MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Corynebacterium halotolerans YIM 70093 = DSM 44683 plasmid pCha1

Total Repeats: 1573

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_020303	GAT	2	6	57698	57703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451945587
1002	NC_020303	TGC	2	6	57730	57735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451945587
1003	NC_020303	GCG	2	6	57738	57743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	451945587
1004	NC_020303	TGC	2	6	57910	57915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451945587
1005	NC_020303	TGC	2	6	57920	57925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451945587
1006	NC_020303	TTC	2	6	57931	57936	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451945587
1007	NC_020303	CGC	2	6	57974	57979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451945587
1008	NC_020303	TCA	2	6	58117	58122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451945587
1009	NC_020303	CAT	2	6	58139	58144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451945587
1010	NC_020303	CAT	2	6	58151	58156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451945587
1011	NC_020303	A	6	6	58265	58270	100 %	0 %	0 %	0 %	451945587
1012	NC_020303	TGG	2	6	58296	58301	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451945587
1013	NC_020303	GGCT	2	8	58314	58321	0 %	25 %	50 %	25 %	451945587
1014	NC_020303	TGG	2	6	59101	59106	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451945588
1015	NC_020303	CCA	2	6	59225	59230	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	451945588
1016	NC_020303	CGC	2	6	59250	59255	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451945588
1017	NC_020303	CCA	2	6	59336	59341	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	451945588
1018	NC_020303	CCG	2	6	59393	59398	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451945588
1019	NC_020303	GCCC	2	8	59452	59459	0 %	0 %	25 %	75 %	451945588
1020	NC_020303	CTC	2	6	59514	59519	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	451945588
1021	NC_020303	GCC	2	6	59587	59592	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451945588
1022	NC_020303	CCG	2	6	59612	59617	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451945588
1023	NC_020303	CGT	2	6	59664	59669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451945588
1024	NC_020303	GCT	2	6	59675	59680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451945588
1025	NC_020303	GTC	2	6	59749	59754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451945588
1026	NC_020303	CCT	2	6	60039	60044	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	451945589
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1028	NC_020303	CA	3	6	60070	60075	50 %	0 %	0 %	50 %	451945589
1029	NC_020303	CAG	2	6	60094	60099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451945589
1030	NC_020303	CTC	2	6	60169	60174	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	451945589
1031	NC_020303	GGCG	2	8	60222	60229	0 %	0 %	75 %	25 %	451945589
1032	NC_020303	GTGG	2	8	60259	60266	0 %	25 %	75 %	0 %	451945589
1033	NC_020303	TCG	2	6	60287	60292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451945589
1034	NC_020303	ATG	2	6	60326	60331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451945589
1035	NC_020303	GCA	2	6	60536	60541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451945590
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1045	NC_020303	GCCG	2	8	61192	61199	0 %	0 %	50 %	50 %	451945591
1046	NC_020303	GCT	2	6	61210	61215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451945591
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1052	NC_020303	CGGC	2	8	61557	61564	0 %	0 %	50 %	50 %	451945591
1053	NC_020303	GGC	2	6	61649	61654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	451945591
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1056	NC_020303	CCGG	2	8	61835	61842	0 %	0 %	50 %	50 %	451945591
1057	NC_020303	GAT	2	6	61895	61900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451945591
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1059	NC_020303	ACG	2	6	61980	61985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451945591
1060	NC_020303	GAC	2	6	61988	61993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451945591
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1066	NC_020303	GAC	2	6	62273	62278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451945591
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1093	NC_020303	GGC	2	6	64136	64141	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	451945593
1094	NC_020303	GGT	2	6	64256	64261	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451945593
1095	NC_020303	CAGG	2	8	64286	64293	25 %	0 %	50 %	25 %	451945593
1096	NC_020303	GT	4	8	64388	64395	0 %	50 %	50 %	0 %	451945593
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1099	NC_020303	CGG	2	6	65011	65016	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	451945594
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1102	NC_020303	CCG	2	6	65135	65140	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451945594
1103	NC_020303	GAG	2	6	65183	65188	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	451945594
1104	NC_020303	GCC	2	6	65240	65245	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451945594
1105	NC_020303	CG	3	6	65246	65251	0 %	0 %	50 %	50 %	451945594
1106	NC_020303	GGT	2	6	65257	65262	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451945594
