MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis IU824 complete genome

Total Repeats: 19948

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2502	NC_020511	TGA	2	6	132586	132591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471328287
2503	NC_020511	TGA	2	6	132640	132645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471328287
2504	NC_020511	AAG	2	6	132681	132686	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471328287
2505	NC_020511	AGCA	2	8	132699	132706	50 %	0 %	25 %	25 %	471328287
2506	NC_020511	GAA	2	6	132794	132799	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471328287
2507	NC_020511	AAAAG	2	10	132820	132829	80 %	0 %	20 %	0 %	471328287
2508	NC_020511	CTT	2	6	132924	132929	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471328287
2509	NC_020511	GGA	2	6	132931	132936	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	471328287
2510	NC_020511	TGA	2	6	133000	133005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471328287
2511	NC_020511	GTT	2	6	133022	133027	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	471328287
2512	NC_020511	A	6	6	133053	133058	100 %	0 %	0 %	0 %	471328287
2513	NC_020511	GGAG	2	8	133063	133070	25 %	0 %	75 %	0 %	471328287
2514	NC_020511	GGA	2	6	133093	133098	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	471328287
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2516	NC_020511	CAGT	2	8	133143	133150	25 %	25 %	25 %	25 %	471328287
2517	NC_020511	GATTC	2	10	133151	133160	20 %	40 %	20 %	20 %	471328287
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2521	NC_020511	GAT	2	6	133291	133296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471328287
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2523	NC_020511	TCC	2	6	133354	133359	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	471328287
2524	NC_020511	GAA	2	6	133376	133381	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471328287
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2526	NC_020511	TC	3	6	133390	133395	0 %	50 %	0 %	50 %	471328287
2527	NC_020511	AAG	2	6	133405	133410	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471328287
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2529	NC_020511	TGA	2	6	133435	133440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471328287
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2531	NC_020511	TGA	2	6	133489	133494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471328287
2532	NC_020511	AAG	2	6	133514	133519	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471328287
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2544	NC_020511	GCGA	2	8	134081	134088	25 %	0 %	50 %	25 %	471328288
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2557	NC_020511	TTC	2	6	134923	134928	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471328288
2558	NC_020511	GGC	2	6	135023	135028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471328288
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2561	NC_020511	GTT	2	6	135128	135133	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	471328288
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2569	NC_020511	GTT	2	6	135422	135427	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	471328288
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2571	NC_020511	CT	3	6	135448	135453	0 %	50 %	0 %	50 %	471328288
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2589	NC_020511	ATTGT	2	10	136468	136477	20 %	60 %	20 %	0 %	471328290
2590	NC_020511	TGG	2	6	136517	136522	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471328290
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2593	NC_020511	GCTA	2	8	136732	136739	25 %	25 %	25 %	25 %	471328291
2594	NC_020511	CGC	2	6	136765	136770	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471328291
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2602	NC_020511	GGAT	2	8	136922	136929	25 %	25 %	50 %	0 %	471328291
2603	NC_020511	CTG	2	6	137043	137048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471328292
2604	NC_020511	CAAT	2	8	137071	137078	50 %	25 %	0 %	25 %	471328292
2605	NC_020511	AAGC	2	8	137125	137132	50 %	0 %	25 %	25 %	471328292
2606	NC_020511	TTTG	2	8	137151	137158	0 %	75 %	25 %	0 %	471328292
2607	NC_020511	GCG	2	6	137194	137199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471328292
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2610	NC_020511	CTG	2	6	137236	137241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471328292
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2621	NC_020511	ATAA	2	8	137500	137507	75 %	25 %	0 %	0 %	471328292
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2994	NC_020511	CCCA	2	8	157223	157230	25 %	0 %	0 %	75 %	471328313
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2996	NC_020511	ATG	2	6	157280	157285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471328313
2997	NC_020511	TAA	2	6	157328	157333	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	471328313
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2999	NC_020511	AGA	2	6	157393	157398	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471328313
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