MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis IU824 complete genome

Total Repeats: 19948

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_020511	AATCT	2	10	241284	241293	40 %	40 %	0 %	20 %	471328381
4502	NC_020511	TCA	2	6	241309	241314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471328381
4503	NC_020511	CA	3	6	241326	241331	50 %	0 %	0 %	50 %	471328381
4504	NC_020511	ACT	2	6	241474	241479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471328381
4505	NC_020511	AGAT	2	8	241488	241495	50 %	25 %	25 %	0 %	471328381
4506	NC_020511	CTT	2	6	241550	241555	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471328381
4507	NC_020511	CTG	2	6	241556	241561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471328381
4508	NC_020511	T	6	6	241575	241580	0 %	100 %	0 %	0 %	471328381
4509	NC_020511	AAT	2	6	241641	241646	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	471328381
4510	NC_020511	ATTA	2	8	241683	241690	50 %	50 %	0 %	0 %	471328381
4511	NC_020511	T	7	7	241741	241747	0 %	100 %	0 %	0 %	471328382
4512	NC_020511	AAT	2	6	241813	241818	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	471328382
4513	NC_020511	TC	3	6	241937	241942	0 %	50 %	0 %	50 %	471328382
4514	NC_020511	AGA	2	6	241984	241989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471328382
4515	NC_020511	CTA	2	6	242058	242063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471328382
4516	NC_020511	GAA	3	9	242088	242096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471328382
4517	NC_020511	T	6	6	242097	242102	0 %	100 %	0 %	0 %	471328382
4518	NC_020511	CTC	2	6	242121	242126	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	471328382
4519	NC_020511	TCCA	2	8	242164	242171	25 %	25 %	0 %	50 %	471328382
4520	NC_020511	CT	3	6	242317	242322	0 %	50 %	0 %	50 %	471328382
4521	NC_020511	CA	4	8	242347	242354	50 %	0 %	0 %	50 %	471328382
4522	NC_020511	CCA	2	6	242364	242369	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	471328382
4523	NC_020511	GAA	2	6	242420	242425	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471328382
4524	NC_020511	GTT	2	6	242439	242444	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	471328382
4525	NC_020511	AAT	2	6	242553	242558	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	471328383
4526	NC_020511	TTAA	2	8	242574	242581	50 %	50 %	0 %	0 %	471328383
4527	NC_020511	CT	3	6	242596	242601	0 %	50 %	0 %	50 %	471328383
4528	NC_020511	TAG	2	6	242635	242640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471328383
4529	NC_020511	CTC	2	6	242671	242676	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	471328383
4530	NC_020511	TAA	2	6	242690	242695	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	471328383
4531	NC_020511	AG	3	6	242702	242707	50 %	0 %	50 %	0 %	471328383
4532	NC_020511	T	8	8	242723	242730	0 %	100 %	0 %	0 %	471328383
4533	NC_020511	TGA	2	6	242732	242737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471328383
4534	NC_020511	TCT	2	6	242758	242763	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471328383
4535	NC_020511	AAG	2	6	242782	242787	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471328383
4536	NC_020511	TAA	2	6	242857	242862	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	471328383
4537	NC_020511	AGA	2	6	242900	242905	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471328383
4538	NC_020511	CAAT	2	8	242914	242921	50 %	25 %	0 %	25 %	471328383
4539	NC_020511	CAA	2	6	242960	242965	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	471328383
4540	NC_020511	ACA	2	6	243041	243046	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	471328383
4541	NC_020511	ACAA	2	8	243067	243074	75 %	0 %	0 %	25 %	471328383
4542	NC_020511	CTT	2	6	243079	243084	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471328383
4543	NC_020511	TCT	2	6	243111	243116	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471328383
4544	NC_020511	ACT	2	6	243167	243172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471328383
4545	NC_020511	CAG	2	6	243262	243267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471328383
4546	NC_020511	GAAAA	2	10	243312	243321	80 %	0 %	20 %	0 %	471328383
4547	NC_020511	AAG	2	6	243332	243337	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471328383
4548	NC_020511	AGCT	2	8	243350	243357	25 %	25 %	25 %	25 %	471328383
4549	NC_020511	TCT	2	6	243409	243414	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471328383
4550	NC_020511	CA	3	6	243466	243471	50 %	0 %	0 %	50 %	471328383
4551	NC_020511	GAG	2	6	243502	243507	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	471328383
4552	NC_020511	TCT	2	6	243517	243522	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471328383
4553	NC_020511	A	7	7	243576	243582	100 %	0 %	0 %	0 %	471328383
4554	NC_020511	ATT	2	6	243674	243679	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	471328383
4555	NC_020511	TGC	2	6	243693	243698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471328383
4556	NC_020511	T	6	6	243704	243709	0 %	100 %	0 %	0 %	471328383
4557	NC_020511	GAA	2	6	243733	243738	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471328383
4558	NC_020511	T	7	7	243754	243760	0 %	100 %	0 %	0 %	471328383
4559	NC_020511	ATC	2	6	243785	243790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471328383
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4561	NC_020511	ACT	2	6	243881	243886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471328383
