MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Cronobacter sakazakii Sp291 plasmid pSP291-2

Total Repeats: 49

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020261	CT	3	6	2152	2157	0 %	50 %	0 %	50 %	449306369
2	NC_020261	AT	3	6	2420	2425	50 %	50 %	0 %	0 %	449306369
3	NC_020261	CG	3	6	2565	2570	0 %	0 %	50 %	50 %	449306370
4	NC_020261	TA	3	6	3039	3044	50 %	50 %	0 %	0 %	449306371
5	NC_020261	TG	3	6	3959	3964	0 %	50 %	50 %	0 %	449306372
6	NC_020261	GA	3	6	4285	4290	50 %	0 %	50 %	0 %	449306372
7	NC_020261	CT	3	6	4598	4603	0 %	50 %	0 %	50 %	449306372
8	NC_020261	AG	3	6	5593	5598	50 %	0 %	50 %	0 %	449306373
9	NC_020261	AT	3	6	5882	5887	50 %	50 %	0 %	0 %	449306374
10	NC_020261	TC	3	6	9973	9978	0 %	50 %	0 %	50 %	449306377
11	NC_020261	GA	3	6	10233	10238	50 %	0 %	50 %	0 %	449306378
12	NC_020261	CG	4	8	11380	11387	0 %	0 %	50 %	50 %	449306379
13	NC_020261	GA	3	6	12124	12129	50 %	0 %	50 %	0 %	449306379
14	NC_020261	AG	3	6	12759	12764	50 %	0 %	50 %	0 %	449306379
15	NC_020261	CG	3	6	12973	12978	0 %	0 %	50 %	50 %	449306379
16	NC_020261	CG	3	6	13540	13545	0 %	0 %	50 %	50 %	449306379
17	NC_020261	GC	3	6	13964	13969	0 %	0 %	50 %	50 %	449306380
18	NC_020261	CT	3	6	17636	17641	0 %	50 %	0 %	50 %	449306383
19	NC_020261	AG	3	6	19119	19124	50 %	0 %	50 %	0 %	449306384
20	NC_020261	CG	3	6	23089	23094	0 %	0 %	50 %	50 %	449306387
21	NC_020261	AC	3	6	25590	25595	50 %	0 %	0 %	50 %	449306388
22	NC_020261	GA	3	6	25982	25987	50 %	0 %	50 %	0 %	449306389
23	NC_020261	CG	3	6	27553	27558	0 %	0 %	50 %	50 %	449306390
24	NC_020261	GC	3	6	29661	29666	0 %	0 %	50 %	50 %	449306391
25	NC_020261	GC	4	8	31541	31548	0 %	0 %	50 %	50 %	449306395
26	NC_020261	GC	3	6	31632	31637	0 %	0 %	50 %	50 %	449306395
27	NC_020261	AT	3	6	32201	32206	50 %	50 %	0 %	0 %	449306396
28	NC_020261	CG	3	6	32600	32605	0 %	0 %	50 %	50 %	449306397
29	NC_020261	AC	3	6	33232	33237	50 %	0 %	0 %	50 %	449306397
30	NC_020261	GA	3	6	35662	35667	50 %	0 %	50 %	0 %	449306400
31	NC_020261	TC	3	6	35930	35935	0 %	50 %	0 %	50 %	449306400
32	NC_020261	CA	3	6	40552	40557	50 %	0 %	0 %	50 %	449306408
33	NC_020261	CA	3	6	40620	40625	50 %	0 %	0 %	50 %	449306408
34	NC_020261	GA	3	6	42518	42523	50 %	0 %	50 %	0 %	449306410
35	NC_020261	CG	3	6	43648	43653	0 %	0 %	50 %	50 %	449306413
36	NC_020261	TA	3	6	43663	43668	50 %	50 %	0 %	0 %	449306413
37	NC_020261	GC	3	6	43856	43861	0 %	0 %	50 %	50 %	449306413
38	NC_020261	TC	3	6	43923	43928	0 %	50 %	0 %	50 %	449306413
39	NC_020261	GT	4	8	45158	45165	0 %	50 %	50 %	0 %	449306414
40	NC_020261	CG	3	6	45204	45209	0 %	0 %	50 %	50 %	449306414
41	NC_020261	GC	3	6	45329	45334	0 %	0 %	50 %	50 %	449306414
42	NC_020261	GC	3	6	46775	46780	0 %	0 %	50 %	50 %	449306415
43	NC_020261	GC	3	6	46985	46990	0 %	0 %	50 %	50 %	449306415
44	NC_020261	AG	3	6	47118	47123	50 %	0 %	50 %	0 %	449306415
45	NC_020261	GA	3	6	47589	47594	50 %	0 %	50 %	0 %	449306415
46	NC_020261	CG	3	6	49467	49472	0 %	0 %	50 %	50 %	449306417
47	NC_020261	GA	3	6	49672	49677	50 %	0 %	50 %	0 %	449306417
48	NC_020261	CT	3	6	49841	49846	0 %	50 %	0 %	50 %	449306417
49	NC_020261	AT	3	6	50674	50679	50 %	50 %	0 %	0 %	449306419

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.