MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis IU824 complete genome

Total Repeats: 19948

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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3502	NC_020511	TCTA	2	8	185771	185778	25 %	50 %	0 %	25 %	471328332
3503	NC_020511	TGC	2	6	185972	185977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471328333
3504	NC_020511	CA	3	6	185993	185998	50 %	0 %	0 %	50 %	471328333
3505	NC_020511	AGA	2	6	186108	186113	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471328333
3506	NC_020511	T	7	7	186464	186470	0 %	100 %	0 %	0 %	471328334
3507	NC_020511	TCT	2	6	186488	186493	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471328334
3508	NC_020511	TG	3	6	186498	186503	0 %	50 %	50 %	0 %	471328334
3509	NC_020511	GTC	2	6	186589	186594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471328334
3510	NC_020511	ATT	2	6	186659	186664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	471328334
3511	NC_020511	TCT	2	6	186678	186683	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471328334
3512	NC_020511	CTT	2	6	186694	186699	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471328334
3513	NC_020511	AAGC	2	8	186732	186739	50 %	0 %	25 %	25 %	471328334
3514	NC_020511	GAA	2	6	186762	186767	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471328334
3515	NC_020511	AAC	2	6	186839	186844	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	471328334
3516	NC_020511	TA	3	6	186916	186921	50 %	50 %	0 %	0 %	471328334
3517	NC_020511	CTT	2	6	186937	186942	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471328334
3518	NC_020511	TAG	2	6	186943	186948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471328334
3519	NC_020511	CAT	2	6	186987	186992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471328334
3520	NC_020511	T	6	6	186994	186999	0 %	100 %	0 %	0 %	471328334
3521	NC_020511	GCTT	2	8	187013	187020	0 %	50 %	25 %	25 %	471328334
3522	NC_020511	CAC	2	6	187045	187050	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	471328334
3523	NC_020511	GAA	2	6	187080	187085	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471328334
3524	NC_020511	AAG	2	6	187186	187191	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471328334
3525	NC_020511	TGT	2	6	187208	187213	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	471328334
3526	NC_020511	ACGAT	2	10	187280	187289	40 %	20 %	20 %	20 %	471328334
3527	NC_020511	TTTA	2	8	187298	187305	25 %	75 %	0 %	0 %	471328334
3528	NC_020511	AAG	2	6	187309	187314	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471328334
3529	NC_020511	AGA	2	6	187394	187399	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471328334
3530	NC_020511	CTT	2	6	187431	187436	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471328334
3531	NC_020511	A	6	6	187449	187454	100 %	0 %	0 %	0 %	471328334
3532	NC_020511	AGG	2	6	187477	187482	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	471328334
3533	NC_020511	GCTT	2	8	187505	187512	0 %	50 %	25 %	25 %	471328334
3534	NC_020511	T	7	7	187511	187517	0 %	100 %	0 %	0 %	471328334
3535	NC_020511	A	6	6	187552	187557	100 %	0 %	0 %	0 %	471328334
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3538	NC_020511	GCTT	2	8	187946	187953	0 %	50 %	25 %	25 %	471328334
3539	NC_020511	TAG	2	6	187984	187989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471328334
3540	NC_020511	GAT	2	6	188022	188027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471328334
3541	NC_020511	T	7	7	188027	188033	0 %	100 %	0 %	0 %	471328334
3542	NC_020511	TTA	2	6	188057	188062	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	471328334
3543	NC_020511	TCC	2	6	188125	188130	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	471328335
3544	NC_020511	ACA	3	9	188131	188139	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	471328335
3545	NC_020511	AGT	2	6	188149	188154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471328335
3546	NC_020511	AAAC	2	8	188174	188181	75 %	0 %	0 %	25 %	471328335
3547	NC_020511	TGC	2	6	188240	188245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471328335
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3549	NC_020511	AGT	2	6	188331	188336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471328335
3550	NC_020511	TTG	2	6	188339	188344	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	471328335
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3552	NC_020511	CAC	2	6	188942	188947	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	471328336
3553	NC_020511	TAC	2	6	189023	189028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471328336
3554	NC_020511	CAT	2	6	189039	189044	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471328336
