MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Cronobacter sakazakii Sp291 plasmid pSP291-1

Total Repeats: 229

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020263	TCGC	2	8	1319	1326	0 %	25 %	25 %	50 %	449306430
2	NC_020263	GCGT	2	8	2063	2070	0 %	25 %	50 %	25 %	449306431
3	NC_020263	CTGG	2	8	2607	2614	0 %	25 %	50 %	25 %	449306432
4	NC_020263	TCGC	2	8	3072	3079	0 %	25 %	25 %	50 %	449306432
5	NC_020263	TTAA	2	8	3445	3452	50 %	50 %	0 %	0 %	449306432
6	NC_020263	CACG	2	8	3700	3707	25 %	0 %	25 %	50 %	449306433
7	NC_020263	CAGC	2	8	3998	4005	25 %	0 %	25 %	50 %	449306433
8	NC_020263	TGCG	2	8	4447	4454	0 %	25 %	50 %	25 %	449306434
9	NC_020263	CCTG	2	8	4463	4470	0 %	25 %	25 %	50 %	449306434
10	NC_020263	TCAG	2	8	6148	6155	25 %	25 %	25 %	25 %	449306435
11	NC_020263	GACC	2	8	6314	6321	25 %	0 %	25 %	50 %	449306435
12	NC_020263	ATCA	2	8	7262	7269	50 %	25 %	0 %	25 %	449306436
13	NC_020263	GACG	2	8	7633	7640	25 %	0 %	50 %	25 %	449306436
14	NC_020263	GACC	2	8	10903	10910	25 %	0 %	25 %	50 %	449306441
15	NC_020263	CTGC	2	8	11956	11963	0 %	25 %	25 %	50 %	449306442
16	NC_020263	GCCA	2	8	12084	12091	25 %	0 %	25 %	50 %	449306442
17	NC_020263	TCGC	2	8	12142	12149	0 %	25 %	25 %	50 %	449306443
18	NC_020263	GCCC	2	8	12424	12431	0 %	0 %	25 %	75 %	449306443
19	NC_020263	TCCG	2	8	12687	12694	0 %	25 %	25 %	50 %	449306443
20	NC_020263	TCGC	2	8	12769	12776	0 %	25 %	25 %	50 %	449306443
21	NC_020263	GGCA	2	8	12870	12877	25 %	0 %	50 %	25 %	449306443
22	NC_020263	GGCG	2	8	12988	12995	0 %	0 %	75 %	25 %	449306443
23	NC_020263	CGCC	2	8	13122	13129	0 %	0 %	25 %	75 %	449306443
24	NC_020263	GCCA	2	8	13258	13265	25 %	0 %	25 %	50 %	449306443
25	NC_020263	TCTT	2	8	13432	13439	0 %	75 %	0 %	25 %	449306444
26	NC_020263	GACC	2	8	13509	13516	25 %	0 %	25 %	50 %	449306444
27	NC_020263	TTGC	2	8	13696	13703	0 %	50 %	25 %	25 %	449306444
28	NC_020263	CTCA	2	8	14121	14128	25 %	25 %	0 %	50 %	449306444
29	NC_020263	GGCG	2	8	14457	14464	0 %	0 %	75 %	25 %	449306444
30	NC_020263	TGAC	2	8	14693	14700	25 %	25 %	25 %	25 %	449306445
31	NC_020263	GTGA	2	8	15136	15143	25 %	25 %	50 %	0 %	449306445
32	NC_020263	GGCA	2	8	15660	15667	25 %	0 %	50 %	25 %	449306445
33	NC_020263	GGCG	2	8	15768	15775	0 %	0 %	75 %	25 %	449306445
34	NC_020263	GGTT	2	8	15867	15874	0 %	50 %	50 %	0 %	449306445
35	NC_020263	GCTG	2	8	16028	16035	0 %	25 %	50 %	25 %	449306445
36	NC_020263	ATCG	2	8	16276	16283	25 %	25 %	25 %	25 %	449306445
37	NC_020263	GGCG	2	8	17040	17047	0 %	0 %	75 %	25 %	449306445
