MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Candidatus Methanomethylophilus alvus Mx1201

Total Repeats: 25275

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020913	TCC	2	6	758	763	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478482032
2	NC_020913	CTT	2	6	787	792	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478482032
3	NC_020913	GAG	2	6	811	816	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478482032
4	NC_020913	CAT	3	9	864	872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478482032
5	NC_020913	ACA	2	6	1013	1018	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478482032
6	NC_020913	ATA	2	6	1030	1035	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478482032
7	NC_020913	AAG	2	6	1048	1053	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478482032
8	NC_020913	CGA	2	6	1143	1148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478482032
9	NC_020913	AAG	2	6	1165	1170	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478482032
10	NC_020913	TAT	2	6	1189	1194	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478482032
11	NC_020913	CAT	2	6	1236	1241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478482032
12	NC_020913	CAA	2	6	1251	1256	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478482032
13	NC_020913	AAC	2	6	1343	1348	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478482032
14	NC_020913	GAA	2	6	1362	1367	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478482032
15	NC_020913	TCT	2	6	1473	1478	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478482032
16	NC_020913	AGA	2	6	1553	1558	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478482032
17	NC_020913	GTG	2	6	1573	1578	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478482032
18	NC_020913	CTT	2	6	1640	1645	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478482032
19	NC_020913	GAT	2	6	1876	1881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478482032
20	NC_020913	GAC	2	6	1923	1928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478482032
21	NC_020913	TCT	2	6	2133	2138	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478482033
22	NC_020913	CGA	3	9	2371	2379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478482033
23	NC_020913	AGA	3	9	2487	2495	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478482033
24	NC_020913	CTT	2	6	2678	2683	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478482034
25	NC_020913	CCA	2	6	2875	2880	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478482034
26	NC_020913	CAT	2	6	3013	3018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478482034
27	NC_020913	ATG	2	6	3321	3326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478482034
28	NC_020913	TGC	2	6	3348	3353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478482034
29	NC_020913	GGA	2	6	3381	3386	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478482034
30	NC_020913	CCG	2	6	3420	3425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	478482034
31	NC_020913	CGA	2	6	3436	3441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478482034
32	NC_020913	CTT	2	6	3476	3481	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478482034
33	NC_020913	CCG	2	6	3560	3565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	478482035
34	NC_020913	GAG	2	6	3706	3711	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478482035
35	NC_020913	ACC	2	6	3847	3852	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478482035
36	NC_020913	TCA	2	6	3884	3889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478482035
37	NC_020913	ACG	2	6	3914	3919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478482035
38	NC_020913	GAC	2	6	3931	3936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478482035
39	NC_020913	CCG	2	6	3975	3980	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	478482035
40	NC_020913	ATT	2	6	4037	4042	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478482035
41	NC_020913	CGC	2	6	4318	4323	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	478482036
42	NC_020913	GAG	2	6	4376	4381	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478482036
43	NC_020913	CGC	2	6	4432	4437	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	478482036
44	NC_020913	CTT	2	6	4500	4505	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478482036
45	NC_020913	GGA	2	6	4553	4558	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478482037
46	NC_020913	ACC	2	6	4608	4613	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478482037
47	NC_020913	CGA	2	6	4616	4621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478482037
48	NC_020913	GCT	2	6	4673	4678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478482037
49	NC_020913	AGA	2	6	4717	4722	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478482037
50	NC_020913	CCG	2	6	4729	4734	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	478482037
51	NC_020913	AGA	2	6	4864	4869	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478482037
52	NC_020913	GAA	2	6	4883	4888	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478482037
53	NC_020913	TCG	2	6	4939	4944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478482037
54	NC_020913	CGA	2	6	4979	4984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478482037
55	NC_020913	TCT	2	6	4993	4998	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478482037
56	NC_020913	TCG	2	6	5092	5097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478482037
57	NC_020913	CGA	2	6	5252	5257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478482037
58	NC_020913	GAC	2	6	5394	5399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478482037
59	NC_020913	CGA	2	6	5479	5484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478482037
60	NC_020913	AAC	2	6	5490	5495	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478482037
61	NC_020913	AGT	2	6	5498	5503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478482037
62	NC_020913	TTC	2	6	5598	5603	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478482037
63	NC_020913	TCA	3	9	5641	5649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478482037
64	NC_020913	TTC	2	6	5712	5717	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478482037
65	NC_020913	GGA	2	6	5718	5723	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478482037
66	NC_020913	CTA	2	6	5750	5755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478482037
67	NC_020913	CGG	2	6	5783	5788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	478482037
68	NC_020913	CGC	2	6	5798	5803	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	478482037
