MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydophila psittaci Mat116

Total Repeats: 21146

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_020248	CCA	2	6	220830	220835	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	449070858
4002	NC_020248	TTC	2	6	220838	220843	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449070858
4003	NC_020248	GCCC	2	8	220912	220919	0 %	0 %	25 %	75 %	449070858
4004	NC_020248	AC	3	6	220993	220998	50 %	0 %	0 %	50 %	449070858
4005	NC_020248	CCA	2	6	221001	221006	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	449070858
4006	NC_020248	CCG	2	6	221085	221090	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	449070858
4007	NC_020248	AGG	2	6	221102	221107	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	449070858
4008	NC_020248	GTTA	2	8	221243	221250	25 %	50 %	25 %	0 %	449070858
4009	NC_020248	ATAG	2	8	221270	221277	50 %	25 %	25 %	0 %	449070858
4010	NC_020248	CCA	2	6	221280	221285	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	449070858
4011	NC_020248	GTT	2	6	221297	221302	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449070858
4012	NC_020248	TG	3	6	221313	221318	0 %	50 %	50 %	0 %	449070858
4013	NC_020248	TGG	2	6	221323	221328	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	449070858
4014	NC_020248	TTGTA	2	10	221333	221342	20 %	60 %	20 %	0 %	449070858
4015	NC_020248	AATGGT	2	12	221507	221518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449070858
4016	NC_020248	AGG	2	6	221558	221563	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	449070858
4017	NC_020248	CTT	2	6	221566	221571	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449070858
4018	NC_020248	TGC	3	9	221630	221638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449070858
4019	NC_020248	T	6	6	221639	221644	0 %	100 %	0 %	0 %	449070858
4020	NC_020248	T	6	6	221656	221661	0 %	100 %	0 %	0 %	449070858
4021	NC_020248	AAT	2	6	221675	221680	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449070858
4022	NC_020248	TTCC	2	8	221815	221822	0 %	50 %	0 %	50 %	449070858
4023	NC_020248	CTG	2	6	221830	221835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449070858
4024	NC_020248	CTT	2	6	221836	221841	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449070858
4025	NC_020248	GA	3	6	221842	221847	50 %	0 %	50 %	0 %	449070858
4026	NC_020248	AGG	2	6	221882	221887	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	449070858
4027	NC_020248	GCT	2	6	221913	221918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449070858
4028	NC_020248	TAAA	2	8	222019	222026	75 %	25 %	0 %	0 %	449070858
4029	NC_020248	CAC	2	6	222028	222033	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	449070858
4030	NC_020248	TTG	2	6	222038	222043	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449070858
4031	NC_020248	ATC	2	6	222050	222055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449070858
4032	NC_020248	TA	3	6	222105	222110	50 %	50 %	0 %	0 %	449070858
4033	NC_020248	AATG	2	8	222176	222183	50 %	25 %	25 %	0 %	449070858
4034	NC_020248	AGTAGA	2	12	222236	222247	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	449070858
4035	NC_020248	TGT	2	6	222254	222259	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449070858
4036	NC_020248	GTA	2	6	222264	222269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449070858
4037	NC_020248	AG	3	6	222306	222311	50 %	0 %	50 %	0 %	449070858
4038	NC_020248	ATG	2	6	222382	222387	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449070858
4039	NC_020248	GCTTA	2	10	222464	222473	20 %	40 %	20 %	20 %	449070858
4040	NC_020248	TTTG	2	8	222484	222491	0 %	75 %	25 %	0 %	449070858
4041	NC_020248	ACT	2	6	222503	222508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449070858
4042	NC_020248	CAGGAG	2	12	222517	222528	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	449070858
4043	NC_020248	AGG	3	9	222530	222538	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	449070858
4044	NC_020248	CTA	2	6	222553	222558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449070858
4045	NC_020248	TGT	2	6	222626	222631	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449070858
4046	NC_020248	TGC	2	6	222651	222656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449070858
4047	NC_020248	TGA	2	6	222668	222673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449070858
4048	NC_020248	GCA	2	6	222765	222770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449070858
4049	NC_020248	ACC	2	6	223017	223022	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	449070859
4050	NC_020248	GGT	2	6	223104	223109	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	449070859