38	NC_020263	TGAT	2	8	17807	17814	25 %	50 %	25 %	0 %	449306446
39	NC_020263	GTCG	2	8	18042	18049	0 %	25 %	50 %	25 %	449306447
40	NC_020263	AAAG	2	8	18810	18817	75 %	0 %	25 %	0 %	449306448
41	NC_020263	CGTG	2	8	18872	18879	0 %	25 %	50 %	25 %	449306448
42	NC_020263	TGCC	2	8	19848	19855	0 %	25 %	25 %	50 %	449306449
43	NC_020263	AGAA	2	8	19925	19932	75 %	0 %	25 %	0 %	449306449
44	NC_020263	TGAA	2	8	20315	20322	50 %	25 %	25 %	0 %	449306450
45	NC_020263	GCCC	2	8	20346	20353	0 %	0 %	25 %	75 %	449306450
46	NC_020263	CAGC	2	8	21472	21479	25 %	0 %	25 %	50 %	449306451
47	NC_020263	GGTG	2	8	21868	21875	0 %	25 %	75 %	0 %	449306451
48	NC_020263	TCCT	2	8	22016	22023	0 %	50 %	0 %	50 %	449306451
49	NC_020263	TCGC	2	8	22100	22107	0 %	25 %	25 %	50 %	449306451
50	NC_020263	CGGT	2	8	23049	23056	0 %	25 %	50 %	25 %	449306452
51	NC_020263	TATG	2	8	24516	24523	25 %	50 %	25 %	0 %	449306455
52	NC_020263	GCAC	2	8	24859	24866	25 %	0 %	25 %	50 %	449306455
53	NC_020263	TGGC	2	8	25509	25516	0 %	25 %	50 %	25 %	449306457
54	NC_020263	GCGG	2	8	25551	25558	0 %	0 %	75 %	25 %	449306457
55	NC_020263	GCCA	2	8	25842	25849	25 %	0 %	25 %	50 %	449306457
56	NC_020263	TCCA	2	8	25883	25890	25 %	25 %	0 %	50 %	449306457
57	NC_020263	GTCG	2	8	26481	26488	0 %	25 %	50 %	25 %	449306458
58	NC_020263	CTAT	2	8	27951	27958	25 %	50 %	0 %	25 %	449306461
59	NC_020263	GTCA	2	8	28261	28268	25 %	25 %	25 %	25 %	449306461
60	NC_020263	CCAG	2	8	28729	28736	25 %	0 %	25 %	50 %	449306461
61	NC_020263	CGGC	2	8	29510	29517	0 %	0 %	50 %	50 %	449306462
62	NC_020263	GATG	2	8	29647	29654	25 %	25 %	50 %	0 %	449306462
63	NC_020263	CGCC	2	8	29749	29756	0 %	0 %	25 %	75 %	449306462
64	NC_020263	CAGC	2	8	30079	30086	25 %	0 %	25 %	50 %	449306463
65	NC_020263	CGCC	2	8	30175	30182	0 %	0 %	25 %	75 %	449306463
66	NC_020263	CGCC	2	8	30523	30530	0 %	0 %	25 %	75 %	449306463
67	NC_020263	CGCT	2	8	32654	32661	0 %	25 %	25 %	50 %	449306464
68	NC_020263	TGGA	2	8	32726	32733	25 %	25 %	50 %	0 %	449306464
69	NC_020263	GATG	2	8	34239	34246	25 %	25 %	50 %	0 %	449306468
70	NC_020263	GGCG	2	8	34506	34513	0 %	0 %	75 %	25 %	449306468
71	NC_020263	GGCT	2	8	34738	34745	0 %	25 %	50 %	25 %	449306468
72	NC_020263	ACGA	2	8	35838	35845	50 %	0 %	25 %	25 %	449306470
73	NC_020263	ATCA	2	8	36602	36609	50 %	25 %	0 %	25 %	449306470
74	NC_020263	GGCG	2	8	36896	36903	0 %	0 %	75 %	25 %	449306470
75	NC_020263	CCCG	2	8	37486	37493	0 %	0 %	25 %	75 %	449306471
76	NC_020263	CGCT	2	8	37576	37583	0 %	25 %	25 %	50 %	449306471
