MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis L2/25667R complete genome

Total Repeats: 20280

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_020930	TGA	2	6	129332	129337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478446943
2502	NC_020930	ATCCA	2	10	129344	129353	40 %	20 %	0 %	40 %	478446943
2503	NC_020930	T	6	6	129356	129361	0 %	100 %	0 %	0 %	478446943
2504	NC_020930	CCG	2	6	129387	129392	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	478446943
2505	NC_020930	CTT	2	6	129415	129420	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478446943
2506	NC_020930	CTT	2	6	129427	129432	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478446943
2507	NC_020930	AGAA	2	8	129437	129444	75 %	0 %	25 %	0 %	478446943
2508	NC_020930	GTA	2	6	129506	129511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478446943
2509	NC_020930	TCA	2	6	129549	129554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478446943
2510	NC_020930	TTC	2	6	129614	129619	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478446943
2511	NC_020930	AGC	2	6	129668	129673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478446943
2512	NC_020930	AG	3	6	129714	129719	50 %	0 %	50 %	0 %	478446943
2513	NC_020930	TCT	2	6	129736	129741	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478446943
2514	NC_020930	CTT	2	6	129742	129747	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478446943
2515	NC_020930	ACC	2	6	129884	129889	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478446943
2516	NC_020930	CGT	2	6	129910	129915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478446943
2517	NC_020930	GAA	2	6	129937	129942	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478446943
2518	NC_020930	CATC	2	8	130017	130024	25 %	25 %	0 %	50 %	478446943
2519	NC_020930	CTT	2	6	130102	130107	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478446943
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2521	NC_020930	CAT	2	6	130156	130161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478446943
2522	NC_020930	GA	3	6	130176	130181	50 %	0 %	50 %	0 %	478446943
2523	NC_020930	GT	5	10	130223	130232	0 %	50 %	50 %	0 %	478446943
2524	NC_020930	TGC	2	6	130292	130297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478446943
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2528	NC_020930	TG	3	6	130616	130621	0 %	50 %	50 %	0 %	478446943
2529	NC_020930	T	6	6	130640	130645	0 %	100 %	0 %	0 %	478446943
2530	NC_020930	GAGG	2	8	130705	130712	25 %	0 %	75 %	0 %	478446943
2531	NC_020930	ATG	2	6	130753	130758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478446943
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2534	NC_020930	TCA	2	6	130815	130820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478446943
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2537	NC_020930	GTT	2	6	130906	130911	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478446943
2538	NC_020930	T	7	7	130970	130976	0 %	100 %	0 %	0 %	478446943
2539	NC_020930	CAG	2	6	131025	131030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478446943
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2542	NC_020930	CTG	2	6	131572	131577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478446944
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2552	NC_020930	AAT	2	6	131988	131993	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478446944
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2554	NC_020930	TGTA	2	8	132100	132107	25 %	50 %	25 %	0 %	478446944
2555	NC_020930	GAG	2	6	132145	132150	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478446944
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2559	NC_020930	AT	3	6	132353	132358	50 %	50 %	0 %	0 %	478446944
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2563	NC_020930	TTC	2	6	132544	132549	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478446944
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2588	NC_020930	TC	3	6	133376	133381	0 %	50 %	0 %	50 %	478446944
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2611	NC_020930	GGA	2	6	134304	134309	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478446945
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2994	NC_020930	TGA	3	9	153284	153292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478446966
2995	NC_020930	TGTT	2	8	153332	153339	0 %	75 %	25 %	0 %	478446966
2996	NC_020930	CTGTG	2	10	153351	153360	0 %	40 %	40 %	20 %	478446966
2997	NC_020930	AGC	2	6	153429	153434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478446966
2998	NC_020930	AG	3	6	153507	153512	50 %	0 %	50 %	0 %	478446966
2999	NC_020930	TTG	2	6	153551	153556	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478446966
3000	NC_020930	TTA	2	6	153589	153594	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478446966

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