MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Clostridium saccharoperbutylacetonicum N1-4(HMT)

Total Repeats: 141713

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_020291	AT	3	6	139921	139926	50 %	50 %	0 %	0 %	451817014
3002	NC_020291	ATTAT	2	10	139994	140003	40 %	60 %	0 %	0 %	451817014
3003	NC_020291	AAT	2	6	140087	140092	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451817014
3004	NC_020291	GAT	2	6	140127	140132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451817014
3005	NC_020291	TAT	2	6	140138	140143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451817014
3006	NC_020291	TGA	2	6	140203	140208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451817014
3007	NC_020291	AGA	2	6	140248	140253	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451817014
3008	NC_020291	TGA	2	6	140294	140299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451817014
3009	NC_020291	ATA	2	6	140302	140307	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451817014
3010	NC_020291	GGA	2	6	140336	140341	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	451817014
3011	NC_020291	GAA	2	6	140371	140376	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451817014
3012	NC_020291	A	6	6	140421	140426	100 %	0 %	0 %	0 %	451817014
3013	NC_020291	A	6	6	140498	140503	100 %	0 %	0 %	0 %	451817014
3014	NC_020291	AAT	2	6	140522	140527	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451817014
3015	NC_020291	AG	3	6	140565	140570	50 %	0 %	50 %	0 %	451817014
3016	NC_020291	A	6	6	140620	140625	100 %	0 %	0 %	0 %	451817014
3017	NC_020291	ATG	2	6	140665	140670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451817014
3018	NC_020291	CGT	2	6	140707	140712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451817014
3019	NC_020291	TA	3	6	140715	140720	50 %	50 %	0 %	0 %	451817014
3020	NC_020291	GAT	2	6	140769	140774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451817014
3021	NC_020291	ATTA	2	8	140795	140802	50 %	50 %	0 %	0 %	451817014
3022	NC_020291	AT	3	6	140804	140809	50 %	50 %	0 %	0 %	451817014
3023	NC_020291	GAA	2	6	140811	140816	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451817014
3024	NC_020291	CAAA	2	8	141171	141178	75 %	0 %	0 %	25 %	451817015
3025	NC_020291	A	6	6	141207	141212	100 %	0 %	0 %	0 %	451817015
3026	NC_020291	AGAAA	2	10	141249	141258	80 %	0 %	20 %	0 %	451817015
3027	NC_020291	A	6	6	141265	141270	100 %	0 %	0 %	0 %	451817015
3028	NC_020291	ATG	2	6	141316	141321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451817015
3029	NC_020291	GAAG	2	8	141348	141355	50 %	0 %	50 %	0 %	451817015
3030	NC_020291	AAT	2	6	141356	141361	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451817015
3031	NC_020291	A	6	6	141380	141385	100 %	0 %	0 %	0 %	451817015
3032	NC_020291	GTT	2	6	141393	141398	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	451817015
3033	NC_020291	AGTTAA	2	12	141443	141454	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	451817015
3034	NC_020291	GAA	2	6	141471	141476	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451817015
3035	NC_020291	TAG	2	6	141559	141564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451817015
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3037	NC_020291	ATA	2	6	141582	141587	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451817015
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3039	NC_020291	AATT	2	8	141642	141649	50 %	50 %	0 %	0 %	451817015
3040	NC_020291	AGA	2	6	141669	141674	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451817016
3041	NC_020291	AAG	2	6	141713	141718	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451817016
3042	NC_020291	GAA	2	6	141725	141730	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451817016
3043	NC_020291	TA	3	6	141776	141781	50 %	50 %	0 %	0 %	451817016
3044	NC_020291	AGA	2	6	141804	141809	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451817016
3045	NC_020291	AAG	2	6	141842	141847	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451817016
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3047	NC_020291	GAGAA	2	10	141959	141968	60 %	0 %	40 %	0 %	451817016
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3051	NC_020291	GA	3	6	142224	142229	50 %	0 %	50 %	0 %	451817016
3052	NC_020291	ATA	2	6	142238	142243	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451817016
3053	NC_020291	GTAGAA	2	12	142252	142263	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	451817016
3054	NC_020291	TGG	2	6	142287	142292	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451817016
3055	NC_020291	AGC	2	6	142293	142298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451817016
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3057	NC_020291	GAA	2	6	142418	142423	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451817016
3058	NC_020291	ATGAT	2	10	142505	142514	40 %	40 %	20 %	0 %	451817016
3059	NC_020291	AT	3	6	142541	142546	50 %	50 %	0 %	0 %	451817016
3060	NC_020291	ACT	2	6	142564	142569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451817016
