MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Candidatus Portiera aleyrodidarum TV

Total Repeats: 358

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020831	TTTGA	2	10	1369	1378	20 %	60 %	20 %	0 %	472328234
2	NC_020831	TAATT	2	10	3010	3019	40 %	60 %	0 %	0 %	472328236
3	NC_020831	ATTAC	2	10	3401	3410	40 %	40 %	0 %	20 %	472328236
4	NC_020831	ATTAA	2	10	5722	5731	60 %	40 %	0 %	0 %	472328238
5	NC_020831	ATTAT	2	10	6069	6078	40 %	60 %	0 %	0 %	472328239
6	NC_020831	AATAA	2	10	6079	6088	80 %	20 %	0 %	0 %	472328239
7	NC_020831	ATATT	2	10	6217	6226	40 %	60 %	0 %	0 %	472328239
8	NC_020831	AACTT	2	10	8024	8033	40 %	40 %	0 %	20 %	472328240
9	NC_020831	ATTTA	2	10	10175	10184	40 %	60 %	0 %	0 %	472328241
10	NC_020831	TATTT	2	10	11186	11195	20 %	80 %	0 %	0 %	472328241
11	NC_020831	AATTA	2	10	11393	11402	60 %	40 %	0 %	0 %	472328242
12	NC_020831	TATTT	2	10	11544	11553	20 %	80 %	0 %	0 %	472328242
13	NC_020831	TAAAT	2	10	11562	11571	60 %	40 %	0 %	0 %	472328242
14	NC_020831	ATTTT	2	10	11652	11661	20 %	80 %	0 %	0 %	472328242
15	NC_020831	ATTAA	2	10	12167	12176	60 %	40 %	0 %	0 %	472328243
16	NC_020831	ATTTT	2	10	12212	12221	20 %	80 %	0 %	0 %	472328243
17	NC_020831	TCTTT	2	10	12261	12270	0 %	80 %	0 %	20 %	472328243
18	NC_020831	ATTTC	2	10	12360	12369	20 %	60 %	0 %	20 %	472328243
19	NC_020831	TTTTC	2	10	13196	13205	0 %	80 %	0 %	20 %	472328243
20	NC_020831	TCATA	2	10	13260	13269	40 %	40 %	0 %	20 %	472328243
21	NC_020831	CTATT	2	10	13380	13389	20 %	60 %	0 %	20 %	472328243
22	NC_020831	AGATT	2	10	13433	13442	40 %	40 %	20 %	0 %	472328243
23	NC_020831	ATTTC	2	10	13959	13968	20 %	60 %	0 %	20 %	472328243
24	NC_020831	ATTTA	2	10	16458	16467	40 %	60 %	0 %	0 %	472328245
25	NC_020831	ATTTT	2	10	16676	16685	20 %	80 %	0 %	0 %	472328245
26	NC_020831	ATTTA	2	10	16845	16854	40 %	60 %	0 %	0 %	472328245
27	NC_020831	ATTAT	2	10	17117	17126	40 %	60 %	0 %	0 %	472328246
28	NC_020831	TAAAG	2	10	18639	18648	60 %	20 %	20 %	0 %	472328247
29	NC_020831	TTCTT	2	10	19662	19671	0 %	80 %	0 %	20 %	472328248
30	NC_020831	ATATA	2	10	19841	19850	60 %	40 %	0 %	0 %	472328248
31	NC_020831	TAAAT	2	10	20091	20100	60 %	40 %	0 %	0 %	472328248
32	NC_020831	ATTTA	2	10	20686	20695	40 %	60 %	0 %	0 %	472328249
33	NC_020831	ATAAA	2	10	20874	20883	80 %	20 %	0 %	0 %	472328249
34	NC_020831	ATTTT	2	10	21798	21807	20 %	80 %	0 %	0 %	472328250
35	NC_020831	TAAAA	2	10	24149	24158	80 %	20 %	0 %	0 %	472328254
36	NC_020831	TATAA	2	10	24168	24177	60 %	40 %	0 %	0 %	472328254
37	NC_020831	TGTAA	2	10	24852	24861	40 %	40 %	20 %	0 %	472328254
38	NC_020831	CAAAA	2	10	26751	26760	80 %	0 %	0 %	20 %	472328254
39	NC_020831	CTAAA	2	10	27519	27528	60 %	20 %	0 %	20 %	472328255
40	NC_020831	AATCA	2	10	27585	27594	60 %	20 %	0 %	20 %	472328255
41	NC_020831	AAATA	2	10	27646	27655	80 %	20 %	0 %	0 %	472328255
42	NC_020831	TAAAA	2	10	27994	28003	80 %	20 %	0 %	0 %	472328255
43	NC_020831	ATATT	2	10	28291	28300	40 %	60 %	0 %	0 %	472328256
44	NC_020831	ATAGA	2	10	28558	28567	60 %	20 %	20 %	0 %	472328256
45	NC_020831	ATAGT	2	10	30830	30839	40 %	40 %	20 %	0 %	472328258
