MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Clostridium saccharoperbutylacetonicum N1-4(HMT) plasmid Csp_135p

Total Repeats: 3156

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_020292	ATTT	2	8	128424	128431	25 %	75 %	0 %	0 %	451822709
3002	NC_020292	TGC	2	6	128470	128475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451822709
3003	NC_020292	TCT	2	6	128480	128485	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451822709
3004	NC_020292	CTGC	2	8	128562	128569	0 %	25 %	25 %	50 %	451822709
3005	NC_020292	T	6	6	128588	128593	0 %	100 %	0 %	0 %	451822709
3006	NC_020292	TAT	2	6	128643	128648	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451822709
3007	NC_020292	TAA	2	6	128697	128702	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451822709
3008	NC_020292	TAA	2	6	128761	128766	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451822709
3009	NC_020292	TCT	3	9	128776	128784	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451822709
3010	NC_020292	AAT	2	6	128790	128795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451822709
3011	NC_020292	ATA	2	6	128893	128898	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451822709
3012	NC_020292	TTC	2	6	128944	128949	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451822709
3013	NC_020292	A	6	6	128953	128958	100 %	0 %	0 %	0 %	451822709
3014	NC_020292	TCAT	2	8	128966	128973	25 %	50 %	0 %	25 %	451822709
3015	NC_020292	AGTA	2	8	128977	128984	50 %	25 %	25 %	0 %	451822709
3016	NC_020292	ATT	2	6	128986	128991	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451822709
3017	NC_020292	CTATT	2	10	129171	129180	20 %	60 %	0 %	20 %	451822709
3018	NC_020292	CTA	2	6	129192	129197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451822709
3019	NC_020292	A	6	6	129229	129234	100 %	0 %	0 %	0 %	451822709
3020	NC_020292	T	6	6	129415	129420	0 %	100 %	0 %	0 %	451822709
3021	NC_020292	CTTT	2	8	129421	129428	0 %	75 %	0 %	25 %	451822709
3022	NC_020292	CTT	2	6	129456	129461	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451822709
3023	NC_020292	TTA	2	6	129658	129663	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451822710
3024	NC_020292	T	6	6	129702	129707	0 %	100 %	0 %	0 %	451822710
3025	NC_020292	TCT	2	6	129726	129731	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451822710
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3027	NC_020292	ACT	2	6	129753	129758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451822710
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3029	NC_020292	T	7	7	129796	129802	0 %	100 %	0 %	0 %	451822710
3030	NC_020292	TAA	2	6	129839	129844	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451822710
3031	NC_020292	ATGT	2	8	129862	129869	25 %	50 %	25 %	0 %	451822710
3032	NC_020292	CAG	2	6	129880	129885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451822710
3033	NC_020292	T	6	6	129942	129947	0 %	100 %	0 %	0 %	451822710
3034	NC_020292	GCT	2	6	129949	129954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451822710
3035	NC_020292	TCT	2	6	129963	129968	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451822710
3036	NC_020292	TA	3	6	130046	130051	50 %	50 %	0 %	0 %	451822710
3037	NC_020292	TTC	2	6	130064	130069	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451822710
3038	NC_020292	TC	3	6	130074	130079	0 %	50 %	0 %	50 %	451822710
3039	NC_020292	ATTCTC	2	12	130080	130091	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	451822710
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3041	NC_020292	TA	3	6	130219	130224	50 %	50 %	0 %	0 %	451822711
3042	NC_020292	CAT	3	9	130246	130254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451822711
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3047	NC_020292	TTTC	2	8	130371	130378	0 %	75 %	0 %	25 %	451822711
3048	NC_020292	TTC	2	6	130387	130392	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451822711
3049	NC_020292	TA	3	6	130441	130446	50 %	50 %	0 %	0 %	451822711
3050	NC_020292	TCA	2	6	130484	130489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451822711
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3052	NC_020292	T	6	6	130541	130546	0 %	100 %	0 %	0 %	451822711
3053	NC_020292	CCT	2	6	130560	130565	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	451822711
3054	NC_020292	T	6	6	130579	130584	0 %	100 %	0 %	0 %	451822711
3055	NC_020292	ATTTTT	2	12	130597	130608	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	451822711
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3058	NC_020292	AATT	2	8	130674	130681	50 %	50 %	0 %	0 %	451822712
3059	NC_020292	ATTTTT	2	12	130690	130701	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	451822712
3060	NC_020292	CATA	2	8	130761	130768	50 %	25 %	0 %	25 %	451822712
3061	NC_020292	T	6	6	130779	130784	0 %	100 %	0 %	0 %	451822712
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3063	NC_020292	TTCAA	2	10	130880	130889	40 %	40 %	0 %	20 %	451822712
3064	NC_020292	CTA	2	6	130908	130913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451822712
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3071	NC_020292	TA	3	6	131154	131159	50 %	50 %	0 %	0 %	451822713
3072	NC_020292	GTA	2	6	131230	131235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451822713
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3075	NC_020292	TAA	2	6	131267	131272	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451822713