4051	NC_020248	CTT	2	6	223130	223135	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449070859
4052	NC_020248	TCT	2	6	223204	223209	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449070859
4053	NC_020248	AG	3	6	223285	223290	50 %	0 %	50 %	0 %	449070859
4054	NC_020248	GAA	2	6	223324	223329	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449070859
4055	NC_020248	GTA	2	6	223381	223386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449070859
4056	NC_020248	AGA	2	6	223554	223559	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449070859
4057	NC_020248	ACA	2	6	223684	223689	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449070859
4058	NC_020248	ATA	2	6	223777	223782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449070859
4059	NC_020248	ACC	2	6	223794	223799	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	449070859
4060	NC_020248	AGC	2	6	223825	223830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449070859
4061	NC_020248	TAT	3	9	223832	223840	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449070859
4062	NC_020248	AGA	2	6	223902	223907	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449070859
4063	NC_020248	CCTT	2	8	223921	223928	0 %	50 %	0 %	50 %	449070859
4064	NC_020248	TCT	2	6	223996	224001	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449070859
4065	NC_020248	TTG	2	6	224046	224051	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449070859
4066	NC_020248	TTC	2	6	224061	224066	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449070859
4067	NC_020248	AT	3	6	224159	224164	50 %	50 %	0 %	0 %	449070859
4068	NC_020248	CAG	2	6	224228	224233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449070859
4069	NC_020248	GCA	2	6	224248	224253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449070859
4070	NC_020248	GAC	2	6	224280	224285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449070859
4071	NC_020248	TGT	2	6	224300	224305	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449070859
4072	NC_020248	CAC	2	6	224381	224386	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	449070859
4073	NC_020248	GGTT	2	8	224422	224429	0 %	50 %	50 %	0 %	449070859
4074	NC_020248	TC	3	6	224477	224482	0 %	50 %	0 %	50 %	449070859
4075	NC_020248	AAT	2	6	224580	224585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449070859
4076	NC_020248	ATT	3	9	224646	224654	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449070859
4077	NC_020248	TAAA	2	8	224754	224761	75 %	25 %	0 %	0 %	449070859
4078	NC_020248	CAC	2	6	224765	224770	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	449070859
4079	NC_020248	CCT	2	6	224854	224859	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	449070859
4080	NC_020248	AGC	2	6	224886	224891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449070859
4081	NC_020248	ATT	2	6	224895	224900	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449070859
4082	NC_020248	GAAT	2	8	224920	224927	50 %	25 %	25 %	0 %	449070859
4083	NC_020248	GGT	2	6	224939	224944	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	449070859
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4085	NC_020248	TTTA	2	8	224982	224989	25 %	75 %	0 %	0 %	449070859
4086	NC_020248	CCA	3	9	225103	225111	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	449070859
4087	NC_020248	TTC	2	6	225124	225129	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449070859
4088	NC_020248	CCA	2	6	225196	225201	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	449070859
4089	NC_020248	ACT	2	6	225226	225231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449070859
4090	NC_020248	AGG	2	6	225307	225312	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	449070859
4091	NC_020248	TG	3	6	225358	225363	0 %	50 %	50 %	0 %	449070859
4092	NC_020248	CTC	2	6	225401	225406	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	449070859
4093	NC_020248	AAG	2	6	225456	225461	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449070859
4094	NC_020248	CTC	2	6	225575	225580	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	449070859
4095	NC_020248	CAC	2	6	225626	225631	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	449070859
4096	NC_020248	GT	3	6	225635	225640	0 %	50 %	50 %	0 %	449070859
4097	NC_020248	AAT	2	6	225676	225681	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449070859
4098	NC_020248	TG	3	6	225696	225701	0 %	50 %	50 %	0 %	449070859
4099	NC_020248	GAA	2	6	225716	225721	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449070859
4100	NC_020248	GAA	2	6	225760	225765	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449070859
4101	NC_020248	TTC	2	6	226032	226037	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449070860
