MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis IU824 complete genome

Total Repeats: 19948

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_020511	GAA	2	6	27809	27814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471328197
502	NC_020511	GGGC	2	8	27875	27882	0 %	0 %	75 %	25 %	471328197
503	NC_020511	T	6	6	27891	27896	0 %	100 %	0 %	0 %	471328197
504	NC_020511	TGA	2	6	27904	27909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471328197
505	NC_020511	GGAGA	2	10	27912	27921	40 %	0 %	60 %	0 %	471328197
506	NC_020511	A	7	7	27962	27968	100 %	0 %	0 %	0 %	471328197
507	NC_020511	AAG	2	6	27979	27984	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471328197
508	NC_020511	T	6	6	27999	28004	0 %	100 %	0 %	0 %	471328197
509	NC_020511	A	8	8	28096	28103	100 %	0 %	0 %	0 %	471328198
510	NC_020511	TTC	2	6	28140	28145	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471328198
511	NC_020511	GTTT	2	8	28158	28165	0 %	75 %	25 %	0 %	471328198
512	NC_020511	CAGA	2	8	28180	28187	50 %	0 %	25 %	25 %	471328198
513	NC_020511	TTC	2	6	28258	28263	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471328198
514	NC_020511	AAG	2	6	28273	28278	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471328198
515	NC_020511	TTC	2	6	28373	28378	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471328198
516	NC_020511	AAG	2	6	28387	28392	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471328198
517	NC_020511	AAG	2	6	28405	28410	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471328198
518	NC_020511	A	6	6	28411	28416	100 %	0 %	0 %	0 %	471328198
519	NC_020511	GAA	2	6	28643	28648	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471328199
520	NC_020511	ATCCG	2	10	28663	28672	20 %	20 %	20 %	40 %	471328199
521	NC_020511	TTC	2	6	28776	28781	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471328199
522	NC_020511	TAG	2	6	28824	28829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471328199
523	NC_020511	AGA	2	6	28837	28842	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471328199
524	NC_020511	GAT	3	9	28919	28927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471328199
525	NC_020511	GAG	2	6	28962	28967	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	471328199
526	NC_020511	TG	3	6	28994	28999	0 %	50 %	50 %	0 %	471328199
527	NC_020511	GCA	2	6	29018	29023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471328199
528	NC_020511	TC	3	6	29047	29052	0 %	50 %	0 %	50 %	471328199
529	NC_020511	AGGGT	2	10	29181	29190	20 %	20 %	60 %	0 %	471328199
530	NC_020511	TTC	2	6	29217	29222	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471328199
531	NC_020511	CAG	2	6	29229	29234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471328199
532	NC_020511	GAA	2	6	29243	29248	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471328199
533	NC_020511	TGA	2	6	29257	29262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471328199
534	NC_020511	TTC	2	6	29290	29295	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471328199
535	NC_020511	GC	4	8	29461	29468	0 %	0 %	50 %	50 %	471328199
536	NC_020511	AAG	2	6	29469	29474	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471328199
537	NC_020511	TA	3	6	29583	29588	50 %	50 %	0 %	0 %	471328199
538	NC_020511	GAA	2	6	29672	29677	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471328199
539	NC_020511	TGT	2	6	29704	29709	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	471328200
540	NC_020511	TCT	2	6	29772	29777	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471328200
541	NC_020511	ACA	2	6	30000	30005	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	471328200
542	NC_020511	ATG	2	6	30010	30015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471328200
543	NC_020511	CTTT	2	8	30152	30159	0 %	75 %	0 %	25 %	471328200
544	NC_020511	TTTG	2	8	30167	30174	0 %	75 %	25 %	0 %	471328200
545	NC_020511	TTGT	2	8	30202	30209	0 %	75 %	25 %	0 %	471328200
546	NC_020511	CCTAT	2	10	30221	30230	20 %	40 %	0 %	40 %	471328200
547	NC_020511	T	6	6	30237	30242	0 %	100 %	0 %	0 %	471328200
548	NC_020511	ATC	2	6	30316	30321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471328200
549	NC_020511	TGGC	2	8	30365	30372	0 %	25 %	50 %	25 %	471328200
550	NC_020511	T	8	8	30471	30478	0 %	100 %	0 %	0 %	471328200
551	NC_020511	ATG	2	6	30496	30501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471328200
552	NC_020511	GA	3	6	30534	30539	50 %	0 %	50 %	0 %	471328200
553	NC_020511	AG	3	6	30632	30637	50 %	0 %	50 %	0 %	471328201
554	NC_020511	GTT	2	6	30713	30718	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	471328201
