MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Corynebacterium callunae DSM 20147 plasmid pCC2

Total Repeats: 169

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020553	CCGC	2	8	963	970	0 %	0 %	25 %	75 %	470157237
2	NC_020553	GGCC	2	8	1102	1109	0 %	0 %	50 %	50 %	470157237
3	NC_020553	GGAC	2	8	1294	1301	25 %	0 %	50 %	25 %	470157237
4	NC_020553	TGAT	2	8	1531	1538	25 %	50 %	25 %	0 %	470157238
5	NC_020553	CGAC	2	8	1766	1773	25 %	0 %	25 %	50 %	470157238
6	NC_020553	GAAG	2	8	1890	1897	50 %	0 %	50 %	0 %	470157238
7	NC_020553	GGCG	2	8	2269	2276	0 %	0 %	75 %	25 %	470157239
8	NC_020553	CTAC	2	8	2344	2351	25 %	25 %	0 %	50 %	470157239
9	NC_020553	TGTT	2	8	2355	2362	0 %	75 %	25 %	0 %	470157239
10	NC_020553	CCCG	2	8	2480	2487	0 %	0 %	25 %	75 %	470157239
11	NC_020553	TAAT	2	8	2942	2949	50 %	50 %	0 %	0 %	470157240
12	NC_020553	GGAC	2	8	3376	3383	25 %	0 %	50 %	25 %	470157240
13	NC_020553	GGCC	2	8	3725	3732	0 %	0 %	50 %	50 %	470157240
14	NC_020553	GGCC	2	8	4113	4120	0 %	0 %	50 %	50 %	470157240
15	NC_020553	TGCC	2	8	5722	5729	0 %	25 %	25 %	50 %	470157243
16	NC_020553	GGGC	2	8	6858	6865	0 %	0 %	75 %	25 %	470157244
17	NC_020553	TCCG	2	8	7128	7135	0 %	25 %	25 %	50 %	470157245
18	NC_020553	CCCG	2	8	7253	7260	0 %	0 %	25 %	75 %	470157245
19	NC_020553	ACGG	2	8	7327	7334	25 %	0 %	50 %	25 %	470157245
20	NC_020553	CGGG	2	8	7336	7343	0 %	0 %	75 %	25 %	470157245
21	NC_020553	GTGA	2	8	7422	7429	25 %	25 %	50 %	0 %	470157245
22	NC_020553	GCGG	2	8	8035	8042	0 %	0 %	75 %	25 %	470157246
23	NC_020553	CCGT	2	8	8778	8785	0 %	25 %	25 %	50 %	470157247
24	NC_020553	CCAG	2	8	9079	9086	25 %	0 %	25 %	50 %	470157247
25	NC_020553	GACC	2	8	9445	9452	25 %	0 %	25 %	50 %	470157247
26	NC_020553	ACCG	2	8	10598	10605	25 %	0 %	25 %	50 %	470157247
27	NC_020553	CGGT	2	8	11193	11200	0 %	25 %	50 %	25 %	470157248
28	NC_020553	GCTG	2	8	11698	11705	0 %	25 %	50 %	25 %	470157248
29	NC_020553	CCTG	2	8	12217	12224	0 %	25 %	25 %	50 %	470157249
30	NC_020553	TGGT	2	8	12382	12389	0 %	50 %	50 %	0 %	470157250
31	NC_020553	GTTC	2	8	12473	12480	0 %	50 %	25 %	25 %	470157250
32	NC_020553	TGCT	2	8	12667	12674	0 %	50 %	25 %	25 %	470157250
33	NC_020553	ATCC	2	8	12845	12852	25 %	25 %	0 %	50 %	470157250
34	NC_020553	GCTG	2	8	12881	12888	0 %	25 %	50 %	25 %	470157250
35	NC_020553	TCAA	2	8	12891	12898	50 %	25 %	0 %	25 %	470157250
36	NC_020553	GCCC	2	8	13026	13033	0 %	0 %	25 %	75 %	470157250
37	NC_020553	CCAC	2	8	13387	13394	25 %	0 %	0 %	75 %	470157250
38	NC_020553	GCTG	2	8	13519	13526	0 %	25 %	50 %	25 %	470157250
39	NC_020553	CGGT	2	8	13609	13616	0 %	25 %	50 %	25 %	470157250
40	NC_020553	CGCC	2	8	13858	13865	0 %	0 %	25 %	75 %	470157250
41	NC_020553	CAGC	2	8	15286	15293	25 %	0 %	25 %	50 %	470157251
42	NC_020553	GAGC	2	8	15466	15473	25 %	0 %	50 %	25 %	470157252
43	NC_020553	TCCG	2	8	16011	16018	0 %	25 %	25 %	50 %	470157252
44	NC_020553	GGCG	2	8	16486	16493	0 %	0 %	75 %	25 %	470157252
45	NC_020553	CTCG	2	8	16618	16625	0 %	25 %	25 %	50 %	470157252
46	NC_020553	GTCG	2	8	16672	16679	0 %	25 %	50 %	25 %	470157252
47	NC_020553	TCAC	2	8	17133	17140	25 %	25 %	0 %	50 %	470157252
