MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Clavibacter michiganensis subsp. nebraskensis NCPPB 2581 complete genome

Total Repeats: 89737

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_020891	GCG	2	6	172180	172185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	473832226
5002	NC_020891	AGC	2	6	172188	172193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	473832226
5003	NC_020891	CGC	2	6	172196	172201	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	473832226
5004	NC_020891	CCG	2	6	172204	172209	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	473832226
5005	NC_020891	AGT	2	6	172240	172245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	473832226
5006	NC_020891	CCA	2	6	172271	172276	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	473832226
5007	NC_020891	TCT	2	6	172285	172290	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	473832226
5008	NC_020891	GC	3	6	172318	172323	0 %	0 %	50 %	50 %	473832226
5009	NC_020891	GAG	2	6	172346	172351	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	473832226
5010	NC_020891	GCG	2	6	172376	172381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	473832226
5011	NC_020891	GCA	2	6	172396	172401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	473832226
5012	NC_020891	GC	3	6	172408	172413	0 %	0 %	50 %	50 %	473832226
5013	NC_020891	CAC	2	6	172714	172719	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	473832227
5014	NC_020891	CGT	2	6	172763	172768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	473832227
5015	NC_020891	GAG	2	6	172773	172778	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	473832227
5016	NC_020891	CCG	2	6	172819	172824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	473832227
5017	NC_020891	CGA	2	6	172838	172843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	473832227
5018	NC_020891	CGC	3	9	172886	172894	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	473832227
5019	NC_020891	CGC	3	9	172958	172966	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	473832227
5020	NC_020891	GGC	2	6	173127	173132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	473832227
5021	NC_020891	GCT	2	6	173138	173143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	473832227
5022	NC_020891	GTT	2	6	173190	173195	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	473832227
5023	NC_020891	CGAC	2	8	173237	173244	25 %	0 %	25 %	50 %	473832227
5024	NC_020891	ACG	2	6	173266	173271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	473832227
5025	NC_020891	CGC	2	6	173348	173353	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	473832227
5026	NC_020891	GAG	2	6	173358	173363	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	473832227
5027	NC_020891	GCG	2	6	173440	173445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	473832227
5028	NC_020891	GGTG	2	8	173453	173460	0 %	25 %	75 %	0 %	473832227
5029	NC_020891	GTC	2	6	173463	173468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	473832227
5030	NC_020891	TCG	2	6	173610	173615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	473832228
5031	NC_020891	CGC	2	6	173620	173625	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	473832228
5032	NC_020891	CAC	2	6	173641	173646	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	473832228
5033	NC_020891	CGC	2	6	173659	173664	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	473832228
5034	NC_020891	CCGGT	2	10	173665	173674	0 %	20 %	40 %	40 %	473832228
5035	NC_020891	CCG	2	6	173763	173768	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	473832228
5036	NC_020891	GAC	2	6	173792	173797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	473832228
5037	NC_020891	CCG	2	6	173888	173893	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	473832228
5038	NC_020891	GTG	2	6	174025	174030	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	473832228
5039	NC_020891	GAT	2	6	174055	174060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	473832228
5040	NC_020891	CG	4	8	174082	174089	0 %	0 %	50 %	50 %	473832228
5041	NC_020891	GC	3	6	174091	174096	0 %	0 %	50 %	50 %	473832228
5042	NC_020891	GGC	2	6	174121	174126	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	473832228
5043	NC_020891	CGG	2	6	174305	174310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	473832229
5044	NC_020891	TGA	2	6	174331	174336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	473832229
5045	NC_020891	CCG	3	9	174386	174394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	473832229
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5047	NC_020891	TCG	2	6	174448	174453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	473832229
5048	NC_020891	AGGC	2	8	174476	174483	25 %	0 %	50 %	25 %	473832229
5049	NC_020891	AGCA	2	8	174492	174499	50 %	0 %	25 %	25 %	473832229
5050	NC_020891	AAC	2	6	174549	174554	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	473832229
5051	NC_020891	CGT	2	6	174586	174591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	473832229
5052	NC_020891	GAT	2	6	174624	174629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	473832229
5053	NC_020891	GCG	2	6	174652	174657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	473832229
5054	NC_020891	GCG	2	6	174700	174705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	473832229
5055	NC_020891	TGT	2	6	174760	174765	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	473832230
5056	NC_020891	GA	3	6	174766	174771	50 %	0 %	50 %	0 %	473832230
5057	NC_020891	GCG	2	6	174785	174790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	473832230
5058	NC_020891	CGG	2	6	174806	174811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	473832230
