MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Candidatus Methanomethylophilus alvus Mx1201

Total Repeats: 32071

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
32001	NC_020913	TGA	2	6	1663140	1663145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478483679
32002	NC_020913	AT	3	6	1663256	1663261	50 %	50 %	0 %	0 %	478483679
32003	NC_020913	CTTC	2	8	1663262	1663269	0 %	50 %	0 %	50 %	478483679
32004	NC_020913	GTC	2	6	1663300	1663305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478483679
32005	NC_020913	TCGC	2	8	1663349	1663356	0 %	25 %	25 %	50 %	478483679
32006	NC_020913	TCC	2	6	1663463	1663468	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478483679
32007	NC_020913	TTC	2	6	1663598	1663603	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478483679
32008	NC_020913	GC	3	6	1663706	1663711	0 %	0 %	50 %	50 %	478483679
32009	NC_020913	TCCC	2	8	1663725	1663732	0 %	25 %	0 %	75 %	478483679
32010	NC_020913	CAT	2	6	1663771	1663776	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478483679
32011	NC_020913	ACC	2	6	1663948	1663953	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478483680
32012	NC_020913	GGT	2	6	1664014	1664019	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478483680
32013	NC_020913	CTC	2	6	1664067	1664072	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478483680
32014	NC_020913	TCG	2	6	1664090	1664095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478483680
32015	NC_020913	CTT	2	6	1664110	1664115	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478483680
32016	NC_020913	GGATGC	2	12	1664125	1664136	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	478483680
32017	NC_020913	GTC	2	6	1664167	1664172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478483680
32018	NC_020913	CTT	2	6	1664188	1664193	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478483680
32019	NC_020913	GGT	2	6	1664206	1664211	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478483680
32020	NC_020913	GGA	2	6	1664241	1664246	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478483680
32021	NC_020913	CT	3	6	1664250	1664255	0 %	50 %	0 %	50 %	478483680
32022	NC_020913	GATG	2	8	1664269	1664276	25 %	25 %	50 %	0 %	478483680
32023	NC_020913	CTC	2	6	1664296	1664301	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478483680
32024	NC_020913	CAC	2	6	1664320	1664325	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478483680
32025	NC_020913	GAG	2	6	1664354	1664359	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478483680
32026	NC_020913	CGG	2	6	1664364	1664369	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	478483680
32027	NC_020913	CTT	2	6	1664383	1664388	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478483680
32028	NC_020913	GGA	2	6	1664422	1664427	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478483680
32029	NC_020913	CTT	2	6	1664470	1664475	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478483680
32030	NC_020913	CGG	2	6	1664517	1664522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	478483680
32031	NC_020913	TGG	2	6	1664543	1664548	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478483680
32032	NC_020913	CGA	2	6	1664601	1664606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478483680
32033	NC_020913	GTT	2	6	1664632	1664637	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478483680
32034	NC_020913	CGT	2	6	1664655	1664660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478483680
32035	NC_020913	CGA	2	6	1664673	1664678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478483680
32036	NC_020913	ATG	2	6	1664720	1664725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478483680
32037	NC_020913	GAAC	2	8	1664848	1664855	50 %	0 %	25 %	25 %	478483680
32038	NC_020913	GGC	2	6	1664884	1664889	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	478483680
32039	NC_020913	CTC	2	6	1664944	1664949	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478483680
32040	NC_020913	GAC	2	6	1664992	1664997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478483680
32041	NC_020913	TGC	2	6	1665229	1665234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478483681
32042	NC_020913	GGC	2	6	1665239	1665244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	478483681
32043	NC_020913	CAC	2	6	1665259	1665264	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478483681
32044	NC_020913	ACC	2	6	1665284	1665289	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478483681
32045	NC_020913	ACCG	2	8	1665340	1665347	25 %	0 %	25 %	50 %	478483681
32046	NC_020913	TCT	2	6	1665426	1665431	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478483681
32047	NC_020913	CCAAT	2	10	1665499	1665508	40 %	20 %	0 %	40 %	478483681
32048	NC_020913	GC	3	6	1665509	1665514	0 %	0 %	50 %	50 %	478483681
32049	NC_020913	TCC	2	6	1665589	1665594	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478483681
32050	NC_020913	GAC	2	6	1665613	1665618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478483681
32051	NC_020913	TGA	2	6	1665627	1665632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478483681
32052	NC_020913	CTC	2	6	1665655	1665660	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478483681
32053	NC_020913	GA	3	6	1665663	1665668	50 %	0 %	50 %	0 %	478483681
32054	NC_020913	ATG	2	6	1665677	1665682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478483681
32055	NC_020913	GTC	2	6	1665685	1665690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478483681
32056	NC_020913	ACC	2	6	1665713	1665718	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478483681
32057	NC_020913	ATA	2	6	1665743	1665748	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478483681
32058	NC_020913	TCC	2	6	1665845	1665850	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478483681
32059	NC_020913	TC	3	6	1665928	1665933	0 %	50 %	0 %	50 %	478483681
32060	NC_020913	AGC	2	6	1665950	1665955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478483681
32061	NC_020913	ACG	2	6	1666136	1666141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478483681
32062	NC_020913	CCA	2	6	1666179	1666184	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478483681
32063	NC_020913	TCA	2	6	1666214	1666219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478483681
32064	NC_020913	TTC	2	6	1666237	1666242	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478483681
32065	NC_020913	AACAG	2	10	1666245	1666254	60 %	0 %	20 %	20 %	478483681
32066	NC_020913	GACG	2	8	1666362	1666369	25 %	0 %	50 %	25 %	478483681
32067	NC_020913	AGATCG	2	12	1666388	1666399	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	478483681
32068	NC_020913	CTT	2	6	1666594	1666599	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478483682
32069	NC_020913	A	6	6	1666654	1666659	100 %	0 %	0 %	0 %	478483682
32070	NC_020913	TGC	3	9	1666754	1666762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478483682
32071	NC_020913	AAG	2	6	1666769	1666774	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478483682

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.