MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis IU888 complete genome

Total Repeats: 20007

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_020512	TAT	2	6	263285	263290	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478428365
5002	NC_020512	CTT	2	6	263297	263302	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428365
5003	NC_020512	AC	3	6	263419	263424	50 %	0 %	0 %	50 %	478428365
5004	NC_020512	GTTC	2	8	263486	263493	0 %	50 %	25 %	25 %	478428365
5005	NC_020512	CT	3	6	263549	263554	0 %	50 %	0 %	50 %	478428365
5006	NC_020512	GCA	2	6	263628	263633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478428365
5007	NC_020512	ATAG	2	8	263649	263656	50 %	25 %	25 %	0 %	478428365
5008	NC_020512	GCT	2	6	263700	263705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478428365
5009	NC_020512	TCG	2	6	263839	263844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478428365
5010	NC_020512	TCA	2	6	263847	263852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478428365
5011	NC_020512	CGA	2	6	263996	264001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478428365
5012	NC_020512	A	6	6	264015	264020	100 %	0 %	0 %	0 %	478428365
5013	NC_020512	GAA	2	6	264042	264047	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478428365
5014	NC_020512	CCTTT	2	10	264072	264081	0 %	60 %	0 %	40 %	478428365
5015	NC_020512	AGA	2	6	264110	264115	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478428365
5016	NC_020512	TCT	2	6	264141	264146	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428365
5017	NC_020512	A	6	6	264172	264177	100 %	0 %	0 %	0 %	478428365
5018	NC_020512	TAT	2	6	264184	264189	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478428365
5019	NC_020512	A	7	7	264271	264277	100 %	0 %	0 %	0 %	478428366
5020	NC_020512	TG	3	6	264415	264420	0 %	50 %	50 %	0 %	478428366
5021	NC_020512	GAA	2	6	264481	264486	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478428366
5022	NC_020512	AAT	2	6	264496	264501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478428366
5023	NC_020512	CAG	2	6	264518	264523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478428366
5024	NC_020512	A	7	7	264653	264659	100 %	0 %	0 %	0 %	478428366
5025	NC_020512	CAT	2	6	264774	264779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478428367
5026	NC_020512	TCT	2	6	264806	264811	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428367
5027	NC_020512	TCT	2	6	264857	264862	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428367
5028	NC_020512	AGA	2	6	264868	264873	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478428367
5029	NC_020512	CAT	2	6	264930	264935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478428367
5030	NC_020512	ACT	2	6	265312	265317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478428368
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5032	NC_020512	CTT	2	6	265541	265546	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428368
5033	NC_020512	AAT	2	6	265569	265574	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478428368
5034	NC_020512	GCT	2	6	265585	265590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478428368
5035	NC_020512	TAA	2	6	265643	265648	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478428368
5036	NC_020512	CTG	2	6	265685	265690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478428368
5037	NC_020512	TA	3	6	265702	265707	50 %	50 %	0 %	0 %	478428368
5038	NC_020512	TTC	3	9	265740	265748	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428368
5039	NC_020512	AAG	2	6	265761	265766	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478428368
5040	NC_020512	GAAA	2	8	265822	265829	75 %	0 %	25 %	0 %	478428368
5041	NC_020512	CAA	2	6	265871	265876	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478428368
5042	NC_020512	AG	4	8	265908	265915	50 %	0 %	50 %	0 %	478428368
5043	NC_020512	AGC	2	6	265920	265925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478428368
5044	NC_020512	ACT	2	6	266418	266423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478428369
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5046	NC_020512	GAA	2	6	266443	266448	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478428369
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5049	NC_020512	AGC	2	6	266615	266620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478428369
5050	NC_020512	TCA	2	6	266623	266628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478428369
5051	NC_020512	CT	3	6	266635	266640	0 %	50 %	0 %	50 %	478428369
5052	NC_020512	TCT	2	6	266661	266666	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428369
5053	NC_020512	GT	3	6	266747	266752	0 %	50 %	50 %	0 %	478428369
5054	NC_020512	CTT	2	6	266824	266829	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428369
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5056	NC_020512	TCA	2	6	266874	266879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478428369
5057	NC_020512	AAC	2	6	266889	266894	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478428369
5058	NC_020512	TTG	2	6	266912	266917	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478428369
5059	NC_020512	AAC	2	6	266964	266969	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478428369
5060	NC_020512	CTA	2	6	267053	267058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478428370
5061	NC_020512	ACA	2	6	267059	267064	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478428370
5062	NC_020512	AGA	2	6	267123	267128	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478428370
5063	NC_020512	GCT	2	6	267130	267135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478428370
5064	NC_020512	ATA	2	6	267208	267213	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478428370
5065	NC_020512	TGA	2	6	267226	267231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478428370
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5069	NC_020512	TGA	2	6	267355	267360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478428370
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5073	NC_020512	CA	3	6	267585	267590	50 %	0 %	0 %	50 %	478428370
5074	NC_020512	GCA	2	6	267712	267717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478428370
5075	NC_020512	ATACA	2	10	267755	267764	60 %	20 %	0 %	20 %	478428370