77	NC_020263	TATC	2	8	38513	38520	25 %	50 %	0 %	25 %	449306471
78	NC_020263	TTTC	2	8	39805	39812	0 %	75 %	0 %	25 %	449306473
79	NC_020263	TGCG	2	8	41125	41132	0 %	25 %	50 %	25 %	449306475
80	NC_020263	CTGT	2	8	41813	41820	0 %	50 %	25 %	25 %	449306475
81	NC_020263	TTCT	2	8	43618	43625	0 %	75 %	0 %	25 %	449306477
82	NC_020263	TCTG	2	8	43791	43798	0 %	50 %	25 %	25 %	449306477
83	NC_020263	CAGA	2	8	43884	43891	50 %	0 %	25 %	25 %	449306477
84	NC_020263	ATAC	2	8	44106	44113	50 %	25 %	0 %	25 %	449306478
85	NC_020263	TGAA	2	8	44128	44135	50 %	25 %	25 %	0 %	449306478
86	NC_020263	GGCG	2	8	44241	44248	0 %	0 %	75 %	25 %	449306478
87	NC_020263	CAGA	3	12	44587	44598	50 %	0 %	25 %	25 %	449306478
88	NC_020263	CACT	2	8	44896	44903	25 %	25 %	0 %	50 %	449306478
89	NC_020263	TTTC	2	8	46620	46627	0 %	75 %	0 %	25 %	449306479
90	NC_020263	GCGT	2	8	46863	46870	0 %	25 %	50 %	25 %	449306479
91	NC_020263	GACG	2	8	47013	47020	25 %	0 %	50 %	25 %	449306480
92	NC_020263	ATTA	2	8	47060	47067	50 %	50 %	0 %	0 %	449306480
93	NC_020263	TGCC	2	8	47447	47454	0 %	25 %	25 %	50 %	449306481
94	NC_020263	CGAG	2	8	48155	48162	25 %	0 %	50 %	25 %	449306481
95	NC_020263	CCCG	2	8	50243	50250	0 %	0 %	25 %	75 %	449306484
96	NC_020263	ATAC	2	8	50302	50309	50 %	25 %	0 %	25 %	449306484
97	NC_020263	GCCA	2	8	50422	50429	25 %	0 %	25 %	50 %	449306484
98	NC_020263	CGGG	2	8	50591	50598	0 %	0 %	75 %	25 %	449306484
99	NC_020263	GGCA	2	8	50882	50889	25 %	0 %	50 %	25 %	449306484
100	NC_020263	CAGC	2	8	50927	50934	25 %	0 %	25 %	50 %	449306484
101	NC_020263	GCTT	2	8	51389	51396	0 %	50 %	25 %	25 %	449306485
102	NC_020263	CGGT	2	8	51397	51404	0 %	25 %	50 %	25 %	449306485
103	NC_020263	GGCG	2	8	51479	51486	0 %	0 %	75 %	25 %	449306485
104	NC_020263	GCGG	2	8	51722	51729	0 %	0 %	75 %	25 %	449306485
105	NC_020263	CTGG	2	8	51851	51858	0 %	25 %	50 %	25 %	449306485
106	NC_020263	CGAA	2	8	51992	51999	50 %	0 %	25 %	25 %	449306485
107	NC_020263	CAGG	2	8	52130	52137	25 %	0 %	50 %	25 %	449306485
108	NC_020263	CAGC	2	8	53757	53764	25 %	0 %	25 %	50 %	449306486
109	NC_020263	GTGC	2	8	54564	54571	0 %	25 %	50 %	25 %	449306486
110	NC_020263	GGCG	2	8	54588	54595	0 %	0 %	75 %	25 %	449306486
111	NC_020263	TGAC	2	8	54971	54978	25 %	25 %	25 %	25 %	449306486
112	NC_020263	TGCC	2	8	55466	55473	0 %	25 %	25 %	50 %	449306487
113	NC_020263	GCTG	2	8	55699	55706	0 %	25 %	50 %	25 %	449306488
114	NC_020263	CGCT	2	8	56083	56090	0 %	25 %	25 %	50 %	449306489
115	NC_020263	AAAG	2	8	56504	56511	75 %	0 %	25 %	0 %	449306489
