MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Clostridium stercorarium subsp. stercorarium DSM 8532

Total Repeats: 49400

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_020887	TTG	2	6	202534	202539	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472465628
3502	NC_020887	GA	3	6	202554	202559	50 %	0 %	50 %	0 %	472465628
3503	NC_020887	AGGT	2	8	202666	202673	25 %	25 %	50 %	0 %	472465628
3504	NC_020887	T	6	6	203048	203053	0 %	100 %	0 %	0 %	472465629
3505	NC_020887	AGG	2	6	203124	203129	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	472465629
3506	NC_020887	CCG	2	6	203145	203150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472465629
3507	NC_020887	TTG	2	6	203221	203226	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472465629
3508	NC_020887	TTG	2	6	203425	203430	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472465629
3509	NC_020887	AAT	2	6	203435	203440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472465629
3510	NC_020887	TAT	2	6	203444	203449	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472465629
3511	NC_020887	TTC	2	6	203498	203503	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472465629
3512	NC_020887	CAC	2	6	203581	203586	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472465629
3513	NC_020887	TAA	2	6	203683	203688	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472465629
3514	NC_020887	ATC	2	6	203696	203701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472465629
3515	NC_020887	A	6	6	203787	203792	100 %	0 %	0 %	0 %	472465629
3516	NC_020887	TA	3	6	203811	203816	50 %	50 %	0 %	0 %	472465629
3517	NC_020887	TTC	2	6	203826	203831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472465629
3518	NC_020887	T	7	7	203845	203851	0 %	100 %	0 %	0 %	472465629
3519	NC_020887	TTCC	2	8	203999	204006	0 %	50 %	0 %	50 %	472465630
3520	NC_020887	CGA	2	6	204013	204018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472465630
3521	NC_020887	T	7	7	204028	204034	0 %	100 %	0 %	0 %	472465630
3522	NC_020887	CAA	2	6	204067	204072	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472465630
3523	NC_020887	TTC	2	6	204146	204151	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472465630
3524	NC_020887	T	6	6	204172	204177	0 %	100 %	0 %	0 %	472465630
3525	NC_020887	TTC	2	6	204179	204184	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472465630
3526	NC_020887	TTC	2	6	204218	204223	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472465630
3527	NC_020887	TGT	2	6	204345	204350	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472465630
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3529	NC_020887	GAA	2	6	207459	207464	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472465631
3530	NC_020887	TGA	2	6	207496	207501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472465631
3531	NC_020887	CAA	2	6	207519	207524	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472465631
3532	NC_020887	A	7	7	207523	207529	100 %	0 %	0 %	0 %	472465631
3533	NC_020887	TAA	2	6	207589	207594	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472465631
3534	NC_020887	A	7	7	207593	207599	100 %	0 %	0 %	0 %	472465631
3535	NC_020887	GAAC	2	8	207691	207698	50 %	0 %	25 %	25 %	472465631
3536	NC_020887	AGAA	2	8	207721	207728	75 %	0 %	25 %	0 %	472465631
3537	NC_020887	GAA	2	6	207731	207736	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472465631
3538	NC_020887	GCT	2	6	207788	207793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472465631
3539	NC_020887	AAT	2	6	207797	207802	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472465631
3540	NC_020887	ATT	2	6	207807	207812	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472465631
3541	NC_020887	ACA	2	6	207828	207833	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472465631
3542	NC_020887	GC	3	6	207912	207917	0 %	0 %	50 %	50 %	472465631
3543	NC_020887	ATTT	2	8	208030	208037	25 %	75 %	0 %	0 %	472465631
3544	NC_020887	GAA	2	6	208049	208054	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472465631
3545	NC_020887	GAT	2	6	208100	208105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472465631
3546	NC_020887	GCAT	2	8	208121	208128	25 %	25 %	25 %	25 %	472465631
3547	NC_020887	GACG	2	8	208234	208241	25 %	0 %	50 %	25 %	472465631
3548	NC_020887	ATG	2	6	208334	208339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472465631
3549	NC_020887	AGAA	2	8	208373	208380	75 %	0 %	25 %	0 %	472465631
3550	NC_020887	ATA	2	6	208467	208472	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472465631
3551	NC_020887	TAT	2	6	208475	208480	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472465631
3552	NC_020887	AT	3	6	209542	209547	50 %	50 %	0 %	0 %	472465632
3553	NC_020887	TTC	2	6	209585	209590	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472465632
3554	NC_020887	TTG	2	6	209636	209641	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472465632
3555	NC_020887	TTC	2	6	209657	209662	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472465632
3556	NC_020887	CCTTT	2	10	209680	209689	0 %	60 %	0 %	40 %	472465632
3557	NC_020887	TAA	2	6	209704	209709	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472465632
3558	NC_020887	CT	3	6	209734	209739	0 %	50 %	0 %	50 %	472465632
3559	NC_020887	CTA	2	6	209805	209810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472465632
3560	NC_020887	CTT	2	6	210046	210051	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472465632
3561	NC_020887	GTTT	2	8	210085	210092	0 %	75 %	25 %	0 %	472465632
3562	NC_020887	TTTTA	2	10	210104	210113	20 %	80 %	0 %	0 %	472465632
3563	NC_020887	TA	3	6	210173	210178	50 %	50 %	0 %	0 %	472465632
3564	NC_020887	TACA	2	8	210196	210203	50 %	25 %	0 %	25 %	472465632
3565	NC_020887	TAG	2	6	210205	210210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472465632