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5079	NC_020512	TCATT	2	10	268155	268164	20 %	60 %	0 %	20 %	478428371
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5090	NC_020512	TTG	2	6	268674	268679	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478428371
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5094	NC_020512	TTCT	2	8	269169	269176	0 %	75 %	0 %	25 %	478428372
5095	NC_020512	GA	3	6	269231	269236	50 %	0 %	50 %	0 %	478428372
5096	NC_020512	TAAAA	2	10	269262	269271	80 %	20 %	0 %	0 %	478428372
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5100	NC_020512	AG	3	6	269419	269424	50 %	0 %	50 %	0 %	478428372
5101	NC_020512	ATT	2	6	269511	269516	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478428372
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5104	NC_020512	AAG	2	6	269639	269644	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478428372
5105	NC_020512	A	7	7	269661	269667	100 %	0 %	0 %	0 %	478428372
5106	NC_020512	CAA	2	6	269741	269746	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478428372
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5109	NC_020512	GAGT	2	8	270146	270153	25 %	25 %	50 %	0 %	478428372
5110	NC_020512	TTAA	2	8	270178	270185	50 %	50 %	0 %	0 %	478428372
5111	NC_020512	ATG	2	6	270212	270217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478428372
5112	NC_020512	AAGTGT	2	12	270315	270326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478428372
5113	NC_020512	GTTC	2	8	270334	270341	0 %	50 %	25 %	25 %	478428372
5114	NC_020512	ATTT	2	8	270452	270459	25 %	75 %	0 %	0 %	478428372
5115	NC_020512	GGA	2	6	270460	270465	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478428372
5116	NC_020512	ATTT	2	8	270491	270498	25 %	75 %	0 %	0 %	478428372
5117	NC_020512	A	6	6	270517	270522	100 %	0 %	0 %	0 %	478428372
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5121	NC_020512	ACT	2	6	270689	270694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478428372
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5123	NC_020512	A	7	7	270799	270805	100 %	0 %	0 %	0 %	478428372
5124	NC_020512	TAA	2	6	270843	270848	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478428372
5125	NC_020512	CTA	2	6	270911	270916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478428372
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5127	NC_020512	TCTA	2	8	270997	271004	25 %	50 %	0 %	25 %	478428372
5128	NC_020512	TTA	2	6	271009	271014	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478428372
5129	NC_020512	A	6	6	271018	271023	100 %	0 %	0 %	0 %	478428372
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5232	NC_020512	ATCCT	2	10	275429	275438	20 %	40 %	0 %	40 %	478428376
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5368	NC_020512	TTC	2	6	281514	281519	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428381
5369	NC_020512	AGA	2	6	281550	281555	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478428381
5370	NC_020512	GAA	2	6	281601	281606	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478428381
5371	NC_020512	CTT	2	6	281609	281614	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428381
5372	NC_020512	TCC	2	6	281784	281789	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478428381
5373	NC_020512	CAG	2	6	281792	281797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478428381
5374	NC_020512	GAA	2	6	281897	281902	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478428381
5375	NC_020512	CACGCG	2	12	282051	282062	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	478428381
5376	NC_020512	ATT	3	9	282075	282083	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478428381
5377	NC_020512	TTTCTT	2	12	282230	282241	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	478428381
5378	NC_020512	TCT	2	6	282354	282359	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428382
5379	NC_020512	TGC	2	6	282377	282382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478428382
5380	NC_020512	TGTT	2	8	282405	282412	0 %	75 %	25 %	0 %	478428382
5381	NC_020512	TTG	2	6	282418	282423	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478428382
5382	NC_020512	AGA	2	6	282442	282447	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478428382
5383	NC_020512	AAC	2	6	282500	282505	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478428382
5384	NC_020512	CAT	2	6	282508	282513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478428382
5385	NC_020512	CTT	2	6	282525	282530	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428382
5386	NC_020512	GTT	2	6	282537	282542	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478428382
5387	NC_020512	CAG	2	6	282570	282575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478428382
5388	NC_020512	CTG	2	6	282583	282588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478428382
5389	NC_020512	GAA	2	6	282618	282623	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478428382
5390	NC_020512	TATC	2	8	282693	282700	25 %	50 %	0 %	25 %	478428382
5391	NC_020512	AGCT	2	8	282714	282721	25 %	25 %	25 %	25 %	478428382
5392	NC_020512	CTG	2	6	282880	282885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478428382
5393	NC_020512	ACG	2	6	282919	282924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478428382
5394	NC_020512	TAA	2	6	282982	282987	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478428382
5395	NC_020512	ATA	2	6	282989	282994	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478428382
5396	NC_020512	ATA	2	6	283044	283049	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478428382
5397	NC_020512	TGC	2	6	283051	283056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478428382
5398	NC_020512	GGA	2	6	283280	283285	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478428382
5399	NC_020512	AGA	2	6	283327	283332	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478428382
5400	NC_020512	GAG	2	6	283407	283412	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478428382
5401	NC_020512	GTT	2	6	283417	283422	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478428382
5402	NC_020512	TTC	2	6	283484	283489	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428382