46	NC_020831	TAATA	2	10	31878	31887	60 %	40 %	0 %	0 %	472328258
47	NC_020831	TAAAT	2	10	31917	31926	60 %	40 %	0 %	0 %	472328258
48	NC_020831	AATTA	2	10	34474	34483	60 %	40 %	0 %	0 %	472328260
49	NC_020831	TTAAT	2	10	36461	36470	40 %	60 %	0 %	0 %	472328263
50	NC_020831	TAATA	2	10	36573	36582	60 %	40 %	0 %	0 %	472328263
51	NC_020831	CAACA	2	10	36646	36655	60 %	0 %	0 %	40 %	472328264
52	NC_020831	TGTTA	2	10	37358	37367	20 %	60 %	20 %	0 %	472328264
53	NC_020831	AATTA	2	10	38021	38030	60 %	40 %	0 %	0 %	472328264
54	NC_020831	AAACC	2	10	38756	38765	60 %	0 %	0 %	40 %	472328265
55	NC_020831	TTCTA	2	10	39742	39751	20 %	60 %	0 %	20 %	472328265
56	NC_020831	AATTT	2	10	40066	40075	40 %	60 %	0 %	0 %	472328266
57	NC_020831	TATAT	2	10	40167	40176	40 %	60 %	0 %	0 %	472328266
58	NC_020831	TTAAT	2	10	40358	40367	40 %	60 %	0 %	0 %	472328266
59	NC_020831	ATTAT	2	10	41466	41475	40 %	60 %	0 %	0 %	472328268
60	NC_020831	ATAAA	2	10	41500	41509	80 %	20 %	0 %	0 %	472328268
61	NC_020831	CAAAT	2	10	42965	42974	60 %	20 %	0 %	20 %	472328269
62	NC_020831	AAATT	2	10	44267	44276	60 %	40 %	0 %	0 %	472328270
63	NC_020831	ATTTA	2	10	44400	44409	40 %	60 %	0 %	0 %	472328270
64	NC_020831	AATTA	2	10	45663	45672	60 %	40 %	0 %	0 %	472328272
65	NC_020831	AAATA	2	10	45726	45735	80 %	20 %	0 %	0 %	472328272
66	NC_020831	GACAG	2	10	46271	46280	40 %	0 %	40 %	20 %	472328273
67	NC_020831	CAAAA	2	10	47050	47059	80 %	0 %	0 %	20 %	472328273
68	NC_020831	ACAAA	2	10	48139	48148	80 %	0 %	0 %	20 %	472328274
69	NC_020831	ATACA	2	10	48825	48834	60 %	20 %	0 %	20 %	472328275
70	NC_020831	TTAAT	2	10	49429	49438	40 %	60 %	0 %	0 %	472328275
71	NC_020831	GGAAA	2	10	50180	50189	60 %	0 %	40 %	0 %	472328276
72	NC_020831	TAAAT	2	10	50588	50597	60 %	40 %	0 %	0 %	472328277
73	NC_020831	AATTA	2	10	53449	53458	60 %	40 %	0 %	0 %	472328280
74	NC_020831	ATACC	2	10	56004	56013	40 %	20 %	0 %	40 %	472328285
75	NC_020831	TAACA	2	10	59102	59111	60 %	20 %	0 %	20 %	472328287
76	NC_020831	AATAT	2	10	59463	59472	60 %	40 %	0 %	0 %	472328287
77	NC_020831	CAATC	2	10	59762	59771	40 %	20 %	0 %	40 %	472328287
78	NC_020831	TAAAA	2	10	60362	60371	80 %	20 %	0 %	0 %	472328288
79	NC_020831	TATTT	2	10	60585	60594	20 %	80 %	0 %	0 %	472328288
80	NC_020831	ATTAT	2	10	60871	60880	40 %	60 %	0 %	0 %	472328289
81	NC_020831	GGTTT	2	10	62845	62854	0 %	60 %	40 %	0 %	472328292
82	NC_020831	TTCAT	2	10	62891	62900	20 %	60 %	0 %	20 %	472328292
83	NC_020831	ATTAG	2	10	63903	63912	40 %	40 %	20 %	0 %	472328292
84	NC_020831	TAATA	2	10	64165	64174	60 %	40 %	0 %	0 %	472328293
85	NC_020831	TATTT	2	10	66974	66983	20 %	80 %	0 %	0 %	472328295
86	NC_020831	AATTA	2	10	67145	67154	60 %	40 %	0 %	0 %	472328295
87	NC_020831	GTATG	2	10	70766	70775	20 %	40 %	40 %	0 %	472328297
88	NC_020831	TAAAA	2	10	71416	71425	80 %	20 %	0 %	0 %	472328297
89	NC_020831	ATATA	2	10	71982	71991	60 %	40 %	0 %	0 %	472328299
90	NC_020831	AAAAG	2	10	72012	72021	80 %	0 %	20 %	0 %	472328299
91	NC_020831	TATAA	2	10	73125	73134	60 %	40 %	0 %	0 %	472328300
92	NC_020831	AATTA	2	10	73864	73873	60 %	40 %	0 %	0 %	472328301
