MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis IU888 complete genome

Total Repeats: 20007

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_020512	AATT	2	8	213403	213410	50 %	50 %	0 %	0 %	478428319
4002	NC_020512	TTG	2	6	213435	213440	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478428319
4003	NC_020512	GAG	2	6	213461	213466	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478428319
4004	NC_020512	GCA	2	6	213620	213625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478428319
4005	NC_020512	CAA	2	6	213666	213671	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478428319
4006	NC_020512	AAT	2	6	213886	213891	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478428319
4007	NC_020512	GAT	2	6	213952	213957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478428319
4008	NC_020512	TTC	2	6	213958	213963	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428319
4009	NC_020512	TTTA	2	8	213964	213971	25 %	75 %	0 %	0 %	478428319
4010	NC_020512	ATT	2	6	214002	214007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478428320
4011	NC_020512	TTG	2	6	214148	214153	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478428320
4012	NC_020512	TC	3	6	214178	214183	0 %	50 %	0 %	50 %	478428320
4013	NC_020512	TTC	2	6	214217	214222	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428320
4014	NC_020512	AGT	2	6	214235	214240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478428320
4015	NC_020512	AACA	2	8	214262	214269	75 %	0 %	0 %	25 %	478428320
4016	NC_020512	TCT	2	6	214288	214293	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428320
4017	NC_020512	TGGA	2	8	214320	214327	25 %	25 %	50 %	0 %	478428320
4018	NC_020512	TTC	2	6	214374	214379	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428320
4019	NC_020512	TA	3	6	214394	214399	50 %	50 %	0 %	0 %	478428320
4020	NC_020512	TTC	2	6	214422	214427	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428320
4021	NC_020512	GCA	2	6	214432	214437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478428320
4022	NC_020512	GCT	2	6	214441	214446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478428320
4023	NC_020512	GGA	2	6	214498	214503	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478428320
4024	NC_020512	T	6	6	214566	214571	0 %	100 %	0 %	0 %	478428320
4025	NC_020512	AACG	2	8	214614	214621	50 %	0 %	25 %	25 %	478428320
4026	NC_020512	TCA	2	6	214657	214662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478428320
4027	NC_020512	CTTT	2	8	214675	214682	0 %	75 %	0 %	25 %	478428320
4028	NC_020512	CCAT	2	8	214705	214712	25 %	25 %	0 %	50 %	478428320
4029	NC_020512	GA	3	6	214723	214728	50 %	0 %	50 %	0 %	478428320
4030	NC_020512	T	6	6	214743	214748	0 %	100 %	0 %	0 %	478428320
4031	NC_020512	AGG	2	6	214767	214772	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478428320
4032	NC_020512	CATT	2	8	214789	214796	25 %	50 %	0 %	25 %	478428320
4033	NC_020512	AGA	2	6	214823	214828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478428320
4034	NC_020512	CAA	2	6	214836	214841	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478428320
4035	NC_020512	ATA	4	12	214879	214890	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478428320
4036	NC_020512	GCT	2	6	214948	214953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478428320
4037	NC_020512	GAA	2	6	215033	215038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478428320
4038	NC_020512	ACG	2	6	215049	215054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478428320
4039	NC_020512	AGCG	2	8	215159	215166	25 %	0 %	50 %	25 %	478428320
4040	NC_020512	CT	3	6	215196	215201	0 %	50 %	0 %	50 %	478428320
4041	NC_020512	CT	3	6	215204	215209	0 %	50 %	0 %	50 %	478428320
4042	NC_020512	AGC	2	6	215211	215216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478428320
4043	NC_020512	A	6	6	215283	215288	100 %	0 %	0 %	0 %	478428320
4044	NC_020512	CAC	2	6	215303	215308	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478428320
4045	NC_020512	TGTTT	2	10	215353	215362	0 %	80 %	20 %	0 %	478428320
4046	NC_020512	CTA	2	6	215405	215410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478428320
4047	NC_020512	TCT	2	6	215425	215430	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428320
4048	NC_020512	TAGA	2	8	215456	215463	50 %	25 %	25 %	0 %	478428320
4049	NC_020512	CTTGT	2	10	215534	215543	0 %	60 %	20 %	20 %	478428320
4050	NC_020512	ATT	2	6	215550	215555	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478428320
4051	NC_020512	CAT	2	6	215624	215629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478428320
4052	NC_020512	AGA	2	6	215726	215731	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478428320
4053	NC_020512	CG	3	6	215829	215834	0 %	0 %	50 %	50 %	478428320
4054	NC_020512	CTGGAT	2	12	215861	215872	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	478428320
4055	NC_020512	GTA	2	6	216086	216091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478428320
4056	NC_020512	ACC	2	6	216100	216105	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478428320
4057	NC_020512	CTTG	2	8	216128	216135	0 %	50 %	25 %	25 %	478428320
4058	NC_020512	GAAATA	2	12	216184	216195	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	478428320
4059	NC_020512	AAC	2	6	216216	216221	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478428320
