MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Clostridium saccharoperbutylacetonicum N1-4(HMT)

Total Repeats: 141713

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_020291	TGA	2	6	24033	24038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816912
502	NC_020291	TGAT	2	8	24131	24138	25 %	50 %	25 %	0 %	451816912
503	NC_020291	TAAA	2	8	24227	24234	75 %	25 %	0 %	0 %	451816912
504	NC_020291	AAT	2	6	24268	24273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451816912
505	NC_020291	AATT	2	8	24311	24318	50 %	50 %	0 %	0 %	451816912
506	NC_020291	AT	4	8	24370	24377	50 %	50 %	0 %	0 %	451816912
507	NC_020291	TGA	2	6	24384	24389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816912
508	NC_020291	TA	3	6	24404	24409	50 %	50 %	0 %	0 %	451816912
509	NC_020291	AT	3	6	24429	24434	50 %	50 %	0 %	0 %	451816912
510	NC_020291	ATT	2	6	24480	24485	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451816912
511	NC_020291	TAAA	2	8	24548	24555	75 %	25 %	0 %	0 %	451816912
512	NC_020291	ATC	2	6	24564	24569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451816912
513	NC_020291	GTA	2	6	24613	24618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816912
514	NC_020291	AGT	2	6	24660	24665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816912
515	NC_020291	ATG	2	6	24718	24723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816912
516	NC_020291	ATG	2	6	24728	24733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816912
517	NC_020291	TTAGTA	2	12	24776	24787	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	451816912
518	NC_020291	A	6	6	24807	24812	100 %	0 %	0 %	0 %	451816912
519	NC_020291	TAA	2	6	24887	24892	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451816912
520	NC_020291	CAT	2	6	25030	25035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451816912
521	NC_020291	CT	3	6	25049	25054	0 %	50 %	0 %	50 %	451816912
522	NC_020291	GTT	2	6	25060	25065	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	451816912
523	NC_020291	AT	3	6	25094	25099	50 %	50 %	0 %	0 %	451816912
524	NC_020291	AATT	2	8	25110	25117	50 %	50 %	0 %	0 %	451816912
525	NC_020291	AAT	2	6	25191	25196	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451816912
526	NC_020291	TTA	2	6	25207	25212	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451816912
527	NC_020291	GAA	2	6	25228	25233	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451816912
528	NC_020291	ATAA	2	8	25234	25241	75 %	25 %	0 %	0 %	451816912
529	NC_020291	TAT	2	6	25278	25283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451816912
530	NC_020291	AGA	2	6	25315	25320	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451816912
531	NC_020291	TA	3	6	25352	25357	50 %	50 %	0 %	0 %	451816912
532	NC_020291	AAGAA	2	10	25391	25400	80 %	0 %	20 %	0 %	451816912
533	NC_020291	CAG	2	6	25412	25417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451816912
534	NC_020291	CAG	2	6	25427	25432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451816912
535	NC_020291	TGA	2	6	25442	25447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816912
536	NC_020291	AGA	2	6	25448	25453	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451816912
537	NC_020291	TAAA	2	8	25460	25467	75 %	25 %	0 %	0 %	451816912
538	NC_020291	TCA	2	6	25471	25476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451816912
539	NC_020291	TAG	2	6	25508	25513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816912
540	NC_020291	GAA	2	6	25534	25539	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451816912
541	NC_020291	GAA	2	6	25592	25597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451816912
542	NC_020291	TAAA	2	8	25610	25617	75 %	25 %	0 %	0 %	451816912
543	NC_020291	AG	3	6	25636	25641	50 %	0 %	50 %	0 %	451816912
544	NC_020291	AGT	2	6	25663	25668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816912
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546	NC_020291	T	6	6	25741	25746	0 %	100 %	0 %	0 %	451816912
547	NC_020291	GATAT	2	10	25759	25768	40 %	40 %	20 %	0 %	451816912
548	NC_020291	GAA	2	6	25804	25809	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451816912
549	NC_020291	ATT	2	6	25844	25849	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451816912
550	NC_020291	TTCATT	2	12	25905	25916	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	451816912
551	NC_020291	TAT	2	6	26034	26039	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451816913
552	NC_020291	TACTT	2	10	26040	26049	20 %	60 %	0 %	20 %	451816913
553	NC_020291	TTA	2	6	26122	26127	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451816913
554	NC_020291	ATGA	2	8	26171	26178	50 %	25 %	25 %	0 %	451816913
555	NC_020291	TCC	2	6	26214	26219	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	451816913
556	NC_020291	TTA	2	6	26324	26329	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451816913
557	NC_020291	GTT	2	6	26337	26342	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	451816913
558	NC_020291	AT	3	6	26359	26364	50 %	50 %	0 %	0 %	451816913
559	NC_020291	T	6	6	26366	26371	0 %	100 %	0 %	0 %	451816913
560	NC_020291	TAGA	2	8	26375	26382	50 %	25 %	25 %	0 %	451816913
561	NC_020291	TAA	2	6	26390	26395	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451816913
562	NC_020291	TGT	2	6	26509	26514	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	451816913
563	NC_020291	ATT	2	6	26613	26618	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451816913
564	NC_020291	CTA	2	6	26665	26670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451816913
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569	NC_020291	TTTAT	2	10	26833	26842	20 %	80 %	0 %	0 %	451816913
570	NC_020291	TAT	2	6	26850	26855	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451816913
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574	NC_020291	ATT	2	6	26913	26918	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451816913
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593	NC_020291	TAAT	2	8	27584	27591	50 %	50 %	0 %	0 %	451816914
594	NC_020291	TAT	2	6	27617	27622	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451816914
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598	NC_020291	AT	3	6	27712	27717	50 %	50 %	0 %	0 %	451816914
599	NC_020291	GCA	2	6	27718	27723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451816914
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603	NC_020291	ATA	2	6	27847	27852	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451816914
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611	NC_020291	TAC	2	6	28320	28325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451816915
612	NC_020291	AGC	2	6	28337	28342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451816915
613	NC_020291	AAG	2	6	28354	28359	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451816915
614	NC_020291	ATA	2	6	28372	28377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451816915
615	NC_020291	AT	3	6	28430	28435	50 %	50 %	0 %	0 %	451816915
616	NC_020291	ATAG	2	8	28492	28499	50 %	25 %	25 %	0 %	451816915
617	NC_020291	AAT	3	9	28500	28508	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451816915
618	NC_020291	AATTT	2	10	28510	28519	40 %	60 %	0 %	0 %	451816915
619	NC_020291	TA	5	10	28554	28563	50 %	50 %	0 %	0 %	451816915
620	NC_020291	TCA	2	6	28581	28586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451816915
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628	NC_020291	AGA	2	6	28821	28826	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451816915
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