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3062	NC_020291	TGG	2	6	142628	142633	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451817016
3063	NC_020291	GAA	2	6	142684	142689	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451817016
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3065	NC_020291	AG	3	6	142859	142864	50 %	0 %	50 %	0 %	451817016
3066	NC_020291	CAAAGA	2	12	142954	142965	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	451817016
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3068	NC_020291	TGA	3	9	142998	143006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451817016
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3070	NC_020291	CCT	2	6	143056	143061	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	451817016
3071	NC_020291	GGAATG	2	12	143068	143079	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	451817016
3072	NC_020291	ATAG	2	8	143083	143090	50 %	25 %	25 %	0 %	451817016
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3076	NC_020291	TTA	2	6	143801	143806	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451817017
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3078	NC_020291	TAGA	2	8	143931	143938	50 %	25 %	25 %	0 %	451817017
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3082	NC_020291	A	6	6	144619	144624	100 %	0 %	0 %	0 %	451817018
3083	NC_020291	AT	3	6	144684	144689	50 %	50 %	0 %	0 %	451817018
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3089	NC_020291	AAC	2	6	144982	144987	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451817018
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3094	NC_020291	GAA	3	9	145410	145418	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451817018
3095	NC_020291	AT	3	6	145580	145585	50 %	50 %	0 %	0 %	451817018
3096	NC_020291	CAGA	2	8	145615	145622	50 %	0 %	25 %	25 %	451817018
3097	NC_020291	TTGA	2	8	145638	145645	25 %	50 %	25 %	0 %	451817018
3098	NC_020291	ATG	2	6	145651	145656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451817018
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3101	NC_020291	TACATC	2	12	145693	145704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451817018
3102	NC_020291	GCT	2	6	145725	145730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451817018
3103	NC_020291	TAAG	2	8	145786	145793	50 %	25 %	25 %	0 %	451817018
3104	NC_020291	TGA	2	6	145811	145816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451817018
3105	NC_020291	AGA	2	6	145842	145847	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451817018
3106	NC_020291	AC	3	6	145891	145896	50 %	0 %	0 %	50 %	451817018
3107	NC_020291	AGA	2	6	145898	145903	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451817018
3108	NC_020291	AAGA	2	8	145942	145949	75 %	0 %	25 %	0 %	451817018
3109	NC_020291	TA	3	6	145974	145979	50 %	50 %	0 %	0 %	451817018
3110	NC_020291	A	6	6	145981	145986	100 %	0 %	0 %	0 %	451817018
3111	NC_020291	GAA	3	9	146146	146154	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451817019
3112	NC_020291	A	6	6	146168	146173	100 %	0 %	0 %	0 %	451817019
3113	NC_020291	TAT	2	6	146176	146181	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451817019
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3115	NC_020291	T	6	6	146236	146241	0 %	100 %	0 %	0 %	451817019
3116	NC_020291	AGT	2	6	146257	146262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451817019
3117	NC_020291	AGA	2	6	146287	146292	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451817019
3118	NC_020291	TAA	2	6	146320	146325	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451817019
3119	NC_020291	ATT	2	6	146352	146357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451817019
3120	NC_020291	CATA	2	8	146448	146455	50 %	25 %	0 %	25 %	451817019
3121	NC_020291	GGA	2	6	146467	146472	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	451817019
3122	NC_020291	ACA	2	6	146528	146533	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451817019
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3124	NC_020291	ATT	2	6	146543	146548	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451817019
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3245	NC_020291	A	7	7	157032	157038	100 %	0 %	0 %	0 %	451817024
3246	NC_020291	GGT	2	6	157122	157127	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451817024
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3495	NC_020291	AGGA	2	8	165899	165906	50 %	0 %	50 %	0 %	451817034
3496	NC_020291	GAA	2	6	165952	165957	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451817034
3497	NC_020291	TCA	2	6	165989	165994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451817034
3498	NC_020291	TAT	2	6	166011	166016	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451817034
3499	NC_020291	AG	3	6	166026	166031	50 %	0 %	50 %	0 %	451817034
3500	NC_020291	GGT	2	6	166174	166179	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451817034

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