MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Candidatus Portiera aleyrodidarum TV

Total Repeats: 205

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020831	GTCAAA	2	12	307	318	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	472328234
2	NC_020831	TAAAGG	2	12	2813	2824	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	472328235
3	NC_020831	CTATAC	2	12	6733	6744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472328239
4	NC_020831	TTTTTC	2	12	10085	10096	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	472328241
5	NC_020831	CACCTA	2	12	10624	10635	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	472328241
6	NC_020831	ATCAAT	2	12	12802	12813	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	472328243
7	NC_020831	AGCTAA	2	12	15413	15424	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	472328244
8	NC_020831	ATATTT	2	12	15671	15682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472328244
9	NC_020831	TTATAA	2	12	17136	17147	50 %	50 %	0 %	0 %	472328246
10	NC_020831	TAACAT	2	12	17575	17586	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	472328246
11	NC_020831	ATGAAT	2	12	17704	17715	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	472328247
12	NC_020831	CAAATC	2	12	17995	18006	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	472328247
13	NC_020831	AAATTA	2	12	18554	18565	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472328247
14	NC_020831	ATAAAT	2	12	20994	21005	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472328249
15	NC_020831	GAATTA	2	12	22388	22399	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	472328251
16	NC_020831	ATTAGA	2	12	23069	23080	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	472328252
17	NC_020831	TTAATT	2	12	23130	23141	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472328252
18	NC_020831	AAATTT	2	12	23590	23601	50 %	50 %	0 %	0 %	472328253
19	NC_020831	TAAAAT	2	12	28138	28149	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472328255
20	NC_020831	AGAAAC	2	12	30488	30499	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	472328257
21	NC_020831	GAAAAA	2	12	36214	36225	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	472328263
22	NC_020831	ATTAAA	2	12	37850	37861	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472328264
23	NC_020831	TCTGGT	2	12	38477	38488	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	472328265
24	NC_020831	ATAATT	2	12	38489	38500	50 %	50 %	0 %	0 %	472328265
25	NC_020831	TAATAT	2	12	40308	40319	50 %	50 %	0 %	0 %	472328266
26	NC_020831	ATTAAT	2	12	40555	40566	50 %	50 %	0 %	0 %	472328266
27	NC_020831	TTTTTA	2	12	41367	41378	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	472328268
28	NC_020831	TTCATC	2	12	42429	42440	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	472328269
29	NC_020831	AATTAA	2	12	42633	42644	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472328269
30	NC_020831	TGATTT	2	12	43320	43331	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	472328270
31	NC_020831	TATTAA	3	18	44604	44621	50 %	50 %	0 %	0 %	472328270
32	NC_020831	TATAGA	2	12	44646	44657	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	472328270
33	NC_020831	TGGTTT	2	12	47790	47801	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472328274
34	NC_020831	ATGTCA	2	12	50557	50568	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	472328276
35	NC_020831	AGAGTA	2	12	51436	51447	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	472328278
36	NC_020831	TATAAA	2	12	54235	54246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472328281
37	NC_020831	TCTACA	2	12	56187	56198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472328285
38	NC_020831	AAAAAT	2	12	57833	57844	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	472328287
39	NC_020831	AATATT	2	12	60930	60941	50 %	50 %	0 %	0 %	472328289
40	NC_020831	GTTTAC	2	12	61290	61301	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	472328290
41	NC_020831	GTTTAG	2	12	61475	61486	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	472328291
42	NC_020831	TTTGTT	2	12	61694	61705	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	472328291
43	NC_020831	TTTACC	2	12	63497	63508	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	472328292
44	NC_020831	ATACCT	2	12	64418	64429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472328293
45	NC_020831	GTAAAC	2	12	65306	65317	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	472328294
46	NC_020831	ATAAAA	2	12	70953	70964	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	472328297
47	NC_020831	ATAAAA	2	12	71001	71012	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	472328297
48	NC_020831	GTAGCT	2	12	73327	73338	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	472328300
49	NC_020831	TCCTAT	2	12	75594	75605	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	472328302
50	NC_020831	GTCTAA	2	12	76134	76145	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	472328302
51	NC_020831	CATATA	2	12	76306	76317	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	472328302
52	NC_020831	GAAAAA	2	12	77031	77042	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	472328303
53	NC_020831	TTAACT	2	12	78444	78455	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	472328304
54	NC_020831	GACCTT	2	12	80996	81007	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	472328306
55	NC_020831	ACTTCG	2	12	81457	81468	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	472328306
56	NC_020831	ACCCAA	2	12	81471	81482	50 %	0 %	0 %	50 %	472328306
57	NC_020831	TCTTTT	2	12	84089	84100	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	472328307
58	NC_020831	CTAATA	2	12	85534	85545	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	472328308
59	NC_020831	TAATAT	2	12	85558	85569	50 %	50 %	0 %	0 %	472328308
60	NC_020831	CCTGTT	2	12	85611	85622	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	472328308
61	NC_020831	ATATTA	2	12	91178	91189	50 %	50 %	0 %	0 %	472328309
62	NC_020831	TATTTC	2	12	91443	91454	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	472328309