93	NC_020831	AATTT	2	10	74129	74138	40 %	60 %	0 %	0 %	472328301
94	NC_020831	GGATG	2	10	74527	74536	20 %	20 %	60 %	0 %	472328302
95	NC_020831	ATTTA	2	10	75693	75702	40 %	60 %	0 %	0 %	472328302
96	NC_020831	GTTAA	2	10	76057	76066	40 %	40 %	20 %	0 %	472328302
97	NC_020831	GGGTA	2	10	77000	77009	20 %	20 %	60 %	0 %	472328303
98	NC_020831	TAATT	2	10	77387	77396	40 %	60 %	0 %	0 %	472328303
99	NC_020831	TTGTT	2	10	78512	78521	0 %	80 %	20 %	0 %	472328304
100	NC_020831	ATTTT	2	10	78921	78930	20 %	80 %	0 %	0 %	472328304
101	NC_020831	AGAAT	2	10	81199	81208	60 %	20 %	20 %	0 %	472328306
102	NC_020831	CATAT	2	10	81787	81796	40 %	40 %	0 %	20 %	472328306
103	NC_020831	ACCTT	2	10	82954	82963	20 %	40 %	0 %	40 %	472328306
104	NC_020831	TTTTA	2	10	83215	83224	20 %	80 %	0 %	0 %	472328307
105	NC_020831	TACCT	2	10	84166	84175	20 %	40 %	0 %	40 %	472328307
106	NC_020831	ATTTT	2	10	84709	84718	20 %	80 %	0 %	0 %	472328308
107	NC_020831	ATTAT	2	10	90584	90593	40 %	60 %	0 %	0 %	472328309
108	NC_020831	ATTTT	2	10	91011	91020	20 %	80 %	0 %	0 %	472328309
109	NC_020831	GATTA	2	10	92823	92832	40 %	40 %	20 %	0 %	472328313
110	NC_020831	AATTA	2	10	96903	96912	60 %	40 %	0 %	0 %	472328316
111	NC_020831	TAATA	2	10	97415	97424	60 %	40 %	0 %	0 %	472328317
112	NC_020831	TATAT	2	10	97835	97844	40 %	60 %	0 %	0 %	472328317
113	NC_020831	CTTTA	2	10	99332	99341	20 %	60 %	0 %	20 %	472328319
114	NC_020831	ATTTT	2	10	99780	99789	20 %	80 %	0 %	0 %	472328321
115	NC_020831	AAACC	2	10	101877	101886	60 %	0 %	0 %	40 %	472328323
116	NC_020831	CTTTT	2	10	105842	105851	0 %	80 %	0 %	20 %	472328325
117	NC_020831	TAAAT	2	10	106034	106043	60 %	40 %	0 %	0 %	472328325
118	NC_020831	AAAAC	2	10	107823	107832	80 %	0 %	0 %	20 %	472328328
119	NC_020831	GTAAT	2	10	108016	108025	40 %	40 %	20 %	0 %	472328328
120	NC_020831	ATTAC	2	10	108582	108591	40 %	40 %	0 %	20 %	472328328
121	NC_020831	CAAAC	2	10	108805	108814	60 %	0 %	0 %	40 %	472328328
122	NC_020831	ACCTA	2	10	109997	110006	40 %	20 %	0 %	40 %	472328328
123	NC_020831	TATTT	2	10	110207	110216	20 %	80 %	0 %	0 %	472328328
124	NC_020831	CTATC	2	10	110534	110543	20 %	40 %	0 %	40 %	472328329
125	NC_020831	TTTTA	2	10	111949	111958	20 %	80 %	0 %	0 %	472328332
126	NC_020831	CATAA	2	10	112833	112842	60 %	20 %	0 %	20 %	472328334
127	NC_020831	AAACT	2	10	116790	116799	60 %	20 %	0 %	20 %	472328340
128	NC_020831	ATTTA	2	10	117613	117622	40 %	60 %	0 %	0 %	472328342
129	NC_020831	CTTTT	2	10	118797	118806	0 %	80 %	0 %	20 %	472328344
130	NC_020831	TAATT	2	10	119027	119036	40 %	60 %	0 %	0 %	472328345
131	NC_020831	ATTGG	2	10	119359	119368	20 %	40 %	40 %	0 %	472328346
132	NC_020831	TAATT	2	10	120022	120031	40 %	60 %	0 %	0 %	472328347
133	NC_020831	TTTTA	2	10	120323	120332	20 %	80 %	0 %	0 %	472328348
134	NC_020831	TTATT	2	10	120861	120870	20 %	80 %	0 %	0 %	472328350
135	NC_020831	CTTAA	2	10	121110	121119	40 %	40 %	0 %	20 %	472328351
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137	NC_020831	TCTTT	2	10	123700	123709	0 %	80 %	0 %	20 %	472328356
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.