MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Corynebacterium callunae DSM 20147 plasmid pCC2

Total Repeats: 42

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020553	CCCCA	2	10	2857	2866	20 %	0 %	0 %	80 %	470157239
2	NC_020553	CCGCC	2	10	3679	3688	0 %	0 %	20 %	80 %	470157240
3	NC_020553	GCCGT	2	10	6410	6419	0 %	20 %	40 %	40 %	470157244
4	NC_020553	TGTGG	2	10	8801	8810	0 %	40 %	60 %	0 %	470157247
5	NC_020553	TCGGG	2	10	9121	9130	0 %	20 %	60 %	20 %	470157247
6	NC_020553	CAGGT	2	10	10061	10070	20 %	20 %	40 %	20 %	470157247
7	NC_020553	TCCTC	2	10	11478	11487	0 %	40 %	0 %	60 %	470157248
8	NC_020553	GCCAC	2	10	11493	11502	20 %	0 %	20 %	60 %	470157248
9	NC_020553	TGATG	2	10	11928	11937	20 %	40 %	40 %	0 %	470157249
10	NC_020553	GGCTG	2	10	13359	13368	0 %	20 %	60 %	20 %	470157250
11	NC_020553	CCTGA	2	10	14163	14172	20 %	20 %	20 %	40 %	470157250
12	NC_020553	CGCTC	2	10	17943	17952	0 %	20 %	20 %	60 %	470157253
13	NC_020553	CAGCG	2	10	18767	18776	20 %	0 %	40 %	40 %	470157253
14	NC_020553	GTGTG	2	10	19105	19114	0 %	40 %	60 %	0 %	470157254
15	NC_020553	CTGGA	2	10	20974	20983	20 %	20 %	40 %	20 %	470157257
16	NC_020553	TTTGC	2	10	22630	22639	0 %	60 %	20 %	20 %	470157259
17	NC_020553	AGCTG	2	10	24781	24790	20 %	20 %	40 %	20 %	470157260
18	NC_020553	AATCT	2	10	26674	26683	40 %	40 %	0 %	20 %	470157262
19	NC_020553	AAGAG	2	10	26708	26717	60 %	0 %	40 %	0 %	470157262
20	NC_020553	TGCCC	2	10	27122	27131	0 %	20 %	20 %	60 %	470157263
21	NC_020553	TGCCC	2	10	28894	28903	0 %	20 %	20 %	60 %	470157266
22	NC_020553	GATCC	2	10	30119	30128	20 %	20 %	20 %	40 %	470157268
23	NC_020553	GAAAA	2	10	30532	30541	80 %	0 %	20 %	0 %	470157268
24	NC_020553	TCGAA	2	10	32145	32154	40 %	20 %	20 %	20 %	470157270
25	NC_020553	TCCTT	2	10	38118	38127	0 %	60 %	0 %	40 %	470157277
26	NC_020553	GATCC	2	10	41344	41353	20 %	20 %	20 %	40 %	470157277
27	NC_020553	TGTCT	2	10	44431	44440	0 %	60 %	20 %	20 %	470157278
28	NC_020553	CTGTG	2	10	45813	45822	0 %	40 %	40 %	20 %	470157279
29	NC_020553	TGCCG	2	10	51465	51474	0 %	20 %	40 %	40 %	470157285
30	NC_020553	GAAAA	2	10	53220	53229	80 %	0 %	20 %	0 %	470157287
31	NC_020553	ATCGG	2	10	54510	54519	20 %	20 %	40 %	20 %	470157288
32	NC_020553	TCACC	2	10	54673	54682	20 %	20 %	0 %	60 %	470157288
33	NC_020553	GATTG	2	10	55455	55464	20 %	40 %	40 %	0 %	470157288
34	NC_020553	AGGCA	2	10	55918	55927	40 %	0 %	40 %	20 %	470157289
35	NC_020553	CTCCG	2	10	60677	60686	0 %	20 %	20 %	60 %	470157295
36	NC_020553	CGCTG	2	10	61646	61655	0 %	20 %	40 %	40 %	470157296
37	NC_020553	ACACG	2	10	64051	64060	40 %	0 %	20 %	40 %	470157297
38	NC_020553	TCAGC	2	10	70607	70616	20 %	20 %	20 %	40 %	470157305
39	NC_020553	CCACA	2	10	70628	70637	40 %	0 %	0 %	60 %	470157305
40	NC_020553	CTTGG	2	10	77303	77312	0 %	40 %	40 %	20 %	470157311
41	NC_020553	CCTCC	2	10	78832	78841	0 %	20 %	0 %	80 %	470157313
42	NC_020553	GCCCC	2	10	84763	84772	0 %	0 %	20 %	80 %	470157318

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.