MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Clostridium saccharoperbutylacetonicum N1-4(HMT) plasmid Csp_135p

Total Repeats: 3156

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_020292	AGA	3	9	26019	26027	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451822633
502	NC_020292	TTAAA	2	10	26087	26096	60 %	40 %	0 %	0 %	451822633
503	NC_020292	AGA	2	6	26127	26132	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451822633
504	NC_020292	ATA	2	6	26152	26157	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451822633
505	NC_020292	AGG	2	6	26162	26167	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	451822633
506	NC_020292	TCC	2	6	26229	26234	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	451822634
507	NC_020292	AT	3	6	26308	26313	50 %	50 %	0 %	0 %	451822634
508	NC_020292	AATC	2	8	26381	26388	50 %	25 %	0 %	25 %	451822634
509	NC_020292	AT	3	6	26448	26453	50 %	50 %	0 %	0 %	451822634
510	NC_020292	ATA	2	6	26487	26492	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451822634
511	NC_020292	AGC	2	6	26573	26578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451822634
512	NC_020292	TCA	2	6	26584	26589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451822634
513	NC_020292	GAT	2	6	26609	26614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451822634
514	NC_020292	ACCA	2	8	26665	26672	50 %	0 %	0 %	50 %	451822634
515	NC_020292	TGTAT	2	10	26686	26695	20 %	60 %	20 %	0 %	451822634
516	NC_020292	TTAA	2	8	26768	26775	50 %	50 %	0 %	0 %	451822634
517	NC_020292	AGTGAA	2	12	26795	26806	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	451822634
518	NC_020292	ATT	2	6	26823	26828	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451822634
519	NC_020292	GTA	2	6	26873	26878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451822634
520	NC_020292	ATG	2	6	26907	26912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451822634
521	NC_020292	AT	3	6	26925	26930	50 %	50 %	0 %	0 %	451822634
522	NC_020292	AT	3	6	26939	26944	50 %	50 %	0 %	0 %	451822634
523	NC_020292	TAA	2	6	26956	26961	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451822634
524	NC_020292	AT	3	6	26994	26999	50 %	50 %	0 %	0 %	451822634
525	NC_020292	A	7	7	27002	27008	100 %	0 %	0 %	0 %	451822634
526	NC_020292	GAT	2	6	27020	27025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451822634
527	NC_020292	ATG	2	6	27051	27056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451822634
528	NC_020292	TGA	2	6	27079	27084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451822634
529	NC_020292	ATG	2	6	27147	27152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451822634
530	NC_020292	ATAA	2	8	27191	27198	75 %	25 %	0 %	0 %	451822634
531	NC_020292	AGA	2	6	27253	27258	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451822634
532	NC_020292	ATG	2	6	27288	27293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451822634
533	NC_020292	T	6	6	27348	27353	0 %	100 %	0 %	0 %	451822634
534	NC_020292	AGAA	2	8	27518	27525	75 %	0 %	25 %	0 %	451822635
535	NC_020292	ATG	2	6	27633	27638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451822635
536	NC_020292	TA	3	6	27651	27656	50 %	50 %	0 %	0 %	451822635
537	NC_020292	TAAA	2	8	27705	27712	75 %	25 %	0 %	0 %	451822635
538	NC_020292	GAT	3	9	27734	27742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451822635
539	NC_020292	A	6	6	27787	27792	100 %	0 %	0 %	0 %	451822635
540	NC_020292	TGA	3	9	27805	27813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451822635
541	NC_020292	TGC	2	6	27918	27923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451822635
542	NC_020292	TAA	2	6	27933	27938	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451822635
543	NC_020292	GTTT	2	8	27952	27959	0 %	75 %	25 %	0 %	451822635
544	NC_020292	TAA	2	6	28024	28029	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451822635
545	NC_020292	ACA	2	6	28047	28052	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451822635
546	NC_020292	CAG	2	6	28116	28121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451822635
547	NC_020292	TGG	2	6	28213	28218	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451822635
548	NC_020292	TTA	2	6	28265	28270	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451822635
549	NC_020292	TAA	2	6	28288	28293	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451822635
550	NC_020292	TA	5	10	28316	28325	50 %	50 %	0 %	0 %	451822635
551	NC_020292	AT	3	6	28336	28341	50 %	50 %	0 %	0 %	451822635
552	NC_020292	ATTTT	2	10	28389	28398	20 %	80 %	0 %	0 %	451822635
553	NC_020292	AGAAAT	2	12	28457	28468	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	451822635
554	NC_020292	ATTA	2	8	28519	28526	50 %	50 %	0 %	0 %	451822635
555	NC_020292	TGG	2	6	28573	28578	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451822635
556	NC_020292	T	6	6	28628	28633	0 %	100 %	0 %	0 %	451822635
557	NC_020292	CTT	2	6	28671	28676	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451822635
558	NC_020292	ATG	2	6	28812	28817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451822635
559	NC_020292	TATT	2	8	28849	28856	25 %	75 %	0 %	0 %	451822635
560	NC_020292	TA	3	6	28877	28882	50 %	50 %	0 %	0 %	451822635
561	NC_020292	TTA	2	6	28916	28921	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451822635
562	NC_020292	A	7	7	28951	28957	100 %	0 %	0 %	0 %	451822635
563	NC_020292	AAT	2	6	28973	28978	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451822635
564	NC_020292	AAAG	2	8	28987	28994	75 %	0 %	25 %	0 %	451822635
565	NC_020292	AGA	2	6	29141	29146	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451822635
566	NC_020292	AT	3	6	29158	29163	50 %	50 %	0 %	0 %	451822635
