MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydophila psittaci Mat116

Total Repeats: 21146

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_020248	ATC	2	6	193336	193341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449070830
3502	NC_020248	GAAA	2	8	193365	193372	75 %	0 %	25 %	0 %	449070830
3503	NC_020248	CAC	2	6	193456	193461	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	449070830
3504	NC_020248	GGA	2	6	193482	193487	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	449070830
3505	NC_020248	TCAT	2	8	193489	193496	25 %	50 %	0 %	25 %	449070830
3506	NC_020248	TTC	2	6	193519	193524	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449070830
3507	NC_020248	ACA	2	6	193542	193547	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449070830
3508	NC_020248	TTC	2	6	194090	194095	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449070831
3509	NC_020248	AGTTA	2	10	194174	194183	40 %	40 %	20 %	0 %	449070831
3510	NC_020248	TTATT	2	10	194194	194203	20 %	80 %	0 %	0 %	449070831
3511	NC_020248	CTG	2	6	194260	194265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449070831
3512	NC_020248	TTA	2	6	194307	194312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449070831
3513	NC_020248	AGG	2	6	194314	194319	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	449070831
3514	NC_020248	ATG	2	6	194350	194355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449070831
3515	NC_020248	ATG	2	6	194392	194397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449070831
3516	NC_020248	ATTT	2	8	194398	194405	25 %	75 %	0 %	0 %	449070831
3517	NC_020248	TGA	3	9	194510	194518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449070831
3518	NC_020248	ACAATC	2	12	194540	194551	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	449070831
3519	NC_020248	TAG	2	6	194588	194593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449070831
3520	NC_020248	CAAAGG	2	12	194671	194682	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	449070831
3521	NC_020248	ATT	2	6	194685	194690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449070831
3522	NC_020248	GA	3	6	194756	194761	50 %	0 %	50 %	0 %	449070831
3523	NC_020248	TGT	2	6	194777	194782	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449070831
3524	NC_020248	TCA	2	6	194808	194813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449070831
3525	NC_020248	GTT	2	6	194858	194863	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449070831
3526	NC_020248	ATT	2	6	194915	194920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449070831
3527	NC_020248	AC	3	6	194922	194927	50 %	0 %	0 %	50 %	449070831
3528	NC_020248	AAT	2	6	194975	194980	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449070831
3529	NC_020248	ACA	2	6	195796	195801	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449070832
3530	NC_020248	GAC	2	6	195821	195826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449070832
3531	NC_020248	AGA	2	6	195829	195834	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449070832
3532	NC_020248	GCA	2	6	195838	195843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449070832
3533	NC_020248	AGGA	2	8	195855	195862	50 %	0 %	50 %	0 %	449070832
3534	NC_020248	CAAA	2	8	195934	195941	75 %	0 %	0 %	25 %	449070832
3535	NC_020248	AAC	2	6	195961	195966	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449070832
3536	NC_020248	AAGA	2	8	196021	196028	75 %	0 %	25 %	0 %	449070832
3537	NC_020248	GTT	2	6	196071	196076	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449070832
3538	NC_020248	TAT	2	6	196127	196132	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449070832
3539	NC_020248	GAG	2	6	196155	196160	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	449070832
3540	NC_020248	GCT	2	6	196172	196177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449070832
3541	NC_020248	TTA	2	6	196182	196187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449070832
3542	NC_020248	GATA	2	8	196202	196209	50 %	25 %	25 %	0 %	449070832
3543	NC_020248	AAAG	2	8	196240	196247	75 %	0 %	25 %	0 %	449070832
3544	NC_020248	GTT	2	6	196262	196267	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449070832
3545	NC_020248	AGA	2	6	196288	196293	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449070832
3546	NC_020248	TTC	2	6	196300	196305	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449070832
3547	NC_020248	AAC	2	6	196325	196330	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449070832
3548	NC_020248	ACGT	2	8	196613	196620	25 %	25 %	25 %	25 %	449070833
3549	NC_020248	GAT	2	6	196716	196721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449070833
3550	NC_020248	TGA	2	6	196758	196763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449070833
3551	NC_020248	A	7	7	196769	196775	100 %	0 %	0 %	0 %	449070833
3552	NC_020248	GTG	2	6	196794	196799	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	449070833
3553	NC_020248	GGC	2	6	196831	196836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	449070833
3554	NC_020248	GAA	2	6	196948	196953	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449070833
3555	NC_020248	CCA	2	6	196967	196972	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	449070833
3556	NC_020248	GAG	2	6	197023	197028	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	449070833
3557	NC_020248	GC	3	6	197035	197040	0 %	0 %	50 %	50 %	449070833
3558	NC_020248	ATT	2	6	197108	197113	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449070833
3559	NC_020248	AGGGT	2	10	197117	197126	20 %	20 %	60 %	0 %	449070833
3560	NC_020248	GAT	2	6	197149	197154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449070833
3561	NC_020248	GAT	2	6	197209	197214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449070833
3562	NC_020248	GAG	2	6	197248	197253	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	449070833