4060	NC_020512	CCA	2	6	216266	216271	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478428320
4061	NC_020512	CGT	2	6	216377	216382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478428320
4062	NC_020512	TTTCT	2	10	216384	216393	0 %	80 %	0 %	20 %	478428320
4063	NC_020512	TAA	2	6	216413	216418	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478428321
4064	NC_020512	CTG	2	6	216451	216456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478428321
4065	NC_020512	CTT	2	6	216581	216586	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428321
4066	NC_020512	ACG	2	6	216719	216724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478428321
4067	NC_020512	ACA	2	6	216954	216959	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478428322
4068	NC_020512	AATA	2	8	216999	217006	75 %	25 %	0 %	0 %	478428322
4069	NC_020512	CTT	2	6	217049	217054	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428322
4070	NC_020512	TTG	2	6	217182	217187	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478428322
4071	NC_020512	TCC	2	6	217192	217197	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478428322
4072	NC_020512	AAG	2	6	217232	217237	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478428322
4073	NC_020512	CTT	2	6	217238	217243	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428322
4074	NC_020512	CTT	2	6	217265	217270	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428322
4075	NC_020512	TGC	2	6	217325	217330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478428322
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4077	NC_020512	CAAA	2	8	217407	217414	75 %	0 %	0 %	25 %	478428322
4078	NC_020512	CCA	2	6	217426	217431	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478428322
4079	NC_020512	TAC	2	6	217478	217483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478428322
4080	NC_020512	CTT	2	6	217541	217546	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428322
4081	NC_020512	TA	3	6	217668	217673	50 %	50 %	0 %	0 %	478428323
4082	NC_020512	ATG	2	6	217721	217726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478428323
4083	NC_020512	TGT	2	6	217729	217734	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478428323
4084	NC_020512	GC	3	6	217794	217799	0 %	0 %	50 %	50 %	478428323
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4086	NC_020512	ATT	2	6	217871	217876	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478428323
4087	NC_020512	CTG	2	6	218023	218028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478428323
4088	NC_020512	CAC	2	6	218051	218056	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478428323
4089	NC_020512	TCT	2	6	218121	218126	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428323
4090	NC_020512	C	6	6	218165	218170	0 %	0 %	0 %	100 %	478428323
4091	NC_020512	ATGA	2	8	218171	218178	50 %	25 %	25 %	0 %	478428323
4092	NC_020512	T	6	6	218205	218210	0 %	100 %	0 %	0 %	478428323
4093	NC_020512	GCA	2	6	218293	218298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478428323
4094	NC_020512	GAA	2	6	218311	218316	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478428323
4095	NC_020512	GAAA	2	8	218364	218371	75 %	0 %	25 %	0 %	478428323
4096	NC_020512	TCA	2	6	218412	218417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478428323
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4098	NC_020512	TCC	2	6	218438	218443	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478428323
4099	NC_020512	T	6	6	218444	218449	0 %	100 %	0 %	0 %	478428323
4100	NC_020512	TAA	2	6	218524	218529	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478428323
4101	NC_020512	CCAC	2	8	218562	218569	25 %	0 %	0 %	75 %	478428323
4102	NC_020512	AGC	2	6	218570	218575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478428323
4103	NC_020512	GAT	2	6	218605	218610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478428323
4104	NC_020512	T	7	7	218747	218753	0 %	100 %	0 %	0 %	478428323
4105	NC_020512	AGA	2	6	219037	219042	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478428324
4106	NC_020512	AGT	2	6	219062	219067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478428324
4107	NC_020512	CTC	2	6	219121	219126	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478428324
4108	NC_020512	AAC	2	6	219135	219140	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478428324
4109	NC_020512	ACA	2	6	219161	219166	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478428324
4110	NC_020512	TC	3	6	219238	219243	0 %	50 %	0 %	50 %	478428324
4111	NC_020512	TTC	2	6	219244	219249	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428324
4112	NC_020512	AAAG	2	8	219255	219262	75 %	0 %	25 %	0 %	478428324
4113	NC_020512	TAC	2	6	219277	219282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478428324
4114	NC_020512	TGC	2	6	219295	219300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478428324
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4116	NC_020512	T	6	6	219379	219384	0 %	100 %	0 %	0 %	478428324
4117	NC_020512	TAA	2	6	219430	219435	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478428324
4118	NC_020512	TCT	2	6	219495	219500	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428324
4119	NC_020512	TCT	2	6	219540	219545	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428324
