MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Candidatus Kinetoplastibacterium crithidii TCC036E

Total Repeats: 373

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020283	TAAAAA	2	12	3289	3300	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	451811150
2	NC_020283	AAGCAA	2	12	3774	3785	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	451811150
3	NC_020283	CTGATG	2	12	4161	4172	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	451811150
4	NC_020283	ATATTT	2	12	5446	5457	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451811151
5	NC_020283	TTCAAA	2	12	5966	5977	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	451811152
6	NC_020283	AAATTC	2	12	6287	6298	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	451811152
7	NC_020283	CATTTT	2	12	6982	6993	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	451811152
8	NC_020283	CATTTT	2	12	7018	7029	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	451811152
9	NC_020283	ATTTTC	2	12	8306	8317	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	451811152
10	NC_020283	TAGTAT	2	12	12643	12654	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	451811156
11	NC_020283	CAAAAT	2	12	13924	13935	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	451811156
12	NC_020283	ATTGTG	2	12	14921	14932	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	451811158
13	NC_020283	GCTATA	2	12	17332	17343	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	451811160
14	NC_020283	TTTTCG	2	12	20433	20444	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	451811164
15	NC_020283	ATATCA	2	12	23146	23157	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	451811168
16	NC_020283	ATATTT	2	12	23242	23253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451811168
17	NC_020283	GAAGGA	2	12	24054	24065	50 %	0 %	50 %	0 %	451811169
18	NC_020283	AGCTTC	2	12	28723	28734	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	451811174
19	NC_020283	ATTGTT	2	12	36482	36493	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	451811181
20	NC_020283	AGGAGC	2	12	38825	38836	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	451811183
21	NC_020283	CATTAG	2	12	40727	40738	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	451811184
22	NC_020283	CTAGCT	2	12	42327	42338	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	451811186
23	NC_020283	TCTGGT	2	12	45452	45463	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	451811189
24	NC_020283	ATCTAG	2	12	45883	45894	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	451811189
25	NC_020283	CTTTTA	2	12	47133	47144	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	451811191
26	NC_020283	CTATTG	2	12	50866	50877	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	451811195
27	NC_020283	TTGGTG	2	12	51845	51856	0 %	50 %	50 %	0 %	451811196
28	NC_020283	TTTAAT	2	12	54852	54863	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451811200
29	NC_020283	GCTAGA	2	12	56734	56745	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	451811201
30	NC_020283	TAGAAG	2	12	64593	64604	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	451811207
31	NC_020283	TGCATT	2	12	70932	70943	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	451811214
32	NC_020283	TTCTAT	2	12	72136	72147	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	451811215
33	NC_020283	ACCTCC	2	12	87032	87043	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	451811227
34	NC_020283	ATTTTA	2	12	87255	87266	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451811227
35	NC_020283	CTTTTT	2	12	88453	88464	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	451811228
36	NC_020283	AGAAAT	2	12	93137	93148	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	451811231
37	NC_020283	TTTAAC	2	12	98061	98072	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	451811233
38	NC_020283	GTTCCA	2	12	100577	100588	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	451811235
39	NC_020283	GCTATA	2	12	101160	101171	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	451811236
40	NC_020283	GTAATA	2	12	106190	106201	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	451811240
41	NC_020283	CGTATT	2	12	106417	106428	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	451811240
42	NC_020283	ATTGTT	2	12	107220	107231	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	451811241
43	NC_020283	TGCTAT	2	12	108853	108864	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	451811243
44	NC_020283	AATTTT	2	12	113082	113093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451811246
45	NC_020283	CATTGT	2	12	116382	116393	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	451811249
46	NC_020283	GATATT	2	12	119798	119809	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	451811252
47	NC_020283	TGTTTT	2	12	125274	125285	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	451811256
48	NC_020283	ACAATC	2	12	134781	134792	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	451811264
49	NC_020283	TTAGCT	2	12	139603	139614	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	451811268
50	NC_020283	TGCTGG	2	12	140219	140230	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	451811269