4562	NC_020511	CAA	2	6	243907	243912	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	471328383
4563	NC_020511	TA	4	8	243926	243933	50 %	50 %	0 %	0 %	471328383
4564	NC_020511	CGAT	2	8	243958	243965	25 %	25 %	25 %	25 %	471328383
4565	NC_020511	ACA	2	6	243984	243989	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	471328383
4566	NC_020511	CAA	2	6	244037	244042	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	471328383
4567	NC_020511	TAA	2	6	244043	244048	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	471328383
4568	NC_020511	TGC	2	6	244049	244054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471328383
4569	NC_020511	GCT	2	6	244056	244061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471328383
4570	NC_020511	CAG	2	6	244063	244068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471328383
4571	NC_020511	CTC	2	6	244144	244149	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	471328383
4572	NC_020511	TAG	2	6	244150	244155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471328383
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4574	NC_020511	AG	3	6	244173	244178	50 %	0 %	50 %	0 %	471328383
4575	NC_020511	TCT	2	6	244510	244515	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471328384
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4577	NC_020511	A	7	7	244558	244564	100 %	0 %	0 %	0 %	471328384
4578	NC_020511	CTTC	2	8	244577	244584	0 %	50 %	0 %	50 %	471328384
4579	NC_020511	CAGA	2	8	244617	244624	50 %	0 %	25 %	25 %	471328384
4580	NC_020511	AAT	2	6	244625	244630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	471328384
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4582	NC_020511	GCTG	2	8	244799	244806	0 %	25 %	50 %	25 %	471328384
4583	NC_020511	CTT	2	6	244818	244823	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471328384
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4585	NC_020511	TAAAC	2	10	244882	244891	60 %	20 %	0 %	20 %	471328384
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4588	NC_020511	TCT	3	9	245009	245017	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471328384
4589	NC_020511	GAA	2	6	245018	245023	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471328384
4590	NC_020511	TTG	2	6	245025	245030	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	471328384
4591	NC_020511	AG	3	6	245057	245062	50 %	0 %	50 %	0 %	471328384
4592	NC_020511	CTTGG	2	10	245063	245072	0 %	40 %	40 %	20 %	471328384
4593	NC_020511	TGT	2	6	245110	245115	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	471328384
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4595	NC_020511	CTG	2	6	245136	245141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471328384
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4597	NC_020511	AATT	2	8	245236	245243	50 %	50 %	0 %	0 %	471328384
4598	NC_020511	TGA	2	6	245254	245259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471328384
4599	NC_020511	TCA	2	6	245279	245284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471328384
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4601	NC_020511	CAG	2	6	245400	245405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471328384
4602	NC_020511	TAAT	2	8	245406	245413	50 %	50 %	0 %	0 %	471328384
4603	NC_020511	TGG	2	6	245422	245427	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471328384
4604	NC_020511	ATTT	2	8	245507	245514	25 %	75 %	0 %	0 %	471328384
4605	NC_020511	CAT	2	6	245556	245561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471328385
4606	NC_020511	TCT	2	6	245568	245573	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471328385
4607	NC_020511	AGT	2	6	245615	245620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471328385
4608	NC_020511	CCTT	2	8	245636	245643	0 %	50 %	0 %	50 %	471328385
4609	NC_020511	GCA	2	6	245724	245729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471328385
4610	NC_020511	TTCA	2	8	245738	245745	25 %	50 %	0 %	25 %	471328385
4611	NC_020511	ATA	2	6	245827	245832	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	471328385
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4614	NC_020511	TGC	2	6	246053	246058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471328385
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4616	NC_020511	TCT	2	6	246126	246131	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471328385
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4621	NC_020511	TCTTT	2	10	246359	246368	0 %	80 %	0 %	20 %	471328385
4622	NC_020511	ATC	2	6	246399	246404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471328385
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4995	NC_020511	CAT	2	6	264930	264935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471328406
4996	NC_020511	ACT	2	6	265312	265317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471328407
4997	NC_020511	TTC	2	6	265404	265409	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471328407
4998	NC_020511	CTT	2	6	265541	265546	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471328407
4999	NC_020511	AAT	2	6	265569	265574	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	471328407
5000	NC_020511	GCT	2	6	265585	265590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471328407

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