MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis IU824 complete genome

Total Repeats: 19948

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_020511	TAA	2	6	265643	265648	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	471328407
5002	NC_020511	CTG	2	6	265685	265690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471328407
5003	NC_020511	TA	3	6	265702	265707	50 %	50 %	0 %	0 %	471328407
5004	NC_020511	TTC	3	9	265740	265748	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471328407
5005	NC_020511	AAG	2	6	265761	265766	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471328407
5006	NC_020511	GAAA	2	8	265822	265829	75 %	0 %	25 %	0 %	471328407
5007	NC_020511	CAA	2	6	265871	265876	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	471328407
5008	NC_020511	AG	4	8	265908	265915	50 %	0 %	50 %	0 %	471328407
5009	NC_020511	AGC	2	6	265920	265925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471328407
5010	NC_020511	ACT	2	6	266418	266423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471328408
5011	NC_020511	T	6	6	266423	266428	0 %	100 %	0 %	0 %	471328408
5012	NC_020511	GAA	2	6	266443	266448	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471328408
5013	NC_020511	CCT	2	6	266458	266463	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	471328408
5014	NC_020511	ACA	2	6	266559	266564	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	471328408
5015	NC_020511	AGC	2	6	266615	266620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471328408
5016	NC_020511	TCA	2	6	266623	266628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471328408
5017	NC_020511	CT	3	6	266635	266640	0 %	50 %	0 %	50 %	471328408
5018	NC_020511	TCT	2	6	266661	266666	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471328408
5019	NC_020511	GT	3	6	266747	266752	0 %	50 %	50 %	0 %	471328408
5020	NC_020511	CTT	2	6	266824	266829	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471328408
5021	NC_020511	ATA	2	6	266844	266849	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	471328408
5022	NC_020511	TCA	2	6	266874	266879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471328408
5023	NC_020511	AAC	2	6	266889	266894	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	471328408
5024	NC_020511	TTG	2	6	266912	266917	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	471328408
5025	NC_020511	AAC	2	6	266964	266969	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	471328408
5026	NC_020511	CTA	2	6	267053	267058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471328409
5027	NC_020511	ACA	2	6	267059	267064	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	471328409
5028	NC_020511	AGA	2	6	267123	267128	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471328409
5029	NC_020511	GCT	2	6	267130	267135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471328409
5030	NC_020511	ATA	2	6	267208	267213	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	471328409
5031	NC_020511	TGA	2	6	267226	267231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471328409
5032	NC_020511	GCA	2	6	267289	267294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471328409
5033	NC_020511	TCG	2	6	267303	267308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471328409
5034	NC_020511	CTT	2	6	267326	267331	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471328409
5035	NC_020511	TGA	2	6	267355	267360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471328409
5036	NC_020511	CCT	2	6	267397	267402	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	471328409
5037	NC_020511	CAA	2	6	267488	267493	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	471328409
5038	NC_020511	AC	3	6	267521	267526	50 %	0 %	0 %	50 %	471328409
5039	NC_020511	CA	3	6	267585	267590	50 %	0 %	0 %	50 %	471328409
5040	NC_020511	GCA	2	6	267712	267717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471328409
5041	NC_020511	ATACA	2	10	267755	267764	60 %	20 %	0 %	20 %	471328409
5042	NC_020511	GCC	2	6	267811	267816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471328409
5043	NC_020511	CTC	2	6	267840	267845	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	471328409
5044	NC_020511	T	6	6	267914	267919	0 %	100 %	0 %	0 %	471328409
5045	NC_020511	TCATT	2	10	268155	268164	20 %	60 %	0 %	20 %	471328410
5046	NC_020511	A	6	6	268168	268173	100 %	0 %	0 %	0 %	471328410
5047	NC_020511	CAG	2	6	268197	268202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471328410
5048	NC_020511	A	6	6	268203	268208	100 %	0 %	0 %	0 %	471328410
5049	NC_020511	ATT	2	6	268219	268224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	471328410
5050	NC_020511	TC	3	6	268320	268325	0 %	50 %	0 %	50 %	471328410
5051	NC_020511	TTC	3	9	268363	268371	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471328410