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4121	NC_020512	CTT	2	6	219649	219654	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428324
4122	NC_020512	AAT	2	6	219728	219733	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478428324
4123	NC_020512	ATT	2	6	219815	219820	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478428324
4124	NC_020512	CTT	2	6	219838	219843	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428324
4125	NC_020512	GTT	2	6	219849	219854	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478428324
4126	NC_020512	A	6	6	219869	219874	100 %	0 %	0 %	0 %	478428324
4127	NC_020512	TTCC	2	8	219903	219910	0 %	50 %	0 %	50 %	478428324
4128	NC_020512	TTC	2	6	219967	219972	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428324
4129	NC_020512	ATC	2	6	219992	219997	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478428324
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4131	NC_020512	TA	3	6	220207	220212	50 %	50 %	0 %	0 %	478428324
4132	NC_020512	CTG	2	6	220249	220254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478428324
4133	NC_020512	CTT	2	6	220270	220275	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428324
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4141	NC_020512	A	6	6	220984	220989	100 %	0 %	0 %	0 %	478428325
4142	NC_020512	CTC	2	6	220999	221004	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478428325
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4144	NC_020512	ATT	2	6	221021	221026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478428325
4145	NC_020512	GCT	2	6	221106	221111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478428325
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4148	NC_020512	TGTC	2	8	221200	221207	0 %	50 %	25 %	25 %	478428325
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4152	NC_020512	CTT	2	6	221449	221454	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428325
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4154	NC_020512	GA	3	6	221485	221490	50 %	0 %	50 %	0 %	478428325
4155	NC_020512	TCT	2	6	221503	221508	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428325
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4157	NC_020512	C	6	6	221558	221563	0 %	0 %	0 %	100 %	478428325
4158	NC_020512	AAATA	2	10	221567	221576	80 %	20 %	0 %	0 %	478428325
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4233	NC_020512	AGA	2	6	224497	224502	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478428328
4234	NC_020512	CTGA	2	8	224507	224514	25 %	25 %	25 %	25 %	478428328
4235	NC_020512	CTA	2	6	224571	224576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478428328
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4238	NC_020512	CTTT	2	8	224691	224698	0 %	75 %	0 %	25 %	478428328
4239	NC_020512	TTTC	2	8	224744	224751	0 %	75 %	0 %	25 %	478428328
4240	NC_020512	TC	3	6	224815	224820	0 %	50 %	0 %	50 %	478428328
4241	NC_020512	A	7	7	224832	224838	100 %	0 %	0 %	0 %	478428328
4242	NC_020512	ACG	2	6	224916	224921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478428328
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4244	NC_020512	AAT	2	6	224939	224944	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478428328
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4246	NC_020512	CTA	2	6	225164	225169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478428329
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4250	NC_020512	GTA	2	6	225220	225225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478428329
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4355	NC_020512	CTAT	2	8	230784	230791	25 %	50 %	0 %	25 %	478428334
4356	NC_020512	TCTT	2	8	230831	230838	0 %	75 %	0 %	25 %	478428334
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4360	NC_020512	CA	3	6	230919	230924	50 %	0 %	0 %	50 %	478428334
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4362	NC_020512	TTGG	2	8	231027	231034	0 %	50 %	50 %	0 %	478428334
4363	NC_020512	TGG	3	9	231046	231054	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478428334
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4368	NC_020512	CTA	2	6	231265	231270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478428335
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4482	NC_020512	TTGA	2	8	237568	237575	25 %	50 %	25 %	0 %	478428339
4483	NC_020512	CTT	2	6	237580	237585	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428339
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4492	NC_020512	ATCC	2	8	238113	238120	25 %	25 %	0 %	50 %	478428339
4493	NC_020512	CTT	2	6	238158	238163	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428339
4494	NC_020512	TCA	2	6	238430	238435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478428339
4495	NC_020512	GAG	2	6	238441	238446	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478428339
4496	NC_020512	A	6	6	238478	238483	100 %	0 %	0 %	0 %	478428339
4497	NC_020512	TTG	2	6	238509	238514	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478428339
4498	NC_020512	TTC	2	6	238583	238588	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428339
4499	NC_020512	GCA	2	6	238665	238670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478428339
4500	NC_020512	C	6	6	238705	238710	0 %	0 %	0 %	100 %	478428339

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