5403	NC_020512	TCT	2	6	283568	283573	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428382
5404	NC_020512	AGT	2	6	283582	283587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478428382
5405	NC_020512	GCT	2	6	283614	283619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478428382
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5408	NC_020512	TAT	2	6	283677	283682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478428382
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5410	NC_020512	CT	3	6	283770	283775	0 %	50 %	0 %	50 %	478428382
5411	NC_020512	ATA	2	6	283813	283818	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478428382
5412	NC_020512	CT	3	6	283909	283914	0 %	50 %	0 %	50 %	478428382
5413	NC_020512	TCT	2	6	283949	283954	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428382
5414	NC_020512	GTA	2	6	284041	284046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478428382
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5418	NC_020512	ATG	2	6	284187	284192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478428382
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5424	NC_020512	TAC	2	6	284542	284547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478428382
5425	NC_020512	GCT	2	6	284592	284597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478428382
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5429	NC_020512	ATTC	2	8	284701	284708	25 %	50 %	0 %	25 %	478428382
5430	NC_020512	CAT	2	6	285020	285025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478428383
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5432	NC_020512	TTC	2	6	285109	285114	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428383
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5434	NC_020512	CTG	2	6	285189	285194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478428383
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5437	NC_020512	CAC	2	6	285505	285510	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478428383
5438	NC_020512	CCT	2	6	285539	285544	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478428383
5439	NC_020512	CTCC	2	8	285587	285594	0 %	25 %	0 %	75 %	478428383
5440	NC_020512	AAGC	2	8	285609	285616	50 %	0 %	25 %	25 %	478428383
5441	NC_020512	ATG	2	6	285626	285631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478428383
5442	NC_020512	T	6	6	285682	285687	0 %	100 %	0 %	0 %	478428383
5443	NC_020512	CTC	2	6	285688	285693	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478428383
5444	NC_020512	GAT	2	6	285737	285742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478428383
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5446	NC_020512	AG	3	6	285810	285815	50 %	0 %	50 %	0 %	478428383
5447	NC_020512	CTT	2	6	286113	286118	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428384
5448	NC_020512	ACT	2	6	286142	286147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478428384
5449	NC_020512	GCTGT	2	10	286155	286164	0 %	40 %	40 %	20 %	478428384
5450	NC_020512	GTC	2	6	286223	286228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478428384
5451	NC_020512	T	6	6	286242	286247	0 %	100 %	0 %	0 %	478428384
5452	NC_020512	ACT	2	6	286270	286275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478428384
5453	NC_020512	ACT	2	6	286339	286344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478428384
5454	NC_020512	TGC	2	6	286375	286380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478428384
5455	NC_020512	T	7	7	286385	286391	0 %	100 %	0 %	0 %	478428384
5456	NC_020512	CTCCTA	2	12	286392	286403	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	478428384
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5459	NC_020512	ATC	2	6	286617	286622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478428384
5460	NC_020512	TGGC	2	8	286627	286634	0 %	25 %	50 %	25 %	478428384
5461	NC_020512	TTCGA	2	10	286646	286655	20 %	40 %	20 %	20 %	478428384
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5463	NC_020512	AG	3	6	286688	286693	50 %	0 %	50 %	0 %	478428384
5464	NC_020512	TTG	2	6	286695	286700	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478428384
5465	NC_020512	ACT	2	6	286728	286733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478428384
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5467	NC_020512	TTG	2	6	286770	286775	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478428385
5468	NC_020512	T	6	6	286802	286807	0 %	100 %	0 %	0 %	478428385
5469	NC_020512	CTTTT	2	10	286959	286968	0 %	80 %	0 %	20 %	478428385
5470	NC_020512	T	7	7	286965	286971	0 %	100 %	0 %	0 %	478428385
5471	NC_020512	GAA	2	6	287019	287024	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478428385
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5473	NC_020512	ATT	2	6	287113	287118	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478428385
5474	NC_020512	AAC	2	6	287148	287153	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478428385
5475	NC_020512	GAA	2	6	287177	287182	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478428385
5476	NC_020512	GAA	2	6	287255	287260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478428385
5477	NC_020512	T	6	6	287264	287269	0 %	100 %	0 %	0 %	478428385
5478	NC_020512	TTC	2	6	287288	287293	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428385
5479	NC_020512	TGT	2	6	287320	287325	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478428385
5480	NC_020512	CTT	2	6	287364	287369	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428385
5481	NC_020512	TTTG	2	8	287395	287402	0 %	75 %	25 %	0 %	478428385
5482	NC_020512	TCTTT	2	10	287403	287412	0 %	80 %	0 %	20 %	478428385
5483	NC_020512	TTTA	2	8	287423	287430	25 %	75 %	0 %	0 %	478428385
5484	NC_020512	A	8	8	287511	287518	100 %	0 %	0 %	0 %	478428385
5485	NC_020512	TTA	2	6	287717	287722	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478428386
5486	NC_020512	T	6	6	287728	287733	0 %	100 %	0 %	0 %	478428386
5487	NC_020512	TTC	2	6	287759	287764	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428386
5488	NC_020512	GAG	2	6	287806	287811	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478428386
5489	NC_020512	CGA	2	6	287814	287819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478428386
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