1107	NC_020303	GGC	2	6	65372	65377	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	451945594
1108	NC_020303	CCGGC	2	10	65391	65400	0 %	0 %	40 %	60 %	451945594
1109	NC_020303	GAT	2	6	65435	65440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451945594
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1111	NC_020303	CAG	2	6	66025	66030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451945595
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1114	NC_020303	CCA	2	6	66224	66229	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	451945595
1115	NC_020303	TCGG	2	8	66250	66257	0 %	25 %	50 %	25 %	451945595
1116	NC_020303	GAA	2	6	66259	66264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451945595
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1118	NC_020303	CCG	2	6	66318	66323	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451945595
1119	NC_020303	GAT	2	6	66423	66428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451945595
1120	NC_020303	CGA	3	9	66516	66524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451945595
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1122	NC_020303	GAC	2	6	66601	66606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451945595
1123	NC_020303	GCA	2	6	66615	66620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451945595
1124	NC_020303	CG	3	6	66700	66705	0 %	0 %	50 %	50 %	451945595
1125	NC_020303	GCACGA	2	12	66729	66740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451945595
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1248	NC_020303	CGG	2	6	72427	72432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	451945600
1249	NC_020303	GTC	2	6	72455	72460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451945600
1250	NC_020303	CGG	2	6	72466	72471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	451945600
1251	NC_020303	ACC	2	6	72507	72512	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	451945600
1252	NC_020303	GGAC	2	8	72564	72571	25 %	0 %	50 %	25 %	451945600
1253	NC_020303	TGA	2	6	72649	72654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451945600
1254	NC_020303	TGA	2	6	72721	72726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451945600
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1262	NC_020303	TCG	2	6	72927	72932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451945600
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1277	NC_020303	GGT	2	6	73741	73746	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451945601
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1279	NC_020303	GGT	2	6	73798	73803	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451945601
1280	NC_020303	TGGGTC	2	12	73826	73837	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	451945601
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1347	NC_020303	ATC	2	6	77035	77040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451945605
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1350	NC_020303	GTGGA	2	10	77217	77226	20 %	20 %	60 %	0 %	451945605
1351	NC_020303	ATG	2	6	77319	77324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451945605
1352	NC_020303	CCT	2	6	77362	77367	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	451945605
1353	NC_020303	ACC	2	6	77373	77378	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	451945605
1354	NC_020303	TGG	2	6	77387	77392	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451945605
1355	NC_020303	TGG	2	6	77409	77414	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451945605
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1359	NC_020303	CTGG	2	8	77453	77460	0 %	25 %	50 %	25 %	451945605
1360	NC_020303	GC	3	6	77465	77470	0 %	0 %	50 %	50 %	451945605
1361	NC_020303	CCT	2	6	77482	77487	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	451945605
1362	NC_020303	CTG	2	6	77511	77516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451945605
1363	NC_020303	TCG	2	6	77536	77541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451945605
1364	NC_020303	CGT	2	6	77588	77593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451945605
1365	NC_020303	ATC	2	6	77634	77639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451945605
1366	NC_020303	CCG	2	6	77647	77652	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451945605
1367	NC_020303	GTG	2	6	77715	77720	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451945605
1368	NC_020303	ACA	2	6	77740	77745	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451945605
1369	NC_020303	CGTCCG	2	12	77747	77758	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	451945605
1370	NC_020303	CGG	2	6	77771	77776	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	451945605
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1372	NC_020303	GCG	2	6	77859	77864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	451945605
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1495	NC_020303	GAA	2	6	83196	83201	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451945610
1496	NC_020303	CCCG	2	8	83203	83210	0 %	0 %	25 %	75 %	451945610
1497	NC_020303	CGC	2	6	83227	83232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451945610
1498	NC_020303	GCC	2	6	83287	83292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451945610
1499	NC_020303	AC	3	6	83304	83309	50 %	0 %	0 %	50 %	451945610
1500	NC_020303	ACC	2	6	83339	83344	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	451945610

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