3555	NC_020511	GGT	2	6	189086	189091	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471328336
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3557	NC_020511	CCT	2	6	189162	189167	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	471328336
3558	NC_020511	CTC	2	6	189255	189260	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	471328336
3559	NC_020511	TTA	2	6	189279	189284	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	471328336
3560	NC_020511	CAA	2	6	191399	191404	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	471328337
3561	NC_020511	ACGAT	2	10	191405	191414	40 %	20 %	20 %	20 %	471328337
3562	NC_020511	ACT	2	6	191557	191562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471328337
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3565	NC_020511	TTC	2	6	191815	191820	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471328337
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3569	NC_020511	TTG	2	6	192004	192009	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	471328337
3570	NC_020511	TGA	2	6	192023	192028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471328337
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3572	NC_020511	TA	3	6	192098	192103	50 %	50 %	0 %	0 %	471328337
3573	NC_020511	TTA	2	6	192145	192150	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	471328337
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3577	NC_020511	TCA	2	6	192343	192348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471328337
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3580	NC_020511	ATTTGC	2	12	192573	192584	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	471328337
3581	NC_020511	CTGG	2	8	193043	193050	0 %	25 %	50 %	25 %	471328338
3582	NC_020511	AAAAG	2	10	193083	193092	80 %	0 %	20 %	0 %	471328338
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3584	NC_020511	TATCA	2	10	193156	193165	40 %	40 %	0 %	20 %	471328338
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3586	NC_020511	AG	3	6	193198	193203	50 %	0 %	50 %	0 %	471328338
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3594	NC_020511	TGCT	2	8	193934	193941	0 %	50 %	25 %	25 %	471328339
3595	NC_020511	ACA	2	6	193986	193991	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	471328339
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3597	NC_020511	GTA	2	6	194038	194043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471328339
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3600	NC_020511	CAT	2	6	194371	194376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471328339
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3602	NC_020511	GGA	2	6	194419	194424	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	471328339
3603	NC_020511	TTC	2	6	194433	194438	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471328339
3604	NC_020511	GCA	2	6	194449	194454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471328339
3605	NC_020511	TCT	2	6	194502	194507	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471328339
3606	NC_020511	ACTC	2	8	194536	194543	25 %	25 %	0 %	50 %	471328339
3607	NC_020511	GATTA	2	10	194555	194564	40 %	40 %	20 %	0 %	471328339
3608	NC_020511	T	6	6	194652	194657	0 %	100 %	0 %	0 %	471328339
3609	NC_020511	ATT	2	6	194680	194685	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	471328339
3610	NC_020511	ATC	2	6	194803	194808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471328339
3611	NC_020511	AAAC	2	8	194852	194859	75 %	0 %	0 %	25 %	471328340
3612	NC_020511	GGC	2	6	194917	194922	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471328340
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3615	NC_020511	TA	3	6	195108	195113	50 %	50 %	0 %	0 %	471328340
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3618	NC_020511	T	6	6	195236	195241	0 %	100 %	0 %	0 %	471328340
3619	NC_020511	TAT	2	6	195344	195349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	471328340
3620	NC_020511	GA	3	6	195367	195372	50 %	0 %	50 %	0 %	471328340
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3622	NC_020511	TAGA	2	8	195435	195442	50 %	25 %	25 %	0 %	471328340
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3995	NC_020511	GA	3	6	214723	214728	50 %	0 %	50 %	0 %	471328359
3996	NC_020511	T	6	6	214743	214748	0 %	100 %	0 %	0 %	471328359
3997	NC_020511	AGG	2	6	214767	214772	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	471328359
3998	NC_020511	CATT	2	8	214789	214796	25 %	50 %	0 %	25 %	471328359
3999	NC_020511	AGA	2	6	214823	214828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471328359
4000	NC_020511	CAA	2	6	214836	214841	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	471328359

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