4102	NC_020248	TGTT	2	8	226095	226102	0 %	75 %	25 %	0 %	449070860
4103	NC_020248	T	6	6	226152	226157	0 %	100 %	0 %	0 %	449070860
4104	NC_020248	TTTC	2	8	226184	226191	0 %	75 %	0 %	25 %	449070860
4105	NC_020248	CAC	2	6	226201	226206	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	449070860
4106	NC_020248	GCCAAC	2	12	226270	226281	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	449070860
4107	NC_020248	T	6	6	226350	226355	0 %	100 %	0 %	0 %	449070861
4108	NC_020248	CTC	2	6	226400	226405	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	449070861
4109	NC_020248	TGA	2	6	226445	226450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449070861
4110	NC_020248	TTG	2	6	226477	226482	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449070861
4111	NC_020248	AACC	2	8	226492	226499	50 %	0 %	0 %	50 %	449070861
4112	NC_020248	TCG	2	6	226559	226564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449070861
4113	NC_020248	AAT	2	6	226668	226673	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449070861
4114	NC_020248	AACA	2	8	226706	226713	75 %	0 %	0 %	25 %	449070861
4115	NC_020248	ATTTT	2	10	226714	226723	20 %	80 %	0 %	0 %	449070861
4116	NC_020248	TAT	2	6	226724	226729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449070861
4117	NC_020248	GGA	2	6	226907	226912	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	449070862
4118	NC_020248	AGG	3	9	226992	227000	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	449070862
4119	NC_020248	CAA	2	6	227021	227026	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449070862
4120	NC_020248	GA	4	8	227038	227045	50 %	0 %	50 %	0 %	449070862
4121	NC_020248	TCC	2	6	227096	227101	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	449070862
4122	NC_020248	T	6	6	227126	227131	0 %	100 %	0 %	0 %	449070862
4123	NC_020248	AAT	2	6	227150	227155	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449070862
4124	NC_020248	AAG	2	6	227178	227183	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449070862
4125	NC_020248	AAGACC	2	12	227263	227274	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	449070862
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4127	NC_020248	T	7	7	227363	227369	0 %	100 %	0 %	0 %	449070862
4128	NC_020248	AAT	2	6	227387	227392	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449070862
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4132	NC_020248	ACAG	2	8	227578	227585	50 %	0 %	25 %	25 %	449070862
4133	NC_020248	CA	3	6	227609	227614	50 %	0 %	0 %	50 %	449070862
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4140	NC_020248	TTC	2	6	228056	228061	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449070862
4141	NC_020248	TCA	2	6	228210	228215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449070862
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4144	NC_020248	GGT	2	6	228530	228535	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	449070863
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4153	NC_020248	T	6	6	228954	228959	0 %	100 %	0 %	0 %	449070864
4154	NC_020248	TAA	2	6	228982	228987	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449070864
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4157	NC_020248	CTT	2	6	229095	229100	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449070864
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4162	NC_020248	T	6	6	229329	229334	0 %	100 %	0 %	0 %	449070865
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4367	NC_020248	TTG	2	6	241920	241925	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449070878
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4490	NC_020248	GTT	2	6	248119	248124	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449070886
4491	NC_020248	GAT	2	6	248169	248174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449070886
4492	NC_020248	GA	3	6	248223	248228	50 %	0 %	50 %	0 %	449070886
4493	NC_020248	TATT	2	8	248239	248246	25 %	75 %	0 %	0 %	449070886
4494	NC_020248	GAA	2	6	248295	248300	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449070886
4495	NC_020248	ATC	2	6	248319	248324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449070886
4496	NC_020248	CAA	2	6	248336	248341	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449070886
4497	NC_020248	CTT	2	6	248429	248434	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449070886
4498	NC_020248	TTCT	2	8	248441	248448	0 %	75 %	0 %	25 %	449070886
4499	NC_020248	AAC	2	6	248450	248455	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449070886
4500	NC_020248	ACA	2	6	248476	248481	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449070886

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