116	NC_020263	TTAC	2	8	56539	56546	25 %	50 %	0 %	25 %	449306490
117	NC_020263	GTTT	2	8	56724	56731	0 %	75 %	25 %	0 %	449306490
118	NC_020263	CCGG	2	8	57005	57012	0 %	0 %	50 %	50 %	449306490
119	NC_020263	CATA	2	8	57066	57073	50 %	25 %	0 %	25 %	449306490
120	NC_020263	TGTC	2	8	57289	57296	0 %	50 %	25 %	25 %	449306491
121	NC_020263	CAGC	2	8	57942	57949	25 %	0 %	25 %	50 %	449306491
122	NC_020263	CGTT	2	8	58615	58622	0 %	50 %	25 %	25 %	449306491
123	NC_020263	GCCA	2	8	58724	58731	25 %	0 %	25 %	50 %	449306491
124	NC_020263	CCGA	2	8	58999	59006	25 %	0 %	25 %	50 %	449306491
125	NC_020263	CAGC	2	8	59229	59236	25 %	0 %	25 %	50 %	449306491
126	NC_020263	GTCA	2	8	59348	59355	25 %	25 %	25 %	25 %	449306492
127	NC_020263	GCCC	2	8	62019	62026	0 %	0 %	25 %	75 %	449306497
128	NC_020263	TGGT	2	8	62150	62157	0 %	50 %	50 %	0 %	449306497
129	NC_020263	AACG	2	8	62410	62417	50 %	0 %	25 %	25 %	449306497
130	NC_020263	CCAT	2	8	63771	63778	25 %	25 %	0 %	50 %	449306499
131	NC_020263	GCTG	2	8	63811	63818	0 %	25 %	50 %	25 %	449306499
132	NC_020263	TTTC	2	8	64105	64112	0 %	75 %	0 %	25 %	449306499
133	NC_020263	GCTG	2	8	64225	64232	0 %	25 %	50 %	25 %	449306499
134	NC_020263	GCAG	2	8	64657	64664	25 %	0 %	50 %	25 %	449306499
135	NC_020263	AGGC	2	8	65343	65350	25 %	0 %	50 %	25 %	449306500
136	NC_020263	TATT	2	8	65477	65484	25 %	75 %	0 %	0 %	449306500
137	NC_020263	GCTG	2	8	65858	65865	0 %	25 %	50 %	25 %	449306500
138	NC_020263	GGAT	2	8	65933	65940	25 %	25 %	50 %	0 %	449306500
139	NC_020263	GGTG	2	8	67535	67542	0 %	25 %	75 %	0 %	449306502
140	NC_020263	GCCT	2	8	67585	67592	0 %	25 %	25 %	50 %	449306502
141	NC_020263	TCCT	2	8	67620	67627	0 %	50 %	0 %	50 %	449306502
142	NC_020263	TCTG	2	8	67763	67770	0 %	50 %	25 %	25 %	449306502
143	NC_020263	GCGG	2	8	67847	67854	0 %	0 %	75 %	25 %	449306502
144	NC_020263	GAAC	2	8	68237	68244	50 %	0 %	25 %	25 %	449306502
145	NC_020263	ACTT	2	8	68669	68676	25 %	50 %	0 %	25 %	449306503
146	NC_020263	CATG	2	8	69315	69322	25 %	25 %	25 %	25 %	449306503
147	NC_020263	TGCC	2	8	69997	70004	0 %	25 %	25 %	50 %	449306504
148	NC_020263	GCCT	2	8	70421	70428	0 %	25 %	25 %	50 %	449306504
149	NC_020263	CCCG	2	8	70519	70526	0 %	0 %	25 %	75 %	449306504
150	NC_020263	TCGC	2	8	70644	70651	0 %	25 %	25 %	50 %	449306504
151	NC_020263	TGGC	2	8	71367	71374	0 %	25 %	50 %	25 %	449306504
152	NC_020263	GCAG	2	8	71586	71593	25 %	0 %	50 %	25 %	449306505
153	NC_020263	ATTG	2	8	71712	71719	25 %	50 %	25 %	0 %	449306505
154	NC_020263	GCGA	2	8	72035	72042	25 %	0 %	50 %	25 %	449306505