5052	NC_020511	TTG	2	6	268380	268385	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	471328410
5053	NC_020511	ACTT	2	8	268455	268462	25 %	50 %	0 %	25 %	471328410
5054	NC_020511	AGC	2	6	268512	268517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471328410
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5056	NC_020511	TTG	2	6	268674	268679	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	471328410
5057	NC_020511	GAA	2	6	268710	268715	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471328410
5058	NC_020511	TAA	2	6	269096	269101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	471328411
5059	NC_020511	A	7	7	269116	269122	100 %	0 %	0 %	0 %	471328411
5060	NC_020511	TTCT	2	8	269169	269176	0 %	75 %	0 %	25 %	471328411
5061	NC_020511	GA	3	6	269231	269236	50 %	0 %	50 %	0 %	471328411
5062	NC_020511	TAAAA	2	10	269262	269271	80 %	20 %	0 %	0 %	471328411
5063	NC_020511	GTT	2	6	269286	269291	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	471328411
5064	NC_020511	TGA	2	6	269307	269312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471328411
5065	NC_020511	TC	3	6	269387	269392	0 %	50 %	0 %	50 %	471328411
5066	NC_020511	AG	3	6	269419	269424	50 %	0 %	50 %	0 %	471328411
5067	NC_020511	ATT	2	6	269511	269516	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	471328411
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5071	NC_020511	A	7	7	269661	269667	100 %	0 %	0 %	0 %	471328411
5072	NC_020511	CAA	2	6	269741	269746	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	471328411
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5076	NC_020511	TTAA	2	8	270178	270185	50 %	50 %	0 %	0 %	471328411
5077	NC_020511	ATG	2	6	270212	270217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471328411
5078	NC_020511	AAGTGT	2	12	270315	270326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471328411
5079	NC_020511	GTTC	2	8	270334	270341	0 %	50 %	25 %	25 %	471328411
5080	NC_020511	ATTT	2	8	270452	270459	25 %	75 %	0 %	0 %	471328411
5081	NC_020511	GGA	2	6	270460	270465	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	471328411
5082	NC_020511	ATTT	2	8	270491	270498	25 %	75 %	0 %	0 %	471328411
5083	NC_020511	A	6	6	270517	270522	100 %	0 %	0 %	0 %	471328411
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5090	NC_020511	TAA	2	6	270843	270848	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	471328411
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5093	NC_020511	TCTA	2	8	270997	271004	25 %	50 %	0 %	25 %	471328411
5094	NC_020511	TTA	2	6	271009	271014	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	471328411
5095	NC_020511	A	6	6	271018	271023	100 %	0 %	0 %	0 %	471328411
5096	NC_020511	AAC	3	9	271071	271079	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	471328411
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5100	NC_020511	AGG	2	6	271188	271193	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	471328411
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5103	NC_020511	AGA	2	6	271293	271298	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471328411
5104	NC_020511	ATG	2	6	271357	271362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471328411
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5106	NC_020511	AAT	2	6	271420	271425	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	471328411
5107	NC_020511	A	6	6	271427	271432	100 %	0 %	0 %	0 %	471328411
5108	NC_020511	TTC	2	6	271450	271455	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471328411
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5110	NC_020511	TTA	2	6	271560	271565	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	471328412
5111	NC_020511	CTAC	2	8	271590	271597	25 %	25 %	0 %	50 %	471328412
5112	NC_020511	AGA	2	6	271652	271657	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471328412
5113	NC_020511	A	6	6	271671	271676	100 %	0 %	0 %	0 %	471328412
5114	NC_020511	CTG	2	6	271681	271686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471328412
5115	NC_020511	GGA	2	6	271733	271738	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	471328412
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5117	NC_020511	GAC	2	6	271770	271775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471328412
5118	NC_020511	A	7	7	271820	271826	100 %	0 %	0 %	0 %	471328412
5119	NC_020511	ATCT	2	8	271834	271841	25 %	50 %	0 %	25 %	471328412
5120	NC_020511	ACA	2	6	271849	271854	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	471328412
5121	NC_020511	GAA	2	6	271920	271925	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471328412
5122	NC_020511	A	6	6	271929	271934	100 %	0 %	0 %	0 %	471328412
5123	NC_020511	AAG	2	6	271957	271962	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471328412
5124	NC_020511	TTC	2	6	271972	271977	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471328412