5059	NC_020891	GCTG	2	8	174850	174857	0 %	25 %	50 %	25 %	473832230
5060	NC_020891	CG	3	6	174930	174935	0 %	0 %	50 %	50 %	473832230
5061	NC_020891	CG	4	8	175031	175038	0 %	0 %	50 %	50 %	473832230
5062	NC_020891	CGT	2	6	175084	175089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	473832230
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5064	NC_020891	TGT	2	6	175155	175160	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	473832230
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5070	NC_020891	GC	3	6	175313	175318	0 %	0 %	50 %	50 %	473832230
5071	NC_020891	GC	3	6	175363	175368	0 %	0 %	50 %	50 %	473832230
5072	NC_020891	GCG	3	9	175429	175437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	473832231
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5081	NC_020891	GTC	2	6	175958	175963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	473832231
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5089	NC_020891	GA	3	6	176350	176355	50 %	0 %	50 %	0 %	473832231
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5104	NC_020891	CCGC	2	8	177440	177447	0 %	0 %	25 %	75 %	473832233
5105	NC_020891	CGG	2	6	177450	177455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	473832233
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5120	NC_020891	GC	3	6	177902	177907	0 %	0 %	50 %	50 %	473832233
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5122	NC_020891	GCC	2	6	177934	177939	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	473832233
5123	NC_020891	CTA	2	6	177942	177947	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	473832233
5124	NC_020891	CTG	2	6	177949	177954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	473832233
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5126	NC_020891	CGA	2	6	177993	177998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	473832233
5127	NC_020891	GC	3	6	178002	178007	0 %	0 %	50 %	50 %	473832233
5128	NC_020891	CGA	2	6	178114	178119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	473832234
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5154	NC_020891	CGT	2	6	178764	178769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	473832236
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5241	NC_020891	GCG	2	6	182136	182141	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	473832239
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5243	NC_020891	CG	3	6	182202	182207	0 %	0 %	50 %	50 %	473832239
5244	NC_020891	TCC	2	6	182257	182262	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	473832239
5245	NC_020891	TGGT	2	8	182287	182294	0 %	50 %	50 %	0 %	473832239
5246	NC_020891	GTC	2	6	182439	182444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	473832240
5247	NC_020891	GCT	2	6	182453	182458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	473832240
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5272	NC_020891	GCG	2	6	183030	183035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	473832240
5273	NC_020891	GGCT	2	8	183051	183058	0 %	25 %	50 %	25 %	473832240
5274	NC_020891	CGC	2	6	183071	183076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	473832240
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5352	NC_020891	CG	3	6	185183	185188	0 %	0 %	50 %	50 %	473832241
5353	NC_020891	GCG	2	6	185201	185206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	473832241
5354	NC_020891	CGT	2	6	185212	185217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	473832241
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5360	NC_020891	CGA	2	6	185380	185385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	473832241
5361	NC_020891	GC	3	6	185386	185391	0 %	0 %	50 %	50 %	473832241
5362	NC_020891	TCC	2	6	185409	185414	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	473832241
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5482	NC_020891	CCG	2	6	188466	188471	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	473832244
5483	NC_020891	ACGCGG	2	12	188478	188489	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	473832244
5484	NC_020891	ACC	2	6	188540	188545	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	473832244
5485	NC_020891	CCG	2	6	188561	188566	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	473832244
5486	NC_020891	C	6	6	188694	188699	0 %	0 %	0 %	100 %	473832245
5487	NC_020891	CCT	2	6	188755	188760	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	473832245
5488	NC_020891	CTC	2	6	188822	188827	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	473832245
5489	NC_020891	GC	3	6	188828	188833	0 %	0 %	50 %	50 %	473832245
5490	NC_020891	CGC	2	6	188842	188847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	473832245
5491	NC_020891	GACC	2	8	188866	188873	25 %	0 %	25 %	50 %	473832245
5492	NC_020891	CTC	2	6	188924	188929	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	473832245
5493	NC_020891	CTCGCC	2	12	188953	188964	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	473832245
5494	NC_020891	GAC	2	6	188966	188971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	473832245
5495	NC_020891	CG	3	6	189008	189013	0 %	0 %	50 %	50 %	473832245
5496	NC_020891	CGC	2	6	189069	189074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	473832245
5497	NC_020891	CGACGC	2	12	189079	189090	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	473832245
5498	NC_020891	CG	3	6	189100	189105	0 %	0 %	50 %	50 %	473832245
5499	NC_020891	CCGCG	2	10	189133	189142	0 %	0 %	40 %	60 %	473832245
5500	NC_020891	CCG	2	6	189143	189148	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	473832245

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