MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Corynebacterium halotolerans YIM 70093 = DSM 44683 plasmid pCha1

Total Repeats: 1573

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_020303	GCC	3	9	28740	28748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451945564
502	NC_020303	ATC	2	6	28752	28757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451945564
503	NC_020303	TCG	2	6	28852	28857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451945564
504	NC_020303	CCGGG	2	10	28871	28880	0 %	0 %	60 %	40 %	451945564
505	NC_020303	CGG	2	6	28894	28899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	451945564
506	NC_020303	TGA	2	6	28924	28929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451945564
507	NC_020303	CGG	2	6	28969	28974	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	451945564
508	NC_020303	CTG	2	6	29055	29060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451945564
509	NC_020303	GGA	2	6	29102	29107	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	451945564
510	NC_020303	CCCCG	2	10	29167	29176	0 %	0 %	20 %	80 %	451945564
511	NC_020303	ATCT	2	8	29205	29212	25 %	50 %	0 %	25 %	451945564
512	NC_020303	CGA	2	6	29285	29290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451945564
513	NC_020303	CCT	2	6	29291	29296	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	451945564
514	NC_020303	CAG	2	6	30130	30135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451945565
515	NC_020303	GGC	2	6	30216	30221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	451945565
516	NC_020303	GAC	2	6	30258	30263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451945565
517	NC_020303	GGC	2	6	30351	30356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	451945565
518	NC_020303	TCA	2	6	30395	30400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451945565
519	NC_020303	CAGC	2	8	30416	30423	25 %	0 %	25 %	50 %	451945565
520	NC_020303	GCA	2	6	30440	30445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451945565
521	NC_020303	GGC	2	6	30450	30455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	451945565
522	NC_020303	CGG	2	6	30479	30484	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	451945565
523	NC_020303	GAT	2	6	30504	30509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451945565
524	NC_020303	GAT	2	6	30519	30524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451945565
525	NC_020303	GGC	2	6	30596	30601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	451945565
526	NC_020303	ACC	2	6	30643	30648	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	451945565
527	NC_020303	ACG	2	6	30652	30657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451945565
528	NC_020303	TCGA	2	8	30673	30680	25 %	25 %	25 %	25 %	451945565
529	NC_020303	AGACCG	2	12	30722	30733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451945565
530	NC_020303	ACC	2	6	30739	30744	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	451945565
531	NC_020303	GCA	2	6	30745	30750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451945565
532	NC_020303	GCG	2	6	30760	30765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	451945565
533	NC_020303	G	6	6	30800	30805	0 %	0 %	100 %	0 %	451945565
534	NC_020303	GGC	2	6	30807	30812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	451945565
535	NC_020303	CGG	2	6	30814	30819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	451945565
536	NC_020303	CCA	2	6	30833	30838	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	451945565
537	NC_020303	GCATC	2	10	30875	30884	20 %	20 %	20 %	40 %	451945565
538	NC_020303	GGC	2	6	30960	30965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	451945565
539	NC_020303	GGC	2	6	31171	31176	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	451945566
540	NC_020303	GGCT	2	8	31200	31207	0 %	25 %	50 %	25 %	451945566
541	NC_020303	CGG	2	6	31246	31251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	451945566
542	NC_020303	GAC	2	6	31277	31282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451945566
543	NC_020303	GGA	2	6	31373	31378	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	451945566
544	NC_020303	GCC	2	6	31385	31390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451945566
545	NC_020303	CCT	2	6	31402	31407	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	451945566
546	NC_020303	CGG	2	6	31419	31424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	451945566
547	NC_020303	ATG	2	6	31473	31478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451945566
548	NC_020303	TCC	2	6	31587	31592	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	451945566
549	NC_020303	GAT	2	6	31712	31717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451945566
550	NC_020303	CCGG	2	8	31728	31735	0 %	0 %	50 %	50 %	451945566
551	NC_020303	CGG	2	6	31769	31774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	451945566
552	NC_020303	GAG	2	6	31848	31853	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	451945566
553	NC_020303	CTC	2	6	31925	31930	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	451945566
554	NC_020303	CGG	2	6	31969	31974	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	451945566
555	NC_020303	GGC	2	6	31994	31999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	451945566
556	NC_020303	CGA	2	6	32020	32025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451945566
557	NC_020303	A	6	6	34137	34142	100 %	0 %	0 %	0 %	451945567
558	NC_020303	TCG	2	6	34203	34208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451945567
559	NC_020303	GCT	2	6	34222	34227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451945567
560	NC_020303	GCC	2	6	34355	34360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451945567
561	NC_020303	CG	3	6	34391	34396	0 %	0 %	50 %	50 %	451945567
562	NC_020303	CGT	2	6	34411	34416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451945567
563	NC_020303	TCA	2	6	34701	34706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451945568
564	NC_020303	CGA	2	6	34713	34718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451945568
565	NC_020303	ACC	2	6	34735	34740	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	451945568
566	NC_020303	TGA	2	6	34764	34769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451945568
