MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis L1/115 complete genome

Total Repeats: 20302

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2244	NC_020929	AAGC	2	8	116322	116329	50 %	0 %	25 %	25 %	478451421
2245	NC_020929	TATCG	2	10	116330	116339	20 %	40 %	20 %	20 %	478451421
2246	NC_020929	T	6	6	116346	116351	0 %	100 %	0 %	0 %	478451421
2247	NC_020929	GGTT	2	8	116654	116661	0 %	50 %	50 %	0 %	478451422
2248	NC_020929	T	7	7	116670	116676	0 %	100 %	0 %	0 %	478451422
2249	NC_020929	GCT	2	6	116796	116801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478451422
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2253	NC_020929	TAT	2	6	117071	117076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478451422
2254	NC_020929	TATC	2	8	117103	117110	25 %	50 %	0 %	25 %	478451422
2255	NC_020929	TTTG	2	8	117200	117207	0 %	75 %	25 %	0 %	478451422
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2260	NC_020929	GTTC	2	8	117396	117403	0 %	50 %	25 %	25 %	478451422
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2352	NC_020929	CCAAT	2	10	122056	122065	40 %	20 %	0 %	40 %	478451428
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2358	NC_020929	TTTC	2	8	122398	122405	0 %	75 %	0 %	25 %	478451428
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2367	NC_020929	TC	3	6	122819	122824	0 %	50 %	0 %	50 %	478451428
2368	NC_020929	ATC	2	6	123002	123007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478451428
2369	NC_020929	AACA	2	8	123026	123033	75 %	0 %	0 %	25 %	478451428
2370	NC_020929	AAAG	2	8	123129	123136	75 %	0 %	25 %	0 %	478451428
2371	NC_020929	GA	3	6	123149	123154	50 %	0 %	50 %	0 %	478451428
2372	NC_020929	GCTTC	2	10	123157	123166	0 %	40 %	20 %	40 %	478451428
2373	NC_020929	CTC	2	6	123194	123199	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478451428
2374	NC_020929	AAGGGT	2	12	123429	123440	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	478451429
2375	NC_020929	AG	3	6	123455	123460	50 %	0 %	50 %	0 %	478451429
2376	NC_020929	T	6	6	123471	123476	0 %	100 %	0 %	0 %	478451429
2377	NC_020929	AGCT	2	8	123504	123511	25 %	25 %	25 %	25 %	478451429
2378	NC_020929	CAA	2	6	123573	123578	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478451429
2379	NC_020929	GGC	2	6	123636	123641	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	478451429
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2381	NC_020929	ATA	2	6	123729	123734	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478451429
2382	NC_020929	TAA	2	6	123858	123863	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478451429
2383	NC_020929	TGA	2	6	123947	123952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478451429
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2385	NC_020929	GAT	2	6	124039	124044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478451429
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2388	NC_020929	T	6	6	124291	124296	0 %	100 %	0 %	0 %	478451430
2389	NC_020929	GA	3	6	124369	124374	50 %	0 %	50 %	0 %	478451430
2390	NC_020929	GGGTTT	2	12	124392	124403	0 %	50 %	50 %	0 %	478451430
2391	NC_020929	CAA	2	6	124418	124423	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478451430
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2394	NC_020929	TGGA	2	8	124460	124467	25 %	25 %	50 %	0 %	478451430
2395	NC_020929	GCAA	2	8	124495	124502	50 %	0 %	25 %	25 %	478451430
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2398	NC_020929	GGA	2	6	124598	124603	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478451430
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2400	NC_020929	TTGCAT	2	12	124674	124685	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	478451430
2401	NC_020929	A	7	7	124692	124698	100 %	0 %	0 %	0 %	478451430
2402	NC_020929	CTG	2	6	124701	124706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478451430
2403	NC_020929	TGA	2	6	124728	124733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478451430
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2406	NC_020929	AG	3	6	124781	124786	50 %	0 %	50 %	0 %	478451430
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2490	NC_020929	ACA	2	6	128641	128646	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478451433
2491	NC_020929	GTC	2	6	128648	128653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478451433
2492	NC_020929	CTT	2	6	128723	128728	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478451433
2493	NC_020929	TGC	2	6	128922	128927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478451434
2494	NC_020929	ATC	2	6	128933	128938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478451434
2495	NC_020929	T	6	6	128939	128944	0 %	100 %	0 %	0 %	478451434
2496	NC_020929	GAA	2	6	129001	129006	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478451434
2497	NC_020929	CTT	3	9	129031	129039	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478451434
2498	NC_020929	GAA	2	6	129199	129204	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478451435
2499	NC_020929	T	6	6	129223	129228	0 %	100 %	0 %	0 %	478451435
2500	NC_020929	AGCT	2	8	129283	129290	25 %	25 %	25 %	25 %	478451436

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