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5132	NC_020511	ATC	2	6	272258	272263	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471328413
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5230	NC_020511	A	6	6	276651	276656	100 %	0 %	0 %	0 %	471328417
5231	NC_020511	TGGT	2	8	276740	276747	0 %	50 %	50 %	0 %	471328417
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5240	NC_020511	CT	3	6	277068	277073	0 %	50 %	0 %	50 %	471328417
5241	NC_020511	GGA	2	6	277095	277100	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	471328417
5242	NC_020511	AAAG	2	8	277109	277116	75 %	0 %	25 %	0 %	471328417
5243	NC_020511	CTC	2	6	277129	277134	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	471328417
5244	NC_020511	TA	3	6	277191	277196	50 %	50 %	0 %	0 %	471328417
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5246	NC_020511	GCT	2	6	277245	277250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471328417
5247	NC_020511	C	6	6	277297	277302	0 %	0 %	0 %	100 %	471328417
5248	NC_020511	ATT	2	6	277310	277315	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	471328417
5249	NC_020511	CT	3	6	277344	277349	0 %	50 %	0 %	50 %	471328417
5250	NC_020511	ATTGT	2	10	277357	277366	20 %	60 %	20 %	0 %	471328417
5251	NC_020511	AATT	2	8	277403	277410	50 %	50 %	0 %	0 %	471328417
5252	NC_020511	ATT	2	6	277437	277442	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	471328417
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5262	NC_020511	TGAT	2	8	277789	277796	25 %	50 %	25 %	0 %	471328417
5263	NC_020511	CTC	2	6	277836	277841	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	471328417
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5325	NC_020511	AAAG	2	8	281083	281090	75 %	0 %	25 %	0 %	471328420
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5334	NC_020511	TTC	2	6	281514	281519	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471328420
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5353	NC_020511	CAG	2	6	282570	282575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471328421
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5357	NC_020511	AGCT	2	8	282714	282721	25 %	25 %	25 %	25 %	471328421
5358	NC_020511	CTG	2	6	282880	282885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471328421
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5368	NC_020511	TTC	2	6	283484	283489	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471328421
5369	NC_020511	TCT	2	6	283568	283573	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471328421
5370	NC_020511	AGT	2	6	283582	283587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471328421
5371	NC_020511	GCT	2	6	283614	283619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471328421
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5374	NC_020511	TAT	2	6	283677	283682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	471328421
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5400	NC_020511	CTG	2	6	285189	285194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471328422
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5403	NC_020511	CAC	2	6	285505	285510	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	471328422
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5406	NC_020511	AAGC	2	8	285609	285616	50 %	0 %	25 %	25 %	471328422
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5450	NC_020511	A	8	8	287511	287518	100 %	0 %	0 %	0 %	471328424
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5483	NC_020511	TGT	2	6	289305	289310	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	471328426
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5487	NC_020511	TA	3	6	289510	289515	50 %	50 %	0 %	0 %	471328426
5488	NC_020511	AACT	2	8	289531	289538	50 %	25 %	0 %	25 %	471328426
5489	NC_020511	CCT	2	6	289564	289569	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	471328427
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5491	NC_020511	A	6	6	289664	289669	100 %	0 %	0 %	0 %	471328427
5492	NC_020511	TTA	2	6	289689	289694	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	471328427
5493	NC_020511	TCA	2	6	289763	289768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471328427
5494	NC_020511	ATT	2	6	289823	289828	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	471328427
5495	NC_020511	GTC	2	6	289832	289837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471328427
5496	NC_020511	AATT	2	8	289848	289855	50 %	50 %	0 %	0 %	471328427
5497	NC_020511	TC	3	6	289866	289871	0 %	50 %	0 %	50 %	471328427
5498	NC_020511	A	6	6	289884	289889	100 %	0 %	0 %	0 %	471328427
5499	NC_020511	TCA	2	6	290056	290061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471328427
5500	NC_020511	TCGT	2	8	290196	290203	0 %	50 %	25 %	25 %	471328427

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