567	NC_020303	TGG	2	6	34803	34808	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451945568
568	NC_020303	CGG	2	6	34859	34864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	451945568
569	NC_020303	TGCC	2	8	34869	34876	0 %	25 %	25 %	50 %	451945568
570	NC_020303	GCG	2	6	34895	34900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	451945568
571	NC_020303	GAGC	2	8	34935	34942	25 %	0 %	50 %	25 %	451945568
572	NC_020303	AGGG	2	8	34952	34959	25 %	0 %	75 %	0 %	451945568
573	NC_020303	GTG	2	6	35042	35047	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451945568
574	NC_020303	CCAC	2	8	35114	35121	25 %	0 %	0 %	75 %	451945568
575	NC_020303	ACG	2	6	35189	35194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451945568
576	NC_020303	CCA	2	6	35273	35278	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	451945568
577	NC_020303	GCT	2	6	35291	35296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451945568
578	NC_020303	CTGC	2	8	35557	35564	0 %	25 %	25 %	50 %	451945569
579	NC_020303	GC	4	8	35616	35623	0 %	0 %	50 %	50 %	451945569
580	NC_020303	CGG	2	6	35680	35685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	451945569
581	NC_020303	ATG	2	6	35727	35732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451945569
582	NC_020303	TGAT	2	8	35757	35764	25 %	50 %	25 %	0 %	451945569
583	NC_020303	GGCG	2	8	35779	35786	0 %	0 %	75 %	25 %	451945569
584	NC_020303	TCA	2	6	35817	35822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451945569
585	NC_020303	CGT	2	6	35914	35919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451945569
586	NC_020303	ATC	2	6	35934	35939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451945569
587	NC_020303	TCC	2	6	35985	35990	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	451945569
588	NC_020303	TGT	2	6	36055	36060	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	451945569
589	NC_020303	TGA	2	6	36106	36111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451945569
590	NC_020303	GTC	2	6	36167	36172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451945569
591	NC_020303	CGG	2	6	36307	36312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	451945569
592	NC_020303	CTG	2	6	36323	36328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451945569
593	NC_020303	GGC	2	6	36350	36355	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	451945569
594	NC_020303	GGGT	2	8	36375	36382	0 %	25 %	75 %	0 %	451945569
595	NC_020303	GGT	2	6	36440	36445	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451945569
596	NC_020303	GCC	2	6	36515	36520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451945569
597	NC_020303	GGC	2	6	36533	36538	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	451945569
598	NC_020303	TGA	2	6	36547	36552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451945569
599	NC_020303	ACC	2	6	36588	36593	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	451945569
600	NC_020303	ACC	2	6	36642	36647	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	451945569
601	NC_020303	CCA	2	6	36700	36705	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	451945569
602	NC_020303	GGGCC	2	10	36737	36746	0 %	0 %	60 %	40 %	451945569
603	NC_020303	GC	3	6	36761	36766	0 %	0 %	50 %	50 %	451945569
604	NC_020303	GGT	2	6	36812	36817	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451945569
605	NC_020303	GGT	2	6	36866	36871	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451945569
606	NC_020303	TCG	2	6	36897	36902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451945569
607	NC_020303	GGAT	2	8	36919	36926	25 %	25 %	50 %	0 %	451945569
608	NC_020303	GCT	2	6	36953	36958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451945569
609	NC_020303	CAGC	2	8	37003	37010	25 %	0 %	25 %	50 %	451945569
610	NC_020303	GCA	2	6	37012	37017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451945569
611	NC_020303	ATG	2	6	37074	37079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451945569
612	NC_020303	CAG	2	6	37103	37108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451945569
613	NC_020303	TCC	2	6	37146	37151	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	451945569
614	NC_020303	CCT	2	6	37192	37197	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	451945569
615	NC_020303	GAG	2	6	37208	37213	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	451945569
616	NC_020303	TCA	2	6	37237	37242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451945569
617	NC_020303	CCA	2	6	37345	37350	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	451945569
618	NC_020303	CAG	2	6	37391	37396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451945569
619	NC_020303	CCA	2	6	37439	37444	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	451945569
620	NC_020303	CTC	2	6	37454	37459	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	451945569
621	NC_020303	GCA	2	6	37534	37539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451945570
622	NC_020303	AGAC	2	8	37565	37572	50 %	0 %	25 %	25 %	451945570
623	NC_020303	TCG	2	6	37580	37585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451945570
624	NC_020303	GGT	2	6	37594	37599	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451945570
625	NC_020303	CGT	2	6	37621	37626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451945570
626	NC_020303	CGA	2	6	37638	37643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451945570
627	NC_020303	CGT	2	6	37658	37663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451945570
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641	NC_020303	GGA	2	6	38298	38303	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	451945571
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753	NC_020303	CTG	2	6	43879	43884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451945576
754	NC_020303	GTG	2	6	43930	43935	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451945576
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874	NC_020303	GCA	2	6	49301	49306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451945580
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877	NC_020303	CTGG	2	8	49431	49438	0 %	25 %	50 %	25 %	451945580
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