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3081	NC_020292	ATG	2	6	131530	131535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451822714
3082	NC_020292	AACCC	2	10	131606	131615	40 %	0 %	0 %	60 %	451822714
3083	NC_020292	CTG	2	6	131638	131643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451822714
3084	NC_020292	ATT	2	6	131704	131709	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451822714
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3094	NC_020292	AATTT	2	10	132099	132108	40 %	60 %	0 %	0 %	451822715
3095	NC_020292	TAAA	2	8	132163	132170	75 %	25 %	0 %	0 %	451822715
3096	NC_020292	TCTTT	2	10	132174	132183	0 %	80 %	0 %	20 %	451822715
3097	NC_020292	TA	3	6	132190	132195	50 %	50 %	0 %	0 %	451822715
3098	NC_020292	T	6	6	132230	132235	0 %	100 %	0 %	0 %	451822715
3099	NC_020292	ATA	2	6	132236	132241	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451822715
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3101	NC_020292	GCTC	2	8	132315	132322	0 %	25 %	25 %	50 %	451822715
3102	NC_020292	AAAAT	2	10	133123	133132	80 %	20 %	0 %	0 %	451822716
3103	NC_020292	AAT	3	9	133142	133150	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451822716
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3107	NC_020292	CAG	2	6	133264	133269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451822716
3108	NC_020292	AAG	2	6	133270	133275	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451822716
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3110	NC_020292	AAT	2	6	133323	133328	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451822716
3111	NC_020292	TAT	2	6	133368	133373	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451822716
3112	NC_020292	GAT	2	6	133380	133385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451822716
3113	NC_020292	TGGA	2	8	133400	133407	25 %	25 %	50 %	0 %	451822716
3114	NC_020292	A	6	6	133409	133414	100 %	0 %	0 %	0 %	451822716
3115	NC_020292	TAT	2	6	133428	133433	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451822716
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3119	NC_020292	TGA	2	6	133547	133552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451822716
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3121	NC_020292	TAA	2	6	133595	133600	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451822716
3122	NC_020292	ATT	2	6	133735	133740	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451822716
3123	NC_020292	A	6	6	133860	133865	100 %	0 %	0 %	0 %	451822716
3124	NC_020292	TAT	2	6	133911	133916	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451822716
3125	NC_020292	GTA	2	6	133923	133928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451822716
3126	NC_020292	TTC	2	6	133967	133972	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451822716
3127	NC_020292	AAT	2	6	134018	134023	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451822717
3128	NC_020292	CAA	2	6	134036	134041	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451822717
3129	NC_020292	TGA	2	6	134106	134111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451822717
3130	NC_020292	TG	3	6	134159	134164	0 %	50 %	50 %	0 %	451822717
3131	NC_020292	CATTTT	2	12	134171	134182	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	451822717
3132	NC_020292	T	6	6	134179	134184	0 %	100 %	0 %	0 %	451822717
3133	NC_020292	TTTTG	2	10	134208	134217	0 %	80 %	20 %	0 %	451822717
3134	NC_020292	TC	3	6	134241	134246	0 %	50 %	0 %	50 %	451822717
3135	NC_020292	GTT	2	6	134247	134252	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	451822717
3136	NC_020292	TAT	3	9	134351	134359	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451822717
3137	NC_020292	TAT	2	6	134367	134372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451822717
3138	NC_020292	TCT	2	6	134380	134385	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451822717
3139	NC_020292	TTTCA	2	10	134433	134442	20 %	60 %	0 %	20 %	451822717
3140	NC_020292	ATGA	2	8	134650	134657	50 %	25 %	25 %	0 %	451822718
3141	NC_020292	CT	3	6	134754	134759	0 %	50 %	0 %	50 %	451822718
3142	NC_020292	GAA	2	6	134836	134841	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451822718
3143	NC_020292	A	6	6	134868	134873	100 %	0 %	0 %	0 %	451822718
3144	NC_020292	AGC	2	6	135061	135066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451822719
3145	NC_020292	CAT	2	6	135069	135074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451822719
3146	NC_020292	TTTC	2	8	135086	135093	0 %	75 %	0 %	25 %	451822719
3147	NC_020292	CAC	2	6	135105	135110	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	451822719
3148	NC_020292	AT	3	6	135144	135149	50 %	50 %	0 %	0 %	451822719
3149	NC_020292	ATT	2	6	135158	135163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451822719
3150	NC_020292	TTG	2	6	135231	135236	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	451822719
3151	NC_020292	CCT	2	6	135239	135244	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	451822719
3152	NC_020292	ATA	2	6	135278	135283	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451822719
3153	NC_020292	GGAT	2	8	135414	135421	25 %	25 %	50 %	0 %	451822720
3154	NC_020292	CAT	2	6	135425	135430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451822720
3155	NC_020292	T	6	6	135430	135435	0 %	100 %	0 %	0 %	451822720
3156	NC_020292	CTTT	2	8	135518	135525	0 %	75 %	0 %	25 %	451822720

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