51	NC_020283	ATTTAC	2	12	140725	140736	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	451811270
52	NC_020283	ATTGCT	2	12	140880	140891	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	451811270
53	NC_020283	CATCTA	2	12	143045	143056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451811272
54	NC_020283	TGTTAA	2	12	145371	145382	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	451811273
55	NC_020283	AAGATA	2	12	152059	152070	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	451811276
56	NC_020283	GTAGAT	2	12	157414	157425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451811280
57	NC_020283	TATGAG	2	12	158965	158976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451811281
58	NC_020283	TACTGT	2	12	159289	159300	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	451811282
59	NC_020283	TTGTAA	2	12	160205	160216	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	451811284
60	NC_020283	CTATAC	2	12	160332	160343	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451811284
61	NC_020283	CTGGAA	2	12	160817	160828	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	451811284
62	NC_020283	GTTGTG	2	12	161107	161118	0 %	50 %	50 %	0 %	451811284
63	NC_020283	AATGAG	2	12	161791	161802	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	451811284
64	NC_020283	TAGAAA	2	12	163349	163360	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	451811286
65	NC_020283	CTATAG	2	12	164959	164970	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	451811287
66	NC_020283	TAAATT	2	12	168719	168730	50 %	50 %	0 %	0 %	451811290
67	NC_020283	TTCATT	2	12	171421	171432	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	451811292
68	NC_020283	ATAGGT	2	12	173000	173011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451811292
69	NC_020283	TTGTTT	2	12	174953	174964	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	451811295
70	NC_020283	ATGTTT	2	12	174989	175000	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	451811295
71	NC_020283	TTTAGA	2	12	175717	175728	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	451811296
72	NC_020283	ATGTTA	2	12	177313	177324	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	451811297
73	NC_020283	AGATGA	2	12	177755	177766	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	451811297
74	NC_020283	TAACAA	2	12	179536	179547	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	451811299
75	NC_020283	CTTTAT	2	12	180106	180117	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	451811300
76	NC_020283	TAGATA	2	12	184215	184226	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	451811304
77	NC_020283	TGATAA	2	12	184468	184479	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	451811304
78	NC_020283	TTAGAA	2	12	188735	188746	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	451811308
79	NC_020283	TTAGAC	2	12	196470	196481	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	451811310
80	NC_020283	AGGTAC	2	12	197009	197020	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	451811310
81	NC_020283	GATTCT	2	12	198363	198374	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	451811310
82	NC_020283	CAAGAT	2	12	199799	199810	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	451811313
83	NC_020283	TTTATA	2	12	204289	204300	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451811317
84	NC_020283	GATGGA	2	12	207511	207522	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	451811320
85	NC_020283	CTATTG	2	12	220431	220442	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	451811330
86	NC_020283	TTTTAT	2	12	232796	232807	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	451811333
87	NC_020283	AGTAGC	2	12	233148	233159	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	451811334
88	NC_020283	GCTATA	2	12	233509	233520	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	451811335
89	NC_020283	TCTAAA	2	12	236210	236221	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	451811338
90	NC_020283	ATCTGG	2	12	236755	236766	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	451811338
91	NC_020283	TGAATT	2	12	238430	238441	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	451811339
92	NC_020283	TATAGA	2	12	240230	240241	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	451811341
93	NC_020283	ATTAGG	2	12	242422	242433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451811343
94	NC_020283	AAAAAT	2	12	245403	245414	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	451811346
95	NC_020283	ATTATG	2	12	249257	249268	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	451811350
96	NC_020283	ATATCT	2	12	250377	250388	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	451811351
97	NC_020283	TAGATA	2	12	255940	255951	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	451811356
98	NC_020283	ATTTTT	2	12	263048	263059	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	451811363
99	NC_020283	TTGTTT	2	12	266012	266023	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	451811364
100	NC_020283	TGTTTT	2	12	273321	273332	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	451811370
