	263967	263972	100 %	0 %	0 %	0 %	478454265
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5370	NC_020931	CCAT	2	8	275991	275998	25 %	25 %	0 %	50 %	478454273
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5470	NC_020931	AAGC	2	8	281405	281412	50 %	0 %	25 %	25 %	478454277
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5476	NC_020931	AG	3	6	281606	281611	50 %	0 %	50 %	0 %	478454277
5477	NC_020931	CTT	2	6	281909	281914	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478454278
5478	NC_020931	ACT	2	6	281938	281943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478454278
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5480	NC_020931	GTC	2	6	282019	282024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478454278
5481	NC_020931	T	6	6	282038	282043	0 %	100 %	0 %	0 %	478454278
5482	NC_020931	ACT	2	6	282066	282071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478454278
5483	NC_020931	ACT	2	6	282135	282140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478454278
5484	NC_020931	TGC	2	6	282171	282176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478454278
5485	NC_020931	T	7	7	282181	282187	0 %	100 %	0 %	0 %	478454278
5486	NC_020931	CTCCTA	2	12	282188	282199	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	478454278
5487	NC_020931	AAC	2	6	282273	282278	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478454278
5488	NC_020931	TC	3	6	282388	282393	0 %	50 %	0 %	50 %	478454278
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5491	NC_020931	ATT	2	6	282477	282482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478454278
5492	NC_020931	AG	3	6	282484	282489	50 %	0 %	50 %	0 %	478454278
5493	NC_020931	TTG	2	6	282491	282496	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478454278
5494	NC_020931	ACT	2	6	282524	282529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478454278
5495	NC_020931	AT	3	6	282534	282539	50 %	50 %	0 %	0 %	478454278
5496	NC_020931	TTG	2	6	282566	282571	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478454279
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5498	NC_020931	CTTT	2	8	282756	282763	0 %	75 %	0 %	25 %	478454279
5499	NC_020931	T	7	7	282761	282767	0 %	100 %	0 %	0 %	478454279
5500	NC_020931	GAA	2	6	282815	282820	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478454279

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