MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis L1/115 complete genome

Total Repeats: 20302

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_020929	CCGTA	2	10	54404	54413	20 %	20 %	20 %	40 %	478451373
1002	NC_020929	TTA	2	6	54434	54439	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478451373
1003	NC_020929	GATT	2	8	54475	54482	25 %	50 %	25 %	0 %	478451373
1004	NC_020929	AATC	2	8	54530	54537	50 %	25 %	0 %	25 %	478451373
1005	NC_020929	A	6	6	54569	54574	100 %	0 %	0 %	0 %	478451373
1006	NC_020929	TATT	2	8	54591	54598	25 %	75 %	0 %	0 %	478451373
1007	NC_020929	CTT	2	6	54600	54605	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478451373
1008	NC_020929	A	7	7	54707	54713	100 %	0 %	0 %	0 %	478451374
1009	NC_020929	TTC	2	6	54730	54735	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478451374
1010	NC_020929	CAC	2	6	54859	54864	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478451374
1011	NC_020929	CAA	2	6	54893	54898	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478451374
1012	NC_020929	GAA	2	6	54920	54925	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478451374
1013	NC_020929	CT	3	6	54944	54949	0 %	50 %	0 %	50 %	478451374
1014	NC_020929	TCGA	2	8	54979	54986	25 %	25 %	25 %	25 %	478451374
1015	NC_020929	CTTC	2	8	55073	55080	0 %	50 %	0 %	50 %	478451374
1016	NC_020929	GAAT	2	8	55108	55115	50 %	25 %	25 %	0 %	478451374
1017	NC_020929	TGT	2	6	55144	55149	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478451374
1018	NC_020929	GAT	2	6	55172	55177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478451374
1019	NC_020929	TTGA	2	8	55178	55185	25 %	50 %	25 %	0 %	478451374
1020	NC_020929	AGC	2	6	55227	55232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478451374
1021	NC_020929	TCA	2	6	55233	55238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478451374
1022	NC_020929	AAG	2	6	55295	55300	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478451374
1023	NC_020929	A	6	6	55367	55372	100 %	0 %	0 %	0 %	478451374
1024	NC_020929	CAA	2	6	55386	55391	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478451374
1025	NC_020929	G	6	6	55423	55428	0 %	0 %	100 %	0 %	478451374
1026	NC_020929	AAT	2	6	55520	55525	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478451374
1027	NC_020929	GGAA	2	8	55534	55541	50 %	0 %	50 %	0 %	478451374
1028	NC_020929	TGG	2	6	55683	55688	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478451374
1029	NC_020929	GGTTCA	2	12	55706	55717	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	478451374
1030	NC_020929	TTATC	2	10	55807	55816	20 %	60 %	0 %	20 %	478451374
1031	NC_020929	AGAA	2	8	55880	55887	75 %	0 %	25 %	0 %	478451374
1032	NC_020929	CTG	2	6	55902	55907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478451374
1033	NC_020929	GAG	2	6	55908	55913	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478451374
1034	NC_020929	AT	3	6	56152	56157	50 %	50 %	0 %	0 %	478451374
1035	NC_020929	TTA	2	6	56167	56172	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478451374
1036	NC_020929	TGT	2	6	56334	56339	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478451375
1037	NC_020929	TGG	2	6	56343	56348	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478451375
1038	NC_020929	T	6	6	56380	56385	0 %	100 %	0 %	0 %	478451375
1039	NC_020929	CTGG	3	12	56445	56456	0 %	25 %	50 %	25 %	478451375
1040	NC_020929	ATT	2	6	56460	56465	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478451375
1041	NC_020929	GAT	2	6	56473	56478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478451375
1042	NC_020929	TCT	2	6	56491	56496	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478451375
1043	NC_020929	TCC	2	6	56505	56510	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478451375
1044	NC_020929	TCC	2	6	56523	56528	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478451375
1045	NC_020929	TTA	2	6	56536	56541	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478451375
1046	NC_020929	TTGC	2	8	56579	56586	0 %	50 %	25 %	25 %	478451375
1047	NC_020929	AGCG	2	8	56619	56626	25 %	0 %	50 %	25 %	478451375
1048	NC_020929	T	6	6	56631	56636	0 %	100 %	0 %	0 %	478451375
1049	NC_020929	GTA	2	6	56662	56667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478451375
1050	NC_020929	GTT	2	6	56773	56778	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478451375
1051	NC_020929	GAT	2	6	56791	56796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478451375