101	NC_020283	TTTGAA	2	12	273657	273668	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	451811370
102	NC_020283	ATTCTT	2	12	274707	274718	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	451811372
103	NC_020283	GTAAAA	2	12	278837	278848	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	451811376
104	NC_020283	ATAGAA	2	12	280586	280597	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	451811377
105	NC_020283	CGAAAT	2	12	280819	280830	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	451811377
106	NC_020283	CTCTTA	2	12	284475	284486	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	451811379
107	NC_020283	TTAGAG	2	12	284580	284591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451811379
108	NC_020283	TATATT	2	12	292078	292089	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451811388
109	NC_020283	TTTCTT	2	12	294998	295009	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	451811390
110	NC_020283	TGATAG	2	12	296380	296391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451811393
111	NC_020283	TTTTAG	2	12	298485	298496	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	451811396
112	NC_020283	ATTAAT	2	12	299484	299495	50 %	50 %	0 %	0 %	451811397
113	NC_020283	AATATA	2	12	300073	300084	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451811398
114	NC_020283	ATATTG	2	12	300641	300652	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	451811399
115	NC_020283	TTGCAT	2	12	301347	301358	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	451811400
116	NC_020283	AATTTA	2	12	301600	301611	50 %	50 %	0 %	0 %	451811400
117	NC_020283	TATAAA	2	12	303930	303941	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451811402
118	NC_020283	TTATAT	2	12	304154	304165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451811402
119	NC_020283	TTGTTA	2	12	304744	304755	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	451811402
120	NC_020283	TTTTGG	2	12	310128	310139	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	451811409
121	NC_020283	CTGCAT	2	12	311033	311044	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	451811410
122	NC_020283	AATTTT	2	12	312124	312135	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451811412
123	NC_020283	GTTCCT	2	12	313959	313970	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	451811413
124	NC_020283	TCTATG	2	12	314571	314582	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	451811414
125	NC_020283	GATAAT	2	12	316775	316786	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	451811416
126	NC_020283	ACACTT	2	12	317063	317074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451811416
127	NC_020283	CCAACA	2	12	321171	321182	50 %	0 %	0 %	50 %	451811420
128	NC_020283	AAATCC	2	12	322672	322683	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	451811422
129	NC_020283	GATTGA	2	12	323755	323766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451811424
130	NC_020283	ATTGAA	2	12	326004	326015	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	451811426
131	NC_020283	TGATAA	2	12	326697	326708	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	451811426
132	NC_020283	AATATA	2	12	327672	327683	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451811427
133	NC_020283	GCTATG	2	12	330014	330025	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	451811431
134	NC_020283	TTGGTC	2	12	330342	330353	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	451811431
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136	NC_020283	GTCATA	2	12	331695	331706	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	451811431
137	NC_020283	TCATCC	2	12	335385	335396	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	451811433
138	NC_020283	GCTAGA	2	12	335887	335898	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	451811434
139	NC_020283	AGATCA	2	12	336393	336404	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	451811434
140	NC_020283	AGCTCT	2	12	337596	337607	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	451811435
141	NC_020283	CTAATA	2	12	341809	341820	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	451811438
142	NC_020283	TTCTGG	2	12	342417	342428	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	451811439
143	NC_020283	TATTGG	2	12	343254	343265	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	451811440
144	NC_020283	TTGATT	2	12	345289	345300	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	451811442
145	NC_020283	CTGGTG	2	12	345805	345816	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	451811442
146	NC_020283	CTTCTC	2	12	349323	349334	0 %	50 %	0 %	50 %	451811443
147	NC_020283	TTATTT	2	12	349578	349589	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	451811443
148	NC_020283	ATAATT	2	12	351309	351320	50 %	50 %	0 %	0 %	451811445
149	NC_020283	TTTTAT	2	12	352297	352308	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	451811446
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151	NC_020283	AAAACA	2	12	354159	354170	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	451811448
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169	NC_020283	AATATT	2	12	397326	397337	50 %	50 %	0 %	0 %	451811490
