MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydophila psittaci Mat116

Total Repeats: 21146

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_020248	AAG	2	6	165718	165723	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449070805
3002	NC_020248	TGG	2	6	165797	165802	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	449070805
3003	NC_020248	AG	4	8	165996	166003	50 %	0 %	50 %	0 %	449070805
3004	NC_020248	GAT	2	6	166035	166040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449070805
3005	NC_020248	GAA	3	9	166053	166061	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449070805
3006	NC_020248	CAA	2	6	166062	166067	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449070805
3007	NC_020248	ATG	2	6	166084	166089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449070805
3008	NC_020248	AAC	2	6	166109	166114	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449070805
3009	NC_020248	TGT	2	6	166193	166198	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449070805
3010	NC_020248	CGAG	2	8	166202	166209	25 %	0 %	50 %	25 %	449070805
3011	NC_020248	GAA	2	6	166221	166226	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449070805
3012	NC_020248	GAT	2	6	166289	166294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449070805
3013	NC_020248	GTG	2	6	166345	166350	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	449070805
3014	NC_020248	GAG	2	6	166365	166370	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	449070805
3015	NC_020248	AAATG	2	10	166400	166409	60 %	20 %	20 %	0 %	449070805
3016	NC_020248	CTT	2	6	166560	166565	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449070805
3017	NC_020248	AAGAGA	2	12	166600	166611	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449070805
3018	NC_020248	GAA	2	6	166674	166679	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449070805
3019	NC_020248	AAT	2	6	166701	166706	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449070805
3020	NC_020248	TCT	2	6	166718	166723	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449070805
3021	NC_020248	AGC	2	6	166813	166818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449070805
3022	NC_020248	G	6	6	166898	166903	0 %	0 %	100 %	0 %	449070805
3023	NC_020248	TGA	2	6	166970	166975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449070805
3024	NC_020248	AAC	2	6	166996	167001	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449070805
3025	NC_020248	TTGC	2	8	167003	167010	0 %	50 %	25 %	25 %	449070805
3026	NC_020248	TTC	2	6	167019	167024	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449070805
3027	NC_020248	AC	3	6	167239	167244	50 %	0 %	0 %	50 %	449070805
3028	NC_020248	TC	3	6	167263	167268	0 %	50 %	0 %	50 %	449070805
3029	NC_020248	GGA	2	6	167295	167300	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	449070805
3030	NC_020248	GAA	2	6	167322	167327	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449070805
3031	NC_020248	TTC	2	6	167334	167339	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449070805
3032	NC_020248	AGC	2	6	167417	167422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449070805
3033	NC_020248	TCG	2	6	167488	167493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449070805
3034	NC_020248	AAG	2	6	167510	167515	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449070805
3035	NC_020248	TCT	2	6	167580	167585	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449070805
3036	NC_020248	CAAC	2	8	167619	167626	50 %	0 %	0 %	50 %	449070805
3037	NC_020248	TGT	2	6	167790	167795	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449070806
3038	NC_020248	A	6	6	167797	167802	100 %	0 %	0 %	0 %	449070806
3039	NC_020248	GT	3	6	167872	167877	0 %	50 %	50 %	0 %	449070806
3040	NC_020248	GCA	2	6	167911	167916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449070806
3041	NC_020248	T	6	6	167917	167922	0 %	100 %	0 %	0 %	449070806
3042	NC_020248	TAC	2	6	167934	167939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449070806
3043	NC_020248	ATTC	2	8	167943	167950	25 %	50 %	0 %	25 %	449070806
3044	NC_020248	ATA	2	6	168023	168028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449070806
3045	NC_020248	GAA	2	6	168040	168045	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449070806
3046	NC_020248	A	8	8	168044	168051	100 %	0 %	0 %	0 %	449070806
3047	NC_020248	TGA	2	6	168166	168171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449070806
3048	NC_020248	GGGGA	2	10	168175	168184	20 %	0 %	80 %	0 %	449070806
3049	NC_020248	TTC	2	6	168186	168191	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449070806
3050	NC_020248	TAA	2	6	168339	168344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449070806
3051	NC_020248	T	6	6	168367	168372	0 %	100 %	0 %	0 %	449070806
3052	NC_020248	T	6	6	168406	168411	0 %	100 %	0 %	0 %	449070806
3053	NC_020248	GAAG	2	8	168439	168446	50 %	0 %	50 %	0 %	449070806
3054	NC_020248	AAAG	2	8	168477	168484	75 %	0 %	25 %	0 %	449070806
3055	NC_020248	A	6	6	168493	168498	100 %	0 %	0 %	0 %	449070806
3056	NC_020248	TG	3	6	168652	168657	0 %	50 %	50 %	0 %	449070806
3057	NC_020248	GTT	2	6	168711	168716	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449070807
3058	NC_020248	T	7	7	168736	168742	0 %	100 %	0 %	0 %	449070807
3059	NC_020248	TGA	2	6	168783	168788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449070807
3060	NC_020248	AGA	2	6	168893	168898	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449070807
