MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis IU888 complete genome

Total Repeats: 20007

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1502	NC_020512	GGGA	2	8	81461	81468	25 %	0 %	75 %	0 %	478428203
1503	NC_020512	CTGC	2	8	81565	81572	0 %	25 %	25 %	50 %	478428204
1504	NC_020512	GCT	2	6	81583	81588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478428204
1505	NC_020512	ATT	2	6	81589	81594	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478428204
1506	NC_020512	CTT	2	6	81632	81637	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428204
1507	NC_020512	CTT	2	6	81653	81658	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428204
1508	NC_020512	CAT	2	6	81700	81705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478428204
1509	NC_020512	TGA	2	6	81822	81827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478428204
1510	NC_020512	AGG	2	6	81833	81838	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478428204
1511	NC_020512	GGTT	2	8	81858	81865	0 %	50 %	50 %	0 %	478428204
1512	NC_020512	GTC	2	6	81881	81886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478428204
1513	NC_020512	CT	3	6	81898	81903	0 %	50 %	0 %	50 %	478428204
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1516	NC_020512	AG	3	6	81917	81922	50 %	0 %	50 %	0 %	478428204
1517	NC_020512	T	6	6	81924	81929	0 %	100 %	0 %	0 %	478428204
1518	NC_020512	CGAT	2	8	81986	81993	25 %	25 %	25 %	25 %	478428204
1519	NC_020512	TCAT	2	8	82061	82068	25 %	50 %	0 %	25 %	478428204
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1522	NC_020512	AGA	2	6	82146	82151	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478428204
1523	NC_020512	AAG	2	6	82163	82168	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478428204
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1530	NC_020512	TTA	2	6	82466	82471	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478428205
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1532	NC_020512	AGAAA	2	10	82524	82533	80 %	0 %	20 %	0 %	478428205
1533	NC_020512	T	6	6	82579	82584	0 %	100 %	0 %	0 %	478428205
1534	NC_020512	GTTA	2	8	82603	82610	25 %	50 %	25 %	0 %	478428205
1535	NC_020512	ACA	2	6	82637	82642	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478428205
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1543	NC_020512	CCT	2	6	82909	82914	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478428205
1544	NC_020512	GGAAG	2	10	83037	83046	40 %	0 %	60 %	0 %	478428205
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1555	NC_020512	TAA	2	6	83457	83462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478428205
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1557	NC_020512	GAA	2	6	83485	83490	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478428205
1558	NC_020512	GA	3	6	83570	83575	50 %	0 %	50 %	0 %	478428205
1559	NC_020512	TAC	2	6	83621	83626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478428206
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1561	NC_020512	T	7	7	83657	83663	0 %	100 %	0 %	0 %	478428206
1562	NC_020512	T	6	6	83670	83675	0 %	100 %	0 %	0 %	478428206
1563	NC_020512	GTA	2	6	83756	83761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478428206
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1565	NC_020512	TATG	2	8	83791	83798	25 %	50 %	25 %	0 %	478428206
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1572	NC_020512	CATT	2	8	83929	83936	25 %	50 %	0 %	25 %	478428206
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1600	NC_020512	ATCC	2	8	85291	85298	25 %	25 %	0 %	50 %	478428207
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1607	NC_020512	AGCGA	2	10	85503	85512	40 %	0 %	40 %	20 %	478428207
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1610	NC_020512	GAA	2	6	85669	85674	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478428207
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1612	NC_020512	AT	3	6	85927	85932	50 %	50 %	0 %	0 %	478428208
1613	NC_020512	AGC	2	6	85995	86000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478428208
1614	NC_020512	AG	3	6	86022	86027	50 %	0 %	50 %	0 %	478428208
1615	NC_020512	GAAA	2	8	86060	86067	75 %	0 %	25 %	0 %	478428208
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1618	NC_020512	AC	3	6	86325	86330	50 %	0 %	0 %	50 %	478428208
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1623	NC_020512	GAAA	2	8	86455	86462	75 %	0 %	25 %	0 %	478428208
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1627	NC_020512	TAG	2	6	86618	86623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478428208
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