MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis IU888 complete genome

Total Repeats: 20007

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_020512	ATC	2	6	288664	288669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478428387
5502	NC_020512	TCC	2	6	288794	288799	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478428387
5503	NC_020512	GTC	2	6	288839	288844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478428387
5504	NC_020512	CTAT	2	8	288855	288862	25 %	50 %	0 %	25 %	478428387
5505	NC_020512	GAA	2	6	288868	288873	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478428387
5506	NC_020512	T	6	6	288914	288919	0 %	100 %	0 %	0 %	478428387
5507	NC_020512	ATG	2	6	288920	288925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478428387
5508	NC_020512	TA	3	6	288947	288952	50 %	50 %	0 %	0 %	478428387
5509	NC_020512	GGT	2	6	289003	289008	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478428387
5510	NC_020512	CTT	2	6	289045	289050	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428387
5511	NC_020512	GAA	2	6	289078	289083	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478428387
5512	NC_020512	ATC	2	6	289148	289153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478428387
5513	NC_020512	TAT	2	6	289179	289184	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478428387
5514	NC_020512	TGA	2	6	289188	289193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478428387
5515	NC_020512	TGA	2	6	289248	289253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478428387
5516	NC_020512	CTCA	2	8	289289	289296	25 %	25 %	0 %	50 %	478428387
5517	NC_020512	TGT	2	6	289305	289310	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478428387
5518	NC_020512	TGC	2	6	289314	289319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478428387
5519	NC_020512	CTA	2	6	289370	289375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478428387
5520	NC_020512	TG	3	6	289495	289500	0 %	50 %	50 %	0 %	478428387
5521	NC_020512	TA	3	6	289510	289515	50 %	50 %	0 %	0 %	478428387
5522	NC_020512	AACT	2	8	289531	289538	50 %	25 %	0 %	25 %	478428387
5523	NC_020512	CCT	2	6	289564	289569	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478428388
5524	NC_020512	ATG	2	6	289598	289603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478428388
5525	NC_020512	A	6	6	289664	289669	100 %	0 %	0 %	0 %	478428388
5526	NC_020512	TTA	2	6	289689	289694	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478428388
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5529	NC_020512	GTC	2	6	289832	289837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478428388
5530	NC_020512	AATT	2	8	289848	289855	50 %	50 %	0 %	0 %	478428388
5531	NC_020512	TC	3	6	289866	289871	0 %	50 %	0 %	50 %	478428388
5532	NC_020512	A	6	6	289884	289889	100 %	0 %	0 %	0 %	478428388
5533	NC_020512	TCA	2	6	290056	290061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478428388
5534	NC_020512	TCGT	2	8	290196	290203	0 %	50 %	25 %	25 %	478428388
5535	NC_020512	A	6	6	290272	290277	100 %	0 %	0 %	0 %	478428388
5536	NC_020512	TGT	2	6	290305	290310	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478428388
5537	NC_020512	TCAT	2	8	290355	290362	25 %	50 %	0 %	25 %	478428388
5538	NC_020512	ATA	2	6	290412	290417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478428388
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5540	NC_020512	GAAC	2	8	290519	290526	50 %	0 %	25 %	25 %	478428388
5541	NC_020512	AC	3	6	290538	290543	50 %	0 %	0 %	50 %	478428388
5542	NC_020512	ATT	2	6	290573	290578	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478428388
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5544	NC_020512	CTC	2	6	290634	290639	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478428388
5545	NC_020512	CTG	2	6	290753	290758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478428389
5546	NC_020512	TGC	2	6	290789	290794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478428389
5547	NC_020512	TCT	3	9	290805	290813	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428389
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5549	NC_020512	GCT	2	6	291118	291123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478428389
5550	NC_020512	TAA	2	6	291128	291133	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478428389
5551	NC_020512	CGAA	2	8	291185	291192	50 %	0 %	25 %	25 %	478428389
5552	NC_020512	CCT	2	6	291195	291200	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478428389
5553	NC_020512	TGT	2	6	291201	291206	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478428389
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5555	NC_020512	ATT	2	6	291219	291224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478428389
5556	NC_020512	AAG	2	6	291251	291256	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478428389
5557	NC_020512	CTT	2	6	291334	291339	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428389
5558	NC_020512	AGT	2	6	291372	291377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478428389
5559	NC_020512	CTT	2	6	291481	291486	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428389
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5561	NC_020512	AAGT	2	8	291531	291538	50 %	25 %	25 %	0 %	478428389
5562	NC_020512	TGCT	2	8	291551	291558	0 %	50 %	25 %	25 %	478428389
5563	NC_020512	CTG	2	6	291574	291579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478428389
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5565	NC_020512	T	6	6	291731	291736	0 %	100 %	0 %	0 %	478428389
5566	NC_020512	TTTC	2	8	291740	291747	0 %	75 %	0 %	25 %	478428389
5567	NC_020512	TA	3	6	291858	291863	50 %	50 %	0 %	0 %	478428389
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5582	NC_020512	CAA	2	6	292611	292616	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478428390
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5587	NC_020512	CAG	2	6	293134	293139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478428391
5588	NC_020512	CGACAT	2	12	293184	293195	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	478428391
5589	NC_020512	ATT	2	6	293227	293232	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478428391
5590	NC_020512	TAC	2	6	293282	293287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478428391
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5592	NC_020512	AGCA	2	8	293384	293391	50 %	0 %	25 %	25 %	478428391
5593	NC_020512	T	6	6	293452	293457	0 %	100 %	0 %	0 %	478428392
5594	NC_020512	AGAT	2	8	293482	293489	50 %	25 %	25 %	0 %	478428392
5595	NC_020512	AGCT	2	8	293506	293513	25 %	25 %	25 %	25 %	478428392
5596	NC_020512	CGAG	2	8	293530	293537	25 %	0 %	50 %	25 %	478428392
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5600	NC_020512	GAA	2	6	293859	293864	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478428392
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5604	NC_020512	TCTT	2	8	294174	294181	0 %	75 %	0 %	25 %	478428393
5605	NC_020512	TCTT	2	8	294188	294195	0 %	75 %	0 %	25 %	478428393
5606	NC_020512	TCT	2	6	294248	294253	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428393
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5609	NC_020512	ACT	2	6	294353	294358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478428393
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5622	NC_020512	CT	3	6	294845	294850	0 %	50 %	0 %	50 %	478428393
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5857	NC_020512	A	7	7	306393	306399	100 %	0 %	0 %	0 %	478428404
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5864	NC_020512	A	6	6	306584	306589	100 %	0 %	0 %	0 %	478428404
5865	NC_020512	CTC	2	6	306596	306601	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478428404
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5993	NC_020512	CAAAGA	2	12	313158	313169	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	478428411
5994	NC_020512	TTA	2	6	313201	313206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478428412
5995	NC_020512	TGGT	2	8	313369	313376	0 %	50 %	50 %	0 %	478428412
5996	NC_020512	ATT	2	6	313379	313384	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478428412
5997	NC_020512	CTTGG	2	10	313404	313413	0 %	40 %	40 %	20 %	478428412
5998	NC_020512	TTG	2	6	313469	313474	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478428412
5999	NC_020512	GCA	2	6	313480	313485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478428412
6000	NC_020512	CA	3	6	313488	313493	50 %	0 %	0 %	50 %	478428412

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