3061	NC_020248	T	7	7	168900	168906	0 %	100 %	0 %	0 %	449070807
3062	NC_020248	CTG	2	6	168907	168912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449070807
3063	NC_020248	TGT	2	6	169833	169838	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449070808
3064	NC_020248	ATA	3	9	169912	169920	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449070808
3065	NC_020248	TAA	2	6	169936	169941	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449070808
3066	NC_020248	T	6	6	170106	170111	0 %	100 %	0 %	0 %	449070809
3067	NC_020248	TAC	2	6	170148	170153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449070809
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3069	NC_020248	T	6	6	170288	170293	0 %	100 %	0 %	0 %	449070809
3070	NC_020248	TTCC	2	8	170350	170357	0 %	50 %	0 %	50 %	449070809
3071	NC_020248	AGA	2	6	170372	170377	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449070809
3072	NC_020248	T	6	6	170378	170383	0 %	100 %	0 %	0 %	449070809
3073	NC_020248	AGT	2	6	170417	170422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449070809
3074	NC_020248	AAG	2	6	170569	170574	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449070809
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3077	NC_020248	TAT	2	6	170712	170717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449070809
3078	NC_020248	TCT	2	6	170721	170726	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449070809
3079	NC_020248	GCT	2	6	170817	170822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449070810
3080	NC_020248	GGC	2	6	170823	170828	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	449070810
3081	NC_020248	AGG	2	6	170873	170878	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	449070810
3082	NC_020248	CTA	2	6	170889	170894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449070810
3083	NC_020248	GAT	2	6	170957	170962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449070810
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3087	NC_020248	GAT	2	6	171109	171114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449070810
3088	NC_020248	ATA	2	6	171122	171127	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449070810
3089	NC_020248	AAC	2	6	171233	171238	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449070810
3090	NC_020248	T	8	8	171280	171287	0 %	100 %	0 %	0 %	449070810
3091	NC_020248	AGA	2	6	171377	171382	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449070810
3092	NC_020248	CTT	2	6	171433	171438	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449070810
3093	NC_020248	GA	3	6	171444	171449	50 %	0 %	50 %	0 %	449070810
3094	NC_020248	TCT	2	6	171545	171550	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449070811
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3096	NC_020248	TC	3	6	171646	171651	0 %	50 %	0 %	50 %	449070811
3097	NC_020248	GTT	2	6	171756	171761	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449070811
3098	NC_020248	TGT	2	6	171814	171819	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449070811
3099	NC_020248	GATA	2	8	171843	171850	50 %	25 %	25 %	0 %	449070811
3100	NC_020248	TTG	2	6	171895	171900	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449070811
3101	NC_020248	GAC	2	6	171924	171929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449070811
3102	NC_020248	ACA	2	6	171995	172000	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449070811
3103	NC_020248	GGA	2	6	172047	172052	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	449070811
3104	NC_020248	ACA	2	6	172169	172174	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449070812
3105	NC_020248	AGG	2	6	172181	172186	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	449070812
3106	NC_020248	AGA	2	6	172258	172263	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449070812
3107	NC_020248	GA	4	8	172426	172433	50 %	0 %	50 %	0 %	449070812
3108	NC_020248	CAGG	2	8	172441	172448	25 %	0 %	50 %	25 %	449070812
3109	NC_020248	T	6	6	172575	172580	0 %	100 %	0 %	0 %	449070812
3110	NC_020248	A	6	6	172812	172817	100 %	0 %	0 %	0 %	449070813
3111	NC_020248	ATTTT	2	10	173189	173198	20 %	80 %	0 %	0 %	449070814
3112	NC_020248	GAGAG	2	10	173206	173215	40 %	0 %	60 %	0 %	449070814
3113	NC_020248	TCG	2	6	173277	173282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449070814
3114	NC_020248	GAA	2	6	173284	173289	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449070814
3115	NC_020248	T	6	6	173324	173329	0 %	100 %	0 %	0 %	449070814
3116	NC_020248	T	7	7	173345	173351	0 %	100 %	0 %	0 %	449070814
3117	NC_020248	GCT	2	6	173391	173396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449070814
3118	NC_020248	GTTTTT	2	12	173435	173446	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	449070814
3119	NC_020248	T	7	7	173442	173448	0 %	100 %	0 %	0 %	449070814
3120	NC_020248	ATG	2	6	173985	173990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449070815
3121	NC_020248	TGCTGG	2	12	174130	174141	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	449070815
3122	NC_020248	AAG	2	6	174237	174242	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449070815
3123	NC_020248	TGA	3	9	174409	174417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449070815
3124	NC_020248	GATAGA	2	12	174418	174429	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	449070815
3125	NC_020248	TCCG	2	8	174432	174439	0 %	25 %	25 %	50 %	449070815
3126	NC_020248	ACA	2	6	174484	174489	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449070815
