MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Clavibacter michiganensis subsp. nebraskensis NCPPB 2581 complete genome

Total Repeats: 89737

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_020891	CCA	2	6	18860	18865	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	473832077
502	NC_020891	GC	3	6	18898	18903	0 %	0 %	50 %	50 %	473832077
503	NC_020891	GC	3	6	18910	18915	0 %	0 %	50 %	50 %	473832077
504	NC_020891	CTC	2	6	18918	18923	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	473832077
505	NC_020891	CTC	2	6	18927	18932	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	473832077
506	NC_020891	GTC	2	6	18933	18938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	473832077
507	NC_020891	GAG	2	6	18948	18953	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	473832077
508	NC_020891	GC	3	6	18973	18978	0 %	0 %	50 %	50 %	473832077
509	NC_020891	GGA	3	9	18984	18992	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	473832077
510	NC_020891	CGG	2	6	19016	19021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	473832077
511	NC_020891	GCG	2	6	19081	19086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	473832077
512	NC_020891	CCGCGA	2	12	19100	19111	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	473832077
513	NC_020891	CGC	2	6	19130	19135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	473832077
514	NC_020891	GCGCG	2	10	19148	19157	0 %	0 %	60 %	40 %	473832077
515	NC_020891	CG	4	8	19154	19161	0 %	0 %	50 %	50 %	473832077
516	NC_020891	CGGC	2	8	19187	19194	0 %	0 %	50 %	50 %	473832077
517	NC_020891	TTC	2	6	19195	19200	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	473832077
518	NC_020891	GGC	2	6	19258	19263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	473832077
519	NC_020891	GCG	2	6	19317	19322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	473832077
520	NC_020891	CGA	2	6	19343	19348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	473832077
521	NC_020891	GC	3	6	19470	19475	0 %	0 %	50 %	50 %	473832077
522	NC_020891	TGA	2	6	19514	19519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	473832077
523	NC_020891	GCG	2	6	19567	19572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	473832077
524	NC_020891	GAT	2	6	19596	19601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	473832077
525	NC_020891	CGCGCT	2	12	19628	19639	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	473832077
526	NC_020891	TGG	2	6	19646	19651	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	473832077
527	NC_020891	TCC	2	6	19699	19704	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	473832077
528	NC_020891	GCG	2	6	19750	19755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	473832077
529	NC_020891	GCC	2	6	19878	19883	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	473832077
530	NC_020891	GCGAT	2	10	19888	19897	20 %	20 %	40 %	20 %	473832077
531	NC_020891	TTC	2	6	19971	19976	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	473832078
532	NC_020891	GCG	2	6	19986	19991	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	473832078
533	NC_020891	TCGTCC	2	12	20012	20023	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	473832078
534	NC_020891	GCC	2	6	20024	20029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	473832078
535	NC_020891	GACCGC	2	12	20042	20053	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	473832078
536	NC_020891	CCG	3	9	20065	20073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	473832078
537	NC_020891	GTC	2	6	20105	20110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	473832078
538	NC_020891	CGACG	2	10	20171	20180	20 %	0 %	40 %	40 %	473832078
539	NC_020891	CGT	2	6	20191	20196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	473832078
540	NC_020891	ATC	3	9	20199	20207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	473832078
541	NC_020891	CGG	2	6	20221	20226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	473832078
542	NC_020891	GCTC	2	8	20275	20282	0 %	25 %	25 %	50 %	473832078
543	NC_020891	CGA	2	6	20305	20310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	473832078
544	NC_020891	CGC	2	6	20329	20334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	473832078
545	NC_020891	GCCG	2	8	20345	20352	0 %	0 %	50 %	50 %	473832078
546	NC_020891	GC	3	6	20379	20384	0 %	0 %	50 %	50 %	473832078
547	NC_020891	CGT	2	6	20422	20427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	473832078
548	NC_020891	TGA	2	6	20632	20637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	473832078
549	NC_020891	GTGCCG	2	12	20640	20651	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	473832078
550	NC_020891	CGG	2	6	20666	20671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	473832078
551	NC_020891	GCA	2	6	20677	20682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	473832078
552	NC_020891	GGC	3	9	20714	20722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	473832078
553	NC_020891	TGA	2	6	20728	20733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	473832078
554	NC_020891	CGGG	2	8	20749	20756	0 %	0 %	75 %	25 %	473832078
555	NC_020891	CG	3	6	20771	20776	0 %	0 %	50 %	50 %	473832078
556	NC_020891	CGA	2	6	20810	20815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	473832078
557	NC_020891	CTG	2	6	20822	20827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	473832078
558	NC_020891	CG	3	6	20834	20839	0 %	0 %	50 %	50 %	473832078
559	NC_020891	CGT	2	6	20950	20955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	473832078
560	NC_020891	CGC	2	6	20957	20962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	473832078
561	NC_020891	CTG	2	6	20963	20968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	473832078
562	NC_020891	CGAC	2	8	20992	20999	25 %	0 %	25 %	50 %	473832078
563	NC_020891	GAA	2	6	21044	21049	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	473832078
564	NC_020891	CGT	2	6	21076	21081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	473832078
565	NC_020891	GTA	2	6	21122	21127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	473832078
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567	NC_020891	GTC	2	6	21185	21190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	473832078
568	NC_020891	GAG	2	6	21201	21206	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	473832078
569	NC_020891	CGA	2	6	21223	21228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	473832078
570	NC_020891	GAT	2	6	21260	21265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	473832078
571	NC_020891	GAC	2	6	21308	21313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	473832078
572	NC_020891	CGC	2	6	21326	21331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	473832078
573	NC_020891	ACC	2	6	21401	21406	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	473832079
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575	NC_020891	GAT	2	6	21457	21462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	473832079
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584	NC_020891	CG	3	6	21642	21647	0 %	0 %	50 %	50 %	473832079
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589	NC_020891	GCC	2	6	21832	21837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	473832079
590	NC_020891	CGT	2	6	21843	21848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	473832079
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592	NC_020891	CGC	2	6	21924	21929	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	473832079
593	NC_020891	GAC	2	6	21952	21957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	473832079
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596	NC_020891	CG	3	6	22098	22103	0 %	0 %	50 %	50 %	473832079
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609	NC_020891	CAGCG	2	10	22541	22550	20 %	0 %	40 %	40 %	473832079
610	NC_020891	GAA	2	6	22597	22602	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	473832079
611	NC_020891	GCC	2	6	22651	22656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	473832079
612	NC_020891	TGA	2	6	22659	22664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	473832079
613	NC_020891	GC	4	8	22737	22744	0 %	0 %	50 %	50 %	473832079
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615	NC_020891	CCT	2	6	22795	22800	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	473832080
616	NC_020891	CGA	2	6	22810	22815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	473832080
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621	NC_020891	GTA	2	6	22994	22999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	473832080
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623	NC_020891	CCAG	2	8	23071	23078	25 %	0 %	25 %	50 %	473832080
624	NC_020891	CGG	3	9	23085	23093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	473832080
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