155	NC_020263	GGCG	2	8	73562	73569	0 %	0 %	75 %	25 %	449306505
156	NC_020263	TGCG	2	8	73727	73734	0 %	25 %	50 %	25 %	449306505
157	NC_020263	GCTG	2	8	76267	76274	0 %	25 %	50 %	25 %	449306508
158	NC_020263	ACCA	2	8	76722	76729	50 %	0 %	0 %	50 %	449306509
159	NC_020263	TGAT	2	8	76846	76853	25 %	50 %	25 %	0 %	449306509
160	NC_020263	GCTC	2	8	77561	77568	0 %	25 %	25 %	50 %	449306509
161	NC_020263	ATCA	2	8	78081	78088	50 %	25 %	0 %	25 %	449306509
162	NC_020263	GGGA	2	8	78994	79001	25 %	0 %	75 %	0 %	449306510
163	NC_020263	GACC	2	8	79205	79212	25 %	0 %	25 %	50 %	449306510
164	NC_020263	AGCG	2	8	79281	79288	25 %	0 %	50 %	25 %	449306510
165	NC_020263	TCGC	2	8	81276	81283	0 %	25 %	25 %	50 %	449306511
166	NC_020263	CGTG	2	8	85174	85181	0 %	25 %	50 %	25 %	449306514
167	NC_020263	ATTT	2	8	85289	85296	25 %	75 %	0 %	0 %	449306514
168	NC_020263	CTGG	2	8	85312	85319	0 %	25 %	50 %	25 %	449306514
169	NC_020263	AAAG	2	8	86288	86295	75 %	0 %	25 %	0 %	449306515
170	NC_020263	CAGG	2	8	86459	86466	25 %	0 %	50 %	25 %	449306515
171	NC_020263	CGCT	2	8	88675	88682	0 %	25 %	25 %	50 %	449306516
172	NC_020263	CATC	2	8	89230	89237	25 %	25 %	0 %	50 %	449306516
173	NC_020263	CCAG	2	8	89389	89396	25 %	0 %	25 %	50 %	449306516
174	NC_020263	CAGA	2	8	89609	89616	50 %	0 %	25 %	25 %	449306516
175	NC_020263	CGCC	2	8	89797	89804	0 %	0 %	25 %	75 %	449306516
176	NC_020263	GCGG	2	8	90135	90142	0 %	0 %	75 %	25 %	449306516
177	NC_020263	GCTG	2	8	90995	91002	0 %	25 %	50 %	25 %	449306517
178	NC_020263	GAAG	2	8	92243	92250	50 %	0 %	50 %	0 %	449306518
179	NC_020263	TGAT	2	8	92463	92470	25 %	50 %	25 %	0 %	449306519
180	NC_020263	CAGC	2	8	92968	92975	25 %	0 %	25 %	50 %	449306519
181	NC_020263	CGCC	2	8	93481	93488	0 %	0 %	25 %	75 %	449306519
182	NC_020263	GTGA	2	8	94878	94885	25 %	25 %	50 %	0 %	449306519
183	NC_020263	CAGG	2	8	95865	95872	25 %	0 %	50 %	25 %	449306520
184	NC_020263	CGTC	2	8	96045	96052	0 %	25 %	25 %	50 %	449306520
185	NC_020263	ACGG	2	8	96201	96208	25 %	0 %	50 %	25 %	449306520
186	NC_020263	GGCG	2	8	96808	96815	0 %	0 %	75 %	25 %	449306520
187	NC_020263	TTCG	2	8	97093	97100	0 %	50 %	25 %	25 %	449306520
188	NC_020263	CGTG	2	8	97841	97848	0 %	25 %	50 %	25 %	449306521
189	NC_020263	GCGT	2	8	98250	98257	0 %	25 %	50 %	25 %	449306521
190	NC_020263	CGCC	2	8	98411	98418	0 %	0 %	25 %	75 %	449306521
191	NC_020263	GACC	2	8	99155	99162	25 %	0 %	25 %	50 %	449306521
192	NC_020263	GAGC	2	8	99519	99526	25 %	0 %	50 %	25 %	449306521
