MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis IU888 complete genome

Total Repeats: 20007

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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3002	NC_020512	GT	3	6	157559	157564	0 %	50 %	50 %	0 %	478428273
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3004	NC_020512	TCT	2	6	157583	157588	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428273
3005	NC_020512	AG	3	6	157598	157603	50 %	0 %	50 %	0 %	478428273
3006	NC_020512	AGG	2	6	157671	157676	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478428273
3007	NC_020512	AG	3	6	157699	157704	50 %	0 %	50 %	0 %	478428273
3008	NC_020512	AG	3	6	157716	157721	50 %	0 %	50 %	0 %	478428273
3009	NC_020512	AG	3	6	157781	157786	50 %	0 %	50 %	0 %	478428273
3010	NC_020512	ATC	2	6	157792	157797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478428273
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3015	NC_020512	ATT	2	6	158084	158089	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478428274
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3017	NC_020512	CTTG	2	8	158269	158276	0 %	50 %	25 %	25 %	478428274
3018	NC_020512	GA	3	6	158285	158290	50 %	0 %	50 %	0 %	478428274
3019	NC_020512	GCA	2	6	158338	158343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478428274
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3021	NC_020512	CTCCAT	2	12	158370	158381	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	478428274
3022	NC_020512	ATT	2	6	158448	158453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478428274
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3029	NC_020512	T	6	6	158716	158721	0 %	100 %	0 %	0 %	478428274
3030	NC_020512	AGA	2	6	158738	158743	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478428274
3031	NC_020512	TCCTTG	2	12	158966	158977	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	478428275
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3042	NC_020512	CAT	2	6	159956	159961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478428276
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3044	NC_020512	TGA	2	6	160214	160219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478428276
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3058	NC_020512	AGA	2	6	160695	160700	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478428277
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3081	NC_020512	A	6	6	162077	162082	100 %	0 %	0 %	0 %	478428278
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3095	NC_020512	GAA	3	9	162857	162865	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478428279
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3098	NC_020512	GA	3	6	163065	163070	50 %	0 %	50 %	0 %	478428279
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3120	NC_020512	AGCAA	2	10	164066	164075	60 %	0 %	20 %	20 %	478428279
3121	NC_020512	TAC	2	6	164092	164097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478428279
3122	NC_020512	TGGC	2	8	164142	164149	0 %	25 %	50 %	25 %	478428279
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3124	NC_020512	GT	3	6	164250	164255	0 %	50 %	50 %	0 %	478428279
3125	NC_020512	GAG	2	6	164259	164264	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478428279
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3128	NC_020512	GAT	2	6	164403	164408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478428280
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3243	NC_020512	AG	4	8	170009	170016	50 %	0 %	50 %	0 %	478428281
3244	NC_020512	TC	4	8	170029	170036	0 %	50 %	0 %	50 %	478428281
3245	NC_020512	CTT	2	6	170053	170058	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428281
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3247	NC_020512	GTTT	2	8	170118	170125	0 %	75 %	25 %	0 %	478428281
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3494	NC_020512	ATCG	2	8	185017	185024	25 %	25 %	25 %	25 %	478428291
3495	NC_020512	TCA	2	6	185100	185105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478428292
3496	NC_020512	GGA	2	6	185115	185120	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478428292
3497	NC_020512	AGAGA	2	10	185208	185217	60 %	0 %	40 %	0 %	478428292
3498	NC_020512	GCA	2	6	185304	185309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478428292
3499	NC_020512	TTA	2	6	185601	185606	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478428292
3500	NC_020512	GAA	2	6	185670	185675	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478428292

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