MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis IU888 complete genome

Total Repeats: 20007

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_020512	GAA	2	6	27809	27814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478428157
502	NC_020512	GGGC	2	8	27875	27882	0 %	0 %	75 %	25 %	478428157
503	NC_020512	T	6	6	27891	27896	0 %	100 %	0 %	0 %	478428157
504	NC_020512	TGA	2	6	27904	27909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478428157
505	NC_020512	GGAGA	2	10	27912	27921	40 %	0 %	60 %	0 %	478428157
506	NC_020512	A	7	7	27962	27968	100 %	0 %	0 %	0 %	478428157
507	NC_020512	AAG	2	6	27979	27984	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478428157
508	NC_020512	T	6	6	27999	28004	0 %	100 %	0 %	0 %	478428157
509	NC_020512	A	8	8	28096	28103	100 %	0 %	0 %	0 %	478428158
510	NC_020512	TTC	2	6	28140	28145	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428158
511	NC_020512	GTTT	2	8	28158	28165	0 %	75 %	25 %	0 %	478428158
512	NC_020512	CAGA	2	8	28180	28187	50 %	0 %	25 %	25 %	478428158
513	NC_020512	TTC	2	6	28258	28263	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428158
514	NC_020512	AAG	2	6	28273	28278	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478428158
515	NC_020512	TTC	2	6	28373	28378	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428158
516	NC_020512	AAG	2	6	28387	28392	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478428158
517	NC_020512	AAG	2	6	28405	28410	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478428158
518	NC_020512	A	6	6	28411	28416	100 %	0 %	0 %	0 %	478428158
519	NC_020512	GAA	2	6	28643	28648	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478428159
520	NC_020512	ATCCG	2	10	28663	28672	20 %	20 %	20 %	40 %	478428159
521	NC_020512	TTC	2	6	28776	28781	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428159
522	NC_020512	TAG	2	6	28824	28829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478428159
523	NC_020512	AGA	2	6	28837	28842	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478428159
524	NC_020512	GAT	3	9	28919	28927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478428159
525	NC_020512	GAG	2	6	28962	28967	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478428159
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527	NC_020512	GCA	2	6	29018	29023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478428159
528	NC_020512	TC	3	6	29047	29052	0 %	50 %	0 %	50 %	478428159
529	NC_020512	AGGGT	2	10	29181	29190	20 %	20 %	60 %	0 %	478428159
530	NC_020512	TTC	2	6	29217	29222	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428159
531	NC_020512	CAG	2	6	29229	29234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478428159
532	NC_020512	GAA	2	6	29243	29248	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478428159
533	NC_020512	TGA	2	6	29257	29262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478428159
534	NC_020512	TTC	2	6	29290	29295	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428159
535	NC_020512	GC	4	8	29461	29468	0 %	0 %	50 %	50 %	478428159
536	NC_020512	AAG	2	6	29469	29474	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478428159
537	NC_020512	TA	3	6	29583	29588	50 %	50 %	0 %	0 %	478428159
538	NC_020512	GAA	2	6	29672	29677	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478428159
539	NC_020512	TGT	2	6	29704	29709	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478428160
540	NC_020512	TCT	2	6	29772	29777	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428160
541	NC_020512	ACA	2	6	30000	30005	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478428160
542	NC_020512	ATG	2	6	30010	30015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478428160
543	NC_020512	CTTT	2	8	30152	30159	0 %	75 %	0 %	25 %	478428160
544	NC_020512	TTTG	2	8	30167	30174	0 %	75 %	25 %	0 %	478428160
545	NC_020512	TTGT	2	8	30202	30209	0 %	75 %	25 %	0 %	478428160
546	NC_020512	CCTAT	2	10	30221	30230	20 %	40 %	0 %	40 %	478428160
547	NC_020512	T	6	6	30237	30242	0 %	100 %	0 %	0 %	478428160
548	NC_020512	ATC	2	6	30316	30321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478428160
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550	NC_020512	T	8	8	30471	30478	0 %	100 %	0 %	0 %	478428160
551	NC_020512	ATG	2	6	30496	30501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478428160
552	NC_020512	GA	3	6	30534	30539	50 %	0 %	50 %	0 %	478428160
553	NC_020512	AG	3	6	30632	30637	50 %	0 %	50 %	0 %	478428161
554	NC_020512	GTT	2	6	30713	30718	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478428161
555	NC_020512	GAA	2	6	30722	30727	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478428161
556	NC_020512	TC	3	6	30741	30746	0 %	50 %	0 %	50 %	478428161
557	NC_020512	TCT	2	6	30788	30793	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428161
558	NC_020512	ACT	2	6	30878	30883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478428161
559	NC_020512	TTC	2	6	30906	30911	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428161
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561	NC_020512	CCT	2	6	30942	30947	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478428161
562	NC_020512	AAAC	2	8	30995	31002	75 %	0 %	0 %	25 %	478428161
563	NC_020512	T	6	6	31012	31017	0 %	100 %	0 %	0 %	478428161
564	NC_020512	AAGGA	2	10	31021	31030	60 %	0 %	40 %	0 %	478428161
565	NC_020512	GGC	2	6	31048	31053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	478428161
566	NC_020512	GAT	2	6	31127	31132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478428161
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568	NC_020512	TAG	2	6	31149	31154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478428161
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570	NC_020512	TAA	2	6	31333	31338	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478428161
571	NC_020512	GA	3	6	31362	31367	50 %	0 %	50 %	0 %	478428161
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573	NC_020512	TCG	2	6	31555	31560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478428161
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578	NC_020512	ATG	2	6	31793	31798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478428161
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581	NC_020512	GA	3	6	31830	31835	50 %	0 %	50 %	0 %	478428161
582	NC_020512	A	7	7	31853	31859	100 %	0 %	0 %	0 %	478428161
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586	NC_020512	GAGCT	2	10	32060	32069	20 %	20 %	40 %	20 %	478428162
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588	NC_020512	A	6	6	32165	32170	100 %	0 %	0 %	0 %	478428162
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595	NC_020512	CTT	2	6	32506	32511	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428163
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598	NC_020512	GAG	2	6	32614	32619	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478428163
599	NC_020512	GCG	2	6	32656	32661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	478428163
600	NC_020512	CT	3	6	32736	32741	0 %	50 %	0 %	50 %	478428163
601	NC_020512	AGA	2	6	32834	32839	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478428163
602	NC_020512	AG	3	6	32868	32873	50 %	0 %	50 %	0 %	478428163
603	NC_020512	AAG	2	6	33022	33027	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478428163
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611	NC_020512	GAA	2	6	33788	33793	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478428165
612	NC_020512	A	6	6	33792	33797	100 %	0 %	0 %	0 %	478428165
613	NC_020512	TGT	2	6	33883	33888	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478428165
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618	NC_020512	T	6	6	34117	34122	0 %	100 %	0 %	0 %	478428165
619	NC_020512	GTT	2	6	34135	34140	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478428165
620	NC_020512	TGA	2	6	34242	34247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478428165
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623	NC_020512	AG	3	6	34378	34383	50 %	0 %	50 %	0 %	478428165
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625	NC_020512	ACA	2	6	34492	34497	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478428166
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630	NC_020512	TTA	2	6	34677	34682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478428166
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