555	NC_020511	GAA	2	6	30722	30727	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471328201
556	NC_020511	TC	3	6	30741	30746	0 %	50 %	0 %	50 %	471328201
557	NC_020511	TCT	2	6	30788	30793	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471328201
558	NC_020511	ACT	2	6	30878	30883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471328201
559	NC_020511	TTC	2	6	30906	30911	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471328201
560	NC_020511	AAAG	2	8	30925	30932	75 %	0 %	25 %	0 %	471328201
561	NC_020511	CCT	2	6	30942	30947	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	471328201
562	NC_020511	AAAC	2	8	30995	31002	75 %	0 %	0 %	25 %	471328201
563	NC_020511	T	6	6	31012	31017	0 %	100 %	0 %	0 %	471328201
564	NC_020511	AAGGA	2	10	31021	31030	60 %	0 %	40 %	0 %	471328201
565	NC_020511	GGC	2	6	31048	31053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471328201
566	NC_020511	GAT	2	6	31127	31132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471328201
567	NC_020511	GATG	2	8	31138	31145	25 %	25 %	50 %	0 %	471328201
568	NC_020511	TAG	2	6	31149	31154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471328201
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570	NC_020511	TAA	2	6	31333	31338	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	471328201
571	NC_020511	GA	3	6	31362	31367	50 %	0 %	50 %	0 %	471328201
572	NC_020511	AGA	2	6	31492	31497	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471328201
573	NC_020511	TCG	2	6	31555	31560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471328201
574	NC_020511	ATG	2	6	31589	31594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471328201
575	NC_020511	TGG	2	6	31603	31608	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471328201
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577	NC_020511	ATT	2	6	31670	31675	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	471328201
578	NC_020511	ATG	2	6	31793	31798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471328201
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581	NC_020511	GA	3	6	31830	31835	50 %	0 %	50 %	0 %	471328201
582	NC_020511	A	7	7	31853	31859	100 %	0 %	0 %	0 %	471328201
583	NC_020511	ACA	2	6	31899	31904	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	471328202
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586	NC_020511	GAGCT	2	10	32060	32069	20 %	20 %	40 %	20 %	471328202
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588	NC_020511	A	6	6	32165	32170	100 %	0 %	0 %	0 %	471328202
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593	NC_020511	AAG	2	6	32460	32465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471328203
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595	NC_020511	CTT	2	6	32506	32511	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471328203
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598	NC_020511	GAG	2	6	32614	32619	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	471328203
599	NC_020511	GCG	2	6	32656	32661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471328203
600	NC_020511	CT	3	6	32736	32741	0 %	50 %	0 %	50 %	471328203
601	NC_020511	AGA	2	6	32834	32839	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471328203
602	NC_020511	AG	3	6	32868	32873	50 %	0 %	50 %	0 %	471328203
603	NC_020511	AAG	2	6	33022	33027	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471328203
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611	NC_020511	GAA	2	6	33788	33793	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471328205
612	NC_020511	A	6	6	33792	33797	100 %	0 %	0 %	0 %	471328205
613	NC_020511	TGT	2	6	33883	33888	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	471328205
614	NC_020511	TGA	2	6	33934	33939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471328205
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618	NC_020511	T	6	6	34117	34122	0 %	100 %	0 %	0 %	471328205
619	NC_020511	GTT	2	6	34135	34140	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	471328205
620	NC_020511	TGA	2	6	34242	34247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471328205
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623	NC_020511	AG	3	6	34378	34383	50 %	0 %	50 %	0 %	471328205
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625	NC_020511	ACA	2	6	34492	34497	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	471328206
626	NC_020511	AG	3	6	34516	34521	50 %	0 %	50 %	0 %	471328206
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