567	NC_020292	TAT	2	6	29203	29208	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451822635
568	NC_020292	A	6	6	29231	29236	100 %	0 %	0 %	0 %	451822635
569	NC_020292	ATG	2	6	29265	29270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451822635
570	NC_020292	AAT	2	6	29318	29323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451822635
571	NC_020292	TAT	2	6	29381	29386	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451822635
572	NC_020292	GAT	2	6	29390	29395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451822635
573	NC_020292	AAGTT	2	10	29433	29442	40 %	40 %	20 %	0 %	451822635
574	NC_020292	CAA	2	6	29508	29513	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451822635
575	NC_020292	ATA	2	6	29517	29522	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451822635
576	NC_020292	AAT	4	12	29540	29551	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451822635
577	NC_020292	TAT	2	6	29573	29578	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451822635
578	NC_020292	GAA	2	6	29591	29596	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451822635
579	NC_020292	GAT	2	6	29603	29608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451822635
580	NC_020292	ATG	2	6	29643	29648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451822635
581	NC_020292	ATG	2	6	29673	29678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451822635
582	NC_020292	TAA	2	6	29692	29697	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451822635
583	NC_020292	GAA	2	6	29711	29716	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451822635
584	NC_020292	TAT	2	6	29797	29802	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451822635
585	NC_020292	AAAT	2	8	29862	29869	75 %	25 %	0 %	0 %	451822635
586	NC_020292	TAA	2	6	29871	29876	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451822635
587	NC_020292	CAAA	2	8	30032	30039	75 %	0 %	0 %	25 %	451822635
588	NC_020292	ATT	2	6	30073	30078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451822635
589	NC_020292	TGA	2	6	30085	30090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451822635
590	NC_020292	TAT	2	6	30122	30127	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451822635
591	NC_020292	CAG	2	6	30132	30137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451822635
592	NC_020292	TGG	2	6	30139	30144	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451822635
593	NC_020292	TAAAT	2	10	30247	30256	60 %	40 %	0 %	0 %	451822635
594	NC_020292	TTA	2	6	30373	30378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451822636
595	NC_020292	A	7	7	30383	30389	100 %	0 %	0 %	0 %	451822636
596	NC_020292	TCA	2	6	30443	30448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451822636
597	NC_020292	AAAG	2	8	30512	30519	75 %	0 %	25 %	0 %	451822636
598	NC_020292	AGA	2	6	30607	30612	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451822636
599	NC_020292	ATG	2	6	30657	30662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451822636
600	NC_020292	TA	3	6	30692	30697	50 %	50 %	0 %	0 %	451822636
601	NC_020292	ATT	2	6	30723	30728	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451822636
602	NC_020292	TGA	2	6	30754	30759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451822636
603	NC_020292	ATTTA	2	10	30792	30801	40 %	60 %	0 %	0 %	451822636
604	NC_020292	TAG	2	6	30819	30824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451822636
605	NC_020292	AAAT	2	8	30828	30835	75 %	25 %	0 %	0 %	451822636
606	NC_020292	TGAA	2	8	30921	30928	50 %	25 %	25 %	0 %	451822636
607	NC_020292	AT	3	6	30962	30967	50 %	50 %	0 %	0 %	451822636
608	NC_020292	ATA	2	6	31037	31042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451822636
609	NC_020292	TAT	2	6	31058	31063	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451822636
610	NC_020292	GAT	2	6	31064	31069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451822636
611	NC_020292	TGA	2	6	31078	31083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451822636
612	NC_020292	AT	3	6	31123	31128	50 %	50 %	0 %	0 %	451822636
613	NC_020292	AAG	2	6	31192	31197	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451822636
614	NC_020292	ATT	2	6	31278	31283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451822636
615	NC_020292	ATA	2	6	31311	31316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451822636
616	NC_020292	TAA	2	6	31347	31352	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451822636
617	NC_020292	TG	3	6	31358	31363	0 %	50 %	50 %	0 %	451822636
618	NC_020292	AT	4	8	31368	31375	50 %	50 %	0 %	0 %	451822636
619	NC_020292	TA	3	6	31395	31400	50 %	50 %	0 %	0 %	451822636
620	NC_020292	TAC	2	6	31453	31458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451822636
621	NC_020292	TAA	2	6	31459	31464	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451822636
622	NC_020292	ATA	2	6	31503	31508	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451822636
623	NC_020292	AGT	2	6	31573	31578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451822636
624	NC_020292	TGA	2	6	31603	31608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451822636
625	NC_020292	AT	3	6	31684	31689	50 %	50 %	0 %	0 %	451822636
626	NC_020292	ATTA	2	8	31700	31707	50 %	50 %	0 %	0 %	451822636
627	NC_020292	A	7	7	31721	31727	100 %	0 %	0 %	0 %	451822636
628	NC_020292	TGC	2	6	31827	31832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451822636
629	NC_020292	TA	3	6	31854	31859	50 %	50 %	0 %	0 %	451822636
630	NC_020292	AG	3	6	31864	31869	50 %	0 %	50 %	0 %	451822636
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885	NC_020292	ATA	2	6	41334	41339	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451822646
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