193	NC_020263	GGCG	2	8	99794	99801	0 %	0 %	75 %	25 %	449306521
194	NC_020263	CGCC	2	8	99943	99950	0 %	0 %	25 %	75 %	449306521
195	NC_020263	GTGG	2	8	99993	100000	0 %	25 %	75 %	0 %	449306521
196	NC_020263	GCAG	2	8	100182	100189	25 %	0 %	50 %	25 %	449306522
197	NC_020263	GGTT	2	8	100609	100616	0 %	50 %	50 %	0 %	449306522
198	NC_020263	GCGT	2	8	100914	100921	0 %	25 %	50 %	25 %	449306522
199	NC_020263	ATGG	2	8	100940	100947	25 %	25 %	50 %	0 %	449306522
200	NC_020263	CGGT	2	8	101061	101068	0 %	25 %	50 %	25 %	449306522
201	NC_020263	AGCG	2	8	101863	101870	25 %	0 %	50 %	25 %	449306522
202	NC_020263	ATCA	2	8	102361	102368	50 %	25 %	0 %	25 %	449306523
203	NC_020263	GTCG	2	8	102616	102623	0 %	25 %	50 %	25 %	449306523
204	NC_020263	GGCA	2	8	103028	103035	25 %	0 %	50 %	25 %	449306523
205	NC_020263	ACCG	2	8	103498	103505	25 %	0 %	25 %	50 %	449306523
206	NC_020263	GCTG	2	8	103796	103803	0 %	25 %	50 %	25 %	449306524
207	NC_020263	CGGG	2	8	104009	104016	0 %	0 %	75 %	25 %	449306525
208	NC_020263	GCCA	2	8	104246	104253	25 %	0 %	25 %	50 %	449306525
209	NC_020263	CGCA	2	8	105402	105409	25 %	0 %	25 %	50 %	449306526
210	NC_020263	GCCC	2	8	105621	105628	0 %	0 %	25 %	75 %	449306526
211	NC_020263	TGGG	2	8	107190	107197	0 %	25 %	75 %	0 %	449306527
212	NC_020263	ACGC	2	8	108351	108358	25 %	0 %	25 %	50 %	449306528
213	NC_020263	GCTG	2	8	108671	108678	0 %	25 %	50 %	25 %	449306528
214	NC_020263	ACGC	2	8	108947	108954	25 %	0 %	25 %	50 %	449306529
215	NC_020263	GCTG	2	8	109042	109049	0 %	25 %	50 %	25 %	449306529
216	NC_020263	GCTG	2	8	109777	109784	0 %	25 %	50 %	25 %	449306529
217	NC_020263	CTGA	2	8	110361	110368	25 %	25 %	25 %	25 %	449306529
218	NC_020263	CCAA	2	8	110813	110820	50 %	0 %	0 %	50 %	449306530
219	NC_020263	TCAG	2	8	110958	110965	25 %	25 %	25 %	25 %	449306530
220	NC_020263	GAAT	2	8	111301	111308	50 %	25 %	25 %	0 %	449306530
221	NC_020263	CTAT	2	8	111423	111430	25 %	50 %	0 %	25 %	449306530
222	NC_020263	CCGG	2	8	111883	111890	0 %	0 %	50 %	50 %	449306530
223	NC_020263	AGAA	2	8	112039	112046	75 %	0 %	25 %	0 %	449306531
224	NC_020263	ACTA	2	8	112218	112225	50 %	25 %	0 %	25 %	449306531
225	NC_020263	CGGT	2	8	113989	113996	0 %	25 %	50 %	25 %	449306531
226	NC_020263	ATAA	2	8	114439	114446	75 %	25 %	0 %	0 %	449306532
227	NC_020263	CTGA	2	8	115170	115177	25 %	25 %	25 %	25 %	449306533
228	NC_020263	ACGA	2	8	115485	115492	50 %	0 %	25 %	25 %	449306533
229	NC_020263	TTCT	2	8	116811	116818	0 %	75 %	0 %	25 %	449306534

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.