63	NC_020831	ATTTTA	2	12	94686	94697	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472328314
64	NC_020831	CTTTAC	2	12	98606	98617	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	472328318
65	NC_020831	CTTTTA	2	12	101161	101172	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	472328322
66	NC_020831	TTACTG	2	12	103734	103745	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	472328324
67	NC_020831	TTTATT	2	12	104651	104662	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	472328325
68	NC_020831	TTTTAT	2	12	106381	106392	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	472328326
69	NC_020831	CTTTTT	2	12	106398	106409	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	472328326
70	NC_020831	TTAAAT	2	12	107489	107500	50 %	50 %	0 %	0 %	472328327
71	NC_020831	TCCTGT	2	12	109430	109441	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	472328328
72	NC_020831	TATTTT	2	12	112108	112119	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	472328332
73	NC_020831	TATTTT	2	12	112192	112203	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	472328332
74	NC_020831	CCTGGT	2	12	114862	114873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472328337
75	NC_020831	TTTTCC	2	12	117207	117218	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472328341
76	NC_020831	AATTTT	2	12	117286	117297	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472328341
77	NC_020831	CTTTTC	2	12	117687	117698	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472328342
78	NC_020831	GTTTGT	2	12	120711	120722	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472328349
79	NC_020831	ACATTT	2	12	121602	121613	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	472328352
80	NC_020831	TTCAAT	2	12	121982	121993	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	472328353
81	NC_020831	TTATAT	2	12	122330	122341	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472328354
82	NC_020831	ATTTAA	2	12	123782	123793	50 %	50 %	0 %	0 %	472328357
83	NC_020831	TTTTTC	2	12	124034	124045	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	472328357
84	NC_020831	ATTTCT	2	12	126326	126337	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	472328361
85	NC_020831	AAAGCT	2	12	127952	127963	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	472328362
86	NC_020831	AATATC	2	12	128044	128055	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	472328362
87	NC_020831	TCTGCT	2	12	128237	128248	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	472328362
88	NC_020831	GTTATA	2	12	128735	128746	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	472328362
89	NC_020831	TCTTGT	2	12	128753	128764	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	472328362
90	NC_020831	GTAGTT	2	12	128846	128857	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	472328362
91	NC_020831	CTCTTC	2	12	133053	133064	0 %	50 %	0 %	50 %	472328365
92	NC_020831	ACATAT	2	12	134363	134374	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	472328366
93	NC_020831	TGAATA	2	12	135589	135600	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	472328366
94	NC_020831	TTCATT	2	12	135855	135866	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	472328366
95	NC_020831	TATTAC	2	12	137135	137146	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	472328366
96	NC_020831	TTTTAA	2	12	137244	137255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472328366
97	NC_020831	TTAATT	2	12	138715	138726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472328368
98	NC_020831	ATTCTA	2	12	139518	139529	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	472328370
99	NC_020831	ACTCTT	2	12	139634	139645	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	472328370
100	NC_020831	ATTAAA	2	12	140881	140892	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472328372
101	NC_020831	ATTTTT	2	12	142634	142645	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	472328375
102	NC_020831	CTGCAC	2	12	143355	143366	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	472328375
103	NC_020831	TAAAAT	2	12	144912	144923	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472328376
104	NC_020831	TAATAT	2	12	145155	145166	50 %	50 %	0 %	0 %	472328376
105	NC_020831	CTATTT	2	12	146648	146659	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	472328377
106	NC_020831	TTTTGG	2	12	148625	148636	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472328380
107	NC_020831	AATAAA	2	12	148921	148932	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	472328380
108	NC_020831	ATTTAT	2	12	151830	151841	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472328385
109	NC_020831	TAATAT	2	12	152711	152722	50 %	50 %	0 %	0 %	472328386
110	NC_020831	TGACCA	2	12	154143	154154	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	472328387
111	NC_020831	TATTTT	2	12	154549	154560	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	472328387
112	NC_020831	CCTTTT	2	12	159099	159110	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472328391
113	NC_020831	TATCTA	2	12	160578	160589	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	472328392
114	NC_020831	ATTTTT	2	12	160598	160609	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	472328392
115	NC_020831	ATGATA	2	12	161028	161039	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	472328393
116	NC_020831	TATTAA	2	12	162956	162967	50 %	50 %	0 %	0 %	472328395
117	NC_020831	TAACAT	2	12	164845	164856	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	472328397
118	NC_020831	TTTTTA	2	12	165255	165266	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	472328397
119	NC_020831	TAATTT	2	12	169922	169933	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472328402
120	NC_020831	ATTTTA	2	12	170156	170167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472328402
121	NC_020831	AATTTA	2	12	170690	170701	50 %	50 %	0 %	0 %	472328403
122	NC_020831	TAGCTA	2	12	171946	171957	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	472328404
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.