48	NC_020553	CCTT	2	8	17406	17413	0 %	50 %	0 %	50 %	470157252
49	NC_020553	CCGG	2	8	18088	18095	0 %	0 %	50 %	50 %	470157253
50	NC_020553	CGGT	2	8	18225	18232	0 %	25 %	50 %	25 %	470157253
51	NC_020553	CCAC	2	8	18633	18640	25 %	0 %	0 %	75 %	470157253
52	NC_020553	CTGG	2	8	18661	18668	0 %	25 %	50 %	25 %	470157253
53	NC_020553	CGTC	2	8	20166	20173	0 %	25 %	25 %	50 %	470157256
54	NC_020553	CTGA	2	8	20466	20473	25 %	25 %	25 %	25 %	470157257
55	NC_020553	GTGA	2	8	20552	20559	25 %	25 %	50 %	0 %	470157257
56	NC_020553	GGCC	2	8	20609	20616	0 %	0 %	50 %	50 %	470157257
57	NC_020553	AACG	2	8	20641	20648	50 %	0 %	25 %	25 %	470157257
58	NC_020553	TCCC	2	8	20802	20809	0 %	25 %	0 %	75 %	470157257
59	NC_020553	CGGC	2	8	20925	20932	0 %	0 %	50 %	50 %	470157257
60	NC_020553	TCCC	2	8	21368	21375	0 %	25 %	0 %	75 %	470157257
61	NC_020553	CAGT	2	8	22150	22157	25 %	25 %	25 %	25 %	470157259
62	NC_020553	TTGA	2	8	22470	22477	25 %	50 %	25 %	0 %	470157259
63	NC_020553	TAAG	2	8	23248	23255	50 %	25 %	25 %	0 %	470157259
64	NC_020553	ATCA	2	8	23652	23659	50 %	25 %	0 %	25 %	470157259
65	NC_020553	GCAG	2	8	23826	23833	25 %	0 %	50 %	25 %	470157260
66	NC_020553	TCGG	2	8	24288	24295	0 %	25 %	50 %	25 %	470157260
67	NC_020553	GTTT	2	8	24341	24348	0 %	75 %	25 %	0 %	470157260
68	NC_020553	CACC	2	8	24351	24358	25 %	0 %	0 %	75 %	470157260
69	NC_020553	AGGG	2	8	27335	27342	25 %	0 %	75 %	0 %	470157263
70	NC_020553	ATTC	2	8	28430	28437	25 %	50 %	0 %	25 %	470157265
71	NC_020553	AGGG	2	8	29107	29114	25 %	0 %	75 %	0 %	470157266
72	NC_020553	AAGG	2	8	30607	30614	50 %	0 %	50 %	0 %	470157268
73	NC_020553	ACCG	2	8	30662	30669	25 %	0 %	25 %	50 %	470157268
74	NC_020553	ATGA	2	8	31991	31998	50 %	25 %	25 %	0 %	470157270
75	NC_020553	ATTG	2	8	32137	32144	25 %	50 %	25 %	0 %	470157270
76	NC_020553	TTCC	2	8	32814	32821	0 %	50 %	0 %	50 %	470157271
77	NC_020553	CAAG	2	8	32945	32952	50 %	0 %	25 %	25 %	470157271
78	NC_020553	ATAG	2	8	33383	33390	50 %	25 %	25 %	0 %	470157272
79	NC_020553	GCTG	2	8	33813	33820	0 %	25 %	50 %	25 %	470157273
80	NC_020553	ATGA	2	8	33854	33861	50 %	25 %	25 %	0 %	470157273
81	NC_020553	GATG	2	8	34396	34403	25 %	25 %	50 %	0 %	470157273
82	NC_020553	GTCT	2	8	34417	34424	0 %	50 %	25 %	25 %	470157273
83	NC_020553	CCGA	2	8	35615	35622	25 %	0 %	25 %	50 %	470157275
84	NC_020553	CACT	2	8	37178	37185	25 %	25 %	0 %	50 %	470157277
85	NC_020553	CAGC	2	8	37476	37483	25 %	0 %	25 %	50 %	470157277
86	NC_020553	TCAG	2	8	38239	38246	25 %	25 %	25 %	25 %	470157277
87	NC_020553	AGGC	2	8	38443	38450	25 %	0 %	50 %	25 %	470157277
88	NC_020553	GCCC	2	8	38514	38521	0 %	0 %	25 %	75 %	470157277
89	NC_020553	TGTT	2	8	39395	39402	0 %	75 %	25 %	0 %	470157277
90	NC_020553	CAGT	2	8	39961	39968	25 %	25 %	25 %	25 %	470157277
91	NC_020553	GGCC	2	8	40284	40291	0 %	0 %	50 %	50 %	470157277
92	NC_020553	TTAT	2	8	41311	41318	25 %	75 %	0 %	0 %	470157277
93	NC_020553	GCAA	2	8	42266	42273	50 %	0 %	25 %	25 %	470157278
94	NC_020553	CTTT	2	8	42717	42724	0 %	75 %	0 %	25 %	470157278
95	NC_020553	CTTC	2	8	43269	43276	0 %	50 %	0 %	50 %	470157278
96	NC_020553	ATGT	2	8	44519	44526	25 %	50 %	25 %	0 %	470157278
