MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis L1/115 complete genome

Total Repeats: 20302

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1502	NC_020929	TC	3	6	78804	78809	0 %	50 %	0 %	50 %	478451390
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1505	NC_020929	TTC	2	6	78864	78869	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478451390
1506	NC_020929	CATG	2	8	78874	78881	25 %	25 %	25 %	25 %	478451390
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1510	NC_020929	GAG	2	6	79518	79523	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478451391
1511	NC_020929	TTC	2	6	79610	79615	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478451391
1512	NC_020929	T	8	8	79617	79624	0 %	100 %	0 %	0 %	478451391
1513	NC_020929	GCC	2	6	79645	79650	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	478451391
1514	NC_020929	TCC	2	6	79693	79698	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478451391
1515	NC_020929	GCT	2	6	79725	79730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478451391
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1519	NC_020929	TGTCT	2	10	80553	80562	0 %	60 %	20 %	20 %	478451392
1520	NC_020929	TGAT	2	8	80627	80634	25 %	50 %	25 %	0 %	478451392
1521	NC_020929	TCAT	2	8	80649	80656	25 %	50 %	0 %	25 %	478451392
1522	NC_020929	T	6	6	80705	80710	0 %	100 %	0 %	0 %	478451392
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1529	NC_020929	GGA	2	6	80973	80978	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478451392
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1531	NC_020929	A	7	7	81020	81026	100 %	0 %	0 %	0 %	478451392
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1533	NC_020929	TATC	2	8	81076	81083	25 %	50 %	0 %	25 %	478451392
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1569	NC_020929	T	6	6	82505	82510	0 %	100 %	0 %	0 %	478451394
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1573	NC_020929	GCG	2	6	82595	82600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	478451394
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1598	NC_020929	T	6	6	83596	83601	0 %	100 %	0 %	0 %	478451395
1599	NC_020929	GTA	2	6	83682	83687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478451395
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1609	NC_020929	TC	3	6	83916	83921	0 %	50 %	0 %	50 %	478451395
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1612	NC_020929	TTTG	2	8	84087	84094	0 %	75 %	25 %	0 %	478451395
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1995	NC_020929	TTTCT	2	10	103759	103768	0 %	80 %	0 %	20 %	478451412
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1998	NC_020929	T	9	9	103822	103830	0 %	100 %	0 %	0 %	478451412
1999	NC_020929	GCA	2	6	103937	103942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478451412
2000	NC_020929	TGC	2	6	103974	103979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478451412

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