1052	NC_020929	GTTGT	2	10	56872	56881	0 %	60 %	40 %	0 %	478451375
1053	NC_020929	T	6	6	56927	56932	0 %	100 %	0 %	0 %	478451375
1054	NC_020929	GAAAAG	2	12	56962	56973	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478451375
1055	NC_020929	TCC	2	6	56977	56982	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478451375
1056	NC_020929	AGT	3	9	57066	57074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478451375
1057	NC_020929	AGCT	2	8	57078	57085	25 %	25 %	25 %	25 %	478451375
1058	NC_020929	CT	3	6	57084	57089	0 %	50 %	0 %	50 %	478451375
1059	NC_020929	GAG	2	6	57097	57102	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478451375
1060	NC_020929	TGG	2	6	57120	57125	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478451375
1061	NC_020929	GT	3	6	57134	57139	0 %	50 %	50 %	0 %	478451375
1062	NC_020929	TGT	2	6	57143	57148	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478451375
1063	NC_020929	AGT	2	6	57153	57158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478451375
1064	NC_020929	GTT	2	6	57246	57251	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478451375
1065	NC_020929	T	6	6	57250	57255	0 %	100 %	0 %	0 %	478451375
1066	NC_020929	TTTG	2	8	57324	57331	0 %	75 %	25 %	0 %	478451375
1067	NC_020929	AGA	2	6	57406	57411	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478451375
1068	NC_020929	CAG	2	6	57569	57574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478451375
1069	NC_020929	ATC	2	6	57579	57584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478451375
1070	NC_020929	TTG	2	6	57591	57596	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478451375
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1072	NC_020929	GGTT	2	8	57784	57791	0 %	50 %	50 %	0 %	478451375
1073	NC_020929	TAA	2	6	57840	57845	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478451375
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1079	NC_020929	ATT	2	6	57910	57915	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478451375
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1085	NC_020929	TGA	2	6	58091	58096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478451376
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1089	NC_020929	TCC	2	6	58253	58258	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478451376
1090	NC_020929	GAG	2	6	58272	58277	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478451376
1091	NC_020929	AGTTGT	2	12	58314	58325	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	478451376
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1093	NC_020929	CTA	2	6	58401	58406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478451376
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1098	NC_020929	GTT	2	6	58729	58734	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478451376
1099	NC_020929	AGGT	2	8	58749	58756	25 %	25 %	50 %	0 %	478451376
1100	NC_020929	CAC	2	6	58862	58867	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478451376
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1102	NC_020929	TCT	2	6	58929	58934	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478451376
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1104	NC_020929	CAA	2	6	59104	59109	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478451376
1105	NC_020929	GCT	2	6	59133	59138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478451376
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1108	NC_020929	TGT	2	6	59206	59211	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478451376
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1110	NC_020929	T	8	8	59245	59252	0 %	100 %	0 %	0 %	478451376
1111	NC_020929	CTT	2	6	59263	59268	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478451376
1112	NC_020929	TTC	2	6	59294	59299	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478451376
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1116	NC_020929	TGAA	2	8	59527	59534	50 %	25 %	25 %	0 %	478451376
1117	NC_020929	TGT	2	6	59541	59546	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478451376
1118	NC_020929	T	8	8	59604	59611	0 %	100 %	0 %	0 %	478451376
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1123	NC_020929	T	6	6	59757	59762	0 %	100 %	0 %	0 %	478451377
1124	NC_020929	CGTT	2	8	59908	59915	0 %	50 %	25 %	25 %	478451377
1125	NC_020929	GGAG	2	8	59917	59924	25 %	0 %	75 %	0 %	478451377
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