3566	NC_020887	TC	3	6	210228	210233	0 %	50 %	0 %	50 %	472465632
3567	NC_020887	CAA	2	6	210244	210249	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472465632
3568	NC_020887	GTA	2	6	210274	210279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472465632
3569	NC_020887	TCT	2	6	210285	210290	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472465632
3570	NC_020887	CTGC	2	8	210364	210371	0 %	25 %	25 %	50 %	472465632
3571	NC_020887	TTG	2	6	210424	210429	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472465632
3572	NC_020887	GCGA	2	8	210463	210470	25 %	0 %	50 %	25 %	472465632
3573	NC_020887	TTA	2	6	210477	210482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472465632
3574	NC_020887	CTT	2	6	210505	210510	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472465632
3575	NC_020887	A	6	6	211157	211162	100 %	0 %	0 %	0 %	472465633
3576	NC_020887	CGG	2	6	211218	211223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472465633
3577	NC_020887	ATG	2	6	211237	211242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472465633
3578	NC_020887	CATTC	2	10	211245	211254	20 %	40 %	0 %	40 %	472465633
3579	NC_020887	CA	3	6	211255	211260	50 %	0 %	0 %	50 %	472465633
3580	NC_020887	CAT	2	6	211263	211268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472465633
3581	NC_020887	CAT	2	6	211314	211319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472465633
3582	NC_020887	TGAA	2	8	211335	211342	50 %	25 %	25 %	0 %	472465633
3583	NC_020887	CAA	2	6	211382	211387	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472465633
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3585	NC_020887	AGT	2	6	211817	211822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472465634
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3587	NC_020887	CCA	2	6	211877	211882	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472465634
3588	NC_020887	GAA	2	6	211904	211909	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472465634
3589	NC_020887	TAC	2	6	211923	211928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472465634
3590	NC_020887	TGT	2	6	211945	211950	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472465634
3591	NC_020887	TA	4	8	211977	211984	50 %	50 %	0 %	0 %	472465634
3592	NC_020887	TA	3	6	211999	212004	50 %	50 %	0 %	0 %	472465634
3593	NC_020887	AATCCG	2	12	212023	212034	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	472465634
3594	NC_020887	CTCTCA	2	12	212093	212104	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	472465634
3595	NC_020887	GGTT	2	8	212133	212140	0 %	50 %	50 %	0 %	472465634
3596	NC_020887	TAT	2	6	212163	212168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472465634
3597	NC_020887	CTAT	2	8	212216	212223	25 %	50 %	0 %	25 %	472465634
3598	NC_020887	AC	3	6	212342	212347	50 %	0 %	0 %	50 %	472465634
3599	NC_020887	TAA	2	6	212410	212415	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472465634
3600	NC_020887	CAA	2	6	212442	212447	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472465634
3601	NC_020887	AGG	2	6	212459	212464	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	472465634
3602	NC_020887	AT	4	8	212551	212558	50 %	50 %	0 %	0 %	472465634
3603	NC_020887	TTC	2	6	212641	212646	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472465634
3604	NC_020887	AAAG	2	8	212654	212661	75 %	0 %	25 %	0 %	472465634
3605	NC_020887	CAG	2	6	212697	212702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472465634
3606	NC_020887	CAAG	2	8	212703	212710	50 %	0 %	25 %	25 %	472465634
3607	NC_020887	AAG	2	6	212722	212727	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472465634
3608	NC_020887	CT	3	6	212730	212735	0 %	50 %	0 %	50 %	472465634
3609	NC_020887	AT	4	8	212740	212747	50 %	50 %	0 %	0 %	472465634
3610	NC_020887	CAG	2	6	212769	212774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472465634
3611	NC_020887	TAAT	2	8	212963	212970	50 %	50 %	0 %	0 %	472465635
3612	NC_020887	TGTT	2	8	213003	213010	0 %	75 %	25 %	0 %	472465635
3613	NC_020887	ATAG	2	8	213069	213076	50 %	25 %	25 %	0 %	472465635
3614	NC_020887	AGT	2	6	213228	213233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472465635
3615	NC_020887	T	7	7	213236	213242	0 %	100 %	0 %	0 %	472465635
3616	NC_020887	GCTT	2	8	213243	213250	0 %	50 %	25 %	25 %	472465635
3617	NC_020887	TTC	2	6	213276	213281	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472465635
3618	NC_020887	TC	3	6	213406	213411	0 %	50 %	0 %	50 %	472465635
3619	NC_020887	TCG	2	6	213414	213419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472465635
3620	NC_020887	GAT	2	6	213428	213433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472465635
3621	NC_020887	CA	3	6	213463	213468	50 %	0 %	0 %	50 %	472465635
3622	NC_020887	TAC	2	6	213515	213520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472465635
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3624	NC_020887	TA	3	6	213618	213623	50 %	50 %	0 %	0 %	472465635
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3993	NC_020887	AGG	2	6	237184	237189	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	472465653
3994	NC_020887	A	6	6	237298	237303	100 %	0 %	0 %	0 %	472465653
3995	NC_020887	GATTT	2	10	237307	237316	20 %	60 %	20 %	0 %	472465653
3996	NC_020887	TCG	2	6	237349	237354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472465653
3997	NC_020887	ATGCCG	2	12	237358	237369	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	472465653
3998	NC_020887	AT	3	6	237413	237418	50 %	50 %	0 %	0 %	472465653
3999	NC_020887	TCG	2	6	237529	237534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472465653
4000	NC_020887	T	6	6	237535	237540	0 %	100 %	0 %	0 %	472465653

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