170	NC_020283	TTCCTC	2	12	399105	399116	0 %	50 %	0 %	50 %	451811491
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217	NC_020283	ATCACT	2	12	501645	501656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451811573
218	NC_020283	TTAAAT	2	12	503526	503537	50 %	50 %	0 %	0 %	451811575
219	NC_020283	TGATAA	2	12	505165	505176	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	451811577
220	NC_020283	AATTAT	2	12	505705	505716	50 %	50 %	0 %	0 %	451811577
221	NC_020283	ATAAAT	2	12	506289	506300	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451811577
222	NC_020283	AAAAAT	2	12	507193	507204	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	451811579
223	NC_020283	TAAAAA	2	12	510668	510679	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	451811583
224	NC_020283	ATTTCA	2	12	512958	512969	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	451811585
225	NC_020283	ATGCTG	2	12	518241	518252	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	451811590
226	NC_020283	TAGAAA	2	12	520498	520509	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	451811593
227	NC_020283	ATATTT	2	12	522296	522307	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451811595
228	NC_020283	TAAAAA	2	12	524583	524594	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	451811596
229	NC_020283	CCAACT	2	12	526403	526414	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	451811598
230	NC_020283	GAAAAA	2	12	531904	531915	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	451811604
231	NC_020283	TCCAAA	2	12	531951	531962	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	451811604
232	NC_020283	AATCAA	2	12	532148	532159	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	451811604
233	NC_020283	CAGTTG	2	12	532301	532312	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	451811604
234	NC_020283	AAATAT	2	12	532527	532538	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451811604
235	NC_020283	TAAAAC	2	12	532817	532828	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	451811605
236	NC_020283	AGACAA	2	12	536060	536071	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	451811608
237	NC_020283	GCAAGT	2	12	538289	538300	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	451811610
238	NC_020283	TAGATA	2	12	538704	538715	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	451811610
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348	NC_020283	GTAATG	2	12	772998	773009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451811818
349	NC_020283	TAAAAT	2	12	774012	774023	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451811819
350	NC_020283	TATTCA	2	12	774380	774391	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	451811819
351	NC_020283	TCGATC	2	12	774639	774650	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	451811819
352	NC_020283	ATCTAC	2	12	779094	779105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451811823
353	NC_020283	ATATTA	2	12	780188	780199	50 %	50 %	0 %	0 %	451811825
354	NC_020283	TTACCA	2	12	783584	783595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451811829
355	NC_020283	ATCTAC	2	12	784179	784190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451811830
356	NC_020283	TTTAAT	2	12	786482	786493	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451811833
357	NC_020283	GGAACA	2	12	787157	787168	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	451811833
358	NC_020283	ATACTA	2	12	787813	787824	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	451811835
359	NC_020283	CATCAC	2	12	788302	788313	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	451811836
360	NC_020283	TACCCT	2	12	788906	788917	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	451811838
361	NC_020283	GCTCAT	2	12	789786	789797	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	451811839
362	NC_020283	AGCTAG	2	12	797469	797480	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	451811856
363	NC_020283	AGTAAT	2	12	800048	800059	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	451811857
364	NC_020283	TCTTGC	2	12	800067	800078	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	451811857
365	NC_020283	AAACCA	2	12	806672	806683	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451811861
366	NC_020283	TCAGCT	2	12	809921	809932	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	451811862
367	NC_020283	TTCCAG	2	12	811552	811563	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	451811864
368	NC_020283	TTAGCA	2	12	811653	811664	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	451811864
369	NC_020283	AAAACT	2	12	813075	813086	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	451811867
370	NC_020283	ATTAGA	2	12	813162	813173	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	451811867
371	NC_020283	AGCTAG	2	12	813945	813956	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	451811868
372	NC_020283	CAGTAG	2	12	819125	819136	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	451811871
373	NC_020283	AGAGAA	2	12	820737	820748	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451811872

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.