3127	NC_020248	CAA	2	6	174620	174625	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449070815
3128	NC_020248	TTC	2	6	174627	174632	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449070815
3129	NC_020248	AGC	2	6	174648	174653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449070815
3130	NC_020248	A	6	6	174664	174669	100 %	0 %	0 %	0 %	449070815
3131	NC_020248	A	6	6	174671	174676	100 %	0 %	0 %	0 %	449070815
3132	NC_020248	ATG	2	6	174776	174781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449070815
3133	NC_020248	AGC	2	6	175021	175026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449070816
3134	NC_020248	TCA	2	6	175098	175103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449070816
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3138	NC_020248	GAA	2	6	175231	175236	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449070816
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3140	NC_020248	CTT	2	6	175417	175422	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449070817
3141	NC_020248	A	6	6	175423	175428	100 %	0 %	0 %	0 %	449070817
3142	NC_020248	T	6	6	175429	175434	0 %	100 %	0 %	0 %	449070817
3143	NC_020248	TCT	2	6	175504	175509	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449070817
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3146	NC_020248	GAA	2	6	175672	175677	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449070817
3147	NC_020248	TGA	2	6	175710	175715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449070817
3148	NC_020248	T	6	6	175726	175731	0 %	100 %	0 %	0 %	449070817
3149	NC_020248	AT	3	6	175737	175742	50 %	50 %	0 %	0 %	449070817
3150	NC_020248	GAA	2	6	175796	175801	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449070817
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3152	NC_020248	TTG	2	6	175894	175899	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449070817
3153	NC_020248	AAGA	2	8	175924	175931	75 %	0 %	25 %	0 %	449070817
3154	NC_020248	CG	3	6	176068	176073	0 %	0 %	50 %	50 %	449070818
3155	NC_020248	GAAA	2	8	176129	176136	75 %	0 %	25 %	0 %	449070818
3156	NC_020248	AGA	2	6	176163	176168	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449070818
3157	NC_020248	ATA	2	6	176238	176243	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449070818
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3160	NC_020248	TTGA	2	8	176588	176595	25 %	50 %	25 %	0 %	449070818
3161	NC_020248	AGA	2	6	176604	176609	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449070818
3162	NC_020248	GAT	2	6	176612	176617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449070818
3163	NC_020248	TGA	2	6	176620	176625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449070818
3164	NC_020248	CGT	2	6	176695	176700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449070819
3165	NC_020248	GGT	2	6	176704	176709	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	449070819
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3179	NC_020248	ACT	2	6	177063	177068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449070819
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3212	NC_020248	GTTA	2	8	178602	178609	25 %	50 %	25 %	0 %	449070819
3213	NC_020248	ATA	2	6	178744	178749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449070819
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3215	NC_020248	TC	3	6	178815	178820	0 %	50 %	0 %	50 %	449070819
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3233	NC_020248	ATC	2	6	180091	180096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449070820
3234	NC_020248	GCT	2	6	180103	180108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449070820
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3236	NC_020248	CGG	2	6	180285	180290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	449070820
3237	NC_020248	TGA	2	6	180323	180328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449070820
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3240	NC_020248	CAA	2	6	180469	180474	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449070820
3241	NC_020248	TTC	2	6	180485	180490	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449070820
3242	NC_020248	TC	4	8	180489	180496	0 %	50 %	0 %	50 %	449070820
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3244	NC_020248	TAT	2	6	180726	180731	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449070820
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3490	NC_020248	TAA	2	6	192947	192952	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449070830
3491	NC_020248	ATT	2	6	192963	192968	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449070830
3492	NC_020248	AGGG	2	8	192976	192983	25 %	0 %	75 %	0 %	449070830
3493	NC_020248	GGA	2	6	193068	193073	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	449070830
3494	NC_020248	GCA	2	6	193083	193088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449070830
3495	NC_020248	TTCA	2	8	193134	193141	25 %	50 %	0 %	25 %	449070830
3496	NC_020248	A	6	6	193160	193165	100 %	0 %	0 %	0 %	449070830
3497	NC_020248	CCCTT	2	10	193183	193192	0 %	40 %	0 %	60 %	449070830
3498	NC_020248	TGA	2	6	193211	193216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449070830
3499	NC_020248	CT	3	6	193233	193238	0 %	50 %	0 %	50 %	449070830
3500	NC_020248	TTA	2	6	193323	193328	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449070830

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