MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis IU888 complete genome

Total Repeats: 20007

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2125	NC_020512	GAA	2	6	112245	112250	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478428231
2126	NC_020512	CAT	2	6	112315	112320	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478428231
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2131	NC_020512	TCT	2	6	112503	112508	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428231
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2152	NC_020512	TCT	2	6	112947	112952	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428231
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2157	NC_020512	GCA	2	6	113100	113105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478428231
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2224	NC_020512	TATCG	2	10	116403	116412	20 %	40 %	20 %	20 %	478428233
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2227	NC_020512	T	7	7	116743	116749	0 %	100 %	0 %	0 %	478428234
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2230	NC_020512	ACA	2	6	116956	116961	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478428234
2231	NC_020512	GGAGA	2	10	117115	117124	40 %	0 %	60 %	0 %	478428234
2232	NC_020512	TAT	2	6	117144	117149	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478428234
2233	NC_020512	TATC	2	8	117176	117183	25 %	50 %	0 %	25 %	478428234
2234	NC_020512	TTTG	2	8	117273	117280	0 %	75 %	25 %	0 %	478428234
2235	NC_020512	AGG	3	9	117285	117293	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478428234
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2237	NC_020512	GA	3	6	117360	117365	50 %	0 %	50 %	0 %	478428234
2238	NC_020512	A	6	6	117413	117418	100 %	0 %	0 %	0 %	478428234
2239	NC_020512	GTTC	2	8	117469	117476	0 %	50 %	25 %	25 %	478428234
2240	NC_020512	TAA	2	6	117489	117494	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478428234
2241	NC_020512	ACC	2	6	117505	117510	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478428234
2242	NC_020512	GCT	2	6	117523	117528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478428234
2243	NC_020512	AGG	2	6	117573	117578	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478428234
2244	NC_020512	ATT	2	6	117607	117612	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478428234
2245	NC_020512	TTC	2	6	117624	117629	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428234
2246	NC_020512	TGC	2	6	117654	117659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478428234
2247	NC_020512	CTG	2	6	117701	117706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478428234
2248	NC_020512	GCA	2	6	117906	117911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478428235
2249	NC_020512	TGC	2	6	117917	117922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478428235
2250	NC_020512	AAG	2	6	117925	117930	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478428235
2251	NC_020512	GAAA	2	8	117977	117984	75 %	0 %	25 %	0 %	478428235
2252	NC_020512	GTT	2	6	118020	118025	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478428235
2253	NC_020512	TAT	2	6	118036	118041	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478428235
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2264	NC_020512	CA	3	6	118531	118536	50 %	0 %	0 %	50 %	478428236
2265	NC_020512	ATC	2	6	118579	118584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478428236
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2267	NC_020512	T	6	6	118747	118752	0 %	100 %	0 %	0 %	478428237
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2271	NC_020512	T	6	6	118906	118911	0 %	100 %	0 %	0 %	478428237
2272	NC_020512	GTT	2	6	119024	119029	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478428237
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2276	NC_020512	CTC	2	6	119124	119129	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478428237
2277	NC_020512	AAAGA	2	10	119165	119174	80 %	0 %	20 %	0 %	478428237
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2279	NC_020512	TTA	2	6	119229	119234	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478428238
2280	NC_020512	T	6	6	119334	119339	0 %	100 %	0 %	0 %	478428238
2281	NC_020512	TTC	2	6	119420	119425	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428238
2282	NC_020512	TCC	2	6	119433	119438	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478428238
2283	NC_020512	TTTA	2	8	119451	119458	25 %	75 %	0 %	0 %	478428238
2284	NC_020512	CTG	2	6	119649	119654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478428238
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2286	NC_020512	T	6	6	119715	119720	0 %	100 %	0 %	0 %	478428238
2287	NC_020512	GA	4	8	119724	119731	50 %	0 %	50 %	0 %	478428238
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2332	NC_020512	GA	3	6	124372	124377	50 %	0 %	50 %	0 %	478428241
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2349	NC_020512	AG	3	6	124784	124789	50 %	0 %	50 %	0 %	478428241
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2352	NC_020512	TGA	2	6	125031	125036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478428241
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2354	NC_020512	TAC	2	6	125084	125089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478428241
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2356	NC_020512	TTG	2	6	125107	125112	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478428241
2357	NC_020512	GA	3	6	125154	125159	50 %	0 %	50 %	0 %	478428241
2358	NC_020512	TAG	2	6	125173	125178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478428241
2359	NC_020512	CTTC	2	8	125180	125187	0 %	50 %	0 %	50 %	478428241
2360	NC_020512	TCA	2	6	125300	125305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478428241
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2362	NC_020512	ATAA	2	8	125383	125390	75 %	25 %	0 %	0 %	478428241
2363	NC_020512	TGAA	2	8	125468	125475	50 %	25 %	25 %	0 %	478428242
2364	NC_020512	TAA	2	6	125763	125768	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478428242
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2367	NC_020512	GAA	2	6	125934	125939	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478428242
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2369	NC_020512	CAG	2	6	126004	126009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478428242
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