69	NC_020913	GCC	2	6	5832	5837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	478482037
70	NC_020913	ACG	2	6	5839	5844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478482037
71	NC_020913	CCT	2	6	5996	6001	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478482037
72	NC_020913	ACA	2	6	6025	6030	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478482037
73	NC_020913	GGC	2	6	6045	6050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	478482037
74	NC_020913	GGA	2	6	6072	6077	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478482037
75	NC_020913	TCT	2	6	6082	6087	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478482037
76	NC_020913	CTT	2	6	6089	6094	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478482037
77	NC_020913	TCA	2	6	6169	6174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478482037
78	NC_020913	TCG	2	6	6199	6204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478482037
79	NC_020913	ATC	2	6	6267	6272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478482037
80	NC_020913	GGC	2	6	6299	6304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	478482037
81	NC_020913	CAT	2	6	6347	6352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478482037
82	NC_020913	GAT	2	6	6359	6364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478482037
83	NC_020913	ACT	2	6	6403	6408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478482037
84	NC_020913	TCA	2	6	6427	6432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478482037
85	NC_020913	ATG	2	6	6531	6536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478482037
86	NC_020913	TTC	2	6	6540	6545	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478482037
87	NC_020913	GGA	3	9	6549	6557	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478482037
88	NC_020913	AAG	2	6	6558	6563	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478482037
89	NC_020913	AGC	3	9	6754	6762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478482038
90	NC_020913	GTC	2	6	6851	6856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478482038
91	NC_020913	CAA	2	6	6996	7001	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478482039
92	NC_020913	AAG	2	6	7031	7036	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478482039
93	NC_020913	AAG	2	6	7045	7050	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478482039
94	NC_020913	AAG	2	6	7111	7116	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478482039
95	NC_020913	AGA	2	6	7130	7135	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478482039
96	NC_020913	AGG	2	6	7136	7141	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478482039
97	NC_020913	TAC	2	6	7210	7215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478482039
98	NC_020913	TGG	2	6	7223	7228	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478482039
99	NC_020913	CAT	2	6	7242	7247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478482039
100	NC_020913	CAT	2	6	7263	7268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478482039
101	NC_020913	TCC	2	6	7336	7341	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478482039
102	NC_020913	TCC	2	6	7400	7405	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478482039
103	NC_020913	GAA	3	9	7457	7465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478482039
104	NC_020913	ACT	2	6	7490	7495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478482040
105	NC_020913	GAA	2	6	7521	7526	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478482040
106	NC_020913	CTC	2	6	7534	7539	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478482040
107	NC_020913	AGA	3	9	7542	7550	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478482040
108	NC_020913	ACA	2	6	7553	7558	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478482040
109	NC_020913	ATG	2	6	7567	7572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478482040
110	NC_020913	GCA	2	6	7703	7708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478482040
111	NC_020913	CTC	2	6	7716	7721	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478482040
112	NC_020913	CAT	2	6	7788	7793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478482040
113	NC_020913	GAG	2	6	7822	7827	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478482040
114	NC_020913	GGA	2	6	7833	7838	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478482040
115	NC_020913	GAA	2	6	7926	7931	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478482040
116	NC_020913	TCG	2	6	7940	7945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478482040
117	NC_020913	CGA	2	6	7950	7955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478482040
118	NC_020913	TCC	2	6	7963	7968	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478482040
119	NC_020913	TAC	2	6	8020	8025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478482040
120	NC_020913	CTG	2	6	8032	8037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478482040
121	NC_020913	GAA	2	6	8106	8111	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478482040
122	NC_020913	CGT	3	9	8157	8165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478482040
123	NC_020913	CGA	2	6	8196	8201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478482040
124	NC_020913	GCA	3	9	8221	8229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478482040
125	NC_020913	GCC	2	6	8242	8247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	478482040
126	NC_020913	GCA	2	6	8259	8264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478482040
127	NC_020913	CGT	2	6	8322	8327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478482040
128	NC_020913	CAA	2	6	8337	8342	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478482040
129	NC_020913	CAA	2	6	8361	8366	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478482040
130	NC_020913	CGT	2	6	8400	8405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478482040
131	NC_020913	GAA	2	6	8493	8498	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478482040
132	NC_020913	CTG	2	6	8500	8505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478482040
133	NC_020913	CGA	2	6	8537	8542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478482041
134	NC_020913	CGT	3	9	8726	8734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478482041
135	NC_020913	AAG	2	6	8775	8780	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478482041
136	NC_020913	TCA	2	6	8935	8940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478482042
137	NC_020913	ATC	2	6	8961	8966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478482042