3563	NC_020248	CTT	2	6	197281	197286	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449070833
3564	NC_020248	TTGG	2	8	197297	197304	0 %	50 %	50 %	0 %	449070833
3565	NC_020248	TCC	2	6	197318	197323	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	449070833
3566	NC_020248	CTT	2	6	197335	197340	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449070833
3567	NC_020248	A	6	6	197370	197375	100 %	0 %	0 %	0 %	449070833
3568	NC_020248	TCT	2	6	197387	197392	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449070833
3569	NC_020248	AAG	2	6	197417	197422	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449070833
3570	NC_020248	GAG	2	6	197470	197475	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	449070833
3571	NC_020248	TGGAT	2	10	197558	197567	20 %	40 %	40 %	0 %	449070833
3572	NC_020248	CTAAA	2	10	197615	197624	60 %	20 %	0 %	20 %	449070833
3573	NC_020248	TTC	2	6	197660	197665	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449070833
3574	NC_020248	TAC	2	6	197685	197690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449070833
3575	NC_020248	TCT	2	6	197723	197728	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449070833
3576	NC_020248	TTC	2	6	197732	197737	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449070833
3577	NC_020248	TTG	2	6	197774	197779	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449070833
3578	NC_020248	GGC	2	6	197787	197792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	449070833
3579	NC_020248	TTC	2	6	197795	197800	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449070833
3580	NC_020248	CAT	2	6	197896	197901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449070833
3581	NC_020248	AAG	2	6	197902	197907	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449070833
3582	NC_020248	CTTTA	2	10	197918	197927	20 %	60 %	0 %	20 %	449070833
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3586	NC_020248	AGA	3	9	198081	198089	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449070833
3587	NC_020248	AAAAT	2	10	198095	198104	80 %	20 %	0 %	0 %	449070833
3588	NC_020248	GCTT	2	8	198230	198237	0 %	50 %	25 %	25 %	449070834
3589	NC_020248	GAG	2	6	198276	198281	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	449070834
3590	NC_020248	AG	3	6	198309	198314	50 %	0 %	50 %	0 %	449070834
3591	NC_020248	TA	4	8	198330	198337	50 %	50 %	0 %	0 %	449070834
3592	NC_020248	TCT	2	6	198346	198351	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449070834
3593	NC_020248	GAA	2	6	198790	198795	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449070835
3594	NC_020248	GTT	2	6	198827	198832	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449070835
3595	NC_020248	GTT	2	6	198843	198848	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449070835
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3597	NC_020248	AAGA	2	8	198914	198921	75 %	0 %	25 %	0 %	449070835
3598	NC_020248	CTT	2	6	198954	198959	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449070835
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3601	NC_020248	GCT	2	6	199301	199306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449070836
3602	NC_020248	A	6	6	199628	199633	100 %	0 %	0 %	0 %	449070836
3603	NC_020248	TGT	2	6	199645	199650	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449070836
3604	NC_020248	CAG	2	6	199687	199692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449070836
3605	NC_020248	ACA	2	6	199703	199708	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449070836
3606	NC_020248	GTT	2	6	199803	199808	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449070836
3607	NC_020248	AAG	2	6	199890	199895	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449070836
3608	NC_020248	GCTT	2	8	199907	199914	0 %	50 %	25 %	25 %	449070836
3609	NC_020248	TGT	2	6	199975	199980	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449070836
3610	NC_020248	TG	3	6	200081	200086	0 %	50 %	50 %	0 %	449070836
3611	NC_020248	A	6	6	200100	200105	100 %	0 %	0 %	0 %	449070836
3612	NC_020248	GGA	2	6	200144	200149	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	449070836
3613	NC_020248	ACT	2	6	200171	200176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449070836
3614	NC_020248	TATG	2	8	200228	200235	25 %	50 %	25 %	0 %	449070836
3615	NC_020248	AGA	2	6	200302	200307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449070836
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3619	NC_020248	GA	3	6	200400	200405	50 %	0 %	50 %	0 %	449070836
3620	NC_020248	GTT	2	6	200462	200467	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449070836
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3622	NC_020248	CTT	2	6	200499	200504	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449070836
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3990	NC_020248	CAG	2	6	220468	220473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449070858
3991	NC_020248	TGC	2	6	220478	220483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449070858
3992	NC_020248	GCA	2	6	220491	220496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449070858
3993	NC_020248	ACT	2	6	220497	220502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449070858
3994	NC_020248	GATT	2	8	220562	220569	25 %	50 %	25 %	0 %	449070858
3995	NC_020248	GTTA	2	8	220574	220581	25 %	50 %	25 %	0 %	449070858
3996	NC_020248	CCA	2	6	220608	220613	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	449070858
3997	NC_020248	AGA	2	6	220679	220684	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449070858
3998	NC_020248	CCA	3	9	220737	220745	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	449070858
3999	NC_020248	T	7	7	220747	220753	0 %	100 %	0 %	0 %	449070858
4000	NC_020248	GGT	2	6	220754	220759	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	449070858

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