97	NC_020553	GAAC	2	8	44776	44783	50 %	0 %	25 %	25 %	470157279
98	NC_020553	TACC	2	8	44912	44919	25 %	25 %	0 %	50 %	470157279
99	NC_020553	AATT	2	8	45095	45102	50 %	50 %	0 %	0 %	470157279
100	NC_020553	TTCG	2	8	45266	45273	0 %	50 %	25 %	25 %	470157279
101	NC_020553	TTTC	3	12	45542	45553	0 %	75 %	0 %	25 %	470157279
102	NC_020553	CCAT	2	8	45607	45614	25 %	25 %	0 %	50 %	470157279
103	NC_020553	GTAG	2	8	46365	46372	25 %	25 %	50 %	0 %	470157279
104	NC_020553	TTTC	2	8	46885	46892	0 %	75 %	0 %	25 %	470157280
105	NC_020553	CCCA	2	8	47844	47851	25 %	0 %	0 %	75 %	470157280
106	NC_020553	GAGC	2	8	48127	48134	25 %	0 %	50 %	25 %	470157280
107	NC_020553	CGGT	2	8	48144	48151	0 %	25 %	50 %	25 %	470157280
108	NC_020553	GCCA	2	8	48215	48222	25 %	0 %	25 %	50 %	470157280
109	NC_020553	CACC	2	8	49361	49368	25 %	0 %	0 %	75 %	470157282
110	NC_020553	ACTC	2	8	49871	49878	25 %	25 %	0 %	50 %	470157282
111	NC_020553	GATG	2	8	50090	50097	25 %	25 %	50 %	0 %	470157282
112	NC_020553	TGGG	2	8	50585	50592	0 %	25 %	75 %	0 %	470157283
113	NC_020553	AGCT	2	8	51119	51126	25 %	25 %	25 %	25 %	470157284
114	NC_020553	CACC	2	8	52408	52415	25 %	0 %	0 %	75 %	470157286
115	NC_020553	CTTC	2	8	52479	52486	0 %	50 %	0 %	50 %	470157286
116	NC_020553	TGCC	2	8	52681	52688	0 %	25 %	25 %	50 %	470157286
117	NC_020553	CCTG	2	8	52925	52932	0 %	25 %	25 %	50 %	470157286
118	NC_020553	TGCG	2	8	53462	53469	0 %	25 %	50 %	25 %	470157287
119	NC_020553	GCTG	2	8	53618	53625	0 %	25 %	50 %	25 %	470157287
120	NC_020553	TCTG	2	8	54857	54864	0 %	50 %	25 %	25 %	470157288
121	NC_020553	ACCC	2	8	55627	55634	25 %	0 %	0 %	75 %	470157289
122	NC_020553	TCGA	2	8	55861	55868	25 %	25 %	25 %	25 %	470157289
123	NC_020553	GAAA	2	8	56157	56164	75 %	0 %	25 %	0 %	470157289
124	NC_020553	TTGC	2	8	57229	57236	0 %	50 %	25 %	25 %	470157292
125	NC_020553	TGGA	2	8	58734	58741	25 %	25 %	50 %	0 %	470157294
126	NC_020553	GGCC	2	8	59063	59070	0 %	0 %	50 %	50 %	470157294
127	NC_020553	AGCA	2	8	59579	59586	50 %	0 %	25 %	25 %	470157294
128	NC_020553	TCAA	2	8	59984	59991	50 %	25 %	0 %	25 %	470157294
129	NC_020553	CACC	2	8	60020	60027	25 %	0 %	0 %	75 %	470157294
130	NC_020553	ATCT	2	8	60336	60343	25 %	50 %	0 %	25 %	470157295
131	NC_020553	GCAC	2	8	60399	60406	25 %	0 %	25 %	50 %	470157295
132	NC_020553	TCGC	2	8	60691	60698	0 %	25 %	25 %	50 %	470157295
133	NC_020553	GTCT	2	8	60779	60786	0 %	50 %	25 %	25 %	470157295
134	NC_020553	TCAA	2	8	61415	61422	50 %	25 %	0 %	25 %	470157295
135	NC_020553	CTGG	2	8	61521	61528	0 %	25 %	50 %	25 %	470157295
136	NC_020553	AAAG	2	8	62501	62508	75 %	0 %	25 %	0 %	470157297
137	NC_020553	TGTA	2	8	63463	63470	25 %	50 %	25 %	0 %	470157297
138	NC_020553	ATGA	2	8	65785	65792	50 %	25 %	25 %	0 %	470157299
139	NC_020553	CAGC	2	8	66154	66161	25 %	0 %	25 %	50 %	470157300
140	NC_020553	TGGA	2	8	66379	66386	25 %	25 %	50 %	0 %	470157300
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144	NC_020553	CACC	2	8	67164	67171	25 %	0 %	0 %	75 %	470157301
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169	NC_020553	CCAG	2	8	84732	84739	25 %	0 %	25 %	50 %	470157318

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.