138	NC_020913	ACC	2	6	8982	8987	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478482042
139	NC_020913	ACG	2	6	9070	9075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478482042
140	NC_020913	CGT	2	6	9218	9223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478482042
141	NC_020913	AGG	2	6	9235	9240	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478482042
142	NC_020913	GAA	2	6	9278	9283	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478482042
143	NC_020913	ATG	2	6	9363	9368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478482042
144	NC_020913	GAG	2	6	9478	9483	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478482042
145	NC_020913	CAG	2	6	9528	9533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478482042
146	NC_020913	TCG	2	6	9562	9567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478482042
147	NC_020913	TCC	2	6	9828	9833	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478482042
148	NC_020913	GAG	2	6	9855	9860	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478482042
149	NC_020913	GCG	2	6	9931	9936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	478482042
150	NC_020913	ACG	2	6	9937	9942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478482042
151	NC_020913	GGA	2	6	9978	9983	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478482042
152	NC_020913	TCT	2	6	10030	10035	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478482042
153	NC_020913	AGC	2	6	10114	10119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478482042
154	NC_020913	AAG	2	6	10134	10139	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478482042
155	NC_020913	AGG	2	6	10210	10215	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478482042
156	NC_020913	AGA	2	6	10255	10260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478482042
157	NC_020913	GAT	2	6	10280	10285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478482042
158	NC_020913	GCA	2	6	10301	10306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478482042
159	NC_020913	ACC	2	6	10315	10320	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478482042
160	NC_020913	TCA	2	6	10369	10374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478482042
161	NC_020913	CAG	2	6	10461	10466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478482042
162	NC_020913	GAG	2	6	10476	10481	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478482042
163	NC_020913	CGA	2	6	10487	10492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478482042
164	NC_020913	GCA	2	6	10500	10505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478482042
165	NC_020913	GAA	2	6	10615	10620	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478482043
166	NC_020913	CGA	2	6	10705	10710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478482043
167	NC_020913	ACC	2	6	10739	10744	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478482043
168	NC_020913	CGG	2	6	10852	10857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	478482043
169	NC_020913	TCT	2	6	11004	11009	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478482043
170	NC_020913	GAG	2	6	11081	11086	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478482043
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172	NC_020913	GAG	2	6	11123	11128	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478482043
173	NC_020913	GAA	2	6	11170	11175	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478482043
174	NC_020913	CGT	2	6	11179	11184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478482043
175	NC_020913	CGA	2	6	11200	11205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478482043
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249	NC_020913	CCG	2	6	15536	15541	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	478482049
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251	NC_020913	GAT	2	6	15712	15717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478482050
252	NC_020913	CAT	2	6	15730	15735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478482050
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254	NC_020913	CGT	2	6	15888	15893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478482050
255	NC_020913	TCC	2	6	16058	16063	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478482050
256	NC_020913	CAT	2	6	16090	16095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478482050
257	NC_020913	CTG	2	6	16103	16108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478482050
258	NC_020913	CGG	2	6	16131	16136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	478482050
259	NC_020913	GGC	2	6	16147	16152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	478482050
260	NC_020913	GCC	2	6	16205	16210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	478482050
261	NC_020913	GTC	2	6	16243	16248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478482050
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263	NC_020913	ACG	2	6	16469	16474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478482050
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267	NC_020913	CCT	3	9	16823	16831	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478482051
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269	NC_020913	CTT	2	6	16928	16933	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478482051
270	NC_020913	CTA	2	6	17053	17058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478482051
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273	NC_020913	CGT	2	6	17218	17223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478482051
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279	NC_020913	CTC	2	6	17518	17523	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478482052
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282	NC_020913	CTC	2	6	17749	17754	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478482052
283	NC_020913	GCG	2	6	17765	17770	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	478482052
284	NC_020913	CTC	2	6	17858	17863	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478482052
285	NC_020913	TCC	2	6	17911	17916	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478482052
286	NC_020913	TCG	2	6	18095	18100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478482052
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291	NC_020913	GAG	2	6	18488	18493	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478482053
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379	NC_020913	CAT	2	6	23830	23835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478482058
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