MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis L1/115 complete genome

Total Repeats: 20302

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5502	NC_020929	TTG	2	6	282440	282445	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478451573
5503	NC_020929	ACT	2	6	282473	282478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478451573
5504	NC_020929	AT	3	6	282483	282488	50 %	50 %	0 %	0 %	478451573
5505	NC_020929	TTG	2	6	282515	282520	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478451574
5506	NC_020929	T	6	6	282547	282552	0 %	100 %	0 %	0 %	478451574
5507	NC_020929	CTTT	2	8	282705	282712	0 %	75 %	0 %	25 %	478451574
5508	NC_020929	T	7	7	282710	282716	0 %	100 %	0 %	0 %	478451574
5509	NC_020929	GAA	2	6	282764	282769	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478451574
5510	NC_020929	TTA	2	6	282824	282829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478451574
5511	NC_020929	ATT	2	6	282858	282863	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478451574
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5513	NC_020929	GAA	2	6	282922	282927	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478451574
5514	NC_020929	GAA	2	6	283000	283005	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478451574
5515	NC_020929	T	6	6	283009	283014	0 %	100 %	0 %	0 %	478451574
5516	NC_020929	TTC	2	6	283033	283038	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478451574
5517	NC_020929	TGT	2	6	283065	283070	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478451574
5518	NC_020929	CTT	2	6	283109	283114	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478451574
5519	NC_020929	TTTG	2	8	283140	283147	0 %	75 %	25 %	0 %	478451574
5520	NC_020929	TCTTT	2	10	283148	283157	0 %	80 %	0 %	20 %	478451574
5521	NC_020929	TTTA	2	8	283168	283175	25 %	75 %	0 %	0 %	478451574
5522	NC_020929	CGC	2	6	283194	283199	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	478451574
5523	NC_020929	A	8	8	283256	283263	100 %	0 %	0 %	0 %	478451574
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5530	NC_020929	AAG	2	6	283628	283633	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478451575
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5532	NC_020929	TA	3	6	283738	283743	50 %	50 %	0 %	0 %	478451575
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5537	NC_020929	A	6	6	284159	284164	100 %	0 %	0 %	0 %	478451576
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5539	NC_020929	TAG	2	6	284278	284283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478451576
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5542	NC_020929	GTC	2	6	284584	284589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478451576
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5544	NC_020929	GAA	2	6	284613	284618	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478451576
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5546	NC_020929	ATG	2	6	284665	284670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478451576
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5551	NC_020929	ATC	2	6	284893	284898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478451576
5552	NC_020929	TAT	2	6	284924	284929	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478451576
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5554	NC_020929	GATT	2	8	284956	284963	25 %	50 %	25 %	0 %	478451576
5555	NC_020929	TGA	2	6	284993	284998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478451576
5556	NC_020929	CTCA	2	8	285034	285041	25 %	25 %	0 %	50 %	478451576
5557	NC_020929	TGT	2	6	285050	285055	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478451576
5558	NC_020929	TGC	2	6	285059	285064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478451576
5559	NC_020929	CTA	2	6	285115	285120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478451576
5560	NC_020929	TG	3	6	285240	285245	0 %	50 %	50 %	0 %	478451576
5561	NC_020929	TA	3	6	285255	285260	50 %	50 %	0 %	0 %	478451576
5562	NC_020929	AACT	2	8	285276	285283	50 %	25 %	0 %	25 %	478451576
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5565	NC_020929	TAC	2	6	285388	285393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478451577
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5993	NC_020929	CTT	2	6	306957	306962	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478451598
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